Summary

Поляризационно-чувствительная двухфотонная микроскопия для определения структуры амилоида без меток

Published: September 08, 2023
doi:

Summary

В данной работе описывается, как поляризационно-чувствительная двухфотонная микроскопия может быть применена для характеристики локальной организации в безметочных амилоидных суперструктурах-сферулитах. В нем также описывается, как подготовить и измерить образец, собрать необходимую установку и проанализировать данные для получения информации о локальной организации амилоидных фибрилл.

Abstract

По сравнению со своим однофотонным аналогом, двухфотонное возбуждение выгодно для экспериментов по биовизуализации из-за его меньшей фототоксичности, более глубокого проникновения в ткани, эффективной работы в плотно упакованных системах и уменьшенной угловой фотоселекции флуорофоров. Таким образом, внедрение поляризационного анализа в двухфотонную флуоресцентную микроскопию (2ПФМ) обеспечивает более точное определение молекулярной организации в образце по сравнению со стандартными методами визуализации, основанными на линейно-оптических процессах. В данной работе мы сосредоточимся на поляризационно-чувствительном 2PFM (ps-2PFM) и его применении при определении молекулярного упорядочения в сложных биоструктурах-амилоидных сферулитах. Нейродегенеративные заболевания, такие как болезнь Альцгеймера или Паркинсона, часто диагностируются путем обнаружения амилоидно-белковых агрегатов, образующихся из-за нарушенного процесса неправильного сворачивания белка. Изучение их структуры приводит к лучшему пониманию пути их создания и, следовательно, к разработке более чувствительных методов диагностики. В данной работе представлен ps-2PFM, адаптированный для определения локального порядка фибрилл внутри сферолитов инсулина крупного рогатого скота и сферических амилоидогенных белковых агрегатов. Более того, мы доказываем, что предложенная методика может разрешить трехмерную организацию фибрилл внутри сферулита.

Introduction

За последние десятилетия, несмотря на значительное развитие многочисленных методов флуоресцентной микроскопии для биовизуализации белков и их агрегатов1, лишь немногие из них были использованы для разрешения их локального упорядочения в образце 2,3. Методом флуоресцентной пожизненной визуализационной микроскопии4 изучена внутренняя структурная гетерогенность амилоидных суперструктур-сферолитов. Кроме того, количественное определение локального упорядочения внутри сложных и плотно упакованных биоструктур, таких как сферолиты, может быть решено с помощью поляризационно-чувствительных методов3. Однако стандартные методы флуоресценции с проникновением в поверхностные ткани ограничены, поскольку использование длин волн УФ-ВИД для возбуждения флуорофоров in vivo приводит к высокомурассеянию света в тканях. Кроме того, такая визуализация часто требует разработки и привязки специфических флуоресцентных зондов к целевой биомолекуле, тем самым увеличивая стоимость и объем работы, необходимой для выполнения визуализации.

Недавно, для решения этих проблем, наша команда адаптировала поляризационно-чувствительную двухфотонную возбужденную флуоресцентную микроскопию (ps-2PFM) для безметочной визуализации биологических структур 6,7. Ps-2PFM позволяет измерять зависимость интенсивности двухфотонной флуоресценции от направления линейной поляризации пучка возбуждения и анализировать поляризацию излучаемой флуоресценции8. Реализация данной методики требует дополнения стандартного тракта возбуждения многофотонной установки микроскопа (рис. 1) полуволновой пластиной для управления плоскостью поляризации света. Затем из сигналов, собранных двумя лавинными фотодами, создаются полярные графики, изображающие зависимость интенсивности двухфотонной возбужденной флуоресценции от поляризации возбуждающего лазерного пучка, собирая таким образом две, взаимно перпендикулярные составляющие поляризации флуоресценции.

Последним этапом является процесс анализа данных с учетом влияния оптических элементов, таких как дихроичные зеркала или объектив с высокой числовой апертурой, на поляризацию. Из-за природы двухфотонного процесса этот метод обеспечивает как уменьшенный угловой фотоотбор, так и повышенное осевое разрешение, так как двухфотонное возбуждение флуорофоров вне фокальной плоскости вероятностно ограничено. Также было доказано, что аналогичные методы могут быть успешно реализованы для визуализации in vivo зондов ближнего инфракрасного диапазона (NIR) для визуализации глубоких тканей9. Ранее Ps-2PFM применялся для изображения флуорофоров в клеточных мембранах10 и ДНК11,12, а также в качестве нестандартных флуоресцентных маркеров биологических систем, таких как наночастицы золота13. Однако во всех этих примерах информация об организации биомолекул была получена опосредованно и требовала заранее определенной взаимной ориентации между флуорофором и биомолекулой.

В одной из наших недавних работ мы показали, что ps-2PFM может быть успешно применен для определения локальной поляризации автофлуоресценции амилоидных суперструктур и флуоресценции тиофлавина Т, амилоид-специфического красителя, связанного с амилоидными фибриллами в сферулитах6. Кроме того, в другом исследовании мы доказали, что ps-2PFM может быть использован для определения ориентации амилоидных фибрилл внутри амилоидных сферолитов в субмикронном режиме, что было подтверждено путем корреляции с изображениями просвечивающей электронной микроскопии (ПЭМ)7. Достижение этого результата стало возможным благодаря i) собственной автофлуоресценции сферолитов-амилоидов при возбуждении одним или двумя фотонами проявлять собственную автофлуоресценцию с максимумами излучения, расположенными в диапазоне от 450 до 500 нм, и сечениями поглощения двух фотонов, сопоставимыми со стандартными флуоресцентными красителями14, ii) математическими моделями, введенными ранее для описания того, как ps-2PEF красителей, мечущих биологические мембраны и структуры ДНК, могут быть применены для Флуоресценция проявляется сферолитами и связанными с ними красителями 8,11,15. Таким образом, прежде чем приступить к анализу, мы настоятельно рекомендуем ознакомиться с необходимой теорией, описанной как в основном тексте, так и в вспомогательной информации нашей первой статьи поэтой теме6. Здесь мы представляем протокол применения метода ps-2PFM для структурной характеристики амилоида бычьих инсулиновых сферолитов без меток.

Protocol

1. Подготовка предметных стекол микроскопа с полностью выращенными сферулитами ПРИМЕЧАНИЕ: См. Таблицу материалов для получения подробной информации обо всех материалах, реагентах и оборудовании, используемых в этом протоколе. Все растворы готовили на …

Representative Results

Представленный протокол содержит пошаговое руководство по подготовке амилоидных суперструктур для испытаний с помощью ps-2PFM, построению микроскопической системы и измерениям соответствующего образца. Тем не менее, перед окончательным набором измерений необходимо правильно выровнят…

Discussion

Поляризационно-чувствительная двухфотонная микроскопия является ценным инструментом для изучения локального упорядочения фибрилл внутри амилоидных суперструктур, требуя лишь небольших модификаций стандартной многофотонной установки. Поскольку он работает с нелинейно-оптическим?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Работа выполнена при поддержке проекта Sonata Bis 9 (2019/34/E/ST5/00276), финансируемого Национальным научным центром Польши.

Materials

Sample preparation
Coverslips, 24 x 24 mm Chemland 04-298.202.04
DPX mountant for histology Sigma-Aldrich 6522 Slide mountant
Eppendorf Safe-Lock tubes, 1.5 mL, polypropylene Chemland 02-63102
Eppendorf ThermoMixer C Eppendorf Used for spherulite incubation
HLP 5UV Water purification system Hydrolab Source of dionized water used in sample preparation
Hydrochloric acid (≥37%, APHA ≤10), Sigma-Aldrich 30721-M
Insulin powder from the bovine pancreas (≥25 units/mg (HPLC)) Sigma-Aldrich I5500
Methanol (HPLC grade) Sigma-Aldrich 270474
Microscope slides with a concave, 76 x 26 x 1 mm Chemland 04-296.202.09
Olympus BX60 Olympus Polarized Optical Microscope used in Figure 2
PTFE thread seal tape, 12 mm x 12 mm x 0.1 mm, 60 gm2 Chemland VIT131097
Microscope ps-2PFM setup
Chameleon Ultra II Coherent
FELH0800 – Ø25.0 mm Longpass Filter Thorlabs
FESH0700 – Ø25.0 mm Shortpass Filter Thorlabs
IDQ100 photon-counting avalanche photodiodes  ID Quantique
Multiphoton short-pass emission filter 720 nm  Semrock
Mounted Achromatic Half-Wave Plate, 690-1200 nm Thorlabs
Nikon Plan Apo Oil Immersion 100x/1.4 NA Nikon
piezo 3D stage Piezosystem Jena
Polarizing Beamsplitter Thorlabs
S130C – Slim Photodiode Power Sensor, Si, 400 – 1100 nm, 500 mW Thorlabs
Software
LabView 2018 National Instruments Version 18.0.1f2
Matplotlib library Version 3.3.2
NumPy library Version 1.19.2
SciPy library Version 1.5.2
Spyder Python 3 IDE Version 4.1.5

References

  1. Petazzi, R. A., Aji, A. K., Chiantia, S., Giraldo, J., Ciruela, F. . Progress in Molecular Biology and Translational Science. 169, 1-41 (2020).
  2. Kress, A., et al. Probing orientational behavior of MHC class I protein and lipid probes in cell membranes by fluorescence polarization-resolved imaging. Biophysical Journal. 101 (2), 468-476 (2011).
  3. Duboisset, J., et al. Thioflavine-T and Congo Red reveal the polymorphism of insulin amyloid fibrils when probed by polarization-resolved fluorescence microscopy. The Journal of Physical Chemistry B. 117 (3), 784-788 (2013).
  4. De Luca, G., et al. Probing ensemble polymorphism and single aggregate structural heterogeneity in insulin amyloid self-assembly. Journal of Colloid and Interface Science. 574, 229-240 (2020).
  5. Helmchen, F., Denk, W. Deep tissue two-photon microscopy. Nature Methods. 2 (12), 932-940 (2005).
  6. Obstarczyk, P., Lipok, M., Grelich-Mucha, M., Samoć, M., Olesiak-Bańska, J. Two-photon excited polarization-dependent autofluorescence of amyloids as a label-free method of fibril organization imaging. The Journal of Physical Chemistry Letters. 12 (5), 1432-1437 (2021).
  7. Obstarczyk, P., Lipok, M., Żak, A., Cwynar, P., Olesiak-Bańska, J. Amyloid fibrils in superstructures – local ordering revealed by polarization analysis of two-photon excited autofluorescence. Biomaterials Science. 10 (6), 1554-1561 (2022).
  8. Le Floc’h, V., Brasselet, S., Roch, J. -. F., Zyss, J. Monitoring of orientation in molecular ensembles by polarization sensitive nonlinear microscopy. The Journal of Physical Chemistry B. 107 (45), 12403-12410 (2003).
  9. Chen, C., et al. In vivo near-infrared two-photon imaging of amyloid plaques in deep brain of Alzheimer’s disease mouse model. ACS Chemical Neuroscience. 9 (12), 3128-3136 (2018).
  10. Gasecka, P., Balla, N. K., Sison, M., Brasselet, S. Lipids-fluorophores interactions probed by combined nonlinear polarized microscopy. The Journal of Physical Chemistry B. 125 (50), 13718-13729 (2021).
  11. Mojzisova, H., et al. Polarization-sensitive two-photon microscopy study of the organization of liquid-crystalline DNA. Biophysical Journal. 97 (8), 2348-2357 (2009).
  12. Olesiak-Banska, J., et al. Liquid crystal phases of DNA: Evaluation of DNA organization by two-photon fluorescence microscopy and polarization analysis. Biopolymers. 95 (6), 365-375 (2011).
  13. Olesiak-Banska, J., et al. Gold nanorods as multifunctional probes in a liquid crystalline DNA matrix. Nanoscale. 5 (22), 10975-10981 (2013).
  14. Grelich-Mucha, M., Lipok, M., Różycka, M., Samoć, M., Olesiak-Bańska, J. One- and two-photon excited autofluorescence of lysozyme amyloids. The Journal of Physical Chemistry Letters. 13 (21), 4673-4681 (2022).
  15. Brasselet, S., Mély, Y., Duportail, G., et al. . Fluorescent Methods to Study Biological Membranes. , 311-337 (2013).
  16. Krebs, M. R., et al. The formation of spherulites by amyloid fibrils of bovine insulin. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101 (40), 14420-14424 (2004).
  17. Aït-Belkacem, D., Gasecka, A., Munhoz, F., Brustlein, S., Brasselet, S. Influence of birefringence on polarization resolved nonlinear microscopy and collagen SHG structural imaging. Optics Express. 18 (14), 14859-14870 (2010).
  18. Schön, P., Munhoz, F., Gasecka, A., Brustlein, S., Brasselet, S. Polarization distortion effects in polarimetric two-photon microscopy. Optics Express. 16 (25), 20891-20901 (2008).
  19. Svoboda, K., Yasuda, R. Principles of two-photon excitation microscopy and its applications to neuroscience. Neuron. 50 (6), 823-839 (2006).
  20. Zipfel, W. R., Williams, R. M., Webb, W. W. Nonlinear magic: multiphoton microscopy in the biosciences. Nature Biotechnology. 21 (11), 1369-1377 (2003).
  21. Ferrand, P., et al. Ultimate use of two-photon fluorescence microscopy to map orientational behavior of fluorophores. Biophysical Journal. 106 (11), 2330-2339 (2014).
  22. Chipman, R. A. Depolarization index and the average degree of polarization. Applied Optics. 44 (13), 2490-2495 (2005).
  23. de Reguardati, S., Pahapill, J., Mikhailov, A., Stepanenko, Y., Rebane, A. High-accuracy reference standards for two-photon absorption in the 680–1050 nm wavelength range. Optics Express. 24 (8), 9053-9066 (2016).
  24. Mansfield, J. C., Mandalia, V., Toms, A., Winlove, C. P., Brasselet, S. Collagen reorganization in cartilage under strain probed by polarization sensitive second harmonic generation microscopy. Journal of The Royal Society Interface. 16 (150), 20180611 (2019).
  25. Duboisset, J., Aït-Belkacem, D., Roche, M., Rigneault, H., Brasselet, S. Generic model of the molecular orientational distribution probed by polarization-resolved second-harmonic generation. Physical Review A. 85 (4), 043829 (2012).
  26. Loksztejn, A., Dzwolak, W. Chiral Bifurcation in aggregating insulin: an induced circular dichroism study. Journal of Molecular Biology. 379 (1), 9-16 (2008).

Play Video

Cite This Article
Lipok, M., Obstarczyk, P., Olesiak-Bańska, J. Polarization-Sensitive Two-Photon Microscopy for a Label-Free Amyloid Structural Characterization. J. Vis. Exp. (199), e65670, doi:10.3791/65670 (2023).

View Video