MouseWalker(MW)ツールボックスを使用して自由に歩くマウスの自発運動パターンを定量的に記述するための実験パイプラインが提供されており、初期のビデオ録画や追跡から定量化後の分析まで、さまざまな結果が得られています。マウスの脊髄挫傷損傷モデルを用いて、MWシステムの有用性を実証した。
ウォーキングやランニングなどの複雑で高度に調整された運動プログラムの実行は、脊髄回路および脊髄上回路のリズミカルな活性化に依存しています。胸部脊髄損傷後、上流回路との通信が損なわれます。これは、順番に、限られた回復の可能性で、調整の喪失につながります。したがって、薬物または治療法の投与後の回復の程度をよりよく評価するためには、脊髄損傷の動物モデルにおける歩行、四肢協調、およびその他の自発運動行動の細かい側面を定量化するための、より詳細で正確な新しいツールが必要です。げっ歯類の自由歩行行動を定量的に評価するために、いくつかのアッセイが長年にわたって開発されてきました。ただし、通常、ステップ歩行戦略、フットプリントパターン、および調整に関連する直接的な測定値が不足しています。これらの欠点に対処するために、フラストレーション全反射(fTIR)通路と追跡および定量化ソフトウェアを組み合わせたMouseWalkerの更新バージョンが提供されています。このオープンソースシステムは、いくつかのグラフィカル出力と運動学的パラメータを抽出するように適合されており、一連の定量化後ツールを使用して、提供された出力データを分析できます。この原稿はまた、この方法がすでに確立された行動テストと組み合わせて、脊髄損傷後の自発運動障害を定量的に記述する方法を示しています。
四肢の効果的な調整は、四足動物に固有のものではありません。人間の前肢と後肢の協調は、水泳や歩行中の速度の変化など、いくつかのタスクを実行するために依然として重要です1。さまざまな四肢運動学2と運動プログラム1,3,4、および固有受容感覚フィードバック回路5は、ヒトと他の哺乳類の間で保存されており、脊髄損傷(SCI)などの運動障害の治療オプションを分析する際に考慮する必要があります6,7,8。
歩くためには、前肢と後肢からのいくつかの脊椎接続が適切に配線され、リズミカルに活性化される必要があり、これには脳からの入力と体性感覚系からのフィードバックが必要です2,9,10。これらの接続は、それぞれ前肢と後肢の頸部と腰部のレベルに位置する中央パターンジェネレーター(CPG)で最高潮に達します1,9,10。多くの場合、SCI後、ニューロンの接続性の破壊と抑制性グリア瘢痕12の形成は、自発運動機能の回復を制限し、結果は、損傷の重症度に応じて、完全な麻痺から四肢のグループの機能の制限までさまざまです。SCI後の自発運動機能を正確に定量化するツールは、回復を監視し、治療やその他の臨床介入の効果を評価するために重要です6。
SCIのマウス挫傷モデルの標準的なメトリックアッセイは、バッソマウススケール(BMS)13,14であり、オープンフィールドアリーナでの体幹の安定性、尾の位置、足底のステッピング、および前肢と後肢の協調を考慮したノンパラメトリックスコアです。BMSはほとんどの場合非常に信頼性が高いですが、自然な変動性を説明し、バイアスを減らすために、動物の動きのすべての角度を観察するには、少なくとも2人の経験豊富な評価者が必要です。
SCI後の運動性能を定量的に評価するために、他のアッセイも開発されています。これらには、回転シリンダー15に費やされた時間を測定するロタロッドテストが含まれます。手すりの欠落と正のはしごの数を測定する水平はしごは16,17。ビーム歩行テストは、動物が狭いビーム18を横切るときにかかる時間と失敗の数を測定します。運動障害の組み合わせを反映しているにもかかわらず、これらのテストのいずれも、前肢と後肢の協調に関する直接的な自発運動情報を生成しません。
歩行行動を具体的かつより徹底的に分析するために、ステップサイクルと歩行戦略を再構築するための他のアッセイが開発されています。一例は、動物のインクを塗った足が白い紙19のシートの上にパターンを描くフットプリントテストです。実行は簡単ですが、ストライド長などの運動学的パラメータを抽出するのは面倒で不正確です。さらに、ステップサイクルの持続時間や脚時調整などの動的パラメータの欠如は、そのアプリケーションを制限します。実際、これらの動的パラメータは、透明な表面を歩くげっ歯類のフレームごとのビデオを分析することによってのみ取得できます。SCI研究では、研究者は、ステップサイクルの再構築や各脚関節の角度変動の測定など、トレッドミルを使用して側面から歩行行動を分析しました4,20,21。このアプローチは非常に有益ですが6、特定の手足のセットに焦点を当てたままであり、調整などの追加の歩行機能が欠けています。
これらのギャップを埋めるために、Hamersたちは、フラストレーション全反射(fTIR)22を用いた光学式タッチセンサーに基づく定量的試験を開発した。この方式では、光は内部反射 によって ガラス中を伝搬し、足を押すと散乱し、最終的に高速度カメラで撮影されます。より最近では、MouseWalkerと呼ばれるこの方法のオープンソースバージョンが利用可能になり、このアプローチは、fTIR通路と追跡および定量化ソフトウェアパッケージとを組み合わせたものである23。この方法を使用して、ユーザは、歩調、空間、および歩行パターン、足跡の位置、および前肢−後肢協調、ならびに足跡パターン(インク付き足場アッセイ6を模倣する)または体軸に対する立脚位相などの視覚的出力を含む、定量的パラメータの大規模なセットを抽出することができる。重要なのは、そのオープンソースの性質により、MATLABスクリプトパッケージを更新することで新しいパラメーターを抽出できることです。
ここでは、以前に公開されたMouseWalker23 システムのアセンブリが更新されます。設定方法の説明と、最高のビデオ品質、トラッキング条件、およびパラメータ取得を実現するために必要なすべての手順が記載されています。マウスウォーカー(MW)出力データセットの分析を強化するために、追加の定量化後ツールも共有されています。最後に、このツールの有用性は、脊髄損傷(SCI)のコンテキストで、一般的な自発運動能力、特にステップサイクルと前肢と後肢の協調の定量化可能な値を取得することによって実証されます。
ここでは、SCI後の自発運動行動を解析することにより、マウスウォーカー法の可能性を実証します。これは、他の標準的なテストでは見逃されるステップ、フットプリント、および歩行パターンの特定の変化に関する新しい洞察を提供します。MW パッケージの更新バージョンを提供するだけでなく、提供されている Python スクリプトを使用してデータ分析ツールについても説明します (手順 5 …
The authors have nothing to disclose.
著者らは、ローラ・タッカーとナタサ・ロンカレビッチの原稿に対するコメントと、メディチーナ分子ジョアン・ロボ・アントゥネス研究所のげっ歯類施設による支援に感謝します。著者らは、プレミオスサンタカーサニューロシエンシアス-脊髄損傷研究のための賞メロエカストロ(MC-36 / 2020)からL.S.およびC.S.M.への財政的支援に感謝したいと思います。本研究は、Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT) (PTDC/BIA-COM/0151/2020)、iNOVA4Health (UIDB/04462/2020 および UIDP/04462/2020)、および LS4FUTURE (LA/P/0087/2020) から C.S.M. L.S. への支援は、CEEC個人主任研究者契約(2021.02253.CEECIND)の支援を受けた。A.F.I.は、FCT(2020.08168.BD)の博士課程のフェローシップによってサポートされました。AMMは、FCTの博士フェローシップ(PD / BD / 128445 / 2017)によってサポートされました。IMは、FCTのポスドクフェローシップ(SFRH/BPD/118051/2016)の支援を受けました。D.N.S.は、FCTの博士研究員(SFRH/BD/138636/2018)の支援を受けました。
45º Mirror | |||
2 aluminum extrusion (2 x 2 cm), 16 cm height, 1 on each side | Misumi | ||
2 aluminum extrusion (2 x 2 cm), 23 cm, @ 45° , 1 on each side | Misumi | ||
1 aluminum extrusion (2 x 2 cm), 83 cm long | Misumi | ||
87 x 23 cm mirror | General glass supplier | ||
black cardboard filler | General stationery supplier | We used 2, one with 69 x 6 cm and another with 69 x 3cm to limit the reflection on the mirror | |
Background backlight | |||
109 x 23 cm plexiglass (0.9525 cm thick) | General hardware supplier | ||
2 lateral aluminum extrusion (4 x 4 cm), 20 cm long, 1 on each side | Misumi | ||
multicolor LED strip | General hardware supplier | ||
white opaque paper to cover the plexyglass | General stationery supplier | ||
fTIR Support base and posts | |||
2 aluminum extrusion (4 x 4 cm), 100 cm height | Misumi | ||
60 x 30 cm metric breadboard | Edmund Optics | #54-641 | |
M6 12 mm screws | Edmund Optics | ||
M6 hex nuts and wahers | Edmund Optics | ||
fTIR Walkway | |||
109 x 8.5 cm plexyglass (1.2 cm thick) | General hardware supplier | 109 x 8.5 cm plexyglass (1.2 cm thick) | |
109 cm long Base-U-channel aluminum with 1.6 cm height x 1.9 cm depth thick folds (to hold the plexyglass) | General hardware supplier | ||
2 lateral aluminum extrusion (4 x 4 cm) 20 cm length, 1 on each side | Misumi | ||
black cardboard filler | General stationery supplier | we used 2 fillers on each side to cover the limits of the plexyglass, avoiding bright edges | |
12 mm screws | Edmund Optics | M6 | |
High speed camera (on a tripod) | |||
Blackfly S USB3 | Blackfly | USB3 | This is a reccomendation. The requirement is to record at least 100 frames per second |
Infinite Horizon Impactor | |||
Infinite Horizon Impactor | Precision Systems and Instrumentation, LLC. | ||
Lens | |||
Nikkon AF Zoom-Nikkor 24-85mm | Nikkon | 2.8-4D IF | This lens is reccomended, however other lens can be used. Make sure it contains a large aperture (i.e., smaller F-stop values), to capture fTIR signals |
Software | |||
MATLAB R2022b | MathWorks | ||
Python 3.9.13 | Python Software Foundation | ||
Anaconda Navigator 2.1.4 | Anaconda, Inc. | ||
Spyder 5.1.5 | Spyder Project Contributors | ||
Walkway wall | |||
2 large rectagular acrilics with 100 x 15 cm | Any bricolage convenience store | ||
2 Trapezian acrilic laterals with 6-10 length x 15 cm height | Any bricolage convenience store | ||
GitHub Materials | |||
Folder name | URL | ||
Boxplots | https://github.com/NeurogeneLocomotion/MouseWalker/tree/main/Boxplots | Script to create Boxplots | |
Docs | https://github.com/NeurogeneLocomotion/MouseWalker/tree/main/Docs | Additional documents | |
Heatmap | https://github.com/NeurogeneLocomotion/MouseWalker/tree/main/Heatmaps | Script to create heatmap | |
Matlat script | https://github.com/NeurogeneLocomotion/MouseWalker/tree/main/Matlab%20Script | MouseWalker matlab script | |
PCA | https://github.com/NeurogeneLocomotion/MouseWalker/tree/main/PCA%20plots | Script to perform Principal Component Analysis | |
Raw data Plots | https://github.com/NeurogeneLocomotion/MouseWalker/tree/main/Rawdata%20Plots | Script to create Raw data plots | |
Residual Analysis | https://github.com/NeurogeneLocomotion/MouseWalker/tree/main/Residual_Analysis | Code to compute residuals from Raw data |