El protocolo proporcionado aquí describe los pasos detallados para realizar estudios de eficacia de fármacos en un modelo bioluminiscente de infección por Trypanosoma cruzi , con un enfoque en la adquisición, análisis e interpretación de datos. También se proporcionan procedimientos de solución de problemas y control de calidad para minimizar los problemas técnicos.
Para controlar y disminuir el impacto en la salud pública de las enfermedades protozoarias humanas, como la enfermedad de Chagas, la leishmaniasis y la tripanosomiasis africana humana, es necesario acelerar el desarrollo de nuevos medicamentos y vacunas. Sin embargo, este proceso está lleno de dificultades, como la muy compleja biología de los parásitos y la patogénesis de las enfermedades y, como es típico de las enfermedades tropicales desatendidas, la financiación comparativamente limitada para la investigación y el desarrollo. Por lo tanto, los modelos de estudio in vitro e in vivo que puedan reproducir suficientemente las características clave de la infección y la enfermedad y que al mismo tiempo proporcionen un uso racional de los recursos son esenciales para avanzar en la investigación de estas afecciones. Un ejemplo es el modelo de ratón de imágenes de bioluminiscencia (BLI) in vivo para la enfermedad de Chagas, que proporciona una detección altamente sensible de la luz de longitud de onda larga generada por los parásitos Trypanosoma cruzi que expresan luciferasa. A pesar de que esta técnica se ha convertido en el enfoque estándar para los estudios de eficacia de fármacos in vivo , los grupos de investigación aún pueden tener dificultades para implementarla debido a la falta de capacitación práctica adecuada sobre el manejo de equipos y la aplicación de procedimientos de control de calidad, incluso cuando se dispone de equipos BLI adecuados. Teniendo en cuenta este panorama, este protocolo tiene como objetivo guiar desde la planificación de experimentos hasta la adquisición y análisis de datos, con detalles que faciliten la implementación de protocolos en grupos de investigación con poca o nula experiencia con BLI, ya sea para la enfermedad de Chagas o para otros modelos de ratones con enfermedades infecciosas.
La enfermedad de Chagas es endémica en América Latina y afecta aproximadamente a siete millones de personas en todo el mundo1. Anualmente, más de 50.000 muertes y pérdidas económicas de alrededor de 7 mil millones de dólares son el resultado de la naturaleza incapacitante de esta enfermedad2. La enfermedad de Chagas es causada por el protozoo Trypanosoma cruzi, un parásito hemoflagelado heteroxénico capaz de infectar mamíferos (silvestres y domésticos) y vectores triatominos (Hemiptera, Reduviidae)3 en las Américas, donde se establece la transmisión vectorial. Otras vías de infección importantes son la transfusión de sangre, el trasplante de órganos, la transmisión oral (por la ingestión de alimentos contaminados con un triatomino infectado)4 y la transmisión congénita. Las vías de transmisión no vectorial han contribuido a la diseminación de la enfermedad de Chagas a zonas no endémicas 3,5.
La enfermedad de Chagas se manifiesta en dos fases clínicas. La fase aguda es, en la mayoría de los casos, asintomática. Las infecciones sintomáticas suelen asociarse a signos inespecíficos como fiebre, fatiga, mialgia, linfadenopatías, esplenomegalia y hepatomegalia. La fase aguda también se asocia a menudo con parasitemia patente y circulación sistémica de parásitos. La muerte puede ocurrir hasta en el 10% de los casos diagnosticados, especialmente en los de infección oral6. La fase crónica a menudo se caracteriza por un largo período de ausencia de síntomas. Con el tiempo, aproximadamente un tercio de los pacientes infectados décadas antes presentan manifestaciones cardíacas, generalmente acompañadas de fibrosis e inflamación miocárdica, y/o trastornos gastrointestinales, en su mayoría relacionados con el desarrollo de síndromes de megaesófago y/o megacolon 3,5,6.
El tratamiento etiológico de la enfermedad de Chagas consiste en solo dos fármacos: benznidazol y nifurtimox. Estos agentes antiparasitarios están disponibles desde hace más de 50 años y tienen una toxicidad considerable y una eficacia limitada 5,7,8. En consecuencia, existe una necesidad apremiante de desarrollar tratamientos nuevos, seguros y más eficaces para los pacientes con enfermedad de Chagas.
Técnicas más sofisticadas y precisas permiten ahora obtener respuestas a viejas preguntas que permiten avanzar en la búsqueda de nuevos tratamientos para la enfermedad de Chagas. En este sentido, la comunidad científica se beneficia enormemente de los parásitos modificados genéticamente para estudios in vivo sobre el curso de la infección y evaluación de la eficacia de los fármacos 9,10,11,12. Un ensayo longitudinal basado en el sistema de imágenes de bioluminiscencia (BLI) permite evaluar la eficacia durante y después de la pauta de tratamiento, lo que lleva a la identificación de compuestos con actividad tripanocida10,13. El método BLI proporciona una medición directa de la carga parasitaria, tanto en circulación como en tejidos y órganos, a través de la cuantificación de la luz producida por el linaje11 modificado genéticamente de T. cruzi CL Brener Luc::Neon, que expresa constitutivamente la luciferasa 12 de luciérnagadesplazada al rojo.
Sin embargo, casi 10 años después del establecimiento del modelo animal BLI de la enfermedad de Chagas y de los estudios de eficacia de los fármacos, solo unos pocos grupos de investigación dominan esta técnica. Este hecho se debe no solo al reducido acceso a equipos de imagen adecuados, sino también a la falta de capacitación y disponibilidad de protocolos estructurados y detallados. Este método presenta varias ventajas frente a otros enfoques, que se basan en la evaluación de la parasitemia por microscopía, serología o evaluación de infecciones de órganos/tejidos por qPCR para la detección de ADN del parásito, ya que permite mejorar el bienestar de los ratones y reducir el uso de animales por la posibilidad de generar datos in vivo más robustos e integrados. Además, podría decirse que este método es más sensible, ya que permite la detección rápida de focos de parásitos en órganos viscerales después del tratamiento farmacológico 10,12. Por lo tanto, este protocolo tiene como objetivo orientar a los grupos de investigación en Parasitología y otras enfermedades infecciosas para establecer esta metodología en sus laboratorios detallando los procedimientos técnicos. Aquí, compartimos la experiencia obtenida a través de la implementación del modelo BLI de la enfermedad de Chagas en Brasil, el primero de su tipo en América Latina, como parte de los esfuerzos de descubrimiento de fármacos coordinados por la iniciativa Medicamentos para Enfermedades Desatendidas (DNDi).
La imagen de bioluminiscencia es un método innovador que permite la detección de un gen de informe utilizando un espectro visible e infrarrojo de radiación electromagnética. Por lo tanto, no hay necesidad de marcadores radiomarcados para rastrear su espécimen35. BLI es adecuado para modelos de roedores y otras especies pequeñas. Es muy útil para estudios preclínicos porque es más seguro y permite varias rondas de imagen, causando molestias mínimas en los animales. Además, la imagen in vivo es muy flexible debido a la posibilidad de combinar bioluminiscencia, fluorescencia y otras técnicas como la tomografía por emisión de positrones36.
Las imágenes ópticas se rigen por propiedades físicas ópticas, como la absorción y la dispersión. Todos los tejidos absorben y dispersan la luz de longitudes de onda distintas de manera diferente37. Un paso crítico es seleccionar un gen indicador sin tener en cuenta la longitud de onda emitida de la luz producida por la reacción química. Si bien el nivel de expresión de un gen reportero puede ser alto in vitro en los ensayos bioluminiscentes, es posible que no se logren los mismos niveles de expresión cuando se progresa al entorno in vivo. En este protocolo, utilizamos la versión optimizada para codones de Photinus pyralis luciferasa (PpyRE9H)38 desplazada al rojo para tripanosomátidos9, que emite luz a 617 nm, una de las más adecuadas para estudios in vivo 39. Las longitudes de onda superiores a 600 nm son menos absorbidas y dispersadas por los cromóforos endógenos del cuerpo, especialmente la hemoglobina y la melanina. Así, las luces rojas pueden ser transmitidas a través de varios centímetros de tejido, permitiendo que los fotones lleguen a la cámara CCD incluso desde el interior de los tejidos viscerales39,40.
Un área de preocupación en los entornos de imágenes es la falta de una comprensión completa de su función y efectos. El binning, una técnica de preprocesamiento, combina la información adquirida por detectores contiguos en un píxel más grande. Este proceso mejora la relación señal-ruido, reduciendo el ruido de fondo y mejorando la sensibilidad. Sin embargo, disminuye la precisión de la resolución espacial, lo que da como resultado una imagen pixelada41,42. Esta compensación es una consideración importante en su estrategia de imagen.
Basado en el Perfil de Producto Objetivo y el Perfil de Candidato Objetivo para la enfermedad de Chagas34, el estudio de prueba de concepto se centra en la sensibilidad para detectar T. cruzi y ayudar a establecer si un nuevo candidato a fármaco puede lograr una cura estéril (representada por la falta de recaída después de varias rondas de inmunosupresión). Por lo tanto, ejecutamos el BLI utilizando el factor de agrupamiento más alto sin sobresaturar la imagen. Cuando la imagen se sobresatura, se realiza una nueva adquisición utilizando un factor de agrupamiento más bajo. Durante el análisis, se aplica una corrección matemática a las imágenes que requirieron un binning diferente. De esta manera, los datos finales deben presentarse utilizando el mismo binning. En la Tabla 1 se muestran los diferentes valores obtenidos cuando se aplicaron factores de agrupación distintivos en la misma imagen y ROI.
Tabla 1: Influencia de la configuración de agrupación en la cuantificación de BLI. Cuantificación de tres ROIs en la imagen del modelo agudo (d13) y del modelo crónico (d118), analizados en diferentes factores de binning. Haga clic aquí para descargar esta tabla.
Debido al escenario actual de la enfermedad de Chagas en la clínica, los esfuerzos de descubrimiento de fármacos tienen como objetivo eliminar completamente los parásitos (cura parasitológica)27,34. Por lo tanto, el protocolo preclínico in vivo incluye enfoques que superan las limitaciones de la sensibilidad técnica de BLI. Uno de los enfoques es tratar a los ratones con ciclofosfamida para disminuir la respuesta inmunitaria que controla la carga parasitaria. Otra estrategia es disminuir la profundidad del tejido y eliminar las capas de músculo, piel y pelaje que obstruyen el camino de la luz hacia la cámara. A través del procedimiento ex vivo, se pueden detectar pequeñas manchas bioluminiscentes, revelando focos de parásitos por debajo del umbral BLI in vivo, como se muestra en la Figura 5C en el resultado ex vivo del ratón tratado por Posa.
El diseño de un experimento piloto para evaluar el modelo en sí y la dinámica de la infección es crucial para establecer un experimento preciso para la evaluación de la eficacia de los medicamentos antiparasitarios. Por lo tanto, el investigador podrá definir con anticipación la configuración adecuada de BLI y el curso del tiempo de infección. En un experimento exploratorio, una herramienta que puede ser útil para definir la configuración de adquisición es la ‘Autoexposición’. Con esta herramienta, el investigador establece la prioridad de tres configuraciones (Tiempo de exposición, Binning y F/Stop) para obtener la mejor imagen posible. En particular, el investigador debe asegurarse de que las imágenes se adquieran dentro del rango dinámico de la cámara CCD, sin sobresaturación ni subexposición, lo que se puede verificar a través de los límites mínimo y máximo de la escala y la función de exposición automática (Menú Editar > Preferencias > Adquisición de pestañas > Autoexposición de pestañas). En este protocolo, la apertura de la cámara se estableció en el valor máximo (F/Stop: 1), y se definieron diferentes tiempos de exposición y factores de agrupación para modelos agudos y crónicos. Estos ajustes dan previsibilidad al tiempo para realizar diferentes rondas de imágenes simultáneamente. Teniendo en cuenta que el método reportero se basa en una reacción enzimática, tanto la biodistribución del sustrato en el ratón como la cinética de la luciferasa influyen en la señal bioluminiscente y, por tanto, en la cuantificación de la infección (Figura 1B). En consecuencia, la adquisición de imágenes en diferentes momentos de la cinética enzimática introduce una variabilidad de datos que no se puede tener en cuenta ni corregir y afecta al cálculo del flujo total (fotones/segundo) o de la radiación (fotones/segundo/cm2/esteradiano). Además, la infección por T. cruzi muestra un posicionamiento espacial dinámico en ratones (diferentes áreas y tejidos, profundidad y carga parasitaria). Por lo tanto, establecer un valor de los recuentos a adquirir podría pasar por alto las fuentes de señal más débiles (bajo número de parásitos en un determinado punto más profundo del tejido) si la fuente de otra señal más fuerte cumple con los criterios de autoexposición definidos.
Una característica complicada del software Living Image es mostrar la imagen adquirida en una escala de color automática. No existe la opción de preajustar la escala para exhibir automáticamente una imagen adquirida completamente nueva de acuerdo con los valores de escala seleccionados (consulte el paso del protocolo 6.2). Esta situación obliga al investigador a cambiar manualmente las imágenes una por una a los valores máximo y mínimo elegidos. Como consecuencia, los usuarios sin experiencia y no bien entrenados no tienen la lectura adecuada durante la sesión de adquisición, y podrían inducir a error a los datos o perder información importante en ese momento. Para eso, el experimento piloto es beneficioso.
Una de las preguntas más comunes sobre el diseño del experimento de prueba de concepto es cómo elegir la duración del tratamiento y la dosis. En el caso de las nuevas entidades químicas, estos parámetros suelen definirse por la potencia y la selectividad del compuesto in vitro, en combinación con los datos generados por el metabolismo y la farmacocinética del fármaco (DMPK) y los estudios de tolerabilidad realizados antes de las pruebas de eficacia in vivo. En resumen, una vez identificados los compuestos capaces de matar selectivamente al parásito en el interior de las células, se realizan in vitro los primeros experimentos ADME (absorción, distribución, metabolismo y excreción) para estimar la solubilidad acuosa, la permeabilidad celular y la estabilidad metabólica de los compuestos, entre otros parámetros. Si los compuestos muestran un buen equilibrio de propiedades in vitro (generalmente definidas en los perfiles de candidatos objetivo), entonces estos candidatos progresan a estudios de farmacocinética (PK) in vivo en ratones sanos, que describen la exposición al compuesto en la sangre (y posiblemente también en los tejidos) y proporcionan una idea general de la tolerabilidad a diferentes niveles de dosis17. 34,43. Idealmente, el objetivo de la evaluación de la farmacocinética en la mayoría de las enfermedades infecciosas es determinar la viabilidad de alcanzar concentraciones plasmáticas libres (corregidas por la unión a proteínas plasmáticas) que estén por encima de las concentraciones EC50/EC90 44 -la concentración efectiva que mata o al menos inhibe el crecimiento del 50% o el 90% de los parásitos, respectivamente- durante un período de tiempo suficientemente largo. Si se logra una exposición suficiente a un cierto nivel de dosis, entonces este régimen se puede utilizar durante los estudios de eficacia utilizando el modelo BLI de Chagas. En el caso de los estudios de reposicionamiento de fármacos, se debe disponer de datos farmacocinéticos in vitro e in vivo. Un buen comienzo para el reperfilado de fármacos son las bases de datos químicas como PubChem45, que proporcionan datos reconocidos que se pueden convertir en ratones utilizando el escalado alométrico46 para estimar los regímenes de tratamiento seguros y no tóxicos que se van a probar. Sin embargo, no siempre es así. Los estudios de PK siguen siendo un campo pasado por alto en la ciencia académica, y pocas empresas farmacéuticas publican sus resultados de PK. La comunidad científica del descubrimiento de fármacos recomienda incluir la evaluación farmacocinética in vivo junto con los ensayos de eficacia de los fármacos (farmacodinamia)47. Por lo tanto, las imágenes preclínicas son compatibles con las mediciones de compuestos simultáneamente, y este enfoque asociado mejora la solidez de los datos.
Además, se controla la manipulación, el peso y las condiciones de salud de los ratones durante todo el experimento. Los signos de toxicidad y los efectos secundarios, como encorvamiento, temblores, pérdida del equilibrio, falta de voluntad para moverse, renuencia a comer o beber, postración o cualquier otra anomalía presente en el grupo o por condiciones individuales del ratón, deben registrarse e informarse en estudios preclínicos. Uno de los objetivos de las imágenes ópticas es garantizar el bienestar de los animales. Por lo tanto, los criterios de valoración humanitarios deben aplicarse en ratones con signos de dolor descritos en la escala ‘Grimace48. Además, los ratones se pesaron semanalmente durante la adquisición de BLI y, con mayor frecuencia, durante la dosificación del fármaco y el tratamiento con CTX. Siguiendo las normas de bienestar animal, los ratones que pierden más del 20% de su peso corporal deben ser sacrificados humanitariamente de inmediato.
El modelo bioluminiscente de T. cruzi es ahora el modelo experimental de última generación para el descubrimiento y desarrollo de nuevos tratamientos para la enfermedad de Chagas. Un modelo que replica las características clave de la infección por T. cruzi y la enfermedad de Chagas49, permitiendo el monitoreo en tiempo real de la parasitemia y la diferenciación de compuestos con variados perfiles de eficacia asociados a modos de acción conocidos. El BLI es una técnica que mejora la asertividad en la identificación de tejidos infectados. Permite la selección precisa de los tejidos infectados para ser utilizada en una amplia gama de enfoques, incluyendo todos los métodos clásicos ya aplicados en la investigación de T. cruzi 50,51. Además, permite a los investigadores explorar tecnologías de vanguardia y desarrollar otras nuevas33. Además, BLI proporciona una mejora del bienestar animal y un uso más racional de acuerdo con los principios de las 3R10,35, todo a la vez.
Varios grupos de investigación centrados en las enfermedades tropicales desatendidas se encuentran en países donde no se dispone de dispositivos de imagen in vivo. Para superar el escenario actual, nuevas redes internacionales como Global BioImaging y sus consorcios asociados promueven acciones para proporcionar acceso abierto a las instalaciones centrales de imagen y mejorar la formación del personal y de los científicos de imagen52,53. Estas iniciativas, junto con protocolos de usuario amigables como este, pueden proporcionar condiciones que democraticen las tecnologías de alta gama para todos los investigadores. La implementación de este método en el descubrimiento preclínico de fármacos ofreció una sólida lectura de eficacia y un valor predictivo de los resultados clínicos, facilitando el descubrimiento de fármacos para la enfermedad de Chagas.
The authors have nothing to disclose.
Los autores agradecen a Amanda Franscisco, John Kelly y Fanny Escudié por proporcionar capacitación y apoyo en BLI en ensayos de eficacia de medicamentos, John Kelly y Simone Calderano por proporcionar parásitos, y Gabriel Padilla por apoyar con los estudios en animales. A.C.S recibió una beca CAPES PSDE para formarse en la London School of Hygiene and Tropical Medicine (Reino Unido). Los autores también desean agradecer a la Plataforma de Citometría de Flujo e Investigación en Imágenes (FLUIR) del Centro de Investigación Científica de la Universidad de São Paulo (CEFAP-USP) por el apoyo técnico en el análisis de los equipos IVIS Spectrum, y al Laboratorio de Genética y Control Sanitario ICB-USP por los ensayos de posexperimentación para el control de calidad de ratones como libres de patógenos específicos. Este proyecto fue financiado por DNDi. DNDi agradece a sus donantes, públicos y privados, que han proporcionado fondos para todas las actividades de DNDi desde su creación en 2003. Una lista completa de los donantes de DNDi se puede encontrar en https://dndi.org/about/donors/.
BD LSRFortessa™ X-20 Cell Analyzer | BD Biosciences | ||
Weighing Balance (animal facility) | Available from several suppliers | ||
IVIS Spectrum In Vivo Imaging System | Revvity (former PerkinElmer) | ||
FlowJ Software v10.7.1 | BD Biosciences | ||
Living Image Software for Spectrum v4.7.1 | Revvity (former PerkinElmer) | License Free Analysis Software called 'Aura Imaging' could be used for the most basic features provided by Spectral Instruments Imaging (Bruker company) (https://spectralinvivo.com/software/) | |
Microsoft Office software | Microsoft | ||
GraphPad Prism v8.4.0 | GraphPad Software Inc. | ||
DMEM Low Glucose | Vitrocell | D0025 | |
Sodium bicarbonate | Sigma-Aldrich | S5761-500G | |
Foetal Bovine Serum (FBS) | Gibco | 16000-044 | |
Penicillin-Streptomycin | Gibco | 15140-122 | |
Trypsin 0.5% EDTA | Gibco | 25300-062 | |
LIT medium | In house | ||
Hygromycin B (50 mg/mL) | Gibco | 10687010 | |
Grace′s Insect Medium | Sigma-Aldrich | G9771 | |
HEPES | Sigma-Aldrich | 54457 | |
IVISBrite d-luciferin potassium salt | Revvity (former PerkinElmer) | 122799 | Also could be used: VivoGlo Luciferin, in vivo grade (Promega/P1043); D-Luciferin, Monopotassium Salt (Thermo Scientific/88293) or PierceD-Luciferin, Monosodium* Salt (Thermo Scientific/88291); D-Luciferin, Potassium Salt (GoldBio/LUCK or eLUCK); D-Luciferin, Sodium* Salt (GoldBio/LUCNA or eLUCNA) *Sodium or potassium salt differences relies minimal chances on solubility, however do not affect in vivo performance. |
DPBS | Gibco | 21600-044 | |
Cyclophosphamide (CTX) | Sigma-Aldrich | C0768-5g | |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D5879 | |
(Hydroxypropyl)methyl cellulose (HPMC) | Sigma-Aldrich | 09963-25G | |
Benzyl alcohol | Sigma-Aldrich | 402834 | |
Tween 80 | Sigma-Aldrich | P1754-1L | |
Benznidazole | ELEA | ||
Posaconazole (Noxafil commercial formulation) | Schering-Phough | ||
Giemsa | Available from several suppliers | ||
gavage needle (stainless-steel straight) – 22GA | Aton | CA2003 | |
1 mL Syringe and 31G needle | Available from several suppliers | ||
1 mL Syringe and removable 26G needle | Available from several suppliers | ||
1 mL Syringe and removable 24G X¾ needle | Available from several suppliers | ||
Sterile Syringe Filter 0.2 µm | Available from several suppliers | ||
A4 Matte Black paper 120gr or thicker | Paper Color/ Canson (Available from several suppliers) | ||
aluminum foil | Available from several suppliers | ||
Neubauer chamber | Available from several suppliers |