Qui, dimostriamo l’uso dell’impedenza elettrica basata su cellule (CEI) come metodo molto semplice e diretto per studiare l’infezione e la replicazione del virus Zika nelle cellule umane in tempo reale. Inoltre, il saggio CEI è utile per la valutazione di composti antivirali.
La tecnologia di impedenza elettrica basata su celle (CEI) misura i cambiamenti di impedenza causati da un monostrato di cellule aderenti in crescita o manipolato su pozzetti a piastre di coltura incorporati con elettrodi. La tecnologia può essere utilizzata per monitorare le conseguenze dell’infezione da virus Zika (ZIKV) e la replicazione cellulare aderente in tempo reale, poiché questo virus è altamente citopatogeno. È un test semplice che non richiede l’uso di etichette o metodi invasivi e ha il vantaggio di fornire dati in tempo reale. La cinetica dell’infezione da ZIKV dipende fortemente dalla linea cellulare impiegata, dal ceppo virale e dalla molteplicità dell’infezione (MOI), che non può essere facilmente studiata con i test convenzionali degli endpoint. Inoltre, il test CEI può essere utilizzato anche per la valutazione e la caratterizzazione di composti antivirali, che possono avere anche proprietà inibitorie dinamiche nel corso dell’infezione. Questo articolo sui metodi fornisce una spiegazione dettagliata dell’esecuzione pratica del saggio CEI e delle sue potenziali applicazioni nella ricerca ZIKV e nella ricerca antivirale in generale.
I focolai di virus Zika (ZIKV) sono associati a gravi complicanze della malattia, come la microcefalia e la sindrome di Guillain-Barre 1,2,3. Sebbene le future epidemie siano plausibili a causa di vari fattori di rischio come la diffusione della distribuzione dei vettori delle zanzare e la crescente urbanizzazione, ad oggi, nessun vaccino o farmaco antivirale è ancora arrivato sul mercato 3,4. Pertanto, i metodi di ricerca tradizionali ZIKV dovrebbero essere integrati con nuovi strumenti per studiare questo virus e i suoi potenziali composti antivirali. La ricerca antivirale si basa spesso su saggi fenotipici, in cui l’endpoint è la presenza di un parametro specifico, come la comparsa di un effetto citopatico indotto da virus (CPE) o la produzione di una particolare proteina indotta da virus per mezzo di un gene reporter 5,6,7. Tuttavia, questi metodi hanno letture degli endpoint, sono laboriosi e possono richiedere analisi complesse. Pertanto, i metodi basati sull’impedenza offrono un’alternativa interessante.
L’impedenza elettrica basata su celle (CEI) è definita come la resistenza al flusso di corrente da un elettrodo all’altro, causata da uno strato cellulare aderente seminato su pozzetti contenenti elettrodi. La consolidata tecnologia CEI impiegata in questa metodologia è Electric Cell-substrate Impedance Sensing (ECIS), originariamente sviluppata da Giaever e Keese 8,9. Questo è usato in un ampio campo di domini di ricerca biologica, come metastasi del cancro, tossicologia e guarigione delle ferite10,11,12. Il suo principio si basa su un campo elettrico generato da un continuo spazzamento di tensioni di corrente alternata (CA) su un intervallo di frequenze13. Le cellule sono esposte a questi campi elettrici non invasivi e, a intervalli predeterminati, vengono misurati i cambiamenti di impedenza causati dalla crescita cellulare o dai cambiamenti nell’aderenza o nella morfologia cellulare14. Inoltre, l’alterata vitalità cellulare porta anche a cambiamenti di impedenza, rendendo la tecnologia uno strumento utile per monitorare l’infezione da virus citopatogeni15,16,17. Poiché i cambiamenti morfologici dello strato cellulare saranno rilevati su scala nanometrica, la tecnologia offre uno strumento di rilevamento altamente sensibile. Il test CEI descritto in questo articolo è un metodo semplice, non invasivo, in tempo reale, label-free per misurare le variazioni di impedenza dello strato cellulare nel tempo.
Sebbene la CEI non sia stata utilizzata per valutare il decorso dell’infezione da ZIKV o i suoi potenziali antivirali, il suo uso come strumento diagnostico è stato studiato prima del18. In un recente studio, l’uso del saggio CEI per determinare l’attività antivirale di diversi inibitori ZIKV nelle cellule A549 è stato validato per la prima volta19. Questo articolo sui metodi descrive questo test CEI in modo più dettagliato e lo espande a varie linee cellulari aderenti, nonché a una varietà di ceppi ZIKV a varie molteplicità di infezione (MOI). In questo modo, viene dimostrato l’uso versatile di questo metodo nella ricerca antivirale sui flavivirus. Il metodo ha il vantaggio cruciale del monitoraggio cellulare in tempo reale, che consente il rilevamento di importanti punti temporali di infezione e l’attività di inibizione dinamica da parte di potenziali composti antivirali. Nel loro insieme, la tecnologia CEI offre uno strumento potente e prezioso per integrare l’attuale gamma di metodologie antivirali.
Questo articolo descrive l’uso del test CEI nella ricerca antivirale ZIKV. Il test ha il vantaggio del monitoraggio in tempo reale e può quindi essere utilizzato per valutare la cinetica dell’infezione da ZIKV e l’inibizione antivirale con composti selettivi. I dati ottenuti con questo metodo consentono un’osservazione oggettiva e visiva della CPE indotta dal virus e della potenza di un potenziale composto antivirale.
Poiché la CEI è un metodo molto sensibile, è necessario prestare molta attenzione quando si esegue questo test cellulare. È fondamentale eseguire un pipettaggio preciso per evitare il più possibile variazioni di pipettaggio. Inoltre, altri fattori che potrebbero influenzare i risultati sperimentali, come il numero di cellule e lo stock virale utilizzato, devono essere mantenuti costanti tra le ripetizioni dell’esperimento. Questi sono fattori che influenzano fortemente la cinetica della crescita cellulare e dell’infezione e potrebbero quindi portare a variazioni nei valori calcolati di CIT50 e/o altri parametri.
Quando si esegue il test CEI in presenza di (potenziali) composti antivirali, è importante determinare se influenzano l’impedenza delle cellule in assenza di virus. La tecnica è così sensibile che le variazioni di impedenza potrebbero essere misurate ben al di sotto delle concentrazioni citotossiche del composto19.
Sebbene in questo articolo siano mostrati solo i dati ZIKV, il test può essere facilmente applicato ad altri virus citopatogeni (flavi), con uno sforzo di ottimizzazione minimo, come la determinazione ottimale della frequenza di monitoraggio CEI. Gli adattamenti del saggio CEI sono stati impiegati con vari virus umani e animali, come la chikungunya, l’influenza A e gli herpesvirus umani ed equini25,26,27,28. Qui, viene anche utilizzato come metodo semplice per la quantificazione dei titoli virali o per l’identificazione di composti antivirali. Questi studi hanno utilizzato l’analisi cellulare in tempo reale, un metodo CEI alternativo.
L’uso della tecnologia CEI è limitato ai tipi di cellule aderenti, poiché il principio del test si basa sulle proprietà delle cellule aderenti per diffondersi attraverso i pozzetti incorporati nell’elettrodo. I rivestimenti superficiali del pozzo come la fibronectina possono essere utilizzati per migliorare l’attaccamento cellulare29. La metodologia presenta altri inconvenienti, il primo legato al suo costo. Oltre all’investimento nel dispositivo di monitoraggio CEI e nell’hardware e nel software di accompagnamento, anche i materiali di consumo sono piuttosto costosi. Inoltre, poiché il protocollo richiede il monitoraggio dell’infezione virale per diversi giorni, è possibile valutare una piastra da 96 pozzetti a settimana. Insieme al costo elevato, questo limita l’utilizzo a impostazioni di velocità effettiva medio-bassa.
A causa di questi problemi di throughput, la tecnologia non è adatta per le impostazioni di screening antivirale. Tuttavia, è molto interessante nelle fasi sperimentali iniziali, ad esempio, quando si valuta la suscettibilità cellulare per lo studio dell’infezione da ZIKV in un determinato contesto correlato alla malattia. La tecnologia è utile anche con linee cellulari trasfettate o knockout per osservare facilmente i cambiamenti nella cinetica dell’infezione, ad esempio, in presenza o assenza di determinati recettori di ingresso. Questo è interessante quando si studia il coinvolgimento di fattori cellulari nell’infezione da ZIKV. Inoltre, nelle fasi precliniche successive, quando è stato selezionato un determinato candidato principale, il test CEI può essere utilizzato per un’ulteriore caratterizzazione approfondita di un composto selezionato. I biosensori CEI possono anche essere modificati immobilizzando alcuni elementi di bioriconoscimento, come gli anticorpi virus-specifici, per la rilevazione di virus18. Nel complesso, ciò evidenzia l’uso versatile dell’Ince in un contesto virologico.
The authors have nothing to disclose.
Gli autori ringraziano Clément Heymann e Gorrit Lootsma per la correzione del manoscritto. Lo studio è stato sostenuto da sovvenzioni interne del Laboratorio di virologia e chemioterapia (Rega Institute, KU Leuven).
A549 cells | American Type Culture Collection (ATCC) | CCL-185 | These cells are cultured in MEM Rega-3 supplemented with 10% FBS, 2 mM L-glutamine, 0.075% sodium bicarbonate. |
Acridine Orange/Propidium Iodide Stain | Logos Biosystems | F23001 | Live/dead stain |
Cellstar polypropylene tubes, 15 mL | Greiner bio-one | 1,88,271 | |
Cellstar polypropylene tubes, 50 mL | Greiner bio-one | 2,27,261 | |
Dulbecco's Modified Essential Medium (DMEM) | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 41965-039 | Cell culture medium for U87 and HEL 299 cells |
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline (DPBS) | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 14190-094 | |
ECIS cultureware 96W20idf | Applied BioPhysics | 96W20idf PET | Assay plate for CEI device |
Electric cell-substrate impedance sensing (ECIS) Z array station | Applied BioPhysics | CEI device, including 96 well station, external control module and laptop with control, acquisition and display software. The necessary software is installed before shipment. NOTE: this device is currently out of production and has been replaced by the more advanced ECIS Z-Theta device | |
Falcon polystyrene tubes, 5 mL | Corning | 352054 | |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Cytiva | SV30160.03 | Cell culture medium additive for all used cells |
HEL 299 cells | ATCC | CCL-137 | These cells are cultured in DMEM supplemented with 10% FBS and 0.01 M HEPES. |
HEPES buffer, 1 M | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 15630-056 | Cell culture medium additive for U87 cells |
Labyrinthopeptin A1 | Kind gift from Prof. Dr. Roderich Süssmuth, Technische Universität Berlin, Germany | Antiviral compound used as an example in this protocol. It is dissolved in DMSO. | |
L-Glutamine, 200 mM | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 25030-024 | Cell culture medium additive for A549 cells |
Luna cell counting slides | Logos Biosystems | L12001 | |
Luna-FL dual fluoresence cell counter | Logos Biosystems | L20001 | Cell viability counter |
Minimum Essential Medium Rega-3 (MEM Rega-3) | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 19993013 | Cell culture medium for A549 cells |
Sodium Bicarbonate, 7.5% | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 25080-060 | Cell culture medium additive for A549 cells |
Tissue culture flask T75 | TPP | Y9076 | |
Trypsin-EDTA, 0.25% | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 25200-056 | Dissociation reagent |
U87 cells | ATCC | HTB-14 | These cells are cultured in DMEM supplemented with 10% FBS and 0.01 M HEPES. |
Virkon Rely+On tablets | Lanxess | 115-0020 | Disinfectant sollution |
Zika virus (ZIKV) MR766 | ATCC | VR-84 | ZIKV prototype strain, isolated from sentinel Rhesus monkey in Uganda in 1968 |
ZIKV PRVABC59 | ATCC | VR-1843 | ZIKV strain isolated from patient in Puerto Rico in 2015 |