Summary

13Marquage C6-glucose associé à la LC-MS : identification des organes primaires des plantes dans la synthèse des métabolites secondaires

Published: March 22, 2024
doi:

Summary

La méthode développée de marquage 13C-6-Glucose combinée à la spectrométrie de masse haute résolution par chromatographie liquide est polyvalente et jette les bases d’études futures sur les organes primaires et les voies impliquées dans la synthèse des métabolites secondaires dans les plantes médicinales, ainsi que sur l’utilisation complète de ces métabolites secondaires.

Abstract

Cet article présente une méthode nouvelle et efficace pour certifier les organes primaires impliqués dans la synthèse des métabolites secondaires. En tant que métabolite secondaire le plus important chez Parispolyphylla var. yunnanensis (Franch.) Main. -Mzt. (PPY), la saponine de Paris (PS) a une variété d’activités pharmacologiques et le PPY est de plus en plus demandé. Cette étude a permis d’établir quatre traitements pour l’alimentation et la non-alimentation des feuilles, des rhizomes et des tiges du faisceau vasculaire 13C6-Glucose afin de certifier précisément les organes primaires impliqués dans la synthèse des saponines de Paris VII (PS VII). En combinant la chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS), les rapports 13C/12C de la feuille, du rhizome, de la tige et de la racine dans différents traitements ont été calculés rapidement et avec précision, et quatre types de rapports de pics d’ions isotopiques PS (M−) ont été trouvés : (M+1) /M, (M+2) /M, (M+3) /M et (M+4) /M. Les résultats ont montré que le rapport de 13C/12C dans les rhizomes des traitements d’alimentation par tige-faisceau vasculaire et rhizome était significativement plus élevé que celui des traitements sans alimentation. Par rapport au traitement non alimentaire, le rapport de molécules de PS VII (M+2) /M dans les feuilles a augmenté de manière significative sous les traitements d’alimentation des feuilles et des tiges. Simultanément, par rapport au traitement non alimentaire, le rapport des molécules de PS VII (M+2) /M dans les feuilles sous traitement au rhizome n’a montré aucune différence significative. De plus, le rapport des molécules de PS VII (M+2) /M dans la tige, la racine et le rhizome n’a montré aucune différence entre les quatre traitements. Par rapport au traitement non nourrissant, le rapport de la molécule de saponine II PARIS (PS II) (M+2) /M dans les feuilles sous traitement foliaire n’a montré aucune différence significative, et le rapport (M+3) /M des molécules de PS II dans les feuilles sous traitement foliaire était plus faible. Les données ont confirmé que l’organe primaire de synthèse du PS VII est les feuilles. Il jette les bases de l’identification future des organes primaires et des voies impliquées dans la synthèse des métabolites secondaires dans les plantes médicinales.

Introduction

Les voies de biosynthèse des métabolites secondaires chez les plantes sont complexes et diversifiées, impliquant des organes d’accumulation très spécifiques et diversifiés1. À l’heure actuelle, les sites de synthèse spécifiques et les organes responsables des métabolites secondaires dans de nombreuses plantes médicinales ne sont pas bien définis. Cette ambiguïté constitue un obstacle important à l’avancement stratégique et à la mise en œuvre de méthodes de culture conçues pour optimiser à la fois le rendement et la qualité des matériaux médicinaux.

La biologie moléculaire, la biochimie et les techniques de marquage isotopique sont largement utilisées pour démêler les voies de synthèse et les sites des métabolites secondaires dans les plantes médicinales 2,3,4,5, et chacune de ces méthodologies présente des forces et des limites uniques, telles que des différences d’efficacité et de précision. Les approches de biologie moléculaire, par exemple, offrent une grande précision pour localiser les sites dans les voies de biosynthèse, mais elles sont particulièrement chronophages. Leur utilité est encore limitée pour les espèces dépourvues de séquences génomiques accessibles au public, ce qui rend ces techniques moins viables dans de tels cas6. En revanche, les techniques de marquage isotopique, qui utilisent des rapports isotopiques tels que 3C/12C, 2H/1H et 18O/16O, constituent un moyen rapide et accessible d’étudier les mécanismes de synthèse, de transport et de stockage des métabolites secondaires 7,8. Ils peuvent révéler la distribution spatiale des composés organiques et des isotopes stables dans les feuilles, permettant ainsi de reconstituer les conditions environnementales vécues par les feuilles tout au long de leur cycle de vie9. De plus, l’application de marqueurs isotopiques externes, tels que le 13C6-Glucose 10 et le 13C 6-Phénylalanine11, permet la génération de métabolites secondaires marqués au carbone, améliorant ainsi notre compréhension de leur production et de leur fonction.

Les techniques traditionnelles de marquage des isotopes du carbone rencontrent des difficultés pour identifier les organes spécifiques responsables de la synthèse des métabolites secondaires en raison de la nature très spécifique à l’espèce de leurs voies de biosynthèse et de leurs mécanismes de transport. La chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS) s’est imposée comme un instrument analytique essentiel dans ce domaine, offrant une méthode robuste pour le suivi des isotopes exogènes dans la synthèse chimique des médicaments et l’étude des processus in vivo tels que l’absorption, la distribution, le métabolisme et l’excrétion12. La sensibilité, la simplicité et la fiabilité supérieures de la LC-MS en font un choix idéal pour surveiller la production de métabolites secondaires dans les plantes13. Ces derniers temps, la LC-MS est devenue de plus en plus privilégiée pour son application dans les techniques de marquage isotopique externe, ce qui permet d’évaluer l’efficacité du marquage sur différents échantillons. Cette méthodologie fournit des informations essentielles sur les organes primaires impliqués dans la synthèse des métabolites secondaires dans les plantes médicinales, servant de complément inestimable aux méthodes biologiques pour identifier les organes de synthèse de ces composés14,15. Par conséquent, cette approche facilite non seulement la comparaison de l’efficacité du marquage entre divers spécimens, mais met également en lumière les organes clés impliqués dans la génération de métabolites secondaires des plantes, améliorant ainsi notre compréhension de leur biosynthèse.

Nous avons introduit une nouvelle méthode qui combine le marquage isotopique du carbone avec la détection LC-MS pour identifier les organes primaires responsables de la synthèse des métabolites secondaires dans les plantes médicinales. La saponine de Paris (PS) a une variété d’activités pharmacologiques telles que l’anticancéreux, l’immunomodulation et l’anti-inflammation16, et le PPY est en demande croissante17. Par conséquent, nous avons utilisé des plantules de PPY comme sujets de recherche et avons décrypté que les feuilles sont le principal organe de synthèse de la saponine de Paris VII (PS VII) (Figure 1B) en utilisant le marquage 13C6-Glucose associé à la méthode LC-MS. Notre approche comprenait quatre traitements différents impliquant l’alimentation en 13C-6-glucose des faisceaux vasculaires des feuilles, des rhizomes et de la tige, ainsi qu’un contrôle non alimentaire. Le choix du 13C6-glucose est stratégique, car il est rapidement métabolisé en acétyl coenzyme A par la respiration, ce qui facilite ensuite la synthèse du PS. En utilisant l’abondance naturelle de 13°C, nous avons utilisé un système de spectrométrie de masse par chromatographie en phase gazeuse et rapport d’isotopes stables (GC-IRMS) pour évaluer les rapports 13C/12C dans divers organes de la plante et pour analyser les rapports isotopiques des pics d’ions dans les molécules PS VII et Paris saponines II (PS II) (figure 1B). Notre méthodologie, qui s’appuie sur 13précurseurs de métabolites secondaires végétaux marqués au carbone et sur des techniques de spectrométrie de masse de pointe, offre une alternative plus simple et plus précise aux méthodes conventionnelles de marquage des isotopes du carbone. Cette nouvelle approche permet non seulement d’approfondir notre compréhension des organes impliqués dans la synthèse des métabolites secondaires chez les plantes médicinales, mais aussi de jeter des bases solides pour de futures explorations des voies de biosynthèse de ces composés.

Protocol

1. Préparation expérimentale Assurez-vous que pendant la croissance des plantes, l’humidité relative de la serre est de 75%, les températures jour/nuit sont de 20 °C/10 °C, la photopériode est composée de 12 h de jour et 12 h de nuit, et l’intensité lumineuse est de 100 μmol·m-2·s-1. Fournir une irradiation à l’aide de lampes à diodes électroluminescentes (DEL), en gardant une distance de 30 cm entre la lampe à DEL et le couvert végétal.REMARQUE…

Representative Results

Pour confirmer que l’apport en13-C6-glucose dans les rhizomes était efficace, nous avons analysé plus en détail les rapports isotopiques 13C/12C dans les rhizomes. Les rapports isotopiques 13C/12C des traitements 3 et 4 étaient beaucoup plus élevés que ceux du traitement 2 (figure 1A). Les résultats ont indiqué que le 13-C-6-glucose des traitements 3 et 4 a pénétré dans les rhizomes par ingestion.<…

Discussion

La mise en œuvre réussie de ce protocole dépend de recherches approfondies sur les propriétés physiologiques des plantes, les tissus, les organes et les métabolites secondaires. L’approche de conception expérimentale décrite dans le protocole pose une base solide pour l’étude des voies de biosynthèse des métabolites secondaires des plantes. Les facteurs critiques de cette expérience sont (1) la détermination de l’âge des semis de plantes vivaces et (2) le choix du bon moment pour le marquage et la dé…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Ce travail a été financé par le programme de la jeunesse de la Fondation nationale des sciences naturelles de Chine (n° 82304670).

Materials

0.1 % Formic acid water Chengdu Kelong Chemical Reagent Factory 44890
13C6-Glucose powder MERCK 110187-42-3
Acetonitrile Chengdu Kelong Chemical Reagent Factory 44890
AUTOSAMPLER VIALS Biosharp Biotechnology Company 44866
BEH C18 column Waters,Milfor,MA 1.7μm,2.1*100 mm
CNC ultrasonic cleaner Kunshan Ultrasound Instrument Co., Ltd KQ-600DE
Compound DiscovererTM  software Thermo Scientific, Fremont,CA 3
Compound DiscovererTM  software  Thermo Scientific,Fremont,CA 3
Electric constant temperature blast drying oven DHG-9146A
Electronic analytical balance Sedolis Scientific Instruments Beijing Co., Ltd SOP
Ethanol  Chengdu Kelong Chemical Reagent Factory 44955
Fully automatic sample rapid grinder Shanghai Jingxin Technology Tissuelyser-48
Gas Chromatography-Stable Isotope Ratio Mass Spectrometer Thermo Fisher Delta V Advantage
Hoagland solution Sigma-Aldrich H2295-1L
Hydroponic tank JRD 1020421
Isodat software Thermo Fisher Scientific 3
Liquid chromatography high-resolution mass spectrometry Agilent Technology  Agilent 1260 -6120 
Nitrogen manufacturing instrument PEAK SCIENTIFIC Genius SQ 24
Organic phase filter Tianjin Jinteng Experimental Equipment Co., Ltd 44890
Oxygen pump Magic Dragon MFL
Quantum sensor Highpoint UPRtek
Scalpel Handskit 11-23
Sprinkling can CHUSHI WJ-001
Xcalibur  software Thermo Fisher Scientific 4.2

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Chen, S., Chang, F., Lin, L., Wang, Y., Wen, F., Zhou, T., Pei, J. 13C6-Glucose Labeling Associated with LC-MS: Identification of Plant Primary Organs in Secondary Metabolite Synthesis. J. Vis. Exp. (205), e66578, doi:10.3791/66578 (2024).

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