Enteroïden zijn in opkomst als een nieuw model voor het bestuderen van weefselfysiologie en pathofysiologie, medicijnontwikkeling en regeneratieve geneeskunde. Hier beschrijven we een 2D-enteroïde-afgeleid kweeksysteem van rundercellen dat co-kweek met relevante weefselceltypen mogelijk maakt. Dit model biedt een translationeel voordeel voor modellering van gastro-intestinaal onderzoek.
Organoïde celkweeksystemen kunnen de complexiteit die in weefsels wordt waargenomen recapituleren, waardoor ze nuttig zijn bij het bestuderen van interacties tussen gastheer en ziekteverwekker, het evalueren van de werkzaamheid en toxiciteit van geneesmiddelen en weefselbio-engineering. Het toepassen van deze modellen om de beschreven redenen kan echter beperkt zijn vanwege het driedimensionale (3D) karakter van deze modellen. Het gebruik van 3D-enteroïde kweeksystemen om spijsverteringsziekten te bestuderen is bijvoorbeeld een uitdaging vanwege de ontoegankelijkheid van het darmlumen en de uitgescheiden stoffen. Stimulatie van 3D-organoïden met ziekteverwekkers vereist inderdaad luminale micro-injectie, mechanische verstoring van de 3D-structuur of het genereren van apicale enteroïden. Bovendien kunnen deze organoïden niet samen met immuun- en stromale cellen worden gekweekt, waardoor diepgaande mechanistische analyse van pathofysiologische dynamiek wordt beperkt. Om dit te omzeilen, optimaliseerden we een tweedimensionaal (2D) enteroïde-afgeleid monolaagkweeksysteem voor runderen, waardoor co-cultuur met andere relevante celtypen mogelijk is. Ileale crypten geïsoleerd uit gezond volwassen vee werden gekweekt om 3D-organoïden te genereren die werden ingevroren voor toekomstig gebruik. Een 2D-monolaag werd gecreëerd met behulp van nieuw leven ingeblazen 3D-enteroïden die werden gepasseerd en verstoord om enkele cellen op te leveren, die werden gezaaid op met basaalmembraanextract gecoate transwell-celcultuurinserts, waardoor hun apicale oppervlak bloot kwam te liggen. De polariteit van de intestinale monolaag, cellulaire differentiatie en barrièrefunctie werden gekarakteriseerd met behulp van immunofluorescentiemicroscopie en het meten van transepitheliale elektrische weerstand. Stimulatie van het apicale oppervlak van de monolaag onthulde de verwachte functionaliteit van de monolaag, zoals aangetoond door cytokinesecretie uit zowel apicale als basale compartimenten. Het beschreven 2D-enteroïde-afgeleide monolaagmodel is veelbelovend bij het onderzoeken van gastheer-pathogeen interacties en darmfysiologie, medicijnontwikkeling en regeneratieve geneeskunde.
Diermodellen in onderzoek spelen een cruciale rol bij het vergroten van ons begrip van de pathofysiologie van ziekten en de dynamiek van de immuunrespons van de gastheer tijdens infectie en ondersteunen de ontwikkeling van nieuwe preventieve en therapeutische strategieën 1,2,3,4. Deze modellen ondersteunen onderzoek, ontdekking en vooruitgang bij dieren en zijn de sleutel tot de vooruitgang van het onderzoek naar de menselijke gezondheid. Decennialang hebben knaagdiermodellen de vooruitgang in immuunmechanismen en fundamenteel biologisch onderzoek voor menselijke ziekten ondersteund 3,5,6,7. Hoewel knaagdiermodellen van cruciaal belang zijn bij screening en onderzoek naar vroege ontwikkeling, bieden grote diermodellen een relevantere vergelijking bij het onderzoeken van ziekten bij de mens in zowel vroege ontdekkings- als latere ontwikkelingsstudies, waaronder therapeutische werkzaamheids- en veiligheidstests 1,3,4,5. Vee biedt duidelijke voordelen in vergelijking met knaagdiermodellen voor een efficiëntere vertaling voor menselijke toepassingen voor sommige ziekten, waaronder cryptosporidiose, salmonellose, tuberculose, respiratoir syncytieel virus en brucellose 1,7,8. Inderdaad, deze en andere ziekten ontwikkelen zich spontaan bij runderen, die verschillende analoge ziektepathogenese en immuunprocessen delen voor mensen, en als een uitgeteelde populatie bootsen runderen de genetische en omgevingsheterogeniteit na die de menselijke immuunresponsen beïnvloedt 5,8,9,10 . De voordelen van rundermodellen voor onderzoek naar infectieziekten kunnen worden gemaximaliseerd door eerst een geavanceerd kweeksysteem toe te passen en vervolgens stapsgewijs in-vivostudies uit te voeren. Het eerste gebruik van een zeer complex kweeksysteem van runderen kan het aantal studies met levende dieren aanzienlijk verminderen en tegelijkertijd de kans op succesvol translationeel en toegepast onderzoek vergroten. Kweekmodellen moeten de ziekteprocessen op orgaanniveau samenvatten voor een optimale voorspellende validiteit, waarbij de oorspronkelijke micro-omgeving van het weefsel ruimtelijk en functioneel behouden blijft.
De mucosale immuunrespons is een veelzijdig systeem dat bestaat uit een zeer efficiënte barrière gevormd door gastro-intestinale enterocyten en diverse populaties immuuncellen die zich onder het slijmvliesoppervlakbevinden11. Dit zeer complexe systeem is van cruciaal belang tijdens infectie bij het handhaven van de GI-homeostase en het initiëren van immuunafweer tegen darmpathogenen11. Communicatie tussen enterocyten en onderliggende aangeboren immuuncellen initieert de ontwikkeling van beschermende immuunresponsen tegen pathogene micro-organismen. Als zodanig zijn kweeksystemen die vergelijkbaar zijn in hun mate van complexiteit noodzakelijk voor een optimaal onderzoek naar interacties tussen gastheer en enterische pathogenen en zijn ze zeer effectief in het begrijpen van de enterische fysiologie en de ontdekking en ontwikkeling van geneesmiddelen12,13. Organoïden zijn een robuust kweeksysteem dat lijkt op de architectuur en functie van het weefsel van oorsprong14,15. De meercelligheid van deze modellen maakt onderzoek mogelijk naar de rol van diverse celpopulaties en de cellulaire interacties die betrokken zijn bij darmgezondheid en -ziekte12,14. Van mensen afgeleide organoïdemodellen in onderzoek worden momenteel echter beperkt door de moeilijkheid om een voldoende kwantiteit en consistente kwaliteit van menselijke darmepitheelcellen te verkrijgen en de beperkte levensvatbaarheid van cellen in kweek. Onsterfelijke cellijnen kunnen worden gebruikt om consistent hoge opbrengsten van homologe culturen in deze modellen te verkrijgen; Getransformeerde cellen missen echter inherent de diversiteit en functionele complexiteit van niet-getransformeerde epitheelcellen16,17. De voordelen van het gebruik van culturen afgeleid van runderweefsel als model voor het onderzoeken van gastro-intestinale ziekten en fysiologie zijn onder meer het gemak waarmee weefselmonsters consequent kunnen worden verkregen van gezonde donoren, verbeterde cellevensvatbaarheid en een grotere cellulaire diversiteit die alleen kan worden bereikt met niet-onsterfelijk weefsel. Vergelijkende weefseltranscriptomics en karakterisering van darmorganoïden onthullen overeenkomsten in geconserveerde orthologe genen en cellulaire potentialen tussen mensen en runderen18. Daarom kan een van runderorganoïden afgeleid kweeksysteem voordelig zijn bij het onderzoeken van darmziekten bij de mens, met bevindingen die gemakkelijk kunnen worden vertaald naar de menselijke geneeskunde.
Het hierin beschreven protocol beschrijft een effectief platform om de reacties van de gastheer op enterische pathogenen of verbindingen en de darmfysiologie te evalueren met behulp van een van runderenteroïden afgeleid 2D primair celkweeksysteem. In tegenstelling tot 3D-organoïden, maken 2D-kweeksystemen die worden gegenereerd op transwell-inserts een dubbele kweek van darmcellen met immuun- of stromale cellen mogelijk, waardoor onderzoek naar de dynamiek op weefselniveau mogelijk is. Met toepassingen in biomedisch onderzoek, farmaceutische ontwikkeling en werkzaamheidstesten, kan dit fysiologisch relevante model de gezondheid en vooruitgang van zowel vee als mensen ten goede komen.
Het hier gepresenteerde protocol beschrijft een fysiologisch relevant model voor het onderzoeken van darmfysiologie en darmaandoeningen. Verschillende onderzoeksgroepen hebben het ontstaan van runderenteroïdeculturen beschreven, waaronder 2D-monolagen 16,19,20,21,22,23,24. Hoewel het genereren van monolagen technisch niet al te uitdagend is, zijn stappen van enkele minuten van cruciaal belang om consequent succesvolle culturen te ontwikkelen. Als zodanig kan de reproduceerbaarheid van 2D-monolagen met behulp van de kort beschreven methoden in de gepubliceerde literatuur een uitdaging zijn voor een beginnende onderzoeker op het gebied van organoïden. Het hierin beschreven protocol is aangepast van deze protocollen en de protocollen die bij andere soorten zijn gepubliceerd, en biedt een stapsgewijze handleiding voor het genereren van monolagen op transwell-inserts die zeer reproduceerbaar is.
Het hierin beschreven protocol kan eenvoudig worden aangepast aan de specifieke doelen van het experimentele ontwerp of de beschikbaarheid van reagentia. Volgens dit protocol kunnen succesvolle culturen inderdaad worden bereikt door monolagen te zaaien met een lagere celdichtheid (bijv. 2,5 x 104) of in afwezigheid van FBS, zoals beschreven in andere publicaties24. Het wijzigen van deze parameters kan echter een verhoogde cultuur vereisen om een confluente monolaag tot stand te brengen. Als andere factoren die integraal deel uitmaken van het onderzoeksontwerp, waaronder co-cultuur met immuuncellen, een specifiek tijdsverloop voor het experiment dicteren, kan de zaaidichtheid indien nodig worden gewijzigd. Hoewel andere basaalmembraanformuleringen kunnen worden vervangen in plaats van degene die in dit protocol wordt gebruikt om 3D-enteroïden en 2D-monolagen te genereren, zullen deze enige optimalisatie vereisen om de optimale verhouding tussen basaalmembraan en media te bepalen.
De toepassing van transwell-inserts in de beschreven methodologie heeft veel voordelen ten opzichte van monolaaggroei op conventioneel plastic en 3D-enteroïde culturen. Vergeleken met standaard weefselkweekplaten, bevordert het gebruik van transwells voor monolaagculturen cellulaire differentiatie en organisatie op een manier die gelijkenis met darmcrypten behoudt14,25. De darmepitheelbarrière is van vitaal belang om de translocatie van gifstoffen en micro-organismen in het lichaam te voorkomen en tegelijkertijd de opname van voedingsstoffen te vergemakkelijken. Als zodanig is het van cruciaal belang om te begrijpen hoe de barrière-integriteit van de darm functioneert in gezonde en wordt veranderd tijdens darmstoornissen of als reactie op verbindingen. In tegenstelling tot 3D-enteroïde culturen is een objectieve beoordeling van de integriteit van de darmbarrière mogelijk bij het combineren van monolagen op transwells en het meten van TEER, zoals hierin wordt aangetoond14,25. Het genereren van 2D-monolagen op transwells maakt ook dubbele kweek mogelijk met relevante celtypen zoals immuun- of stromale cellen. Hierdoor kan kritisch belangrijke overspraak tussen darmcellen en cellen van de weefselmicro-omgeving worden gekarakteriseerd, wat niet kan worden bereikt met 3D-culturen. Blootstelling aan het apicale oppervlak van de monolaag maakt niet alleen experimentele blootstelling aan ziekteverwekkers en verbindingen en het verzamelen van luminale producten mogelijk, maar maakt ook onderzoek mogelijk naar andere aspecten van darmfysiologie en -ziekte, waaronder het onderzoek naar de darmmicrobiota en de moleculaire absorptie- of transportfysiologie13. Onafhankelijke controle over de apicale en basale darmoppervlakken is een duidelijk voordeel ten opzichte van 3D-enteroïde modellen.
Door middel van verschillende proefexperimenten hebben we de belangrijkste stappen geïdentificeerd die hebben bijgedragen aan het succes van het protocol. Hoewel weefselmonsters van de hele darm ‘s nachts kunnen worden gekoeld en de volgende dag kunnen worden verwerkt, moeten de weefseldissociatie en isolatie van cryptefragmenten onmiddellijk worden uitgevoerd om het uiteenvallen van de geïsoleerde cryptefracties te voorkomen. Na het voltooien van de PBS-wasbeurten kan het centrifugeren van de crypten in wasmedia helpen om het afbreken van de crypte te voorkomen, zoals beschreven in stap 2.3.10. Bij het passeren van de enteroïden of het oogsten ervan voor monolaagvorming, is het essentieel om de enteroïden te scheiden van de BME-koepels. Het wasmedium moet ijskoud zijn om te helpen bij het oplossen van de BME. Daarentegen kan het gebruik van voorverwarmde TrypLE en het tweemaal filteren van de celsuspensie helpen bij het vormen van de afzonderlijke cellen die nodig zijn voor het genereren van monolagen. Ten slotte kan het handmatig manoeuvreren van de plaat in de vorm van het cijfer 8 helpen om de afzonderlijke cellen gelijkmatig over het transwell-inzetstuk te verspreiden.
Een belangrijke beperking van dit protocol is dat de 2D-monolagen zijn geproduceerd uit enteroïde voorraden die zijn gegenereerd uit een volwassen Holstein-os (>2 jaar oud). Het rijpende maagdarmkanaal bij kalveren kan kleine aanpassingen in het beschreven protocol noodzakelijk maken om optimale resultaten te verkrijgen. In de literatuur zijn rasspecifieke verschillen in de darmfysiologie van runderrassen beschreven26. Hoewel het niet bekend is of deze verschillen van invloed kunnen zijn op enteroïde en de daaropvolgende monolaaggeneratie, vermoeden we dat eventuele verschillen zouden resulteren in slechts kleine wijzigingen in ons protocol. Bovendien heeft het 2D-cultuurmodel enkele inherente nadelen. In vergelijking met 3D-enteroïde modellen kunnen 2D-culturen sommige aspecten van de darmweefselarchitectuur en cellulaire diversiteit missen en beperkingen en uitdagingen creëren die verband houden met de verspreiding van 2D-cultuur13. Toch tonen studies aan dat sommige monolagen de verwachte crypte-organisatie kunnen nabootsen27, en sommige van deze beperkingen kunnen zelfs worden overwonnen door 2D-culturen tot stand te brengen met een lucht-vloeistofinterface. Niettemin moeten de beperkingen van dit model volledig in overweging worden genomen om te bepalen of de toepassing ervan geschikt is voor de experimentele vraag die wordt gesteld.
Dit protocol beschrijft een geoptimaliseerd kweeksysteem dat het maagdarmkanaal van het rund modelleert met behulp van enteroïden die zijn afgeleid van het runderileum om monolagen te vormen op transwell-inserts. Met een breed scala aan toepassingen, van onderzoek naar infectieziekten tot het ontdekken van geneesmiddelen en regeneratieve geneeskunde, zou dit high-throughput kweeksysteem kunnen leiden tot de ongekende ontwikkeling van preventieve en therapeutische strategieën die voor beide partijen voordelig kunnen zijn voor de gezondheid van mens en dier.
The authors have nothing to disclose.
We erkennen het gebruik van de Cellular and Molecular Core Facility aan de Midwestern University.
0.2 mL pipette tip | MidSci | PR-200RK-S | |
1 µm PET 24-well cell culture inserts | Corning | 353104 | |
1000 mL pipette tip | MidSci | PR-1250RK-S | |
22 G needle | Becton, Dickinson and Company | 305156 | |
24-well culture vessel | Corning | 353504 | |
40 μm cell strainer | Corning | 431750 | |
50 mL centrifuge tube | Fisher scientific | 14-955-240 | |
5-mL pipet tip | Fisher scientific | 30075307 | |
5 mL syringe | Becton, Dickinson and Company | 309647 | |
5 mL tube | Eppendorf | 30119401 | |
Anti-Cytokeratin -18 (C-04) | Abcam | AB668-1001 | |
B-27 supplement without vitamin A | Gibco | 12-587-010 | |
Belysa software | Luminex | 40-122 | Immunoassay curve fitting software |
Bovine serum albumin (BSA) | Fisher bioreagents | BP9704-100 | |
Caspofungin acetate | Selleckchem | S3073 | |
Cell lifter | Fisher Scientific | 08-100-241 | |
Chromogranin-A (E-5) | Santa Cruz Biotechnology | SC-271738 | |
Coverslips | Fisher scientific | 12-540-C | |
Cryovials | Neptune scientific | 3471.X | |
Cultrex Ultimatrix RGF BME | R&D Systems | BME001-05 | |
DAPI | MilliporeSigma | D9542-5MG | |
Dissecting scissors | VWR | 82027-588 | |
Dithiothreitol (DTT) solution | Thermo Scientific | FERR0861 | |
DMEM/ F-12 1.1 medium (with L-glutamine, without HEPES) | Cytiva | SH30271.01 | |
E-cadherin | Cell Signaling Technology | #3195 | |
Ethylenediaminetetraacetic acid | Fisher Scientific | BP2482500 | |
FBS | Corning | MT35070CV | |
Gentamicin | Gibco | 15710064 | |
Glass microscope slide | Fisher scientific | 12-550-07 | |
Goat anti-mouse Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11001 | |
Goat anti-mouse Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21235 | |
Goat anti-rabbit Alexa Fluor 555 | Invitrogen | A21428 | |
Hemacytometer | Bio-Rad | 1450015 | |
IntestiCult organoid Differentiation medium (Human) | StemCell Technologies | 100-0214 | |
IntestiCult organoid growth medium (Human) | StemCell Technologies | 0-6010 | |
Keyence BZ-X700 | Keyence | BZ-X700 | |
LY2157299 (Galunisertib) | Selleckchem | S2230 | |
MAGPIX system | Luminex | Magpix system | Compact multiplexing unit |
Microscope | Keyence | BZ-X700 | |
MILLIPLEX Bovine Cytokine/Chemokine Magnetic Bead Panel | MilliporeSigma | BCYT1-33K | Bead-based multiplex assay |
Mr. Frosty container | Nalgene | 5100-0001 | |
Non-Enzymatic Cell Dissociation Solution | ATCC | 30-2103 | |
NutriFreeze D10 Cryopreservation Media | Biological Industries | 05-713-1B | |
Orbital shaking platform | Thermo Fisher | 88880021 | |
Pam3Csk4 | invivogen | tlrl-pms | |
Parafilm sealing film | dot scientific inc. | #HS234526C | |
Paraformaldehyde 16% solution | Electron Microscopy Sciences | 15710 | |
Phalloidin-FITC | R&D Systems | 5782/12U | |
Phosphate buffered saline | Fisher Scientific | BP399-20 | |
Prolong Glass Antifade | Invitrogen | P36982 | |
Rabbit anti-human Lyzozyme (EC3.2.1.17) | Agilent technologies | A009902-2 | |
SB202190 (FHPI) | Selleckchem | S1077 | |
Shaking water bath | Thermo Fisher | MaxQ 7000 | |
Sodium Azide | VWR | BDH7465-2 | |
Streptomycin | Teknova | S6525 | |
Trypan Blue dye | Gibco | 15250-061 | |
TrypLE express enzyme | Life technologies | 12604013 | |
Tween 20 | Fisher Scientific | BP337 | |
Voltohmmeter | MilliporeSigma | Millicell ERS-2 | |
Y-27632 | Selleckchem | S1049 |