Summary

Charakterisierung von Modulatoren von Protease-aktivierten Rezeptoren mit einem Calciummobilisierungsassay unter Verwendung eines Plattenreaders

Published: May 24, 2024
doi:

Summary

Es wurde ein verbessertes Protokoll für einen Kalziummobilisierungsassay mit Endothelzellen entwickelt, der zur Identifizierung von Liganden von Protease-aktivierten Rezeptoren (PARs) verwendet wird. Das neue Protokoll reduziert die Gesamttestzeit um 90-120 Minuten und liefert reproduzierbare Konzentrations-Wirkungs-Kurven.

Abstract

Veränderungen der Kalziumkonzentration in Zellen werden mit Hilfe von intrazellulären, fluoreszierenden, kalziumbindenden Farbstoffen und bildgebenden Instrumenten, die Fluoreszenzemissionen von bis zu 1.536 Wells gleichzeitig messen können, schnell und im Hochdurchsatz überwacht. Diese Instrumente sind jedoch viel teurer und können im Vergleich zu weit verbreiteten Plattenlesegeräten, die die Wells einzeln scannen, eine Herausforderung in der Wartung darstellen. Hier wird ein optimierter Platten-Reader-Assay für die Verwendung mit einer Endothelzelllinie (EA.hy926) beschrieben, um die Protease-aktivierte Rezeptor (PAR)-getriebene Aktivierung desG-αq-Signalwegs und die anschließende Kalziummobilisierung unter Verwendung des Kalzium-bindenden Farbstoffs Fluo-4 zu messen. Dieser Assay wurde zur Charakterisierung einer Reihe von PAR-Liganden verwendet, einschließlich der allosterischen, auf PAR1 abzielenden entzündungshemmenden “Parmodulin”-Liganden, die im Dockendorff-Labor identifiziert wurden. Dieses Protokoll macht einen automatisierten Liquid Handler überflüssig und ermöglicht das Screening von PAR-Liganden bei mittlerem Durchsatz in 96-Well-Platten und sollte für die Untersuchung anderer Rezeptoren anwendbar sein, die die Kalziummobilisierung initiieren.

Introduction

Protease-aktivierte Rezeptoren (PARs)1,2,3 sind eine Unterfamilie der G-Protein-gekoppelten Rezeptoren (GPCRs) der Klasse A, die in einer Vielzahl von Zelltypen exprimiert werden, einschließlich Blutplättchen und Endothelzellen 4,5,6,7. Im Gegensatz zu den meisten GPCRs haben PARs einen einzigartigen intramolekularen Aktivierungsmodus. Die meisten GPCRs werden durch lösliche Liganden aktiviert, die mit einer ausgeprägten Bindungstasche interagieren, aber PARs werden durch die proteolytische Spaltung des N-Terminus aktiviert, was zu einem neuen angebundenen Liganden führt, der mit der extrazellulären Schleifen-2-Domäne auf der Oberfläche einer Zelle interagieren kann 6,8,9. Diese Interaktion aktiviert den Rezeptor und kann mehrere Signalwege initiieren, die Effekte wie Entzündungen und Thrombozytenaktivierung fördern 4,10,11,12. Verschiedene Proteasen können PARs durch Spaltung an einzigartigen Stellen am N-Terminus aktivieren, wodurch unterschiedliche angebundene Liganden (TL) sichtbar werden, die Rezeptorkonformationen stabilisieren, die unterschiedliche Signalwege initiieren 9,13,14,15. Zum Beispiel wird bei dem am besten untersuchten Mitglied der Unterfamilie, PAR1, die Spaltung durch Thrombin verwendet, um zahlreiche biologische Prozesse zu unterstützen, einschließlich der Thrombozytenaktivierung und der Leukozytenrekrutierung in das Endothel, kann aber zu schädlichen Effekten führen, wenn der Rezeptor überexprimiert oder überaktiviert wird 4,16,17,18,19,20,21 . Umgekehrt kann die Spaltung durch aktiviertes Protein C (aPC) die entzündungshemmende Wirkung und die Aufrechterhaltung der Endothelbarrieren fördern 15,22,23,24,25,26,27,28,29. PARs können auch durch Peptidanaloga der TLs intermolekular aktiviert werden 13,30,31. Diese Peptide werden routinemäßig zur Messung der PAR-Hemmung (Modulation) anstelle von PAR-Targeting-Proteasen verwendet, und sie werden in diesem Protokoll verwendet.

Zahlreiche Erkrankungen sind mit pathologischer PAR1-Signalgebung verbunden, darunter Sepsis22,32, Herz-Kreislauf-Erkrankungen 33,34,35,36,37,38, Nierenerkrankungen 39,40,41,42, Sichelzellanämie 43, Fibrose44, Osteoporose und Osteoarthritis45,46, Neurodegeneration 47,48,49,50,51 und Krebs 52,53,54,55,56,57,58,59. Antagonisten von PAR1 werden seit den 1990er Jahren als Thrombozytenaggregationshemmer für Herz-Kreislauf-Erkrankungen untersucht, und die wachsende Liste von Krankheiten, die mit dem Rezeptor in Verbindung gebracht werden, erfordert die Identifizierung neuartiger Liganden für den Einsatz als biologische Sonden (Werkzeugverbindungen) oder als potenzielle Therapeutika. Derzeit gibt es nur einen von der FDA zugelassenen PAR1-Antagonisten, Vorapaxar, der zur Behandlung der koronaren Herzkrankheit bei Hochrisikopatienten eingesetzt wird 34,36,37,60. Ein alternativer PAR1-Antagonist, das Pepducin PZ-128, schloss eine erfolgreiche Phase-II-Studie zur Thromboseprävention bei Herzkatheterpatienten ab38. Die Arbeitsgruppe Dockendorff hat sich auf die medizinische Chemie und Pharmakologie einer separaten Klasse von kleinen Molekülen, den PAR1-Liganden, den Parmodulinen61,62, konzentriert. Im Gegensatz zu berichteten PAR1-Antagonisten wie Vorapaxar sind Parmoduline allosterische, verzerrte Modulatoren von PAR1, die selektiv denG-αq-Signalweg blockieren und gleichzeitig zytoprotektive Effekte ähnlich wie aPC fördern. Im Gegensatz zu potenten orthosterischen PAR1-Antagonisten wie Vorapaxar sind publizierte Parmoduline auch reversibel 63,64,65.

Zunächst wurden Parmoduline von Flaumenhaft und Mitarbeitern hinsichtlich ihrer Fähigkeit identifiziert, die P-Selektin-Expression oder die Granulsekretion in Blutplättchen zu hemmen61,66. Es war jedoch eine alternative Methode erforderlich, um die Auswirkungen von Parmodulinen auf Endothelzellen zu untersuchen. Eine gängige Methode zur Überwachung der GPCR-bezogenen Signalübertragung ist die Messung der intrazellulären Ca2+-Mobilisierung, eines wichtigen sekundären Botenstoffs, der mit einem geeigneten intrazellulären Kalziumbindungsfarbstoff gemessen werden kann67,68. Es wurden substanzielle Beweise dafür vorgelegt, dass die durch PAR1 induzierte Calciummobilisierung durch die Aktivierung von Gαq 69,70 erfolgt. Sobald PAR1 durch seinen angebundenen Liganden (oder einen geeigneten exogenen Liganden) aktiviert wird, erfährt es eine Konformationsänderung, die dazu führt, dass Guanosindiphosphat (GDP), das an die Gαq-Untereinheit gebunden ist, durch Guanosintriphosphat (GTP) ersetzt wird68. Die Gαq-Untereinheit aktiviert dann die Phospholipase Cβ (PLC-β), die die Hydrolyse von Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphat (PIP2) katalysiert und 1,4,5-Inositoltriphosphat (IP3) und Diacylglycerin (DAG) bildet. Schließlich bindet IP3 an IP3-empfindliche Ca2+-Kanäle in der Membran des endoplasmatischen Retikulums, wodurch Ca2+ in das Zytoplasma freigesetzt werden kann, wo es anCa2+-abhängige Fluoreszenzfarbstoffe wie Fluo-4 binden kann, die den Zellen zugesetzt werden71. Dieser Prozess findet innerhalb von Sekunden statt und kann die Konzentration von Ca2+ um das 100-fache erhöhen, was zu einer drastischen Veränderung der Menge an calciumgebundenem Farbstoff und einem robusten Fluoreszenzsignal führt.

Im Jahr 2018 stellte die Dockendorff-Gruppe einen Ca2+ -Mobilisierungsassay mit mittlerem Durchsatz vor, der zur Identifizierung von Antagonisten desG-αq-Signalwegs von PAR172 verwendet werden konnte. Der Assay verwendete EA.hy92673, eine hybride humane Endothelzelllinie, die für mehrere Passagen ohne merkliche Veränderung der PAR1-Expression verwendet werden kann und für In-vitro-Messungen zytoprotektiver Wirkungen etabliert ist.

Das ursprüngliche Protokoll verwendete EA.hy926-Zellen in 96-Well-Platten, die mit Fluo-4/AM-Farbstoff beladen waren, der aufgrund seiner intensiven Fluoreszenz bei 488 nm und seiner hohen Zellpermeabilität ausgewählt wurde. Nachdem der Farbstoff in die Zellen geladen war, wurden langwierige Waschschritte mit einem automatisierten 8-Kanal-Liquid-Handler durchgeführt (schnellere Methoden des Liquid Handlings, wie z. B. ein 96-Kanal-Wascher, waren nicht zugänglich). Die Reproduzierbarkeit dieses Assays war besser als die ohne den sorgfältigen, automatisierten robotischen Medienwechsel. Antagonisten wurden dann mit den Zellen inkubiert, PAR1 wurde durch die sequentielle Zugabe eines selektiven Agonisten (jeweils 16 Wells) aktiviert, und Veränderungen der Fluoreszenz infolge der Kalziummobilisierung und Farbstoffbindung wurden gemessen, um die Aktivität zu bestimmen.

Dieses Protokoll ermöglicht zwar die Messung der PAR1-vermittelten Kalziummobilisierung, ist jedoch durch die Zeit begrenzt, die für den Assay jeder 96-Well-Platte erforderlich ist. Lange Experimentierzeiten sind nicht nur deshalb problematisch, weil die Anzahl der Verbindungen, die täglich gescreent werden können, begrenzt ist, sondern auch, weil der Farbstoffausfluss im Laufe der Zeit auftritt und das Assay-Fenster durch Erhöhung der basalen Fluoreszenz verengt. Ein Beitrag zur langen Versuchszeit ist die Verwendung eines 8-Kanal-Liquid-Handlers für die Plattenreinigung, der jedes Experiment um mehr als 30 Minuten verlängert. Die erforderlichen Trinkgelder wurden auch aufgrund von Problemen in der Lieferkette schwierig. Hier wird über ein aktualisiertes Protokoll für den PAR-vermittelten Calciummobilisierungsassay berichtet, der keinen Liquid Handler benötigt und daher mit höherem Durchsatz ausgeführt werden kann. Dieses Protokoll sollte auch für die Messung der Signalübertragung mit anderen GPCRs geeignet sein, die zu einer intrazellulären Kalziummobilisierung führen. Dieses aktualisierte Plattenleseprotokoll ist ideal für akademische und kleine industrielle Labore, die nicht über die Ressourcen für teure Zellbildgebungsinstrumente verfügen, aber zahlreiche Verbindungen schnell screenen müssen. Ein Beispiel für einen Calciummobilisierungsassay mit einem Plate Imager finden Sie unter Caers et al.74.

Protocol

Alle in den Schritten 1 und 2 des folgenden Protokolls vorgenommenen Medienaustausche/-ergänzungen werden in einer sterilen Haube durchgeführt. Sofern nicht anders angegeben, müssen alle Kunststoffe, die in der sterilen Haube verwendet werden, sterilisiert und versiegelt gekauft oder ordnungsgemäß im Autoklaven sterilisiert werden. 1. Initiierung der EA.hy926-Zelllinie Erwerben Sie EA.hy926-Zellen. Lagern Sie Fläschch…

Representative Results

Der Zweck dieses Assays besteht im Allgemeinen darin, Konzentrations-Wirkungs-Kurven (CRCs) für drei bis vier neue Parmoduline zu erstellen. Auf jeder Assay-Platte wird oft ein zusätzlicher CRC für eine bekannte Verbindung, wie z.B. NRD-21, erzeugt, der aufgrund seines bekannten IC50 als Qualitätscheck für das Experiment dient. Zur Generierung von CRCs sollte eine Plattenkarte, wie sie in Tabelle 1 dargestellt ist, geplant werden. Wenn stattdessen Einzelp…

Discussion

Während das zuvor berichtete Protokoll72 im Allgemeinen zuverlässig war und es uns ermöglichte, ein neues Leitparmodulin zu identifizieren, war NRD-21,62 ein effizienteres Protokoll gewünscht. Der Assay wurde während der durch die COVID-19-Pandemie verursachten Lieferengpässe weiter beeinträchtigt. Die Beschaffung von Spitzen für den automatisierten Liquid Handler wurde schwierig, und der Versuch, die Spitzen zu waschen, zu sterilis…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Wir danken Irene Hernandez, Trudy Holyst, Dr. Hartmut Weiler (Versiti Blood Research Institute) und Dr. Leggy Arnold (University of Wisconsin-Milwaukee) für die Bereitstellung von Raum und indirekter Unterstützung dieses Projekts sowie Dr. John McCorvy (Medical College of Wisconsin) für sachdienliche Beratung. Wir danken dem National Heart, Lung, and Blood Institute (R15HL127636), dem U.S. Department of Defense (W81XWH22101) und der National Science Foundation (2223225) für die Unterstützung durch die Zuschüsse.

Materials

Cell Culture Reagents
Adherent EA.hy926 cells ATCC CRL-2922
CellStripper cell dissociation reagent Corning 25-056-CI Trypsin can optionally be used, but should definitely be avoided with PAR2 assays.
Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) w/phenol red Corning 10-013-CV
Fetal Bovine Serum (FBS) Avantor 97068-091
Gelatin from porcine skin MilliporeSigma G2500 Use to make an aqueous 0.4% (w/v) solution with deionized water. Autoclave before use to sterilize.
Pen/Strep (100X) Corning 30-002-CI
Phosphate-buffered saline (PBS) Corning 21-040-CV
Trypan Blue (0.4% w/v) Corning 25-900-CI
Calcium Mobilization Reagents
4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid (HEPES) Thermo 172571000
Bovine serum albumin (BSA) Avantor 97061-420
Calcium chloride dihydrate Thermo 42352-0250
Dimethyl sulfoxide Thermo J66650-AD
Fluo-4/AM Invitrogen F14201
Hank's balanced salt solution (Ca/Mg/phenol-red free) Corning 21-022-CV
Magnesium chloride hexahydrate MilliporeSigma M2393
Pluronic F-127 (Poloxamer 407) Spectrum Chemical P1166
Probenecid TCI America P1975
Sodium hydroxide VWR International BDH9292
TFLLRN-NH2 (TFA salt) Prepared by Trudy Holyst at the Versiti Blood Research Institute
Materials
96-well culture-treated, black-walled, clear bottom assay plate Corning 3603 with transparent lids
Centrifuge tube, 15 mL Avantor 89039-664
Centrifuge tube, 50 mL Avantor 89039-656
Culture flask, T-75 Corning 353136 tissue culture treated
Disposable reagent reservoir, 50 mL Corning RES-V-50-S
Enspire plate reader Perkin Elmer Discontinued
Microcentrifuge tube, 1.5 mL Avantor 20170-038
Pasteur pipette, 9" Fisher 13-678-6B must be sterilized
PCR tube strip with separate flat cap strips Avantor 76318-802
Pipette tips, 20 µL Biotix 63300042 sterile, filtered tips
Pipette tips, 200 µL Biotix 63300044 sterile, filtered tips
Pipette tips, 1250 µL Biotix 63300047 sterile, filtered tips
Prism GraphPad volume 6 used
Serological pipette, 5 mL Tradewinds Direct  07-5005
Serological pipette, 10 mL Tradewinds Direct  07-5010
Serological pipette, 25 mL Tradewinds Direct  07-5025

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DeRousse, J. T., Dockendorff, C. Characterizing Modulators of Protease-Activated Receptors with a Calcium Mobilization Assay Using a Plate Reader. J. Vis. Exp. (207), e66507, doi:10.3791/66507 (2024).

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