Describimos un protocolo para aislar criptas murinas del intestino delgado y cultivar organoides 3D intestinales de las criptas. Además, describimos un método para generar organoides a partir de una sola célula madre intestinal en ausencia de un nicho celular subepitelial.
En la actualidad, el cultivo de organoides representa una herramienta importante para los estudios in vitro de diferentes aspectos biológicos y enfermedades en diferentes órganos. Las criptas murinas del intestino delgado pueden formar organoides que imitan el epitelio intestinal cuando se cultivan en una matriz extracelular 3D. Los organoides están compuestos por todos los tipos de células que cumplen diversas funciones homeostáticas intestinales. Estos incluyen células de Paneth, células enteroendocrinas, enterocitos, células caliciformes y células de penacho. Se agregan moléculas bien caracterizadas al medio de cultivo para enriquecer las células madre intestinales (ISC) marcadas con repeticiones ricas en leucina que contienen el receptor 5 acoplado a proteína G y se utilizan para impulsar la diferenciación en linajes específicos; estas moléculas incluyen el factor de crecimiento epidérmico, Noggin (una proteína morfogenética ósea) y R-spondin 1. Además, también se detalla un protocolo para generar organoides a partir de un único ISC positivo para el receptor hepatocelular B2 (EphB2) productor de eritropoyetina. En este artículo de métodos, se describen técnicas para aislar criptas del intestino delgado y un solo ISC de los tejidos y garantizar el establecimiento eficiente de organoides.
Los organoides intestinales, que se establecieron por primera vez en 2009, se han convertido en una poderosa herramienta in vitro para estudiar la biología intestinal dada su similitud morfológica y funcional con los tejidos maduros. Recientemente, los avances tecnológicos en organoides cultivados derivados de células madre de tejido adulto han permitido el cultivo a largo plazo de células madre intestinales (ISC) con potencial de autorrenovación y diferenciación. Estos organoides han sido ampliamente utilizados para estudios de investigación básica y traslacional sobre fisiología gastrointestinal y fisiopatología 1,2,3,4,5,6. Los organoides 3D desarrollados por el grupo Clevers proporcionan una poderosa herramienta para estudiar el epitelio intestinal con mayor relevancia fisiológica7. Dado que los organoides intestinales se derivan de células madre tisulares y están compuestos de múltiples tipos de células, recapitulan la funcionalidad del epitelio intestinal. Cabe destacar que una célula madre 5-positiva (Lgr5+) del receptor acoplado a proteínas G que contiene repeticiones ricas en leucina también puede generar organoides 3D sin células de Paneth o un nicho ISC como el nicho epitelial o el nicho estromal7. Sin embargo, la capacidad de formación de organoides de las células Lgr5+ de un solo ordenamiento es baja en comparación con las de las criptas y los dobletes de células ISC-Paneth8.
Un número creciente de estudios han demostrado que los métodos de incubación del ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) o la disociación de la colagenasa causan aflojamiento en el epitelio y la liberación de criptas. Como la disociación enzimática puede tener un efecto sobre el estado celular de las criptas, generalmente se usa un método de aislamiento mecánico para disociar el tejido. Aunque la digestión mecánica es una técnica rápida, este método puede estar asociado con rendimientos de criptas inconsistentes o mala viabilidad celular9. Por lo tanto, el tratamiento con EDTA y la disociación mecánica se pueden combinar para generar mejores rendimientos de criptas. Una característica de la metodología mostrada en este artículo es el uso de agitación vigorosa de los fragmentos de tejido después de la quelación con EDTA10. La agitación vigorosa permite el aislamiento eficiente de las criptas de los complejos cripta-vellosidades en el intestino delgado. El grado de agitación manual determina la separación. Por lo tanto, la obtención de criptas de complejos es importante para los experimentadores en este campo. Además, la habilidad adecuada puede reducir la contaminación de las vellosidades al mínimo y aumentar el número de criptas.
Por lo tanto, este protocolo experimental, que emplea organoides del intestino delgado derivados de murina, puede aislar mejor las criptas con fuerza física después del tratamiento con EDTA para la disociación. Se sabe que el patrón de expresión del receptor hepatocelular productor de eritropoyetina B2 (EphB2) refleja en parte el entorno de la cripta. Por ejemplo, las células positivas para EphB2 se organizan de abajo hacia arriba11. La clasificación celular activada por fluorescencia (FACS) se llevó a cabo en función de la expresión de EphB2, y las células obtenidas se dividieron en cuatro grupos: EphB2alta, EphB2med, EphB2baja y EphB2neg. Luego, se demostró el crecimiento de organoides de célulasaltas EphB2 de una sola clasificación en ratones de tipo salvaje (WT).
Este protocolo describe un método para aislar consistentemente criptas del intestino delgado y el posterior cultivo de organoides 3D. Para mejorar la velocidad de liberación de criptas, se estableció un método de aislamiento mecánico que implica agitación vigorosa después del tratamiento con EDTA. La composición del medio es diferente del protocolo original de Sato et al.7. El medio original es relativamente costoso. Por lo tanto, en la Tabla 1 se muestra un medio de cultivo y un medio personalizado para organoides murinos del intestino delgado que contienen inhibidores farmacológicos, factores de crecimiento recombinantes y/o medios acondicionados. Wnt3A y N-acetilcisteína no se incluyen en el medio de cultivo en este protocolo. Como las células de Paneth expresan Wnt3, las células producen Wnt3 y apoyan el mantenimiento de ISC. Además, durante el curso del aislamiento de la cripta, no se utiliza el medio acondicionado. El modelo organoide es dinámico y tiene heterogeneidad celular y estructural (células de Paneth, enterocitos, células caliciformes, células enteroendocrinas, células del mechón e ISC). Por lo tanto, estos organoides se pueden utilizar a escala para estudiar cuestiones fundamentales de la biología de los organoides.
El gradiente EphB2 mantiene el tallo ISC y la proliferación a lo largo del eje cripta-vellosidad en el intestino delgado adulto18. La ventaja de hacer organoides a partir de una sola célula EphB2 en comparación con criptas aisladas se relaciona con la comprensión de la biología de los ISC murinos, ya que los ISC desempeñan un papel clave en diversos trastornos intestinales humanos. Las ISC únicas dealta expresión de EphB2 se pueden cultivar para formar organoides de manera similar al desarrollo de organoides a partir de ISC únicas que expresan Lgr5. El paso más importante es dividir con precisión las células en cuatro grupos (EphB2alto, EphB2med, EphB2bajo y EphB2neg) de acuerdo con la expresión EphB2 en las criptas usando FACS. Los gráficos de dispersión hacia adelante frente a los laterales (FSC vs. SSC) se usan comúnmente para identificar celdas de interés en función de su tamaño y granularidad. FSC indica el tamaño de la celda, y SSC se relaciona con la complejidad o granularidad de la celda en la puerta P0 (Figura 2A). En este trabajo, las células que cayeron dentro de la puerta definida (P0) se analizaron posteriormente para determinar su viabilidad. A continuación, se determinó su viabilidad de acuerdo con las poblaciones negativas y positivas de señales de fluorescencia 7-AAD. La frontera entre las células 7-AAD-negativas y -positivas se decidió estrictamente para obtener las negativas con una contaminación celular positiva mínima. Las puertas EphB2 se establecieron aproximadamente en función de la expresión graduada EphB2.
Para confirmar que los cuatro grupos estaban divididos con precisión, se analizó la expresión de ARNm de genes seleccionados. Los niveles de ARNm de los marcadores ISC son altos en las célulasaltas de EphB220. Además, los niveles de ARNm de los marcadores específicos de células progenitoras son relativamente altos en las célulasmédicas EphB220. Sin embargo, la supresión de EphB2 en célulasEphB2 bajas y EphB2neg es baja o negativa en comparación con la de EphB2alta y EphB2med cells20. Las medidas anteriores deben tomarse para garantizar el enriquecimiento de la alta población celular de EphB2 antes del recubrimiento. Sin embargo, el crecimiento de organoides de menos del 6% de las célulasaltas de EphB2 puede deberse a la muerte de las células madre durante el proceso de cultivo, no al temblor vigoroso durante el aislamiento de la cripta. Se ha demostrado que la aplicación de un inhibidor selectivo de la quinasa asociada a Rho (ROCK) a las células madre embrionarias humanas disminuye notablemente la apoptosis inducida por disociación22. Por lo tanto, como cambio técnico, vale la pena intentar agregar el inhibidor de ROCK a una concentración más alta y con una incubación más larga para mejorar la viabilidad.
Las células de Paneth secretoras de Wnt3A junto a los ISC proporcionan un apoyo esencial a los ISC8. De hecho, los dobletes de células ISC-Paneth muestran una capacidad de formación de organoides fuertemente aumentada en comparación con las ISC individuales8. Además, se ha demostrado que la adición de Wnt3A a la concentración de 100 ng/mL durante los primeros 3 días de cultivo aumenta la capacidad formadora de organoides8. Por lo tanto, como otro cambio técnico, la adición de Wnt3A exógeno podría mejorar la capacidad de formación de organoides de ISC únicos dealta expresión de EphB2.
En comparación con los enfoques in vivo, los organoides pueden ser fácilmente utilizados para la manipulación genética, el análisis de fenotipos de malignidad y el cribado de fármacos20,23. Una combinación de quelación con EDTA y un método de aislamiento mecánico es eficaz, reproducible y eficiente en el tiempo para crear organoides del intestino delgado a partir de criptas y puede ser fácilmente seguida por el personal del laboratorio sin ninguna experiencia avanzada. Por lo tanto, la adición del aislamiento mecánico con agitación vigorosa después del tratamiento con EDTA puede establecer eficientemente organoides murinos del intestino delgado ex vivo y proporcionar una herramienta potencial para el cultivo de organoides y el modelado de enfermedades de otros tejidos epiteliales adultos.
Las células epiteliales intestinales están polarizadas y orientadas con el lado apical dirigido hacia la luz. Sin embargo, el lado apical que mira hacia la luz de los organoides 3D está en su interior. Por lo tanto, esta organización impide el acceso al lado apical, que es un problema cuando se estudian los efectos de los componentes luminales, como nutrientes, microbios y metabolitos en las células epiteliales. Para sortear esta desventaja, se ha desarrollado un cultivo de células organoides como monocapas2D 24. En términos de aplicaciones futuras, se utilizará el cultivo de monocapas de células organoides, ya que representa el sistema más eficiente y manejable.
The authors have nothing to disclose.
Este trabajo fue apoyado por Grants-in-Aid for Scientific Research (C) a T.T. (números de subvención JP17K07495 y JP20K06751). Agradecemos al Prof. Mineko Kengaku por el uso de equipos para la obtención de imágenes de lapso de tiempo a largo plazo (LCV100; Olimpo).
1.5 mL Eppendorf tube | Eppendorf | 0030 125.215 | |
5 mL syringe | TERUMO | SS-05SZ | |
15 mL Falcon tube | Iwaki | 2325-015 | |
20 μm cell strainer | Sysmex | 04-004-2325 | |
24-well plate | Iwaki | 3820-024 | |
50 mL Falcon tube | Iwaki | 2345-050 | |
60 mm tissue culture dish | FALCON | 353002 | |
70 μm cell strainer | Falcon | 352350 | |
100 mm Petri dish | Iwaki | 3020-100 | |
7-AAD | BD Biosciences | 559925 | |
Advanced DMEM/F12 | Gibco | 12634-010 | |
Alexa Fluor 568 Goat Anti-Mouse IgG (H+L) | Invitrogen | A-11004 | |
Anti-EphB2 APC-conjugated antibody | BD Biosciences | 564699 | |
C57BL6/J mice | Japan SLC, Inc. | ||
Clean bench | HITACHI | CCV-1306E | |
Confocal laser scanning microscope | Olympus | FV3000 | |
EDTA (0.5 mol/L) | Nacalai Tesque | 06894-14 | 2 mM |
FACSMelody | BD Life Sciences-Biosciences | 661762 | |
Fetal bovine serum | Sigma | 173012 | 1% (v/v) |
Fiji (software) | https://fiji.sc/ | ||
Gentamicin (10 mg/mL) | Nacalai Tesque | 16672-04 | 25 μg/mL |
Hammacher laboratory scissor | SANSYO | 91-1538 | |
Incubator | Panasonic | MCO-170-PJ | |
Laboratory tweezer | AS-ONE | 7-164-04 | |
L-Glutamine 200 mM | Gibco | 25030081 | 2 mM |
Matrigel | BD Biosciences | 354230 | ECM for 3D organoids |
Mouse Anti-Human Lysozyme | LSBio | LS-B8704-100 | |
Murine EGF (20 μg/mL stock solution) | PeproTech | 315-09 | 20 ng/mL |
PBS 1x | Gibco | 10010-023 | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Gibco | 15140-122 | 50 U/mL |
Pipetman (10 μL, 20 μL, 200 μL, and 1,000 μL) | GILSON | 1-6855-12, -13, -15, and -16 | |
Recombinant murine Noggin (20 μg/mL stock solution | R&D Systems | 1967-NG-025 | 100 ng/mL |
Recombinant murine R-Spondin 1 (250 μg/mL stock solution) | R&D Systems | 3474-RS-050 | 500 ng/mL |
Sorbitol | Nacalai Tesque | 32021-95 | 2% (w/v) |
TE2000-S (inverted microscope) | Nikon | 24131 | |
Time-lapse image microscope | Olympus | LCV100 | |
TrypLE Express 1x | Gibco | 12605-010 | |
ULVAC | ULVAC KIKO Inc. | 100073 | |
Y-27632 | Fujifilm | 331752-47-7 | 10 μM |