Civciv embriyoları, insan glioblastoma (GBM) beyin tümörlerini ovo ve in vivo beyin dilimi ko-kültürlerinde incelemek için kullanılır. GBM hücre davranışı, ex vivo ko-kültürlerde hızlandırılmış mikroskopi ile kaydedilebilir ve her iki preparat da deneysel son noktada ayrıntılı 3D konfokal analiz ile analiz edilebilir.
Civciv embriyosu, omurgalı gelişiminin incelenmesi için, özellikle deneysel manipülasyonlar için ideal bir model sistem olmuştur. Civciv embriyosunun kullanımı, insan glioblastoma (GBM) beyin tümörlerinin in vivo oluşumunu ve tümör hücrelerinin çevreleyen beyin dokusuna invazivliğini incelemek için genişletilmiştir. GBM tümörleri, floresan olarak etiketlenmiş hücrelerin bir süspansiyonunun ovodaki E5 orta beyin (optik tektum) ventrikülüne enjekte edilmesiyle oluşturulabilir.
GBM hücrelerine bağlı olarak, kompakt tümörler ventrikülde ve beyin duvarında rastgele oluşur ve hücre grupları beyin duvarı dokusunu istila eder. Tümörlü sabit E15 tektasının kalın doku kesitleri (350 μm), konfokal z-stack görüntülerinin 3D rekonstrüksiyonu ile analiz edildiğinde istilacı hücrelerin sıklıkla kan damarları boyunca göç ettiğini ortaya çıkarmak için immünoboya ile boyanabilir. Canlı E15 orta beyin ve ön beyin dilimleri (250-350 μm), floresan olarak etiketlenmiş GBM hücrelerinin, yaklaşık 1 haftalık bir süre boyunca kan damarları boyunca da meydana gelebilen hücre invazyonunu analiz etmek için ex vivo ko-kültürler sağlamak için rastgele olmayan yerlere sokulabileceği membran ekleri üzerinde kültürlenebilir. Bu ex vivo ko-kültürler, canlı hücre davranışını gözlemlemek için geniş alan veya konfokal floresan hızlandırılmış mikroskopi ile izlenebilir.
Ko-kültürlü dilimler daha sonra sabitlenebilir, immünoboyalı olabilir ve istilanın kan damarları veya aksonlar boyunca gerçekleşip gerçekleşmediğini belirlemek için konfokal mikroskopi ile analiz edilebilir. Ek olarak, ko-kültür sistemi, farklı hücre tiplerinin ve renklerinin agregalarını farklı hassas yerlere yerleştirerek ve hücre hareketlerini gözlemleyerek potansiyel hücre-hücre etkileşimlerini araştırmak için kullanılabilir. İlaç tedavileri ex vivo kültürlerde yapılabilirken, bu tedaviler in ovo sistemi ile uyumlu değildir. Bu iki tamamlayıcı yaklaşım, yüksek oranda manipüle edilebilir omurgalı beyin ortamında insan GBM hücre davranışının ve tümör oluşumunun ayrıntılı ve kesin analizlerine izin verir.
Kanser hücresi davranışlarının in vitro çalışmaları, in vivo ksenogreft modellerinde tümör oluşumu ve hücre invazyonu sırasında gözlenen daha karmaşık davranış sırasında çalışan potansiyel mekanizmaları incelemek için sıklıkla kullanılır. Örneğin, glioblastoma (GBM) ile, in vitro çalışmalar, L1CAM’in yeni bir civciv embriyo ksenograft beyin tümörü modeli 1,2,3,4,5’te tümör oluşumu ve beyin invazyonu sırasında potansiyel olarak nasıl çalıştığına dair mekanizmaları ortaya çıkarmıştır. İn vitro ve in vivo deneyler birbirlerini yararlı şekillerde tamamlasalar da, sonuçların nasıl ilişkilendirilebileceği konusunda önemli bir boşluk bırakırlar. Örneğin, bir çanaktaki GBM hücre hareketliliğinin mekanik analizleri oldukça yapay bir durumdur ve in vivo ksenogreft modelleri sadece tümör oluşumu ve hücre davranışının statik zaman noktası veya bitiş noktası analizlerini ortaya çıkarabilir. Kemirgenleri veya civciv embriyolarını kullanan in vivo çalışmalar, hücreler bu ksenogreft modellerinde beyin dokusunu istila ederken, hücre davranışını izlemek için kendilerini kolayca ödünç vermezler. Bununla birlikte, civciv embriyo ksenogreft modeli, yapışma proteini L1CAM’in insan T98G GBM hücrelerinin 2,5 invaziv yeteneğinde uyarıcı bir rol oynadığını göstermiştir.
Bu soruna uygun bir çözüme, ex vivo model olarak adlandırılan organotipik bir beyin dilimi kültür modeli kullanılarak hem in vivo hem de in vitro yöntemlerle köprü kurularak ulaşılabilir. Bu ex vivo modelde, canlı beyin dokusu birkaç haftaya kadar birkaç yüz mikron kalınlığında tutulabilir, bu da kanser hücrelerinin implante edilmesini, zaman içinde gerçek dokudaki davranışlarını gözlemlemeyi ve daha sonra deneyin sonunda daha ayrıntılı bir belirteç analizi yapmayı mümkün kılar.
Popüler bir organotipik dilim kültürü yöntemi, yarı saydam veya şeffaf gözenekli bir zarın üzerine birkaç yüz mikron kalınlığında bir beyin dilimini kültürlemek, dokuyu havaya maruz bırakmak, ancak besin ortamının dokuyu zarın altından sürdürmesine izin vermek olmuştur (Stoppini ve ark.6’ya bakınız). Bu yöntemin farklı varyasyonları, farklı ortamlar veya farklı membran ekleri kullanmak da dahil olmak üzere farklı çalışmalar için kullanılmıştır. Farklı membran uçları arasında 30 mm çapında, 35 mm kültür kabında gözenekli (0,4 μm) membran kesici uç 6 ve 6 delikli plakalar için hücre kültürü ekleri (0,4 μm) bulunur7. Farklı ortamlar arasında% 50 MEM / HEPES +% 25 ısı ile inaktive edilmiş at serumu +% 25 Hanks dengeli tuz çözeltisi (HBSS)8,% 50 azaltılmış serum ortamı +% 25 at serumu +% 25 HBSS9 ve diğerleri bulunur. Floresan olarak etiketlenmiş GBM hücreleri ile birlikte yarı saydam veya şeffaf bir membran kullanılırsa, bu tür kültürler ters çevrilmiş bir geniş alan veya konfokal floresan mikroskobu 10,11,12,13,14,15 kullanılarak aşağıdan görüntülenebilir.
Kemirgenler kullanılarak birçok in vivo ortotopik beyin tümörü ksenogreft ve ex vivo organotipik beyin dilimi kültürü modeli kurulmuş olsa da, yukarıda belirtildiği gibi, civciv embriyosu (Gallus gallus) bu amaçlar için yeterince kullanılmamıştır. Bununla birlikte, civciv embriyosunun hem insan hem de sıçan glioma invazyonu 1,2,5 çalışması için in vivo ortotopik bir ksenogreft modeli olarak kullanılabileceği gösterilmiştir. Civciv embriyo beyinlerine ksenograflanmış hücreler, kemirgen modellerinde gözlemlenenlere benzer istila paternleri sergilemiş ve civciv embriyolarının GBM tümör hücresi analizi için in vivo bir model olarak kullanılmasını daha da desteklemiştir. Civciv embriyoları da ucuzdur, kemirgenlerden daha kolay korunabilir (yani, bir laboratuar inkübatöründeki yumurta kabuklarında) ve çalışması çok daha kolaydır, bu da onları kısa süreli in vivo GBM çalışmaları için çekici bir seçenek haline getirir. Yakın tarihli bir makale, dilimlerin en az 7 gün boyunca canlı olduğu normal beyin gelişimi sırasında aksonların oluşumu ve büyümesi için civciv embriyosu beyin dilimi kültürlerinin kullanımını açıklamıştır16. Bununla birlikte, bu tür civciv embriyo beyin dilimi kültürlerinin bir doku ortamında GBM hücre davranışının ex vivo analizi için kullanılması eksiktir. Bu makalede, hem insan GBM hücrelerinin hem de GBM kök hücrelerinin (GSC’ler) erken civciv embriyo beynine in vivo transplantasyonu ve GBM hücrelerinin canlı civciv embriyo beyin dilimi kültürlerine ex vivo olarak sokulması anlatılmaktadır. Ortaya çıkan tümörlerin bazı temsili örnekleri ve bu preparatlardan elde edilen hücre invazyon paternleri de verilmektedir.
Hücrelerin orta beyin (optik tektum) ventrikülüne enjeksiyonu için protokoldeki kritik adımlar, yumurtadaki koryoallantoik membrandaki kan damarlarına zarar vermemeyi veya enjeksiyondan önce ve enjeksiyon sırasında embriyoyu çevrelememeyi içerir, ancak embriyoyu hemen çevreleyen amniyon zarı, hücreleri orta beyne enjekte ederken kafayı konumlandırmak için hafifçe çekilebilir ve tutulabilir. Amniyon nispeten serttir ve beynin ortasındaki büyük, yuvarlak yapı olan optik tektuma diğer eliyle hücrelerin enjeksiyonu için kafayı konumlandırmak ve bir elle sabit tutmak için ince forsepslerle çekilebilir. Genel olarak, enjekte edilen embriyoların canlılığı, bilinmeyen faktörlere bağlı olarak% 25 ila% 75 arasında değişmektedir ve pratik olarak hayatta kalan her embriyo, optik tektumda en az küçük bir tümör içerir. Canlı beyin dilimleri üretmedeki kritik adımlar, fazla sıvı dokusunun lekelenmesini içerir, böylece agaroz dilimleme sırasında beyne yapışır ve zar ekine yerleştirilene kadar doku ve dilimleri soğuk tutar. Farklı hücre tipleri sferoidleri farklı şekilde (hız ve boyut olarak) oluşturduğundan, poli-HEMA plakalarındaki kaplanmış hücre yoğunluğu ve sferoidlerin toplanmasından önceki sürenin uzunluğu her hücre tipi için optimize edilmelidir.
Buradaki çalışma, beyin dilimi canlılığının resmi bir uzunlamasına çalışmasına tabi tutulmamıştır. Yang ve ark. burada kullanılanlara benzer civciv embriyo beyin dilimi kültürleri kullanmış ve dilimlerin en az 7 gün boyunca iyi yaşayabilirliğini göstermiştir16. Önceki çalışmalar, OT dokusu suboptimal ortamda tutulduğunda, dokuda, buradaki çalışmadaki dilimlerde meydana gelmeyen birçok piknotik çekirdeğin ortaya çıktığını göstermiştir. Ek olarak, dilimler optimal olmayan koşullarda dejenere olduğunda, kan damarları parçalanır ve laminin-pozitif kürelerin sıraları olarak görünür (gösterilmemiştir). Bu nedenle, buradaki canlılık elektrofizyoloji veya aktif kaspaz-3 ekspresyonu gibi yöntemlerle kontrol edilmemiş olsa da, suboptimal kültür koşulları altında görülen hücre ölümü göstergelerinin hiçbiri burada ortaya çıkmamıştır.
OT, in vivo beyin tümörü deneyleri için odaklanmıştır, çünkü en büyük ventriküle sahip en kolay enjekte edilen bölgedir. Embriyonun yumurta sarısının üstünde erişilebilir kalacak kadar küçük olduğu son gün olan E5’te, tüm beyin bölgeleri ince bir ventrikül bölgesinden başka bir şey olmadığı için enjeksiyonlar bir ventrikül içine yapılmalıdır. Bununla birlikte, bu enjeksiyonlar, beyin parankimini istila eden hücrelere sahip gömülü tümörlerde başarılı bir şekilde sonuçlanır. Bazen, ortaya çıkan tümörler ön beyinde veya beyincikte bulunur, ancak bu yaygın değildir. E15 optik tektumunun Ex vivo dilimleri öncelikle buradaki deneyler için kullanılmıştır, böylece ex vivo ko-kültür sonuçları in vivo enjeksiyon deneyleri ile ilişkilendirilebilir. Bununla birlikte, ön beyin dilimleri de uygundur ve optik tektuma kıyasla daha geniş bir yüzey alanına ve çok ince bir ventriküle sahiptir, bu da ön beyni in vivo enjeksiyonlarla ilişkili olmayan ex vivo ko-kültürler için daha uygun hale getirebilir.
Burada, in vivo enjeksiyonların, ardından doku fiksasyonu, titreşimli doku dilimleyici kesitleme ve laminin ve diğer belirteçler için immün boyamanın, kan damarlarına yakın beyin dokusundaki GBM hücrelerinin ve GSC’lerin yüksek çözünürlüklü görüntüleriyle sonuçlandığı gösterilmiştir. Tümör hücreleri ve kan damarları arasındaki ilişkileri belirleme yeteneği, konfokal yazılımı ve üreticinin talimatlarını kullanarak konfokal optik bölümlerin z-yığınlarından 3D hacim render’ları oluşturarak büyük ölçüde kolaylaştırılmıştır. GFP, mCherry ve DiD etiketli hücrelerin geniş alan floresan mikroskopisi kullanılarak hızlandırılmış görüntüleme mümkündü; Bununla birlikte, yüksek oranda floresan sferoidlere yakın olan göç eden hücreler bazen sferoidden gelen “parıltı” ile gizlenmiştir. Bu istenmeyen etki, geniş alan görüntüleri toplamak için pozlama sürelerini dikkatlice ayarlayarak bir miktar en aza indirilebilir. Zaman içinde konfokal z-yığınları (4D) kullanılarak hızlandırılmış görüntüleme, sferoidlerden gelen odak dışı parıltıyı ortadan kaldırdı ve koyu bir arka plana sahip keskin bir şekilde tanımlanmış göç eden hücrelerle sonuçlandı. Bu, protokolde tanımlanmamıştır, ancak beyin dilimleri 6 delikli bir plastik plakadaki şeffaf zar ekleri üzerindeyken gerçekleştirilen geniş alan hızlandırılmış görüntülemeye benzer şekilde gerçekleştirilmiştir. Konfokal hızlandırılmış görüntüleme, bireysel hücrelerin ve davranışlarının belirgin şekilde daha net görüntüleriyle sonuçlanmasına rağmen, 20 saatlik bir süre boyunca 10 dakikalık aralıklarla 10 z-düzlemi / noktalı z-yığınlarını toplayan çok noktalı bir hızlandırılmış deney, tarama kafası galvanometrelerinin yaygın bir kullanımıdır. Bu, galvanometrelerin ömrünü önemli ölçüde azaltabileceğinden, bu yöntem akıllıca kullanılır.
Civciv embriyo sistemi, GBM hücre davranışını araştıran hem in vivo enjeksiyon hem de ex vivo ko-kültür deneyleri için çok uygun olmasına rağmen, bu model sistemin birkaç sınırlaması vardır. Herhangi bir ksenogreft sisteminde olduğu gibi, insan hücrelerinin implante edildiği ortam insan beyni değildir, ancak GBM hücre davranışı, kemirgen modellerinde ve insan hastalarında bunu taklit ediyor gibi görünmektedir. E5 üzerinde in vivo enjeksiyon deneyleri yapıldıktan sonra, tümörlerin normalde E15’e kadar 10 gün boyunca oluşmasına izin verilir. Bu açıkça tümörigenez ve hücre invazyonunun tüm yönlerini incelemek için yeterli zaman değildir. Bununla birlikte, burada beyin parankiminde katı tümörlerin oluştuğu, hücrelerin tümör içinde etkileşime girdiği ve kendilerini yeniden düzenlediği ve önemli beyin invazyonunun hem kan damarları boyunca hem de bu nispeten kısa süre içinde yaygın olarak meydana geldiği gösterilmiştir. İn vivo civciv embriyo sisteminin bir diğer sınırlaması, civciv embriyo gelişimi sırasında çalışan büyük yumurta sarısı ve ekstraembriyonik dolaşım sistemi nedeniyle ilaç veya diğer tedaviler için uygun olmamasıdır. Topikal sıvı ilaç tedavileri, embriyodan çok daha büyük yumurta sarısı kütlesine difüzyon nedeniyle beyinde oldukça değişken ve bilinmeyen bir konsantrasyona neden olacaktır. Benzer şekilde, ilaçların çok hassas ekstraembriyonik dolaşım sistemine intravenöz enjeksiyonu, kan damarlarından sızacak veya yayılacak ve ayrıca beyinde bilinmeyen konsantrasyonlara neden olacaktır. Bu, ex vivo dilim kültürü yönteminin benimsenmesinin ana nedenlerinden biridir – böylece sadece hücre davranışı hızlandırılmış mikroskopi ile gözlemlenebilir ve izlenemez, aynı zamanda bir çanak4’teki GBM hücre davranışını değiştirmede başarılı olan tedavilerin daha alakalı bir beyin dokusu ortamında test edilebilmesi için.
Civciv embriyosu ortotopik beyin tümörü model sisteminin geliştirilmesi, GBM tümör oluşumu ve invaziv hücre davranışının incelenmesi için mevcut sistemlere ve araçlara önemli bir katkı olarak görülmektedir. Döllenmiş tavuk yumurtalarının çoğu alanda kolayca bulunabilmesi muhtemeldir, kemirgenlere kıyasla ucuzdurlar, hayvan bakım maliyeti yoktur, embriyolar çok esnek ve enfeksiyona karşı dirençlidir (yani, çoğu iş bir tezgah üstünde yapılır), embriyolar oldukça manipüle edilebilir ve kabuksuz kültür19’da yetiştirilebilir ve civciv embriyoları omurgalı hayvanlar olarak kabul edilmez ve bu nedenle NIH kılavuzları tarafından IACUC onayı gerektirmez (kurumsal gereksinimler) değişebilir). Bu nedenle, bu çoklu avantajlar, civciv embriyo sistemini, sorularını ve deneylerini sınırlamalarına girenlerle sınırlarsa çok çekici kılar. Civciv embriyosunu kullanan başkaları tarafından çoklu GBM hücre çalışmaları yapılmıştır, ancak bunlar neredeyse sadece embriyonun koryoallantoik zarını (CAM) 20,21,22,23,24,25,26,27,28,29 ve uzuv tomurcuğu 30’u kullanmıştır, beyin değil. E231’de civciv beynine medulloblastom implante eden bir rapor da var. Kuşkusuz, civciv embriyosunun ortotopik bir ksenogreft model sistemi olarak kullanılması, burada açıklandığı gibi, insan GBM tümör biyolojisi için CAM kullanan çalışmalardan çok daha anlamlı sonuçlar vermelidir.
Bu çalışmalar, insan GBM hücresi ve GSC davranışı çalışmaları için civciv embriyosu beyin tümörü model sistemini tam olarak kullanmaya başlamış olsa da, başkalarının kullanımları genişleteceği ve daha fazla potansiyel uygulama bulacağı umulmaktadır. Bu sistemin sadece GBM tümör oluşumunu ve hücre davranışını düzenleyen mekanizmaları ortaya çıkarmakla kalmayacağını, aynı zamanda spesifik ilaçların ve maddelerin spesifik hastaların hücreleri üzerinde klinik öncesi test edilmesine izin vereceğini de hayal edebiliriz. Örneğin, beyin dilimi kültürleri önceden ayarlanmışsa, tümör hücreleri, cerrahi tümör rezeksiyonlarından parçalar veya hasta kaynaklı GBM organoidleri32 doğrudan ex vivo ko-kültüre yerleştirilebilir ve çeşitli tedaviler birkaç gün içinde değerlendirilebilir. Benzer şekilde, ayrışmış hasta hücreleri, tümör oluşturma ve beyin parankimini istila etme yeteneklerini değerlendirmek için doğrudan ovo’daki E5 orta beyinlerine enjekte edilebilir. Bu nedenle, buradaki yöntemlerin ve temsili sonuçların açıklamalarının, beyin kanseri araştırmaları için oldukça az kullanılan bu sistemin kullanımını kolaylaştıracağı ve teşvik edeceği umulmaktadır.
The authors have nothing to disclose.
Bu çalışma kısmen Ulusal Kanser Enstitüsü’nden (R03CA227312) D.S.G.’ye bir hibe ve Lisa Dean Moseley Vakfı’ndan cömert bir hibe ile finanse edildi. Canlı GBM örnekleri, Helen F. Graham Kanser Merkezi ve Araştırma Enstitüsü Doku Tedarik Merkezi aracılığıyla hasta onayı ile elde edildi. A.R.’ye finansman Ulusal Araştırma Kaynakları Merkezi ve Ulusal Translasyonel Bilimleri Geliştirme Merkezi, Ulusal Sağlık Enstitüleri (UL1TR003107) tarafından sağlanmıştır. N.P., A.L., Z.W. ve K.S.’ye yaz lisans araştırma bursları Delaware Üniversitesi Lisans Araştırma Programı tarafından sağlanmıştır.
1 cm x 1 cm square hole paper punch | Birabira | N/A | |
1 mm biopsy punch pen | Robbins Instruments | 20335 | |
6 well insert plate (Corning Transwell) | Millipore Sigma | CLS3450 | |
9" Disposable Pasteur Pipets | Fisher Scientific | 13-678-20C | |
15 mL centrifuge tubes | Fisher Scientific | 05-539-12 | |
24 well plate | Corning Costar | 3526 | |
50 mL centrifuge tubes | Fisher Scientific | 05-539-9 | |
Agar | Fisher BioReagents | BP1423-500 | for embedding fixed brains |
Alexafluor 488-conjugated GAM IgG | Jackson Immunoresearch | 115-605-146 | |
Alexafluor 647-conjugated GAM IgG | Jackson Immunoresearch | 115-545-146 | |
Aluminum foil | ReynoldsWrap | N/A | |
Ampicillin | Sigma Aldrich | A-9518 | |
anti-integrin alpha-6 monoclonal antibody GOH3 | Santa Cruz Biotechnology | sc-19622 | |
anti-L1CAM monoclonal antibody UJ127 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53386 | |
anti-laminin monoclonal antibody | Developmental Studies Hybridoma Bank | 3H11 | |
anti-nestin monoclonal antibody 10c2 | Santa Cruz Biotechnology | sc-23927 | |
anti-Sox2 monoclonal antibody E-4 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365823 | |
B27 supplement without vitamin A | GIBCO | 17504-044 | |
bisbenzimide (Hoechst 33258) | Sigma-Aldrich | B2883 | nuclear stain |
Cell culture incubator | Forma | standard humidified CO2 incubator | |
Centrifuge | Beckman Coulter | ||
Confocal microscope | Nikon Instruments | C2si+ | With custom-made cell incubator chamber |
Confocal microscope objective lenses | Nikon Instruments | Plan Apo lenses, except S Plan Fluor ELWD 20x 0.45 NA objective lens for confocal time-lapse imaging | |
Confocal microscope software | Nikon Instruments | NIS Elements | Version 5.2 |
Curved foreceps | World Precision Intruments | 504478 | |
Curved scissors | Fine Science Tools | ||
Curved spatula | Fisher Scientific | 14-375-20 | |
Cyanoacrylate glue | Krazy Glue | KG-585 12R | |
D-Glucose | Millipore Sigma | G8270 | |
DiD far red fluorescent dye | Invitrogen | V22887 | Vybrant DiD |
DMEM | Sigma Aldrich | D5671 | |
DMEM/F12 | Sigma Aldrich | D8437 | |
DMSO | Sigma Aldrich | D4540 | |
Dulbecco's Phosphate buffered saline (PBS) | Sigma Aldrich | P5493-1L | |
egg incubator | Humidaire | ||
electrical tape (10 mil thick/254 µm) | Scotch | N/A | |
Ethanol 200 proof | Decon Laboratories | 2701 | |
Fast green FCF dye | Avocado Research Chemicals | 16520 | |
FBS | Gemini Bio-products | 900-108 | |
filter paper | Fisher Scientific | ||
Gauze | Dynarex | 3353 | |
Glass Capillaries for microinjection | World Precision Instruments | TW100-4 | |
Glycerol | Fisher BioReagents | BP228-1 | for mounting media |
GSCs (human glioblastoma stem cells) | Not applicable | Isolated from patient GBM specimens in Galileo laboratory in GSC media and then transduced with a GFP encoding lentiviral vector. Cells used were between passage 10 and 30. | |
Hanks Balanced Salt Solution (HBSS) | Corning | 21-020-CV | |
Hemacytometer | Hausser scientific | ||
Heparin | Fisher Scientific | BP2524-100 | |
HEPES buffer | Sigma Aldrich | H0887 | |
Horse Serum (HI) | Gibco | 26050-088 | |
Human FGF-2 | BioVision | 4037-1000 | |
Human TGF-α | BioVision | 4339-1000 | |
Inverted phase contrast microscope | Nikon Instruments | TMS | for routine viewing of cultured cells |
KCl | Fisher Scientific | BP366 | |
KH2PO4 | Fisher Scientific | P284 | |
Laboratory film | Parafilm | ||
Labquake Shaker | LabIndustries | T400-110 | |
L-Glut:Pen:Strep | Gemini Bio-products | 400-110 | |
Low-melt agarose | Fisher Scientific | BP1360 | for embedding live brains |
Matrix | Corning Matrigel | 354234 | |
Medium 199 | GIBCO | 11150-059 | |
MEM | Corning | 10-010-CV | |
Metal vibratome block | |||
Micropipette tips (20, 200, 1,000 µL) | Fisherbrand | ||
Micropipettors (20, 200, 1,000 µL) | Gilson | ||
Microscope Coverglass (no. 1.5 thickness) | Fisherbrand | 12544A | |
NaCl | Fisher Scientific | S271 | |
NaH2PO4 + H2O | Fisher Scientific | S369 | |
NaHCO3 | Fisher Scientific | BP328 | |
Normal goat serum | Millipore Sigma | 526-M | |
N-propyl gallate | Sigma Aldrich | P3130 | for mounting media |
Parafilm | Parafilm | ||
Paraformaldehyde | Electron Microscopy Sciences | 15710 | |
PBS | Sigma Aldrich | P5493-1L | |
Pencil | |||
Plain Microscope slides | Fisherbrand | 12-550-A3 | |
Plastic 35 mm Petri dish | Becton Dickinson | 351008 | |
pneumatic picopump | World Precision Intruments | PV830 | |
Poly(2-hydroxyethyl methacrylate) (poly-HEMA) | Sigma Aldrich | P-3932 | |
razor blade- double edge | PACE | for cutting fixed brain slices | |
sapphire knife | Delaware Diamond Knives | for cutting live brain slices | |
Scalpel | TruMed | 1001 | |
Sodium cacodylate buffer 0.2 M pH 7.4 | Electron Microscopy Sciences | 11652 | |
Specimen chamber for vibratome | custom-made | ||
Stereo Dissecting Microscope | Nikon Instruments | SMZ1500 | Equipped with epifluorescence |
straight foreceps | World Precision Intruments | 500233 | |
straight scissors | Fine Science Tools | ||
Sucrose | Mallinckrodt | 7723 | |
Time-lapse fluorescence microscope (widefield fluorescence) | Nikon Instruments | TE2000-E | With custom-made cell incubator chamber (see Fotos et al., 2006) |
Tissue culture dish polystyrene 100 mm | Thermo Fisher Scientific | 130182 | for cell culturing |
Tissue culture dish polystyrene 60 mm | Becton Dickinson | 353004 | for cell culturing |
Transfer pipette | American Central Scientific Co. | FFP011 | |
Transparent tape | Scotch | ||
Triton X-100 | Sigma Aldrich | T-8787 | |
Trypsin (0.25%) + 2.21 mM EDTA | Corning | 25-053-CI | |
U-118 MG human GBM cell line | ATCC | HTB-15 | Cells were transduced with a lentiviral vector encoding the entire ectodomain sequence of the L1CAM adhesion protein and then with lentiviral vector pUltra-hot encoding mCherry. Passage numbers are unknown. |
Vacuum pump | Cole-Parmer | EW-07532-40 | "Air Cadet" |
Vibrating tissue slicer | Vibratome | 3000 | for cutting live and fixed brain slices |