אנצפלומיאליטיס אוטואימונית ניסיונית (EAE) משמשת כמודל של בעלי חיים לטרשת נפוצה. מאמר זה מתאר גישה לניקוד דלקת בחוט השדרה, דמיאלינציה ופגיעה אקסונלית ב- EAE. בנוסף, מוצגת שיטה לכימות רמות האור של נוירופילמנט מסיס בסרום העכברים, המאפשרת הערכה של פגיעה אקסונלית בעכברים חיים.
אנצפלומיאליטיס אוטואימונית ניסיונית (EAE) היא מודל נפוץ מבוסס חיסון של טרשת נפוצה (MS). מחלה זו יכולה להיגרם במכרסמים על ידי חיסון פעיל עם רכיבים חלבוניים של מעטפת המיאלין ואדג’ובנט שלם של פרוינד (CFA) או על ידי העברת תאי T T ספציפיים למיאלין ממכרסמים עם חלבון מיאלין/CFA למכרסמים תמימים. חומרת EAE מדורגת בדרך כלל בסולם קליני בן 5 נקודות המודד את מידת השיתוק העולה, אך סולם זה אינו אופטימלי להערכת מידת ההתאוששות מ- EAE. לדוגמה, התוצאות הקליניות נשארות גבוהות בחלק מהמודלים של EAE (למשל, אוליגודנדרוציטים מיאלין גליקופרוטאין [MOG] מודל המושרה בפפטיד של EAE) למרות הרזולוציה של דלקת. לכן, חשוב להשלים ניקוד קליני עם ניקוד היסטולוגי של EAE, אשר גם מספק אמצעי לחקור את המנגנונים הבסיסיים של פגיעה תאית במערכת העצבים המרכזית (CNS).
כאן, מוצג פרוטוקול פשוט כדי להכין ולהכתים קטעי חוט שדרה ומוח מעכברים ולדרג דלקת, דמיאלינציה ופגיעה אקסונלית בחוט השדרה. השיטה לניקוד חדירת לויקוציטים בחוט השדרה יכולה להיות מיושמת גם כדי לדרג דלקת במוח ב- EAE. פרוטוקול למדידת אור נוירופילמנט מסיס (sNF-L) בסרום של עכברים באמצעות בדיקת מולקולה קטנה (SIMOA) מתואר גם כן, המספק משוב על מידת הפגיעה הכוללת במערכת העצבים המרכזית בעכברים חיים.
אנצפלומיאליטיס אוטואימונית ניסיונית (EAE) היא המודל הנפוץ ביותר למחלת הדה-מיאלינציה האנושית, טרשת נפוצה (MS)1. פתולוגיה דלקתית קלאסית של טרשת נפוצה, כולל חדירתתאי עוזר מסוג IFN-γ (גמא) ו- IL-17 המייצרים T 2, חדירת מונוציטים דלקתיים3, היווצרות נגעים דלקתיים פריווסקולריים ותת-מנינגיאליים4, והתרחשות של פגיעה באקסון4 במערכת העצבים המרכזית (CNS), נצפתה גם ב- EAE 5,6,7,8,9. הדמיון במנגנוני החיסון בין EAE לטרשת נפוצה הפך את EAE למודל פרה-קליני מתאים לבדיקת היעילות ומנגנוני הפעולה של מספר טיפולים מאושרים מבוססי חיסון לטרשת נפוצה, כולל נטליזומאב, פינגולימוד, דימתיל פומרט וגלטירמר אצטט (נסקרב-1,5). משטרי EAE מסוימים מדגימים היבטים אחרים של פתולוגיה מתקדמת של טרשת נפוצה מעבר לפגיעה אקסונלית, כולל התפתחות של דלקת תת-קרום המוח במוח, דמיאלינציה כרונית, ניוון חוט השדרה, סינפסה ואובדן נוירונים 6,10,11,12. לפיכך, EAE יש תועלת עבור סינון היעילות של טיפולים neuroprotective עבור טרשת נפוצה.
EAE מושרה במכרסמים במספר דרכים. חיסון פעיל הוא שיטת האינדוקציה הנפוצה ביותר וכולל חיסון של מכרסמים עם אנטיגנים של מיאלין (חלבונים מלאים או פפטידים) המתחלבים ב- CFA בתוספת Mycobacterium tuberculosis13 שהומת בחום. בהתאם לזן של עכבר, רעלן שעלת (PTX) מנוהל גם ביום 0 ויום 2 של החיסון כדי להגדיל את החדירה של מחלה13. EAE יכול גם להיגרם על ידי העברה מאמצת של תאי T ספציפיים למיאלין המתקבלים מעכברים בעלי מיאלין/CFA לעכברים בריאים14 או יכול להתפתח באופן ספונטני בעכברים המבטאים יתר על המידה קולטני תאי T ספציפיים לאנטיגנים העיקריים של המיאלין5.
חומרת המחלה והתקדמותה מדורגות בדרך כלל באמצעות סולם קליני דיסקרטי בן 5 נקודות: 1 – צליעה בזנב, 2 – חולשת גפיים אחוריות או כף רגל, 3 – שיתוק מוחלט באחת או בשתי הגפיים האחוריות, 4 – חולשת גפיים קדמיות, 5 – מוות או מוות13. מערכת ניקוד קלינית זו מבוססת על תיעוד ההתקדמות של שיתוק עולה המתרחש עם תחילת המחלה, אך היא פחות רגישה בלכידת מידת ההחלמה מהתקפים דלקתיים במערכת העצבים המרכזית. לדוגמה, גם עכברים שעושים אמבולציה עם קושי וגם עכברים שעושים אמבולציה בקלות אך מפגינים חולשה באחיזת הרגליים מקבלים ציון 2 בסולם EAE. ציונים יכולים להישאר גבוהים בשלב הפוסט-אקוטי של EAE עקב נוכחות של פגיעה או אובדן אקסונים קבועים, למרות הרזולוציה של התגובה הדלקתית9. נעשו מגוון ניסיונות לפתח מערכות ניקוד מעודנות יותר, מבחנים התנהגותיים, מדדים של חוזק הגפיים האחוריות והאחיזה, ומערכות ניטור אינפרא אדום כדי ללכוד טוב יותר הבדלים בליקויים קליניים ב- EAE 9,16,17,18; עם זאת, מדדי ניקוד מורכבים יותר אלה אינם מבחינים בין תרומת דלקת לעומת פגיעה ברקמה לליקויים הנוירולוגיים הבסיסיים. לפיכך, גישת תקן הזהב לציון חומרת EAE היא לבצע ניקוד קליני והיסטולוגי כאחד.
כאן, מתואר פרוטוקול כיצד לנתח ולהטמיע דגימות חוט שדרה ומוח עכבר בפרפין באופן שלוכד את התהליך הסטוכסטי של היווצרות נגעים המתרחש ב- EAE. פרוטוקול מוצג גם כיצד להכתים חלקים עם Luxol fast blue (LFB), שנוצר במקור על ידי Kluver ו- Barrera19, המזהה מיאלין במערכת העצבים המרכזית. החלקים מוכתמים ב-LFB בלבד (לצורך ניתוח דה-מיאלינציה) או מוכתמים נגדית בהמטוקסילין ובאאוזין (H&E) כדי לסייע בהדמיה ובציון של נגעים דלקתיים. פרוטוקולים מסופקים גם כדי לכמת את נוכחותם של לויקוציטים כוללים (CD45), אובדן מיאלין, ואת מספר האקסונים הפגועים (SMI-32) בחוט השדרה באמצעות נוגדנים זמינים מסחרית, טכניקות אימונוהיסטוכימיות (IHC) ותוכנות נגישות לציבור. הפרוטוקול המשמש לכימות לויקוציטים בחוט השדרה יכול להיות מיושם גם כדי לכמת לויקוציטים במוח.
הערכה היסטולוגית של אובדן אקסונלי ופגיעה במוח קשה יותר באופן יחסי מאשר בחוט השדרה, שכן אסופות החומר הלבן במוח אינן פועלות במקביל זו לזו. המדידה של אור נוירופילמנט בסרום (sNF-L) התגלתה כסמן ביולוגי מבטיח לפגיעה עצבית בטרשת נפוצה20,21. מחקרים אחרונים הרחיבו טכנולוגיה זו ל- EAE 22,23,24. כאן, מוצגת שיטה למדידת אור נוירופילמנט בסרום (sNF-L) בעכברים חיים באמצעות בדיקת מולקולות קטנות (SIMOA). שיטה זו דורשת רק כמות קטנה של סרום וניתן לעשות זאת בעכברים חיים תוך חצי יום בלבד, מה שמספק משוב מהיר על האופן שבו טיפול נבדק משפיע על הפגיעה הכוללת במערכת העצבים המרכזית. כל השיטות המתוארות כאן יכולות להיות מיושמות על עכברים מכל מין או זן.
צביעה היסטולוגית של חוט השדרה היא כלי חשוב בהערכת חומרת המחלה, במיוחד במקרים בהם קיימים הבדלים בין קבוצות הטיפול במידת ההחלמה מהמחלה בשלב הפוסט-אקוטי של המחלה. צביעה בגין חדירת תאי מערכת החיסון (CD45), מיאלין (LFB) ופגיעה אקסונלית (SMI-32) מסייעת לאפיין את הגורם הבסיסי לשינוי הציונים הקליניים בעכברים. פרוטוקול הצביעה ההיסטולוגית המתואר כאן מספק פרספקטיבה של דלקת, כמו גם את מידת הפגיעה במיאלין ובאקסונל. יתר על כן, התוצאות המוצגות מאמתות מדידת sNF-L כשיטה להעריך את היקף הנזק העצבי הכולל ב- EAE.
הפרמטרים הקריטיים לניתוח זה הם להבטיח שהחוקרים יהיו עיוורים לזהות המקטעים ושיש דגימה שוות ערך בכל רמה של חוט השדרה על פני העכברים השונים. הסיבה לכך היא שחומרת הדלקת יכולה להיות גדולה יותר ברמות נמוכות יותר של הטבל. פרמטר קריטי נוסף הוא גודל קבוצות הניסוי. חוטי השדרה והמוח נקצרים בדרך כלל מ-6-8 עכברים לכל קבוצה בנקודת הסיום כדי לראות הבדלים משמעותיים בין קבוצות עם טיפולים או גנוטיפים בעלי גודל השפעה צנוע. חשוב גם לוודא שלעכברים נבחרים, כאשר הם ממוצעים, יש ציונים ממוצעים מייצגים של הקבוצה כולה. לגבי פתרון בעיות, בעיה נפוצה בה נתקלים אלה שאינם מנוסים בפרוטוקול היא שחוט השדרה קבוע למשך זמן לא מספיק והוא אינו נשלף בקלות מעמוד השדרה. אם זה המקרה, ניתן לנתח את חוט השדרה באופן ידני מהעמוד על ידי חיתוך לאורך תהליכי עמוד השדרה באמצעות מספריים עדינים ופתיחת העמוד כדי לחשוף את חוט השדרה. לחילופין, ניתן לקבע רקמות למספר ימים נוספים מבלי להפריע להצלחת צביעת הנוגדנים. שיבוט הנוגדנים המתואר כאן עובד ברקמה קבועה עד שבועיים בפורמלין.
הטבעה של חלקי חוט השדרה דורשת מיומנות ותרגול. מומלץ להרכיב זכוכית מגדלת ולכוון מנורה מעל עמדת ההטבעה כדי לראות טוב יותר אם החתכים נופלים בחתך רוחב או בחתך אורך. שמירה על אורכם של חלקי חוט השדרה בפחות מ -2 מ”מ במהלך הברוטו תעזור להם ליפול בחתך רוחב. בעיה נפוצה נוספת בה נתקלים משתמשים פחות מנוסים היא שה-LFB מתאדה במהלך הדגירה הלילית, ומשאיר חצי מהמגלשה מוכתמת וחצי לא מוכתמת. כדי למנוע אידוי, יש לאטום את צלחת צביעת הזכוכית בסרט תרמופלסטי ולאחר מכן בניילון נצמד. אם מתרחשת אידוי וחלקים מוכתמים באופן לא אחיד, מומלץ להסיר לחלוטין את הכחול של המגלשות עם ליתיום פחמתי ולהכתים אותן שוב ב- LFB למשך הלילה. בעיה נפוצה נוספת היא שמשתמשים אינם מבטלים לחלוטין את הכחול של החומר האפור לאחר LFB. זה קריטי לבחון חלקים בודדים תחת המיקרוסקופ כדי לוודא כי כמות מספקת של de-bluing הושגה לפני שתמשיך עם צעדים אחרים בפרוטוקול. בנוסף, למרות שכתמי CD45 ו- SMI-32 IHC מתפקדים בצורה חזקה, עדיין חשוב לפתור את ריכוזי הנוגדנים בניסויים ראשוניים עבור כל מנת נוגדנים חדשה שמתקבלת. זה יכול להיעשות על ידי בדיקת מגוון ריכוזים של הנוגדן על קטע בקרה חיובית (EAE חוט השדרה). צביעה ראשונה צריכה לכלול גם בקרה שלילית המורכבת מנוגדן משני בלבד ללא הוספת נוגדן ראשוני. לבסוף, קריטי בניתוח התמונות לסף תמונות בודדות מכיוון שהצביעה יכולה להיות לא אחידה בין שקופיות או מקטעים.
פרוטוקול זה משתמש בתוכנה זמינה באופן חופשי. אם אין לאדם גישה למעבד, להטמעה או למיקרוטום, ניתן להפנות שלבים אלה לליבת פתולוגיה מבוססת בית חולים המציעה שירותים אלה. כמו כן, אם אין לאדם גישה לסורק שקופיות, ניתן להשתמש במיקרוסקופ אור המצויד במצלמת וידאו כדי לשמור תמונות TIFF של חוט השדרה או אזורי המוח. לזרימת עבודה מבוססת מיקרוסקופ, לכוד קטעי LFB או LFB/H&E בהספק נמוך (הגדלה של 40x) ועבור צביעת CD45 ו-SMI-32, צלם לפחות ארבעה חלונות המרוכזים בחלקים הגחונים, הגביים והצדיים של חוט השדרה (הגדלה של פי 200 עבור CD45 והגדלה של 400x עבור SMI-32). ניתן לבצע ניתוח תמונות על תמונות אלה כדי לכמת את הצביעה באופן דומה למתואר.
ההחלטה באיזו גישה היסטולוגית לנקוט כדי לדרג EAE תלויה עד כמה הציונים הקליניים שונים בין הקבוצות. לדוגמה, אם יש הבדלים דרסטיים בניקוד הקליני של EAE (קבוצה אחת קיבלה EAE ואחת לא), זה בדרך כלל מתייחס להבדלים בדלקת בתיווך היקפי. במקרה זה, ניקוד עבור נוכחות של נגעים demyelinating על חלקים מוכתמים LFB / H&E הוא מספיק ויגלה הבדלים בין קבוצות. אם הקבוצות דומות יותר בניקוד הקליני בתחילת המחקר, ובמקום זאת יש הבדלים במידת ההחלמה הקלינית (לדוגמה, ניסוי באיור 5A), עדיף ליישם את זרימת העבודה ההיסטולוגית המלאה המתוארת כאן, כולל ניקוד של דלקת במוח בגזע המוח ובמוח הקטן, כדי להבחין אם ההבדלים בכרוניקה של המחלה קשורים להבדלים בדלקת או לנזק לרקמות. אם נמצאו הבדלים בדלקת כפי שהוערכו על ידי ספירת CD45, ניתן לבצע מחקרי IHC נוספים כדי להכתים תאי T (אנטי CD3), מונוציטים / מקרופאגים מסתננים (Mac3) ומיקרוגליה (Iba-1/TMEM119) (שיבוטים מומלצים של נוגדנים נמצאים בטבלה משלימה 3). הפעלת מיקרוגליה משתקפת על ידי עלייה בעוצמת צביעת Iba-1 על מיקרוגליה בעלת תווית כפולה Iba-1+TMEM-19+ ונסיגה מוגברת של תהליכי מיקרוגליה שניתן להעריך על ידי ניתוח שול בסעיפים32. יתר על כן, טכניקות כמו ציטומטריית זרימה או ריצוף RNA של תא בודד יכולות להיות מיושמות כדי לבצע אפיון עמוק יותר של התדירות והפנוטיפ של אוכלוסיות החיסון במוח ובחוט השדרה.
ספירת אקסונים SMI-32+ היא שיטה רגישה לאיתור פגיעה באקסון ב-EAE32,33 וב-MS34. SMI-32, אשר מזהה את הצורה הלא זרחנית של neurofilament כבד או בינוני מצטבר נורות קצה של נוירונים transected. חלופה לאיתור אקסונים פגועים היא להכתים בחלבון מבשר עמילואיד (APP) שיכול להצטבר באקסונים כתוצאה משיבוש בהעברת האקסון33. דפוס הכתמים עבור SMI-32 ו- APP למרות ששניהם משקפים פגיעה באקסון, אינם חופפים בדרך כלל, מה שמעיד על כך שהם מזהים פתולוגיות שונות33. ניתן גם להשלים מדדים היסטולוגיים של פגיעה אקסונית על ידי מדידת sNF-L, שהוא מדד מהיר ורגיש לפגיעה אקסונלית מתמשכת הן בעמוד השדרה והן במוח. זה מציע את היתרון כי זה יכול להיעשות בחצי יום בעכברים חיים. החיסרון של שיטה זו הוא שהערכות יקרות והמכונה מתמחה מאוד. החברה שמוכרת את ערכת sNF-L מציעה תשלום עבור שירות למי שאין לו גישה למכונת SIMOA. חלופה להערכת פגיעה באקסון היא ניקוד עבור אובדן אקסונים על ידי ספירת אקסונים במקטעים מוכתמים בכחול טולוידין של חוט השדרה12 או ספירת צרורות נוירופילמנט שזוהו על ידי SMI-31 באזורים של החומר הלבן של חוט השדרה32. שתי גישות אלה מייגעות יותר מאשר מדידת SMI-32 או sNF-L.
אם הציונים הקליניים של EAE שונים בין הקבוצות, אך ניקוד עבור דלקת, דמיאלינציה ופגיעה אקסונלית אינו מגלה הבדלים בין הקבוצות, ייתכן שיהיה שימושי להכתים עבור הפעלת אסטרוציטים באמצעות GFAP (ראה טבלה משלימה 3 לשיבוט נוגדנים מומלץ). הפעלת אסטרוציטים קשורה לעלייה בצביעת GFAP וזה הוכח בקורלציה עם התקדמות EAE בכמה מודלים של EAE, כולל EAE כרוני בחולדת DA35.
לסיכום, פרוטוקול זה מתאר שיטות ומספק זרימת עבודה של ניתוח לביצוע ניקוד היסטולוגי של EAE.
The authors have nothing to disclose.
אנו מודים לד”ר ריימונד סובל (אוניברסיטת סטנפורד) על שהראה לנו את השיטה שלו לגרוס ולתקן קטעי מוח וחוט שדרה. אנו מודים לקייל רוברטון ולמילאן גנגולי ממרכז טורונטו לפנוגנומיקה על לימוד שיטת ההטבעה ועל חיתוך כל כך הרבה מחלקי המוח וחוט השדרה שלנו. אנו מודים לד”ר מתיו קוסיק ולד”ר רוברט פוג’ינאמי (אוניברסיטת יוטה) על שיתוף הפרוטוקולים שלהם לניקוד דלקת תת-קרום המוח והפריווסקולרית בחוט השדרה. אנו מודים לשלינה עוסמאן על שיתוף השיבוט של נוגדן CD45. אנו מודים ל-Xiofang Lu על ההכשרה במעבד הרקמות ובתחנת הטמעת הרקמות, ועל תחזוקת ציוד זה במרכז המחקר קינן למחקר ביו-רפואי בבית החולים סנט מייקל. עבודה זו נתמכה על ידי מענק ביו-רפואי מטרשת נפוצה קנדה (ל-SED). כרמן אוצ’יפארי נתמכת על ידי סטודנטית מממשלת קנדה. נוריה אלוורז-סנצ’ז נתמכת על ידי מלגת קינן לפוסט-דוקטורט.
10% Neutral Buffered Formalin | Sigma Aldrich | HT501128-4L | Used to fix spinal cord and brain specimens |
1000 mL Glass Beaker | Pyrex | 1000 | |
15 mL Falcon Tube | Starstedt | 62.554.100 | Fixing and storing spinal cord and brain |
250 mL Erlenmeyer Flask | Pyrex | 4980 | |
500 mL Glass Beaker | Pyrex | 1003 | |
92 mm x 16 mm Petri Dishes | Starstedt | 82-1473-001 | Used in the tissue grossing procedure |
95% Ethyl Alcohol | Commercial Alcohols | P016EA95 | Dehydration and rehydration steps |
ABC Elite Kit | Vector Labratories | PK6100 | Used for immunohistochemistry labeling |
Aqua Hold 2 PAP Pen | Cole Parmer | UZ-75955-53 | Used for drawing around tissue sections in Immunohistochemical Staining |
Avidin/Biotin Blocking Kit | Vector Labratories | SP-2001 | |
Biosafety Cabinet | Any | ||
Biotinylated rabbit anti-rat IgG | Vector Labratories | BA-4000 | Used for CD45 staining |
C57BL6/J Mice | Jackson Laboratory | Stock # 664 | These mice were used in experiments shown in paper. |
Centrifuge | Thermo Fisher Scientific | Sorvall ST Plus | |
CitriSolv | Fisher Scientific | 04-355-121 | Used for de-waxing. Is an alternative to xylene |
DAB Kit | Vector Labratories | SK-4100 | Used for developing in immunohistochemistry |
ddH2O | – | – | |
Disposable Scalpel | Magna | M92-10 | Used for grossing spinal cord and brain |
DWK Life Sciences (Wheaton) glass staining dish | Cole Parmer | UZ-48585-60 | Used for histochemical staining and washes |
DWK Life Sciences (Wheaton) glass staining rack | Cole Parmer | 10061392 | Used for immunohistochemistry and histochemistry |
Eosin Y | Bioshop | 173772-87-1 | Stains cytoplasm |
Feather Microtome Blades | Fisher Scientific | 12-634-1C | Used for sectioning paraffin |
Filter Paper | Whatman | 1001110 | Used to filter the formalin (during grossing) and the luxol fast blue |
Fine Surgical Scissors | Fine Science Tools | 14160-10 | Used to snip brain and the skull |
Fumehood | Any | ||
Gibco DPBS | Fisher Scientific | 14190944 | |
Glacial Acetic Acid | BioShop | ACE333.4 | Used in the luxol fast blue staining procedure |
Histoplex Histology Containers | Starplex Scientific | 565-060-26 | Fixing spinal cord and brain |
Hydrogen Peroxide | Fisher Chemicals | H325-500 | Used to remove endogenous peroxidase in the tissue |
ImageJ | NIH | https://imagej.nih.gov/ij/download.html | |
Kimtech Science Kimwipes | Kimberly Clark Professional | 34155 | Used for immunohistochemistry |
Lens paper | VWR | 52846-001 | Used for trapping spinal cord species in cassette during processing |
Light microscope | Any | ||
Lithium carbonate | Sigma Aldrich | 554-13-3 | De-blueing after luxol fast blue staining |
Luxol blue | Sigma Aldrich | 1328-51-4 | Stains CNS myelin |
M.O.M Immunodetection Kit | Vector Labratories | BMK-2202 | Used to stain SMI-32 |
Methanol | Fisher Chemicals | A454.2 | Used for fixation |
Mayer's Hematoxylin | Electron Microscopy Sciences | 26381-02 | Stains nuclei |
Micro-Adson Forceps with Teeth | Fine Science Tools | 11027-12 | Used for reflecting the skull during dissections |
Microcentrifuge | Eppendorf | Model 5417R | |
Microvette Capillary Tubes CB 300 Z | Starstedt | 16.440.100 | Used for blood collection |
Micrscope Cover Glass | Fisher Scientific | 12545A | Used for coverslipping |
Mini Shaker | VWR | 12620-938 | Used for making buffers |
NF light kit | Quanterix | 103186 | This kit can be used for detection of mouse or human soluble neurofilament in serum |
Nitrile Gloves | VWR | 76307-462 | Safety |
Normal Goat Serum | Vector Labratories | S-1000 | Blocking reagent |
Normal Rabbit Serum | Vector Labratories | S-5000 | Blocking reagent |
OmniSette Tissue Cassettes | Fisher Scientific | M4935FS | Used for embedding spinal cord and brain |
p1000 Pipette and Tips | various | ||
p200 Pipette and Tips | various | ||
Paraffin Embedding station | Leica Biosystems | Model EG1160 | |
Paraplast Tissue Infiltration/Embedding Medium | Leica Biosystems | 39601006 | Used for embedding spinal cord and brain |
Permount Mounting Medium | Fisher Chemicals | SP15-100 | Used for mounting coverslips on slides |
pH meter | Fisher Scientific | 13636AB315B | Used for pHing buffers |
Plastic Transfer Pipettes | Fisher Scientific | 13-711-20 | Used for pHing buffers |
Potassium Chloride | BioShop | 7447-40-7 | Used for making PBS |
Potassium Phosphate Monobasic | BioShop | 7778-77-0 | Used for making PBS |
Pressure Cooker | Nordic Ware | Tender Cooker | |
Purified rat anti-mouse CD45 | Vector Labratories | 553076 | Detects leukocytes |
Reagent grade alcohol 100% | VWR | 89370-084 | Dehydration and rehydration steps |
Reagent grade alcohol 70% | VWR | 64-17-5 | Dehydration and rehydration steps |
Rotary Microtome | Leica Biosystems | Model RM2235 | |
Simoa Machine | Quanterix | HD-X | |
Slide Scanner | Zeiss | AxioScan.Z1 | |
SMI-32 mouse IgG1 antibody | Biolegend | 801701 | Detects damaged axons |
Sodium Chloride | BioShop | 7647-14-5 | Used for making PBS |
Sodium Phosphate Dibasic | Bioshop | 7558-79-4 | Used for making PBS |
Standard Adson Forceps | Fine Science Tools | 11150-10 | Used for dissection steps |
Superfrost Plus Microscope slides | Fisher Scientific | 12-550-15 | Used to collect sections |
Surgical Tough Cuts | Fine Science Tools | 14110-15 | Used to cut through the spine, body wall, and skin |
Tissue Processor | Leica Biosystems | Model TP1020 | |
Tri-soldium citrate | Thermo Fisher Scientific | 03-04-6132 | Used for antigen retrieval |
Tween-20 | BioBasic | 9005-64-5 | Used for washing sections |
X-P Pierce XP-100 plate seal | Excel Scientific | 12-140 | Used for the sNF-L Assay |
Xylene | Fisher Chemicals | 1330-20-7 | Used for de-waxing and clearing sections |
Funnel | Cole Parmer | RK-63100-64 | Used to filter formalin before grossing tissue |
Stir Plate | Any | Used to make solutions | |
Oven | Any | Used to bake tissue sections after cutting | |
Parafilm | Bemis | 13-374-10 | Used to seal LFB staining dish |
Microwave | Any | Timing may vary depending on the microwave model | |
Bovine Serum Albumin (BSA) | Sigma Aldrich | 9048-46-8 | Used to make blocking buffer |
1.5 mL Microcentrifuge Tubes | Fisher Scientific | 05-408–129 | Used to store mouse serum samples |
Vortex | Any | Used to prepare samples for sNF-L assay | |
Waterbath | Any | Used to warm enzyme substrate for sNF-L assay |