Мы описываем протокол для выделения мышиных тонких кишечных крипт и культивирования кишечных 3D-органоидов из крипт. Кроме того, мы описываем способ получения органоидов из одной стволовой клетки кишечника в отсутствие субэпителиальной клеточной ниши.
В настоящее время органоидная культура представляет собой важный инструмент для исследований in vitro различных биологических аспектов и заболеваний в различных органах. Мышиные тонкие кишечные крипты могут образовывать органоиды, которые имитируют кишечный эпителий при культивировании во внеклеточном 3D-матриксе. Органоиды состоят из всех типов клеток, которые выполняют различные гомеостатические функции кишечника. К ним относятся клетки Панета, энтероэндокринные клетки, энтероциты, бокаловидные клетки и пучковые клетки. Хорошо охарактеризованные молекулы добавляют в культуральную среду для обогащения кишечных стволовых клеток (МСК), меченных богатыми лейцином повторами, содержащими рецептор 5, связанный с G-белком, и используются для дифференцировки по определенным линиям; эти молекулы включают эпидермальный фактор роста, ноггин (костный морфогенетический белок) и R-спондин 1. Кроме того, подробно описан протокол генерации органоидов из одного гепатоцеллюлярного рецептора B2 (EphB2)-положительного ISC, продуцирующего эритропоэтин. В этой статье описаны методы выделения тонких кишечных крипт и одного ISC из тканей и обеспечения эффективного установления органоидов.
Кишечные органоиды, которые были впервые созданы в 2009 году, стали мощным инструментом in vitro для изучения биологии кишечника, учитывая их морфологическое и функциональное сходство со зрелыми тканями. В последнее время технологические достижения в области культивируемых органоидов, полученных из стволовых клеток взрослой ткани, позволили проводить долгосрочную культуру кишечных стволовых клеток (ISC) с потенциалом самообновления и дифференцировки. Эти органоиды широко используются для фундаментальных и трансляционных исследований по физиологии желудочно-кишечного тракта и патофизиологии 1,2,3,4,5,6. 3D-органоиды, разработанные группой Clevers, представляют собой мощный инструмент для изучения кишечного эпителия с улучшенной физиологической значимостью7. Поскольку кишечные органоиды получены из тканевых стволовых клеток и состоят из нескольких типов клеток, они повторяют функциональность кишечного эпителия. Следует отметить, что стволовая клетка, содержащая 5-положительный рецептор, связанный с G-белком (Lgr5+), также может генерировать 3D-органоиды без каких-либо клеток Панета или ниши ISC, такой как эпителиальная ниша или стромальная ниша7. Однако органоидообразующая способность односортных клеток Lgr5+ низка по сравнению с таковыми у дублетов клеток крипт и ISC-Paneth8.
Все большее число исследований показало, что методы инкубации этилендиаминтетрауксусной кислоты (ЭДТА) или диссоциации коллагеназы вызывают ослабление эпителия и высвобождение крипт. Поскольку ферментативная диссоциация может влиять на состояние клеток крипт, для диссоциации ткани обычно используется метод механической изоляции. Хотя механическое пищеварение является быстрым методом, этот метод может быть связан с непостоянным выходом крипт или плохой жизнеспособностью клеток9. Таким образом, обработка ЭДТА и механическая диссоциация могут быть объединены для получения лучших выходов крипты. Особенностью методики, показанной в данной статье, является использование энергичного встряхивания тканевых фрагментов после хелатирования ЭДТА10. Энергичное встряхивание позволяет эффективно изолировать крипты от комплексов крипты-ворсинок в тонком кишечнике. Степень ручного встряхивания определяет разделение. Таким образом, получение крипт из комплексов важно для экспериментаторов в этой области. Кроме того, надлежащая сноровка может свести загрязнение ворсинок к минимуму и увеличить количество склепов.
Следовательно, этот экспериментальный протокол, в котором используются органоиды тонкой кишки мышиного происхождения, может лучше изолировать крипты с физической силой после обработки ЭДТА для диссоциации. Известно, что паттерн экспрессии эритропоэтин-продуцирующего гепатоцеллюлярного рецептора В2 (EphB2) частично отражает среду крипты. Например, EphB2-положительные клетки организованы снизу вверх11. Флуоресцентно-активируемая сортировка клеток (FACS) проводилась на основе экспрессии EphB2, и полученные клетки были разделены на четыре группы: EphB2высокий, EphB2med, EphB2низкий и EphB2neg. Затем был продемонстрирован рост органоидов из односортныхвысоких клеток EphB2 у мышей дикого типа (WT).
В этом протоколе описывается метод последовательной изоляции сккриптов тонкой кишки и последующего культивирования 3D-органоидов. Для повышения скорости высвобождения крипты был разработан метод механической изоляции, включающий энергичное встряхивание после обработки ЭДТА. Состав среды отличается от исходного протокола Sato et al.7. Оригинальный носитель относительно дорогой. Таким образом, питательная среда и специализированная среда для органоидов тонкой кишки мышей, содержащие фармакологические ингибиторы, рекомбинантные факторы роста и/или кондиционированные среды, показаны в таблице 1. Wnt3A и N-ацетилцистеин не включены в питательную среду в этом протоколе. Поскольку клетки Панета экспрессируют Wnt3, клетки производят Wnt3 и поддерживают обслуживание ISC. Кроме того, при выделении крипты кондиционированная среда не используется. Органоидная модель является динамической и имеет клеточную и структурную гетерогенность (клетки Панета, энтероциты, бокаловидные клетки, энтероэндокринные клетки, пучковые клетки и МСК). Следовательно, эти органоиды могут быть использованы в масштабе для изучения фундаментальных вопросов биологии органоидов.
Градиент EphB2 поддерживает стволовость и пролиферацию ISC вдоль оси крипты-ворсинок в тонкой кишкевзрослого человека 18. Преимущество получения органоидов из одной клетки EphB2 по сравнению с изолированными криптами связано с пониманием биологии мышиных ISC, поскольку ISC играют ключевую роль в различных кишечных расстройствах человека. Одиночные EphB2 свысокой экспрессией ISC могут культивироваться с образованием органоидов аналогично развитию органоидов из одиночных Lgr5-экспрессирующих ISC. Наиболее важным шагом является точное разделение клеток на четыре группы (EphB2высокий, EphB2медицинский, EphB2низкий и EphB2neg) в соответствии с экспрессией EphB2 в криптах с использованием FACS. Графики прямого и бокового рассеяния (FSC и SSC) обычно используются для идентификации интересующих ячеек на основе их размера и детализации. FSC указывает размер ячейки, а SSC относится к сложности или детализации ячейки в затворе P0 (рис. 2A). В этой работе клетки, попавшие в определенные ворота (P0), были впоследствии проанализированы на жизнеспособность. Затем их жизнеспособность определяли по отрицательным и положительным популяциям сигналов флуоресценции 7-AAD. Граница между 7-AAD-отрицательными и -положительными клетками была строго определена так, чтобы получить отрицательные с минимальным положительным клеточным загрязнением. Вентили EphB2 были примерно установлены на основе градуированного выражения EphB2.
Чтобы подтвердить, что четыре группы были точно разделены, была проанализирована экспрессия мРНК выбранных генов. Уровни мРНК маркеров ISC высоки вклетках EphB2 с высоким уровнем 20. Кроме того, уровни мРНК маркеров, специфичных для клеток-предшественников, относительно высоки вмедицинских клетках EphB220. Тем не менее, эксэкспрессия EphB2 в клетках EphB2 с низким уровнем иEphB2 neg является низкой или отрицательной по сравнению с экспрессией EphB2с высоким уровнем имедицинскими клетками EphB2 20. Предыдущие меры должны быть приняты для обеспечения обогащениявысококлеточной популяции EphB2 перед нанесением покрытия. Однако рост органоидов менее чем на 6% изклеток с высоким содержанием EphB2 может быть обусловлен гибелью стволовых клеток во время процесса культивирования, а не энергичным встряхиванием во время выделения крипты. Было показано, что применение селективного ингибитора Rho-ассоциированной киназы (ROCK) к эмбриональным стволовым клеткам человека заметно уменьшает индуцированный диссоциацией апоптоз22. Таким образом, в качестве технического изменения стоит попробовать добавить ингибитор ROCK в более высокой концентрации и с более длительной инкубацией для повышения жизнеспособности.
Wnt3A-секретирующие клетки Paneth рядом с ISC обеспечивают существенную поддержку ISC8. Действительно, дублеты ячеек ISC-Paneth демонстрируют значительно повышенную органоидообразующую способность по сравнению с одиночными ISC8. Кроме того, было показано, что добавление Wnt3A в концентрации 100 нг/мл в течение первых 3 дней культивирования увеличивает органоидообразующую способность8. Таким образом, в качестве еще одного технического изменения добавление экзогенного Wnt3A может улучшить органоидообразующую способность одиночных EphB2с высокой экспрессией ISC.
По сравнению с подходами in vivo, органоиды могут быть легко использованы для генетических манипуляций, анализа фенотипов злокачественных новообразований и скрининга лекарств20,23. Комбинация хелатирования ЭДТА и метода механической изоляции является эффективной, воспроизводимой и эффективной по времени для создания органоидов тонкой кишки из крипт и может быть легко использована персоналом лаборатории без какого-либо передового опыта. Таким образом, добавление механической изоляции с энергичным встряхиванием после обработки ЭДТА может эффективно установить органоиды тонкой кишки мышей ex vivo и предоставить потенциальный инструмент для культивирования органоидов и моделирования заболеваний других эпителиальных тканей взрослого человека.
Эпителиальные клетки кишечника поляризованы и ориентированы апикальной стороной, направленной к просвету. Однако апикальная сторона, обращенная к просвету 3D-органоидов, находится внутри них. Таким образом, эта организация предотвращает доступ к апикальной стороне, что является проблемой при изучении воздействия компонентов просвета, таких как питательные вещества, микробы и метаболиты, на эпителиальные клетки. Чтобы обойти этот недостаток, была разработана культура органоидных клеток в виде2D-монослоев 24. С точки зрения будущих применений, будет использоваться культивирование монослоев органоидных клеток, поскольку это представляет собой наиболее эффективную и управляемую систему.
The authors have nothing to disclose.
Эта работа была поддержана грантами на научные исследования (C) для T.T. (номера грантов JP17K07495 и JP20K06751). Мы благодарим профессора Минеко Кенгаку за использование оборудования для долгосрочной покадровой съемки (LCV100; Олимп).
1.5 mL Eppendorf tube | Eppendorf | 0030 125.215 | |
5 mL syringe | TERUMO | SS-05SZ | |
15 mL Falcon tube | Iwaki | 2325-015 | |
20 μm cell strainer | Sysmex | 04-004-2325 | |
24-well plate | Iwaki | 3820-024 | |
50 mL Falcon tube | Iwaki | 2345-050 | |
60 mm tissue culture dish | FALCON | 353002 | |
70 μm cell strainer | Falcon | 352350 | |
100 mm Petri dish | Iwaki | 3020-100 | |
7-AAD | BD Biosciences | 559925 | |
Advanced DMEM/F12 | Gibco | 12634-010 | |
Alexa Fluor 568 Goat Anti-Mouse IgG (H+L) | Invitrogen | A-11004 | |
Anti-EphB2 APC-conjugated antibody | BD Biosciences | 564699 | |
C57BL6/J mice | Japan SLC, Inc. | ||
Clean bench | HITACHI | CCV-1306E | |
Confocal laser scanning microscope | Olympus | FV3000 | |
EDTA (0.5 mol/L) | Nacalai Tesque | 06894-14 | 2 mM |
FACSMelody | BD Life Sciences-Biosciences | 661762 | |
Fetal bovine serum | Sigma | 173012 | 1% (v/v) |
Fiji (software) | https://fiji.sc/ | ||
Gentamicin (10 mg/mL) | Nacalai Tesque | 16672-04 | 25 μg/mL |
Hammacher laboratory scissor | SANSYO | 91-1538 | |
Incubator | Panasonic | MCO-170-PJ | |
Laboratory tweezer | AS-ONE | 7-164-04 | |
L-Glutamine 200 mM | Gibco | 25030081 | 2 mM |
Matrigel | BD Biosciences | 354230 | ECM for 3D organoids |
Mouse Anti-Human Lysozyme | LSBio | LS-B8704-100 | |
Murine EGF (20 μg/mL stock solution) | PeproTech | 315-09 | 20 ng/mL |
PBS 1x | Gibco | 10010-023 | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Gibco | 15140-122 | 50 U/mL |
Pipetman (10 μL, 20 μL, 200 μL, and 1,000 μL) | GILSON | 1-6855-12, -13, -15, and -16 | |
Recombinant murine Noggin (20 μg/mL stock solution | R&D Systems | 1967-NG-025 | 100 ng/mL |
Recombinant murine R-Spondin 1 (250 μg/mL stock solution) | R&D Systems | 3474-RS-050 | 500 ng/mL |
Sorbitol | Nacalai Tesque | 32021-95 | 2% (w/v) |
TE2000-S (inverted microscope) | Nikon | 24131 | |
Time-lapse image microscope | Olympus | LCV100 | |
TrypLE Express 1x | Gibco | 12605-010 | |
ULVAC | ULVAC KIKO Inc. | 100073 | |
Y-27632 | Fujifilm | 331752-47-7 | 10 μM |