В этом отчете представлены протоколы сборки, культивирования клеток и анализов на платформе μSiM для построения моделей гематоэнцефалического барьера.
microSiM (μSiM) представляет собой мембранную культуральную платформу для моделирования гематоэнцефалического барьера (ГЭБ). В отличие от традиционных мембранных платформ, μSiM предоставляет экспериментаторам новые возможности, включая визуализацию живых клеток, беспрепятственную паракринную передачу сигналов между камерами крови и мозга, а также возможность прямой визуализации иммунофлуоресценции без необходимости извлечения/перемонтажа мембран. В данной работе мы демонстрируем базовое использование платформы для создания монокультурных (эндотелиальные клетки) и кокультуральных (эндотелиальные клетки и перициты) моделей ГЭБ с использованием ультратонких нанопористых мембран из нитрида кремния. Мы продемонстрировали совместимость как с первичными клеточными культурами, так и с культурами индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека (ИПСК). Представлены методы качественного анализа моделей ГЭБ методом иммунофлуоресцентного окрашивания и продемонстрировано использование μSiM для количественной оценки барьерной функции в анализе проницаемости малых молекул. Предоставленные методы должны позволить пользователям создавать свои барьерные модели на платформе, продвигая использование технологии тканевых чипов для изучения тканей человека.
Живые ткани разделены специализированными клетками, которые создают и поддерживают барьеры и регулируют, какие клетки и молекулы транспортируются из одного отсека в другой. Неправильная регуляция барьерных функций может быть источником как острых, так и хронических заболеваний. Гематоэнцефалический барьер (ГЭБ) является наиболее рестриктивным тканевым барьером в организме человека1. Дисфункция ГЭБ лежит в основе широкого спектра заболеваний центральной нервной системы (ЦНС), включая болезнь Альцгеймера2, болезнь Паркинсона3,4 и рассеянный склероз 5,6. Повреждение ГЭБ также связано с долгосрочными когнитивными нарушениями в результате острых расстройств, таких как сепсис7, COVID-198 и послеоперационный делирий9. Разработка лекарств с потенциалом для лечения заболеваний головного мозга была удручающе трудной задачей из-за проблемы преднамеренного нарушения ГЭБ для доставки биологически активных молекул к мишенямв мозге. По этим причинам методы изучения функции ГЭБ in vitro имеют первостепенное значение для понимания и лечения заболеваний ЦНС.
Основные методы измерения барьерной функции in vitro включают создание монослоя или кокультуры на полупроницаемой мембране и измерение сопротивления, придаваемого клетками либо диффузии малых молекул, либо небольшим электрическим токам. Несмотря на то, что появление микрофизиологических систем (МПС) привело к обилию вариантов моделирования ГЭБ в 3D15,16, разнообразие геометрий систем затрудняет сравнение измерений проницаемости между МПС или установленными литературными значениями. Установление достоверных исходных значений особенно важно в исследованиях ГЭБ, где из-за обширной барьерной регуляции эндотелиальными клетками сосудов головного мозга значения проницаемости in vitro тщательно изучаются12,17,18. По этим причинам измерения проницаемости в монослоях, установленных на 2D-мембранах, останутся основным элементом исследований ГЭБ в течение многих лет. Это справедливо и для других тканевых барьеров, включая эпителиальные барьеры, где абсолютные значения исходной проницаемости используются для валидации и сравнения моделей in vitro 19,20,21.
С целью создания нового ценного инструмента для исследовательского сообщества BBB, мы представили22 и усовершенствовали 23,24,25,26 микроустройствос платформойSilicon membrane (μSiM) для использования в моделировании барьерных тканей в течение последних 5 лет. Отличительной особенностью платформы является ультратонкая (толщиной <100 нм) мембрана с сотнями миллионов нанопор 27,28 или смесь нанопор и микропор29. Отдельно стоящие мембранные чипы производятся на кремниевом «чипе» размером 300 мкм, который стабилизирует ультратонкие структуры30 и позволяет использовать пинцет для сборки устройства. Из-за своей ультратонкой природы мембраны имеют проницаемость, которая на два порядка выше, чем у обычных мембран с трековым травлением, используемых в коммерческих мембранных установках для культивирования мембран31,32. На практике это означает, что препятствие мембраны для диффузии молекул меньшего размера, чем нанопоры (<60 нм), ничтожно мало33. Таким образом, для клеточных барьеров только клетки и матрицы, которые они депонируют, будут определять скорость транспорта малых молекул из апикальных в базальные компартменты, разделенные мембраной34. Конструкция прибора и ультратонкая природа мембран также обеспечивают множество преимуществ для оптической микроскопии. К ним относятся: 1) возможность наблюдения за живыми культурами с помощью фазового контраста или визуализации яркого поля, 2) способность флуоресцентного окрашивания и изображения in situ без необходимости извлечения и переноса мембраны на покровное стекло, и 3) тот факт, что мембраны тоньше, чем конфокальные «срезы», так что прямые кокультуры имеют более естественное расстояние между типами клеток, чем это может быть достигнуто с помощью мембран толщиной 6-10 мкм с трековым травлением.
Совсем недавно мы перевели платформу в модульный формат, чтобы облегчить быструю сборку34 и настройку35,36. Мы использовали модульный формат для распределения компонентов устройств между нашими биоинженерными и сотрудничающими лабораториями мозгового барьера. Затем мы совместно разработали протоколы для сборки устройств, монокультуры и совместного культивирования, иммунофлуоресцентного окрашивания и проницаемости малых молекул и показали, что эти методы воспроизводимы в разных лабораториях. Используя эти протоколы, мы также показали, что модульная платформа поддерживает валидированный ГЭБ, разработанный с использованием метода расширенного эндотелиального культивирования (EECM) для создания микрососудистых эндотелиальных клеток головного мозга (BMEC) из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека (ИПСК)37. Цель настоящего отчета состоит в том, чтобы более подробно рассмотреть эти методы и с помощью сопроводительного видео способствовать более широкому внедрению платформы в сообществе BBB.
Несмотря на то, что мембранная стружка была разработана для обеспечения стабильности, она может треснуть или сломаться при неправильном обращении во время сборки. Таким образом, очень важно захватить стружку в выемках пинцета для стружки и аккуратно поместить ее в приспособление. При обращении с устройствами в целом необходимо соблюдать особые меры предосторожности, чтобы не ударить и не уронить устройства. Во время приклеивания микросхемы мембраны к приспособлению А1 стружка должна быть уложена ровно и отцентрирована на стойке приспособления А1, чтобы избежать растрескивания мембраны во время присоединения к компоненту 1. Кроме того, после снятия защитных масок следует избегать любого контакта с открытыми слоями PSA. При работе с компонентом 2 после снятия защитной маски рекомендуется держать его вдоль края компонента и пинцетом захватывать треугольник, свободный от PSA.
В то время как протоколы культивирования клеток были описаны для возможных моделей ГЭБ, описанная здесь модель кокультуры ГЭБ BMEC/перицитов может быть достаточной или недостаточной в зависимости от физиологического контекста и интересующих вопросов. Например, транспорт иммунных клеток в основном происходит в посткапиллярных венулах головного мозга41,42. В этих областях периваскулярное пространство отделяет барьер BMEC/перицитов от глиальных ограничителей, устанавливаемых астроцитами. Таким образом, в посткапиллярных венулах нервно-сосудистая единица (НВУ) состоит из двух физически разделенных барьеров, соединенных последовательно, и астроцитарные концевые ножки не контактируют непосредственно с гематобарьером BMEC/перицитами, что хорошо представлено в современной модели. Если целью является модель NVU, учитывающая влияние факторов, секретируемых астроцитами, на гематоэнцеатный барьер, то к устройству можно добавить компартмент астроцитов, который обеспечивает обмен растворимыми факторами через периваскулярное пространство. Этот пример был проиллюстрирован ранее, и его можно было бы расширить, включив в него другие клетки, такие как микроглия и нейроны в трехмерном «мозговом» отсеке. Модульная архитектура платформы позволяет использовать простые стратегии сборки для достижения этих реконфигураций, чтобы платформа была настолько простой или сложной, насколько это необходимо для решения имеющихся гипотез. Настройка каждой клеточной культуры; Тем не менее, он должен быть оптимизирован для новых клеточных линий и мультикультур. Например, из-за свойств мембран из нитрида кремния может потребоваться корректировка растворов для покрытия по сравнению с планшетами для культур тканей. Включение фибронектина, как правило, способствует прикреплению клеток и выживанию. Кроме того, пользователи могли культивировать эндотелиальные клетки и перициты в противоположных направлениях. В этом случае может потребоваться изменение, например, способа выполнения и интерпретации измерений проницаемости. Однако описание шагов для этого типа культуры выходит за рамки данной статьи.
Еще одной проблемой, с которой можно столкнуться при культивировании клеток, является быстрое испарение среды, поскольку устройства могут быть более чувствительны к изменениям в окружающей среде по сравнению со стандартными планшетами и колбами для культивирования тканей. Если наблюдается избыточное испарение или замедление роста клеток, необходимо измерить все критические параметры инкубатора, чтобы обеспечить точные настройки. В тканевый колпачок или маленькую чашку Петри, помещенную внутрь камеры для культивирования клеток, можно добавить больше воды, или заменить среду более часто. Далее пузырьки могут попасть в нижний канал и застрять в траншее для траншейных устройств. Хотя их можно удалить, проще всего избежать добавления пузырьков в первую очередь. Для этого важно убедиться в отсутствии пузырьков в наконечнике пипетки или воздухе на конце наконечника для пипетки перед подачей питательной среды в нижнюю камеру. Кроме того, испарение среды в канале может привести к образованию зазора между поверхностью среды и верхней частью порта. Небольшой объем среды может быть пипетирован в один порт до тех пор, пока среда не достигнет поверхности противоположного порта, после чего среда может быть заменена в этом противоположном порту. В то время как среды hECSR и E6 + 10% FBS не следует нагревать на водяной бане, другие среды можно предварительно нагреть, чтобы уменьшить образование пузырьков. Если пузырь все-таки попадет в нижнюю камеру, его можно удалить, быстро пипетируя 100 мкл через канал. Однако этот метод может привести к загрязнению между камерами или разливу среды по поверхности устройства. Это также может привести к нарушению клеточных слоев. В качестве альтернативы можно сначала удалить среду из канала, а затем снова ввести ее объемом 50 мкл. Однако предварительное удаление носителя может привести к образованию пузырьков в канале. Если пузырь находится не непосредственно под областью мембраны, его можно оставить в канале, не оказывая влияния на культуру клеток.
Прикрепление и рост перицитов, как показано на рисунке 2, может быть сложной задачей. Использование оптимизированной плотности посева имеет важное значение для формирования слоя с физиологически релевантным соотношением перицитов и эндотелиальных клеток. Кроме того, поскольку перициты чувствительны к сдвигу, все обмены средами в канале должны происходить очень медленно, чтобы защитить клетки. Для культуры АЖЖХ улучшенное прикрепление может быть достигнуто путем покрытия нижней камеры коллагеном IV типа 800 мкг/мл или фибронектином 100 мкг/мл.
Иммуноцитохимия в описанных здесь устройствах позволяет качественно анализировать здоровье и функцию клеток. Методы окрашивания в планшетах для культуры тканей или других платформах должны быть непосредственно перенесены на платформу. Для культивирования клеток только в верхней камере, после фиксации, PBS может быть добавлен в нижнюю камеру и оставлен на оставшиеся этапы, при этом блокировка и окрашивание выполняются только в верхней камере. Это сводит к минимуму риски разрыва мембран или попадания пузырьков в нижнюю камеру. Для совместного окрашивания мы рекомендуем использовать обе камеры на всех этапах. Важно отметить, что вязкость фиксатора и PBS отличается от вязкости среды. Таким образом, может быть легче добавлять пузырьки в нижнюю камеру, и перед пипеткой в нижнюю камеру следует проявлять особую осторожность при проверке наконечников дозатора на наличие воздуха на конце наконечника.
Протокол, описанный для анализа проницаемости малых молекул, позволяет функционально и количественно оценить барьерную функцию эндотелиальных клеток, культивируемых в устройстве μSiM. Одной из проблем, с которой можно столкнуться во время этого анализа, является попадание пузырьков воздуха в пипетку во время отбора образца из нижнего канала на этапе протокола 4.1.7.4. Чтобы избежать этой проблемы, важно убедиться, что наконечник запечатан в порту перед началом отбора пробы, и образец не должен быть взят слишком быстро. Если это не решит проблему, размер используемых наконечников может быть слишком маленьким или слишком большим, чтобы поместиться в порты; воспользуйтесь советами, перечисленными в Таблице материалов. Если при измерении неожиданно высоких значений проницаемости наблюдаются неожиданные высокие значения проницаемости, несмотря на то, что монослой выглядит здоровым, необходимо проверить целостность монослоя на предмет нарушения во время отбора пробы. Мы рекомендуем всегда проверять монослой под микроскопом сразу после взятия образца. Если монослой все еще выглядит неповрежденным и здоровым, образец можно зафиксировать и оценить биологические маркеры барьерной функции, например, с помощью иммуноокрашивания соединительных белков. И наоборот, если измеряются неожиданно низкие значения проницаемости, важно убедиться, что из нижнего канала отбирается 50 мкл среды без каких-либо пузырьков воздуха. Если среда выходит из отверстия для отбора проб сразу после установки наконечника резервуара, эта среда должна быть собрана до установки пипетки в отверстие для отбора проб, так как большая часть флуоресцентной малой молекулы будет присутствовать в начальном объеме 10 мкл, отобранном из нижнего канала. Рисование кругов вокруг портов с помощью гидрофобного пера или размещение гидрофобной ленты с отверстием вокруг порта предотвращает распространение пассивно перекачиваемой среды. Если во время отбора проб удаляются пузырьки или не удаляется полная проба объемом 50 мкл, образец не должен использоваться. В качестве альтернативы можно определить точный объем и использовать его при расчете проницаемости; однако это следует делать только в том случае, если удаляемый объем составляет ≥40 мкл, что соответствует ~98-99% извлечения красителя34.
The authors have nothing to disclose.
J.L.M., B.E., T.R.G., M.C.M., P.K., M.T., K.C. и L.W. были профинансированы грантом NIH R33 HL154249. J.L.M. финансировался R44 GM137651. M.M. был профинансирован Программой Шмидта Института неврологии Дель Монте Университета Рочестера. M.T. финансировался RF1 AG079138. K.C. финансировался Международным фондом этических исследований.
Antibodies | |||
CD31 Polyclonal antibody | Thermo Fisher Scientific | PA5-32321 | |
Claudin-5 mouse IgG antibody, 4C3C2 | Thermo Fisher Scientific | 35-2500 | |
Goat α-Mouse IgG Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A11001 | |
Goat α-Rabbit IgG Alexa Fluor 568 | Thermo Fisher Scientific | A11011 | |
Hoechst 33342 | Life Technologies | H3570 | |
NG2, mouse IgG2a, 9.2.27 | Millipore | MAB2029 | |
Occludin mouse IgG antibody, OC-3F10 | Thermo Fisher Scientific | 33-1500 | |
PDGFRβ, rabbit IgG antibody, 28E1 | Cell Signaling Technology | 3169 | |
VE-cadherin mouse IgG2B Clone # 123413 | R&D Systems | MAB9381 | |
ZO-1 rabbit IgG antibody, polyclonal | Thermo Fisher Scientific | 40-2200 | |
Chemicals, peptides, and recombinant proteins | |||
100% Methanol | VWR | 101443-718 | Can be substituted with similar products |
16% Paraformaldehyde | Thermo Fisher Scientific | 28908 | Can be substituted with similar products |
Accutase | Thermo Fisher Scientific | A1110501 | |
Acetic acid | Sigma-Aldrich | 695092 | |
B27 supplement | Thermo Fischer Scientific | 17504044 | |
bFGF | R&D Systems | 233-FB-025 | |
Collagen IV from human placenta | Sigma-Aldrich | C5533 | |
Collagen, Type I solution from rat tail | Sigma-Aldrich | C3867-1VL | Can be substituted with similar products |
DMEM/Ham’s F12 | Thermo Fisher Scientific | 11320033 | |
EGM-2 Endothelial Cell Growth Medium-2 BulletKit | Lonza | CC-3162 | |
Essential 6 medium | Thermo Fisher Scientific | A1516401 | |
Fetal bovine serum (FBS) | Peak Serum | PS-FB1 | |
Fibronectin from bovine plasma | Sigma-Aldrich | F1141 | |
Fibronectin human protein, plasma | ThermoFisher Scientific | 33016015 | Can be substituted with similar products |
hESFM | Thermo Fisher Scientific | 11111044 | |
Lucifer Yellow CH dilithium salt | Sigma-Aldrich | 861502 | |
Normal goat serum | Thermo Fisher Scientific | 500627 | Can be substituted with similar products |
PBS without calcium, magnesium | Cytiva | SH30256.01 | Can be substituted with similar products |
Pericyte Medium | ScienCell | 1201 | Use complete kit (includes supplements) |
Poly-L-Lysine, 10 mg/mL | ScienCell | 0413 | |
Triton X-100 | JT Baker | X198-05 | Can be substituted with similar products |
UltraPure DNase/RNase-Free Distilled Water | Invitrogen™ | 10977015 | Can be substituted with similar products |
Experimental models: Cell lines | |||
Blood-brain barrier hCMEC/D3 cell line | Sigma-Aldrich | SCC066 | |
Human brain vascular pericytes | ScienCell | 1200 | |
iPS(IMR90)-4 human induced pluripotent stem cells | WiCell | RRID:CVCL_C437 | |
Glassware and Plasticware | |||
150 mm TC-treated Cell Culture Dish with 20 mm Grid | Falcon | 353025 | |
Clamps | VWR | MFLX06832-10 | |
Corning tissue culture plates (6-well) | Corning | 3506 | |
Flat 96-well non-binding microplates | Greiner Bio-One | 655900 | |
Microscope Slide Device Holder | SiMPore | USIM-SB | Dimensions compatible with micropscope slide holders |
Nunc 15 mL Conical Sterile Polypropylene Centrifuge Tubes | Thermo Fischer Scientific | 339651 | |
Nunc 50 mL Conical Sterile Polypropylene Centrifuge Tubes | Thermo Fischer Scientific | 339653 | Tube caps can be filled with water for cell culture |
P20-200 pipette tips | VWR | 76322-516 | Alternate brands may not seal as effectively into ports |
Transwell filters (12 well, 12 mm, 0.4 μm pore size, PC) | CoStar | 3401 | |
Instruments | |||
10X Objective (For Andor) | Nikon Instruments Inc. | MRD00105 | Air; WD: 4 mm; NA 0.45 |
10X Objective (For Nikon) | Nikon Instruments Inc. | MRP40102 | Air; WD: 6.2 mm; NA 0.25 |
40X Objective (LWD) (For Andor) | Nikon Instruments Inc. | MRD77410 | Water immersion; WD: 590-610 mm; NA 1.15 |
Andor Spinning Disc Confocal microscope | Oxford Instruments, Andor | ||
Nikon Eclipse Ts2 Phase Contrast Microscope | Nikon Instruments Inc. | Can be substituted with similar products | |
TECAN Infinite M200 | TECAN | Can be substituted with similar products | |
Other | |||
Advanced PAP Pen | Millipore Sigma | Z672548 | 2 mm tip is recommended |
Assembly kit with fixtures | SiMPore | USIM-JIGSET | Including fixure A1, A2, B1, and B2 |
Camera Adapter for Microscopes | AmScope | CA-CAN-SLR Canon SLR / D-SLR | Φ23.2 – Φ30 adapter fits Nikon Eclipse Ts2 |
Canon EOS Rebel SL3 DSLR Camera | Canon | EOS 250D, BH #CAEDRSL3B, MFR #3453C001 | Can be substituted with similar products |
Cell strainer, 40 µm | Millipore Sigma (Corning) | CLS431750 | |
Component 1 | SiMPore | USIM-C1 | |
Component 2 | SiMPore | USIM-C2 | |
Membrane chips | SiMPore | NPSN100-1L | Other chips formats are available |
SMD handling tweezer double angle | Techni-Tool | 758TW003 | "Chip Tweezers" |
Stainless steel precision type GG tweezer | Techni-Tool | 758TW534 | "Straight Tweezers" |
Software | |||
Fiji | ImageJ | For image processing | |
Fusion | Oxford Instruments, Andor | Instructions for version 2.3.0.44 | |
i-control | TECAN | Instructions for version 2.0 | |
Imaris | Oxford Instruments | For image processing. Instructions for version 9.9.0 |