Op maat gemaakte micro-drives maken het mogelijk om corticale opnameplaatsen op submillimeters te richten met lineaire siliciumarrays.
De zijdeaap biedt een ideaal model voor het onderzoeken van laminaire corticale circuits vanwege het gladde corticale oppervlak, dat opnames met lineaire arrays mogelijk maakt. Het zijdeaapje is de laatste tijd in populariteit gegroeid vanwege de vergelijkbare neurale functionele organisatie als andere primaten en de technische voordelen voor opname en beeldvorming. Neurofysiologie in dit model brengt echter een aantal unieke uitdagingen met zich mee vanwege het kleine formaat en het ontbreken van gyri als anatomische oriëntatiepunten. Met behulp van op maat gemaakte microaandrijvingen kunnen onderzoekers de plaatsing van lineaire arrays manipuleren tot op de millimeter nauwkeurig en betrouwbaar opnemen op dezelfde retinotopisch gerichte locatie gedurende opnamedagen. Dit protocol beschrijft de stap-voor-stap opbouw van het micro-drive positioneringssysteem en de neurofysiologische opnametechniek met silicium lineaire elektrode-arrays. Met nauwkeurige controle van de plaatsing van de elektroden tijdens opnamesessies, kunnen onderzoekers gemakkelijk de cortex doorkruisen om interessegebieden te identificeren op basis van hun retinotopische organisatie en de afstemmingseigenschappen van de geregistreerde neuronen. Verder is het met behulp van dit laminaire array-elektrodesysteem mogelijk om een stroombrondichtheidsanalyse (CSD) toe te passen om de opnamediepte van individuele neuronen te bepalen. Dit protocol demonstreert ook voorbeelden van laminaire opnames, waaronder spike-golfvormen geïsoleerd in Kilosort, die meerdere kanalen op de arrays overspannen.
Het zijdeaapje (Callithrix jacchus) is de laatste jaren snel in populariteit gegroeid als model om de hersenfunctie te bestuderen. Deze groeiende populariteit is te danken aan de toegankelijkheid van de gladde cortex van het zijdeaapje, de overeenkomsten in neurale functionele organisatie met mensen en andere primaten, en het kleine formaat en de snelle voortplantingssnelheid1. Naarmate dit modelorganisme in populariteit is gegroeid, is er een snelle ontwikkeling geweest in de neurofysiologische technieken die geschikt zijn voor gebruik in de hersenen van zijdeaapjes. Elektrofysiologische methoden worden veel gebruikt in de neurowetenschappen om de activiteit van afzonderlijke neuronen in de cortex van zowel knaagdieren als primaten te bestuderen, wat resulteert in een ongeëvenaarde temporele resolutie en locatietoegang. Vanwege de relatieve nieuwheid van de zijdeaap als model van visuele neurowetenschappen, is de optimalisatie van wakkere elektrofysiologische technieken nog steeds in ontwikkeling. Eerdere studies hebben aangetoond dat er robuuste protocollen zijn opgesteld voor elektrofysiologie in verdoofde preparaten2, en vroege neurofysiologische studies die wakker zijn, hebben de betrouwbaarheid van eenkanaals wolfraamelectodes aangetoond3. In de afgelopen jaren hebben onderzoekers het gebruik van op silicium gebaseerde micro-elektrode-arrays vastgesteld voor wakkere neurofysiologie4. De zijdeaap vormt echter unieke uitdagingen voor het richten vanwege zijn kleine hersenomvang en het ontbreken van anatomische oriëntatiepunten. Dit protocol schetst hoe een micro-drive-opnamesysteem kan worden gebouwd en gebruikt dat geschikt is voor het zijdeaapje en dat het mogelijk maakt om grote populaties neuronen op te nemen met lineaire arrays van silicium terwijl minimale weefselschade wordt veroorzaakt.
Het werken met het zijdeaapje vormt een uitdaging vanwege de kleinere schaal van de retinotopische kaarten in de visuele cortex in vergelijking met grotere primaten. Een kleine verschuiving van de elektroden met slechts 1 mm kan leiden tot aanzienlijke veranderingen in de kaarten. Bovendien moeten onderzoekers vaak de plaatsing van de elektroden tussen de opnamesessies wijzigen om een breder scala aan retinotopische posities in de visuele cortex te verkrijgen. De huidige semi-chronische preparaten maken het niet mogelijk om de elektrodepositionering dagelijks of met voldoende precisie aan te passen om specifieke locaties op submillimeterschalen aan te passen5. Met dit in gedachten maakt het voorgestelde micro-drive-systeem gebruik van een X-Y-elektrodetrap die een lichtgewicht microdrive op een opnamekamer monteert en het mogelijk maakt om corticale plaatsen op submillimeters te richten. De beweegbare X-Y-trapcomponenten maken verticale en horizontale beweging van de lineaire array mogelijk om de corticale gebieden systematisch te doorkruisen, wat nodig is om interessegebieden te identificeren (via retinotopie en afstemmingseigenschappen). Tijdens opnamesessies kunnen onderzoekers de X-Y-fase ook handmatig aanpassen om de beoogde locaties binnen het gebied te verschuiven. Dit is een belangrijk voordeel ten opzichte van alternatieve technieken waarbij gebruik wordt gemaakt van semi-chronische opnamepreparaten, die geen gemakkelijke mechanismen voor het richten van elektroden hebben.
De micro-drive is een veelzijdig hulpmiddel waarmee verschillende siliciumarrays kunnen worden bevestigd om in de cortex te worden neergelaten. In dit protocol werd een aangepaste sonde met twee 32-kanaals lineaire arrays op een afstand van 200 μm uit elkaar gebruikt voor het onderzoek van laminaire circuits die de corticale diepte overspannen. De meeste methoden voor het onderzoeken van de neurale circuits bemonsteren meestal de elektrische potentialen of afzonderlijke eenheden gemiddeld over alle lagen van de hersenschors. Recent onderzoek heeft echter intrigerende bevindingen opgeleverd over corticale laminaire microschakelingen6. Door gebruik te maken van de microaandrijving kunnen onderzoekers laminaire sondes gebruiken en fijne aanpassingen maken aan de opnamediepte om uitgebreide bemonstering over alle lagen te garanderen.
Dit systeem kan worden geconstrueerd met in de handel verkrijgbare componenten en kan eenvoudig worden aangepast voor verschillende experimentele technieken of sondes. De belangrijkste voordelen van deze voorbereiding zijn de mogelijkheid om de X-Y-opnamepositie met submillimeterprecisie te veranderen en om de diepte van de opname in de cortex te regelen. Dit protocol bevat stap-voor-stap instructies voor het construeren van de X-Y fase micro-drive en neurofysiologische opnametechnieken.
Er zijn momenteel verschillende methoden (bijv. chronisch, semi-chronisch, acuut) beschikbaar voor het uitvoeren van neurofysiologische experimenten bij niet-menselijke primaten. De gewone zijdeaap vormt een unieke uitdaging voor neurofysiologische experimenten vanwege zijn kleine formaat en het ontbreken van gyri als anatomische oriëntatiepunten. Dit vereist dat onderzoekers neurofysiologische oriëntatiepunten gebruiken, zoals de retinotopie en afstemmingseigenschappen van interessegebieden om de opnamedoelen te ident…
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd ondersteund door de National Institutes of Health (NIH) subsidie R01 EY030998 (J.F.M., A.B. en S.C.). Deze methode is gebaseerd op methoden die zijn ontwikkeld in Coop et al. (under review, 2022; https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.10.11.511827v2.abstract). We willen Dina Graf en leden van het Mitchell-lab bedanken voor hun hulp bij de verzorging en behandeling van het zijdeaapje.
1/4 Hp burr drill bit | McMaster & Carr | Cat# 43035A32 | Carbide Bur with 1/4" Shank Diameter, Rounded Cylinder Head, trade Number SC-1, single Cut(https://www.mcmaster.com/products/bur-bits/burs-7/?s=1%2F4%22+bur+bits) |
1x1mm Crist Grid | Crist Instruments | 1 mm x 1 mm Grid | https://www.cristinstrument.com/products/implant-intro/grids |
91% isopropyl alcohol | Medline | N/A | https://www.medline.com/product/Medline-Isopropyl-Rubbing-Alcohol/Bulk-Alcohol/Z05-PF03807?question=91%25%20isopropyl%20alcohol |
Acquisition Board | Open-Ephys | N/A | https://open-ephys.org/acquisition-system/eux9baf6a5s8tid06hk1mw5aafjdz1 |
Bacitracin Ointment | Medline: Cosette Pharmaceuticals Inc | N/A | https://www.medline.com/product/Bacitracin-Ointment/Antibiotics/Z05-PF86957?question=bacitr |
Blunt straight Forceps | Medline | N/A | https://www.medline.com/category/Central-Sterile/Surgical-Instruments/Forceps/Z05-CA16_02_20/products |
Bone wax | Medline | ETHW31G | https://www.medline.com/product/Ethicon-Bone-Wax/Bone-Wax/Z05-PF61528?question=bonewax |
C&B Metabond Quick Adhesive Cement System | Parkell, Inc. | SKU: S380 | https://www.parkell.com/C-B-Metabond-Quick-Adhesive-Cement-System |
Clavamox | MWI Animal Health | N/A | |
Contact lens solution | Bausch and lomb | Various sources available | |
Custom Printed 3D printed parts | ProtoLab | https://marmolab.bcs.rochester.edu/resources.html | |
DB25-G2 25 Pin Male Plug Port Signal Connector | Various Sources | DB25-G2 25 | DB25-G2 25 Pin Male Plug Port Signal 2 Row Terminal Breakout Board Screw Nut Connector |
diamond saw attachement for dremmel | Dremmel | 545 Diamond Wheel | https://www.dremel.com/us/en/p/545-26150545ab |
Digitizing Head-stages | Intan | RHD 32channel (Part #C3314) | https://intantech.com/RHD_headstages.html?tabSelect=RHD32ch&yPos=120.80 000305175781 |
EDOT | Sigma Aldrich | Product # 483028 | https://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/aldrich/483028 |
Helping Hands | Harbor Freight | N/A | https://www.harborfreight.com/helping-hands-60501.html |
Hook Electrical Clips | Various Sources | N/A | Hook test Cable wires |
Interface Cables (RHD 3-ft (0.9 m) ultra thin SPI cable) | Intan | Part #C3213 | https://intantech.com/RHD_SPI_cables.html |
Lab jack | Various Sources | N/A | https://www.amazon.com/Stainless-Steel-Scissor-Stand-Platform/dp/B07T8FM85H/ref=asc_df_B07T8FM85H/?tag=&linkCode=df0&hvadid=366343 827267&hvpos=&hvnetw=g&hvrand =2036619536500717246&hvpone =&hvptwo=&hvqmt=&hvdev=c&hv dvcmdl=&hvlocint=&hvlocphy=900 5674&hvtargid=pla-795933567991& ref=&adgrpid=71496544770&th=1 |
Meloxicam | MWI Animal Health | N/A | |
Micro-drive | Crist Instrument | 3-NRMD | https://www.cristinstrument.com/products/microdrives/miniature-microdrive-3-nrmd |
Multi-channel linear silicon arrays with 64 channel connector | NeuroNexus | A1x32-5mm-25-177 | https://www.neuronexus.com/products/electrode-arrays/up-to-10-mm-depth/ |
NanoZ Omentics Adapter- 32 Channel | NeuraLynx | ADPT-NZ-N2T-32 | https://neuralynx.com/hardware/adpt-nz-n2t-32 |
NanoZ System | Plexon | NanoZ Impedence Tester | https://plexon.com/products/nanoz-impedance-tester/ |
Narishige Micromanipulator | Narishige | Stereotaxic Micromanipulator | https://usa.narishige-group.com/ |
Open-Ephys GUI | Open-Ephys | https://open-ephys.org/ | |
Polyimide Tubing (OD(in): 0.021 / ID(in) 0.018 ) | Various Sources (Chamfr) | Chamfr Cat#HPC01895 | https://chamfr.com/sellers/teleflex-medical-oem-llc/ |
Primate Chair | Custom made by University of Rochester Machine Shop | Designs online | https://marmolab.bcs.rochester.edu/resources.html |
Poly(sodium 4-styrenesulfonate) (PSS) | Sigma Aldrich | Product # 243051 | https://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/aldrich/243051 |
RHD USB Interface board | Intan | RHD2000 Evaluation Board Version 1.0 | https://intantech.com/RHD_USB_interface_board.html |
Silastic gel | World Precision Instuments | # KWIK-SIL | Low Toxicity Silicone Adhesive ((https://www.wpiinc.com/kwik-sil-low-toxicity-silicone-adhesive) |
Slow release buprenorphine | Compounding Pharmacy | ||
Stainless steel wire 36 gauge | McMaster & Carr | Cat# 6517K11 | Round Bend-and-Stay Multipurpose 304 Stainless Steel Wire, Matte Finish, 1-Foot Long, 0.008" Diameter |
Stanley 6-Piece Precision Screwdriver Set | Stanley | 1.4mm flathead screwdriver | https://www.amazon.com/Stanley-Tools-6-Piece-Precision-Screwdriver/dp/B076621ZGC/ref=sr_1_3?crid=237VSK5FNFP9N&keywords= stanley+66-052&qid=1672764369&sprefix= stanley+66-052%2Caps%2C90&sr=8-3 |
Steel Screws | McMaster & Carr | type 00 stainless steel hex screws and 1/8” in length | https://www.mcmaster.com/ |
Steel Tube | McMaster & Carr | 28 gauge stainless steel tubing | https://www.mcmaster.com/tubing/multipurpose-304-stainless-steel-6/id~0-055/ |
Superglue | Loctite | SuperGlue Gel Control | https://www.loctiteproducts.com/en/products/fix/super-glue/loctite_super_gluegelcontrol.html |