Het huidige protocol beschrijft infectietests om de therapietrouw, invasie en intracellulaire replicatie van Shigella te ondervragen met behulp van in vitro epitheelcellijnen.
De aan de mens aangepaste darmbacteriële ziekteverwekker Shigella veroorzaakt miljoenen infecties per jaar, creëert langdurige groei-effecten bij pediatrische patiënten en is wereldwijd een belangrijke oorzaak van sterfgevallen door diarree. Infectie veroorzaakt waterige of bloederige diarree als gevolg van de ziekteverwekker die het maagdarmkanaal passeert en de epitheelcellen langs de dikke darm infecteert. Met een duizelingwekkende toename van antibioticaresistentie en het huidige gebrek aan goedgekeurde vaccins, zijn gestandaardiseerde onderzoeksprotocollen van cruciaal belang voor het bestuderen van deze formidabele ziekteverwekker. Hier worden methodologieën gepresenteerd om de moleculaire pathogenese van Shigella te onderzoeken met behulp van in vitro analyses van bacteriële adherentie, invasie en intracellulaire replicatie in epitheelcellen van de dikke darm. Voorafgaand aan infectieanalyses werd het virulentiefenotype van Shigella-kolonies geverifieerd door de opname van de Congorode kleurstof op agarplaten. Aangevuld laboratoriummedium kan ook worden overwogen tijdens het kweken van bacteriën om in vivo omstandigheden na te bootsen. Bacteriële cellen worden vervolgens gebruikt in een gestandaardiseerd protocol om darmepitheelcellen in weefselkweekplaten te infecteren bij een vastgestelde multipliciteit van infectie met aanpassingen om elk stadium van infectie te analyseren. Voor hechtingstesten worden Shigella-cellen geïncubeerd met verlaagde medianiveaus om bacterieel contact met epitheelcellen te bevorderen. Voor zowel invasie- als intracellulaire replicatietests wordt gentamicine gedurende verschillende tijdsintervallen toegepast om extracellulaire bacteriën te elimineren en de beoordeling van invasie en/of de kwantificering van intracellulaire replicatiesnelheden mogelijk te maken. Alle infectieprotocollen sommen aanhangende, binnengedrongen en/of intracellulaire bacteriën op door geïnfecteerde epitheelcellysaten serieel te verdunnen en bacteriële kolonievormende eenheden te plateren ten opzichte van infecterende titers op Congo-rode agarplaten. Samen maken deze protocollen onafhankelijke karakterisering en vergelijkingen mogelijk voor elk stadium van Shigella-infectie van epitheelcellen om deze ziekteverwekker met succes te bestuderen.
Diarreeziekten veroorzaakt door darmbacteriële pathogenen vormen een aanzienlijke wereldwijde gezondheidslast. In 2016 waren diarreeziekten verantwoordelijk voor 1,3 miljoen sterfgevallen wereldwijd en waren ze de vierde belangrijkste doodsoorzaak bij kinderen jonger dan vijf jaar 1,2 jaar. De Gram-negatieve, enterische bacteriële ziekteverwekker Shigella is de veroorzaker van shigellose, een belangrijke oorzaak van sterfgevallen door diarreewereldwijd3. Shigellose veroorzaakt elk jaar aanzienlijke morbiditeit en mortaliteit bij kinderen uit lage- en middeninkomenslanden 4,5, terwijl infecties in landen met een hoog inkomen verband houden met uitbraken van kinderdagverblijven, door voedsel overgedragen en door water overgedragen uitbraken 6,7,8,9. Ineffectieve vaccinontwikkeling10 en stijgende percentages antimicrobiële resistentie (AMR)11,12 hebben het beheer van grootschalige Shigella-uitbraken bemoeilijkt. Uit recente gegevens van de Centers for Disease Control and Prevention blijkt dat bijna 46% van de Shigella-infecties in de Verenigde Staten in 2020 resistentie tegen geneesmiddelen vertoonde13,14, terwijl de Wereldgezondheidsorganisatie Shigella heeft uitgeroepen tot een prioritaire AMR-ziekteverwekker waarvoor dringend nieuwe therapieën nodig zijn15.
Shigella-infecties worden gemakkelijk overgedragen via de fecaal-orale route bij inname van besmet voedsel of water, of door direct menselijk contact. Shigella is geëvolueerd tot een efficiënte, aan de mens aangepaste ziekteverwekker, met een infectieuze dosis van 10-100 bacteriën die voldoende zijn om ziekte te veroorzaken16. Tijdens de overgang van de dunne darm wordt Shigella blootgesteld aan omgevingssignalen, zoals verhoogde temperatuur en gal17. Detectie van deze signalen induceert transcriptionele veranderingen om virulentiefactoren tot expressie te brengen die het vermogen van de bacteriën om de menselijke dikke darm te infecteren verbeteren 17,18,19. Shigella dringt het epitheel van de dikke darm niet binnen vanaf het apicale oppervlak, maar passeert eerder door de epitheellaag na opname in gespecialiseerde antigeenpresenterende microvouwcellen (M-cellen) in het follikel-geassocieerde epitheel 20,21,22. Na transcytose worden Shigella-cellen gefagocyteerd door residente macrofagen. Shigella ontsnapt snel aan het fagosoom en veroorzaakt de celdood van macrofagen, wat resulteert in het vrijkomen van pro-inflammatoire cytokines 5,23,24. Shigella dringt vervolgens de epitheelcellen van de dikke darm binnen vanaf de basolaterale zijde, lyseert de macropinocytaire vacuole en vestigt een replicatieve niche in het cytoplasma 5,25. Pro-inflammatoire cytokines, met name interleukine-8 (IL-8), rekruteren polymorfonucleaire neutrofiele leukocyten (PMN’s) naar de plaats van infectie, wat de epitheliale tight junctions verzwakt en bacteriële infiltratie van de epitheelbekleding mogelijk maakt om de basolateraleinfectie te verergeren. De PMN’s vernietigen het geïnfecteerde epitheelslijmvlies om de infectie in te dammen, wat resulteert in de karakteristieke symptomen van bacillaire (bloederige)dysenterie. Hoewel invasie- en intracellulaire replicatiemechanismen grondig zijn gekarakteriseerd, toont nieuw onderzoek belangrijke nieuwe concepten aan bij Shigella-infectie, waaronder virulentieregulatie tijdens gastro-intestinale (GI) transit17, therapietrouw19, verbeterde basolaterale toegang door barrièrepermeabiliteit26 en asymptomatisch dragerschap bij ondervoede kinderen27.
Het vermogen van Shigella spp. om diarree te veroorzaken is beperkt tot mensen en niet-menselijke primaten (NHP)28. Shigella darminfectiemodellen zijn ontwikkeld voor zebravissen29, muizen30, cavia’s31, konijnen 21,32,33 en varkens34,35. Geen van deze modelsystemen kan echter nauwkeurig de ziektekenmerken repliceren die worden waargenomen tijdens menselijke infectie36. Hoewel NHP-modellen van shigellose zijn opgesteld om de pathogenese van Shigella te bestuderen, zijn deze modelsystemen duur om te implementeren en vereisen ze kunstmatig hoge infectieuze doses, tot negen ordes van grootte hoger dan de infectieuze dosis van mensen 37,38,39,40,41,42. De opmerkelijke aanpassing van Shigella voor infectie van menselijke gastheren vereist dus het gebruik van van mensen afgeleide celculturen om fysiologisch relevante modellen na te bootsen voor nauwkeurige ondervraging van de pathogenese van Shigella.
Hier worden gedetailleerde procedures beschreven om de mate van Shigella-therapietrouw , invasie van en replicatie in HT-29 colonepitheelcellen te meten. Met behulp van deze gestandaardiseerde protocollen kunnen de moleculaire mechanismen waarmee bacteriële virulentiegenen en omgevingssignalen elke stap van Shigella-infectie beïnvloeden, worden ondervraagd om de dynamische interactierelatie tussen gastheer en ziekteverwekker beter te begrijpen.
Dit protocol beschrijft een reeks van drie gestandaardiseerde assays om Shigella-adhesie, invasie en intracellulaire replicatie van darmepitheelcellen te bestuderen. Hoewel deze methoden slechts aangepaste versies zijn van klassieke gentamicine-assays die worden gebruikt om de invasie en intracellulaire replicatie van verschillende bacteriële pathogenen in gastheercellen te bestuderen 49,50,51, moeten speciale overwegingen worden toegepast bij het bestuderen van<sup class="xre…
The authors have nothing to disclose.
Ondersteuning voor de auteurs omvat de afdeling Kindergeneeskunde van het Massachusetts General Hospital, de Executive Committee on Research Interim Support Funding (ISF)-prijs 2022A009041, de subsidie van het National Institute of Allergy and Infectious Diseases R21AI146405 en de National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases-subsidie Nutrition Obesity Research Center in Harvard (NORCH) 2P30DK040561-26. De financiers hadden geen rol in de opzet van het onderzoek, het verzamelen en analyseren van gegevens, de beslissing om te publiceren of de voorbereiding van het manuscript.
0.22 μm PES filter | Millipore-Sigma | SCGP00525 | Sterile, polyethersulfone filter for sterilizing up to 50 mL media |
14 mL culture tubes | Corning | 352059 | 17 mm x 100 mm polypropylene test tubes with cap |
50 mL conical tubes | Corning | 430829 | 50 mL clear polypropylene conical bottom centrifuge tubes with leak-proof cap |
6-well tissue culture plates | Corning | 3516 | Plates are treated for optimal cell attachment |
Bile salts | Sigma-Aldrich | B8756 | 1:1 ratio of cholate to deoxycholate |
Congo red dye | Sigma-Aldrich | C6277 | A benzidine-based anionic diazo dye, >85% purity |
Countess cell counting chamber slide | Invitrogen | C10283 | To be used with the Countess Automated Cell Counter |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D8418 | A a highly polar organic reagent |
Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco | 10569-010 | DMEM is supplemented with high glucose, sodium pyruvate, GlutaMAX, and Phenol Red |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Sigma-Aldrich | F4135 | Heat-inactivated, sterile |
Gentamicin | Sigma-Aldrich | G3632 | Stock concentration is 50 mg/mL |
HT-29 cell line | ATCC | HTB-38 | Adenocarcinoma cell line; colorectal in origin |
Paraffin film | Bemis | PM999 | Laboratory sealing film |
Petri dishes | Thermo Fisher Scientific | FB0875713 | 100 mm x 15 mm Petri dishes for solid media |
Phosphate-buffered saline (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 10010049 | 1x concentration; pH 7.4 |
Select agar | Invitrogen | 30391023 | A mixture of polysaccharides extracted from red seaweed cell walls to make bacterial plating media |
T75 flasks | Corning | 430641U | Tissue culture flasks |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | A common non-ionic surfactant and emulsifier |
Trypan blue stain | Invitrogen | T10282 | A dye to detect dead tissue culture cells; only live cells can exclude the dye |
Trypsin-EDTA | Gibco | 25200-056 | Reagent for cell dissociation for cell line maintenance and passaging |
Tryptic Soy Broth (TSB) | Sigma-Aldrich | T8907 | Bacterial growth media |