ここでは、長期バイオバンキングのための初代気管支上皮細胞の単離と増殖、および気液界面での培養による分化上皮細胞の生成のための、再現性があり、手頃な価格で堅牢な方法を紹介します。
気道上皮細胞層は、肺組織と外部環境との間の最初の障壁を形成し、それによって感染性病原体や大気汚染物質などの吸入物質に絶えずさらされます。気道上皮層は、多種多様な急性・慢性肺疾患において中心的な役割を果たしており、この上皮を標的とした様々な治療が吸入によって行われています。病因における上皮の役割と、それを治療の標的にする方法を理解するには、堅牢で代表的なモデルが必要です。 in vitro 上皮培養モデルはますます使用されており、制御された環境で実験を行い、細胞をさまざまな種類の刺激、毒物、または感染因子にさらすという利点があります。不死化または腫瘍細胞株の代わりに初代細胞を使用することは、これらの細胞が培養中に細胞株と比較して上皮のより良い表現を有する偽層別分極上皮細胞層に分化するという利点を有する。
ここでは、肺組織からの気道上皮細胞の単離と培養のために、過去数十年にわたって最適化されてきた堅牢なプロトコルを紹介します。この手順は、気液界面(ALI)で培養することにより、初代気管支上皮細胞(PBEC)の単離、増殖、培養、および粘液繊毛分化の成功を可能にし、バイオバンキングのプロトコルを含みます。さらに、細胞特異的マーカー遺伝子を用いたこれらの培養物の特性評価が記載されている。これらのALI-PBEC培養物は、タバコの煙全体または炎症メディエーターへの曝露、ウイルスまたは細菌との共培養/感染など、さまざまな用途に使用できます。
この原稿で提供されるプロトコルは、手順を段階的に説明しており、実験室でそのような培養システムを実施または適応させることに関心のある人に基礎および/または参照を提供することが期待されています。
様々な急性および慢性肺疾患における気道上皮の役割は、様々なレビューに記載されている1、2、3、4、5、6、7。気道上皮細胞の高分化培養は、気道上皮の役割を解明するための重要なツールです。気液界面(ALI)気道上皮細胞培養は、気道基底上皮細胞の分化を促進し、それによって気道上皮を確実にin vitroで研究するために広く適用されています8,9。過去数年間で、COVID-19パンデミックに関連する新しい研究イニシアチブと動物を含まない研究への世界的な移行の結果として、そのようなモデルの使用はさらに増加しました。したがって、このモデル細胞株の使用の増加は、堅牢な結果を得るための手順と経験を共有する必要性を強調しています。これにより、研究グループ間の結果の比較も可能になります。手順の堅牢性は重要な特性であるため、品質管理を受ける必要があります。いくつかの研究所は、ALIで一次気道上皮細胞を培養するためのプロトコルの開発に投資しています。これらの手順を詳細に共有することで、時間、労力、必要な予算を削減できます。これらの詳細には、例えば、様々な製造業者によって提供される細胞培養プラスチックおよび培地の選択が含まれ、これが得られる培養物の特性に影響を与えることが見出されたからである10、11、12。これは、そのような洞察がない場合、結果が影響を受けたり、さまざまなラボにわたる検証作業が妨げられたりする可能性があるため、培養手順の経験と詳細を共有することの重要性を強調しています。
ヒト肺上皮は、基底細胞、繊毛細胞、杯細胞、クラブ細胞などの主要なタイプを含むさまざまな細胞タイプで構成されています。in vitroで気道の上皮細胞層を確実に模倣するためには、これらの細胞型を培養モデルで表し、それらの分極と機能を維持する必要があります13、14、15、16。ドナーの特性(疾患状態を含む)および細胞の解剖学的起源(すなわち、鼻、気管、大および小の気道)が細胞培養の細胞組成および機能応答に影響を与える可能性があることの認識も同様に重要である。関連する専門知識と実践は、初代気道上皮細胞を正常に培養し、直感的に(培養中の目視検査によって)そして定量的に培養の品質を評価するための前提条件です。この貢献の目的は、気管および小気道上皮細胞の培養にも適用できる、初代ヒト気管支上皮細胞(PBEC)の単離および培養のための費用効果と時間効率の高い方法を提供することです。切除された肺組織からそのような細胞を単離する方法を説明することに加えて、拡大およびバイオバンクのための方法、そして最後に妥当なコストと期間内での高分化型ALI培養の確立および特性評価のための方法が提示され、議論される。
ここで提示するプロトコルは、切除された肺組織からのヒト気管支上皮細胞の単離、分化能を失うことなく細胞を最適に増殖させる方法、凍結保存手順、および高分化型ALI-PBEC培養物を生成するための手順について説明しています。さらに、品質管理の説明、および差別化されたALI-PBECの監視と評価の手順が提供されます。
説明されているプロトコルは、肺がんの診断に関連する手術を受けている患者の肺葉から切除された肉眼的に正常な腫瘍のない気管支リングから始まります。したがって、これらのリングは厳密には健康な組織と見なすことができず、したがって細胞培養特性に影響を与える可能性があることに注意する必要があります。気管支上皮細胞を得るための代替供給源には、気管支生検、気管支ブラッシング、または移植ドナーまたはレシピエント肺からの組織を使用することが含まれる。発生源に関係なく、肺組織を使用する場合、微生物汚染のリスクを考慮する必要があるため、細胞培養の微生物汚染のリスクを減らすために、さまざまな培養培地で抗生物質が使用されます。特に、マイコプラズマは、細胞培養に対する多種多様な影響、細胞培養で一般的に使用される抗生物質に対する耐性、およびマイコプラズマ汚染がマイコプラズマ検出アッセイによってのみ確認できるという事実のために、細胞培養における高い一般的なリスクです。したがって、肺組織から細胞を単離した後の細胞培養の初期段階では、広域スペクトル抗菌製剤プリモシンが使用され、培養プロセス中に、無作為に選択されたサンプルがマイコプラズマの存在について試験される。
気管支リングから始まる単離手順は、分化能力を損なうことなくALIで培養を開始するために必要なこれらの初代細胞の増殖の程度を可能にするのに十分な出発材料を提供します。しかし、限られた細胞数で単離された上皮細胞の増殖を開始することは、ALI培養のために播種することができる十分な細胞を有する十分な数のインサートを得ることに問題を引き起こす可能性がある。初代細胞の長期培養および反復継代は、複製老化をもたらす可能性がある。この制限を克服するために、さまざまなソリューションが提案されています。Horaniらは、Rhoキナーゼ阻害剤(ROCK)Y−27632が基底細胞の増殖を増加させることを示し30、Mouらは、分化した上皮細胞層31の特性を維持しながら基底幹細胞を拡張するために二重Smad阻害を使用し、Sachsらは、気道上皮細胞を拡張し、複数回継代の過程でそれらの分化能を維持するために使用することができる気道オルガノイド系を開発した32.後者の方法は、早産児(妊娠28週齢<)からの気管吸引液(TA)や気管支肺胞洗浄(BAL)液などの細胞数が非常に少ないソースから細胞を増殖させるためにも使用され、ここで説明するようにALI培養に移しました33。BALおよびTAから単離された細胞は、気管支組織から生成された細胞と同様の分化能力を示したが、Notchシグナル伝達阻害またはTh2サイトカインIL-13を用いてより繊毛またはより多くの杯細胞含有培養物に分化が偏った場合、差異が観察された33。したがって、ALI-PBECを同様のアプローチで上皮細胞数の低い出発物質から培養する場合は、プロトコルのセクション6で説明されているように、基本的な品質基準について培養物を常に確認することをお勧めします。重要なことに、フィーダー細胞の使用は、時間と細胞数が不可欠な移植可能な足場工学の設定で不可欠な、より大きな細胞数の取得にも役立つ可能性があります。このことは、気管疾患患者由来の生検から自家上皮細胞を培養し、マウス胚フィーダー層(有糸分裂的に不活化された3T3-J2線維芽細胞)および上記のRho/ROCK経路阻害剤(Y-27632)の存在下で細胞を急速に増殖させた研究によって示されています34。得られた細胞培養は、気管足場の再増殖に有用であることが見出され、したがって、これは移植モデルに適したプロトコルと見なすことができる。
この貢献で説明されているプロトコルを使用する場合だけでなく、他の培養プロトコルを使用する場合も、必然的に選択バイアスが導入されます。培養を開始するために使用される細胞の起源、培地組成、およびその他のプロトコルの詳細などのプロトコルの詳細の違いは、培養物の細胞組成の変化、ひいてはALI培養の応答の変化につながる可能性があることを認識することが重要です33、35。加えて、気道細胞10、11を分化させるための異なる培地を比較すると、細胞特性の違いも観察された。PneumaCult培地とcBD培地を比較すると、杯細胞とクラブ細胞のmRNAマーカー、TEER値、および細胞層の厚さに違いが見られました。これらの観察に基づいて、統計的裏付けがないにもかかわらず、使用されるドナーの数が少なく、培地組成が顧客に知られておらず、PneumaCult培地のコストが高いため、私たちの研究室ではcBD培地を使用することが決定されました。
説明したように、細胞はオルガノイド培養を使用して最初に増殖させ、その後2D ALIインサートシステムに移すことができます。気道上皮オルガノイドは空気浮遊物質への曝露には適していないのに対し、ALI 2Dシステムを使用すると、タバコの煙23,36などの浮遊物質が培養気道上皮細胞に与える影響を評価できるため、これは重要です。ALI気道上皮細胞培養を確立するための別のアプローチは、ヒト多能性幹細胞(hiPSC)の分化によって気道上皮細胞を生成することです37。このようなプロトコルでは、近位気道前駆細胞への分化後の分化プロトコールの最終段階で、ここで説明したものと同様の手順を用いてALIへの培養によって細胞を分化させることができる。
現在のプロトコールでは、ALIでの培養にはcBD培地が用いられている。cBD培地は、Fulcherら38 および他の研究に触発された、異なるサプリメントの混合物を加えることによって調製される無血清培地である。サプリメント溶液には、52 μg/mLのウシ下垂体抽出物(BPE)、0.5 μg/mLのヒドロコルチゾン、0.5 ng/mLのヒトEGF、0.5 μg/mLのエピネフリン、10 μg/mLのトランスフェリン、5 μg/mLのインスリン、6.5 ng/mLのトリヨードサイロニン、および0.1 ng/mLのRA39が含まれています。BPEは組織抽出物であり、バッチごとの変動を受けるため、培地を完全に定義された培地と見なすことはできず、動物を含まないものでもありません。完全に定義された細胞培養培地は、バッチ間の差異を最小限に抑えるために好ましい。動物を含まない研究への移行を考慮すると、動物性食品を含まず、科学界にとって手頃な価格の定義された培地を作成するための努力がなされることが重要です。
研究課題に応じて、ALIモデルに基づいてさまざまな実験セットアップを使用できます。例えば、分化プロセスに影響を与える可能性のある化合物の影響を調べるために、これは、水中培養のさまざまな段階、分化中、または高分化段階で化合物を培養物に添加することによって対処できます。ALI-PBEC培養物の細胞組成は、特定の化合物を添加することによって影響を受ける可能性があります。例えば、IL-13の存在下でALI-PBECを分化させると、より多くの杯細胞とより少ない繊毛細胞を含む培養が生成されますが、分化中にγセクレターゼ阻害剤DAPT(Notchシグナル伝達をブロックするために使用)で処理すると、杯細胞を犠牲にしてより多くの繊毛細胞で培養されます23,40,41,42。
さらに、細胞を刺激するか、または特定のプロセスを遮断する薬剤は、基底区画に適用することも、培養物の頂端区画に(非常に少量で)適用することもできる。細胞は、頂端側から空気中の物質にさらされることもあります。このような暴露設計は、PBECに対するディーゼル排気ガスまたはタバコの煙全体の影響を研究するために使用されています23,43,44。培地は、培地を交換するたびに回収して、基底側で分泌されたタンパク質をモニターすることができます。基礎培地をリフレッシュしながらPBSで洗浄した細胞の頂端側についても同様である。いわゆる頂端洗浄液を採取し、オプションのジチオエリスリトール(DTE)を添加して、杯細胞によって生成される粘液をより効率的に解離します。細胞ライセートは、総タンパク質、RNA、染色体およびミトコンドリアDNAの単離のために得ることができます。細胞は、プラスチックインサートからポリエチレンテレフタレート(PET)膜を切断し、さらにこの膜を複数の免疫蛍光染色のためにより小さな断片に切断することによって、特異的マーカーに対する抗体を用いてさらに研究することができる45。さらに、フローサイトメトリーまたはFACSは、インサート内の細胞のトリプシン処理後に使用することもできる。ALI段階では、電気抵抗を測定し、続いて電気抵抗がメンブレンインサートの表面積に反比例するTEERを計算することにより、細胞バリアの発達をモニターできます。計算は、次の式を使用してオームの法則に基づいています:ここで、Rmは測定された電気抵抗、Rbはコーティングおよびセルのないインサートのベースライン電気抵抗、SAはインサートの膜の表面積です。EVOM2およびSTX/箸電極を使用した電気抵抗の測定は簡単ですが、ウェルに導入する際の取り扱い手順に大きく依存します。また、電極の形状は比較的大きな表面積17のバリア機能の測定に影響することが示唆された。
正確な組織表現を増加させることを目的としたALI細胞培養システムのさらなる改善には、白血球、線維芽細胞または内皮細胞などの追加の細胞型の共培養が含まれる46,47,48。ALI-PBECと顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF)またはM-CSF分化マクロファージとの共培養は、自然上皮応答および修復に著しく影響することが観察されている48。このような共文化モデルでは、中程度の互換性が問題になる可能性があることに注意することが重要です。気道上皮細胞培養に使用される培地はPBEC専用に開発されており、他の細胞種には最適ではない可能性があるため、最適化が必要です。単離されたPBECを使用できる気道生物学の分野で見られる別のタイプの進歩は、臓器チップ(OoC)技術の使用です49,50。この技術を使用して、ストレッチ、空気、媒体の流れなどの呼吸と血流の機械的な力の影響を調べることができます29。
さまざまなドナーからのPBECを使用する場合、ドナー間の変動性は重要である可能性があるため、上皮細胞培養研究でこの変動性を説明するために、複数のドナーからの細胞を使用することを検討することが重要です。ALI-PBECの培養には時間がかかり、かなりのコストがかかるため、1つの細胞培養インサートで異なるドナーの細胞を混合してALI-PBEC培養を確立するオプションを検討します。このようにして、様々な個々のドナーに由来する培養物の応答を分析する前に、初代細胞を用いてパイロット実験を容易に行うことができる。さらに、異なる特性(例えば、異なる年齢カテゴリーまたは性別)を有するドナーを、探索的研究のためにグループ化することができる。ドナーミックスを使用する場合、より高い増殖率の結果として1人のドナーが結果を支配する可能性を防ぐために、異なるドナーの等しい細胞数が存在することを確認することが重要です。したがって、個々のドナーからの細胞は別々に増殖され、個々のドナーからの細胞の播種と比較してインサート内でより高い密度で播種され、ALIに移行する前のインサートでの増殖を最小限に抑える。ドナーミックスと対応する個々のドナーの反応は、SARS-CoV-2の感染動態を研究することによって比較されました。RT-qPCRおよび免疫蛍光染色を用いて、ドナーミックスは、産生されたウイルス粒子の数が同程度で、感染細胞の数が類似していることを示すことにより、様々な個々のドナーの良好な表現を提供することが観察された28。
動物モデルにとって許容可能な代替手段となるためには、培養気管支上皮細胞の遺伝子編集が実行可能であるべきである51。ALI-PBECに低分子干渉RNA(siRNA)を用いることによるRNA干渉技術を検討しているが、培養液中に細胞にsiRNAをトランスフェクトする必要があるため、培養中にsiRNAトランスフェクションを頻繁に繰り返さない限り、ALI培養中は培養期間が長いため、ノックダウンが十分に維持されない52.それにもかかわらず、siRNAは、水中基底細胞における遺伝子発現を改変するために首尾よく使用することができる。また、CRISPR/Cas9技術を用いて、リボ核タンパク質(RNP)送達を用いた初代ALI気道上皮細胞培養において遺伝子編集に成功した者もいる 53。このような技術を使用する場合、細胞が完全な分化能力を維持することが不可欠です。初代気道細胞培養は無期限に継代できないため、遺伝子編集細胞のクローン増殖は容易ではなく、トランスフェクト細胞を選択するための培地の追加は煩雑です。そのため、全ての培養細胞において望ましいノックダウンを達成することは困難である。ノックアウトクローンを生成するための代替案は、hiPSCにおけるノックアウト戦略の使用54 および気道上皮細胞を生成するためのこれらの細胞の使用である。最適ではないが別の代替案は、遺伝子編集細胞55をクローン的に増殖させるために不死化PBEC系統を確立することである。
ここで提示されたプロトコルは、高度に分化した疑似層別化ALI-PBECを生成する1つの方法ですが、提示されたプロトコルと比較して、より小さな違いと大きな違いで、そのような文化を確立する他のプロトコルも見出されています。私たちの意見では、ALI-PBECシステムおよび気道上皮細胞の同様の培養システムが動物実験の有効な代替手段になるには、培養方法の実験室全体の検証と厳格な品質管理が不可欠です。
The authors have nothing to disclose.
この寄稿で説明されているモデルを使用した研究は、オランダ肺財団、オランダ健康研究開発機構(ZonMw、COVID-19 MKMD助成金)、オランダ動物実験代替協会(Stichting Proefdiervrij、助成金#114025007)、ベーリンガーインゲルハイムやガラパゴスなどの企業からの研究助成金など、さまざまな資金提供機関によってサポートされています。 図 1 は BioRender.com を使用して作成しました。
1,000 ohm test resistor | World Precision Instruments | N/A | Used to calibrate the EVOM2 Epithelial Voltohmmeter |
4-[2-(5,6,7,8-Tetrahydro-5,5,8,8-tetramethyl-2-naphthalenyl)ethynyl)-benzoic acid (EC 23) | Tocris | 4011 | Used in cBD medium |
6-well Clear TC-treated Multiple Well Plates | Corning | 3506 | Used in the first step to grow the cells isolated form the bronchial ring |
Airway Epithelial Cell Growth Medium Kit | PromoCell | C-21160 | Used to compare to cBD medium |
Bead Bath 20 Liter | Lab Armor | 74220-720 | Used to pre-warm cell culture solutions |
BEGM Bronchial Epithelial Cell Growth Medium BulletKit | LONZA | CC-3170 | Used to compare to cBD medium |
Bovine albumin fraction V (BSA) | Thermo Fisher Scientific | 15260037 | Used in coating solution |
Bovine pituitary extract (BPE) | Thermo Fisher Scientific | 37000-015 | Used in c-KSFM |
Bronchial epithelial cell growth supplement (BEpiCGS) | ScienCell Research Laboratories | 3262 | Used in cBD medium |
Bronchial epithelial cell medium-basal (BEpiCM-b) | ScienCell Research Laboratories | SCC3211-b | Used in cBD medium |
Cell culture inserts; 12 mm Transwell with 0.4 µm pore polyester membrane insert | Corning | 3460 | Cell culture inserts used in the protocol |
Cell culture inserts; 12-well inserts, 0.4 µm PET clear | CellQART made by SABEU | 9310412 | Cell culture inserts used to compare with Corning cell culture inserts |
Cell culture inserts; 12-well ThinCert Tissue culture Inserts | Greiner Bio-One | 82050-032 | Cell culture inserts used to compare with Corning cell culture inserts |
CELLSTAR flask, TC, PS, 250 ml, 75 cm2 | Greiner Bio-One | 658170 | Used to expand the number cells |
CFX Maestro 1.0 | Bio-Rad | N/A | Software program for analyzing qPCR data generated with the CFX384 System |
CFX384 Touch Real-Time PCR Detection System | Bio-Rad | 1855484 | qPCR detection system |
Chopstick electrode set | World Precision Instruments | STX2 | Used to measure electrical resistance in ALI-PBEC |
CO2-Incubator | PHCbi | MCO-170AICUV-PE | Cell culture incubator used for mycplasma free cell cultures |
CO2-Incubator | Hereaus | Heracell 150 | Cell culture incubator used for possibly mycplasma infected cell cultures |
Coolcell Container | Corning | 432006 | Used to cryopreserve cells at -80 °C before transfer to liquid N2 |
Countess 3 Automated cell counter | Thermo Fisher Scientific | AMQAX2000 | Used to count cells and determine the cell concentration |
Cryovials | Nalgene | 479-3224 | Used to cryopreserve cells in |
D-Glucose | Avantor VWR BDH CHEMICALS | 101174Y | Used in soft trypsin |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Avantor VWR | 0231 | Used in cell freeze medium |
dNTP (10 mM) | Promega | U1515 | Used in the synthesis of cDNA |
Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM) + 4500 mg/l D-Glucose | STEMCELL Technologies | 36250 | Used in cBD medium |
Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM) 4.5 g/l glucose with l-glutamine | LONZA | LOBE12-604F | Used in cBD medium to compare with DMEM from other manufacturers |
Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM), high glucose, pyruvate | Thermo Fisher Scientific | 41966029 | Used in cBD medium to compare with DMEM from other manufacturers |
Epidermal growth factor (EGF) | Thermo Fisher Scientific | 37000-015 | Used in c-KSFM |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Avantor VWR BDH CHEMICALS | 443885J | Used in soft trypsin |
EVOM2 Epithelial Voltohmmeter | World Precision Instruments | 91799 | Used with the chopstick electrode set to measure electrical resistance in ALI-PBEC |
Fibronectin solution, Human | PromoCell | C-43060 | Used in coating solution |
Glutamax | Thermo Fisher Scientific | 35050038 | Used in cBD medium |
Hanks balanced salt solution (HBSS) | ScienCell Research Laboratories | SCC0313 | Used to dissolve protease XIV |
IQ SYBR Green Super mix | Bio-Rad | 170887 | qPCR reagent |
Isoproterenol hydrochloride, (-)- | Sigma-Aldrich | I-6504 | Used in c-KSFM |
Keratinocyte-SFM (KSFM) | Thermo Fisher Scientific | 17005-034 | Used in c-KSFM |
Maxwell RSC Instrument | Promega | AS4500 | Automated RNA isolation system |
Maxwell RSC simplyRNA Tissue Kit | Promega | AS1340 | Used to isolate total RNA with the Maxwell RSC Instrument |
M-MLV Reverse transcriptase | Promega | M5301 | Used in the synthesis of cDNA |
M-MLV Reverse transcriptase 5X reaction buffer | Promega | M531A | Used in the synthesis of cDNA |
MycoStrip | InvivoGen | rep-mys-10 | Used to detect the presence of mycoplasma in cell culture samples |
N-2-hydroxyethylpiperazine-N-2-ethane sulfonic acid (HEPES) | Thermo Fisher Scientific | 15630056 | Used in cBD medium |
Oligo(dT)15 | Qiagen | 79237 | Used in the synthesis of cDNA |
Penicillin/Streptomycin solution (Pen/Strep) | ScienCell Research Laboratories | SCC0513 | Used as antibiotic in c-KSFM and cBD medium |
Phosphate buffered saline (PBS) | LUMC pharmacy | N/A | Used in different steps of the protocol |
Pneumacult-ALI Medium | STEMCELL Technologies | 05002 | Used to grow cells in the differentiation stage to compare to cBD medium |
Pneumacult-Ex Plus Medium | STEMCELL Technologies | 05040 | Used to grow cells in the submerged stage to compare to cBD medium |
Primer, ATP5B, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: TCACCCAGGCTGGTTCAGA |
Primer, ATP5B, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: AGTGGCCAGGGTAGGCTGAT |
Primer, FOXJ1, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: GGAGGGGACGTAAATCCCTA |
Primer, FOXJ1, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: TTGGTCCCAGTAGTTCCAGC |
Primer, MUC5AC, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: CCTTCGACGGACAGAGCTAC |
Primer, MUC5AC, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: TCTCGGTGACAACACGAAAG |
Primer, MUC5B, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: GGGCTTTGACAAGAGAGT |
Primer, MUC5B, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: AGGATGGTCGTGTTGATGCG |
Primer, RPL13A, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: AAGGTGGTGGTCGTACGCTGTG |
Primer, RPL13A, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: CGGGAAGGGTTGGTGTTCATCC |
Primer, SCGB1A1, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: ACATGAGGGAGGCAGGGGCTC |
Primer, SCGB1A1, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: ACTCAAAGCATGGCAGCGGCA |
Primer, TP63, forward | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: CCACCTGGACGTATTCCACTG |
Primer, TP63, reverse | Integrated DNA Technologies | N/A | Nucleotide sequence: TCGAATCAAATGACTAGGAGGGG |
Primocin | InvivoGen | ant-pm-2 | Used as antimicrobial agent against bacteria, mycoplasma, and fungi in c-KSFM medium |
Protease XIV | Sigma-Aldrich | P5147 | Used for the enzymatic treatment of the bronchial ring |
RNAsin Recombinant Ribonuclease inhibitor | Promega | N2515 | Used in the synthesis of cDNA |
Soybean trypsin inhibitor (SBTI) | Sigma-Aldrich | T9128 | Used to inhibit the action of soft trypsin |
T100 Thermal Cycler | Bio-Rad | 1861096 | Used in the synthesis of cDNA |
TissueSAFE plus | MILESTONE MEDICAL | N/A | Vacuum transfer system for biological specimens |
Trypan blue solution | Thermo Fisher Scientific | 15250061 | Used to count live- and dead cells |
Trypsin 1:250 | Thermo Fisher Scientific | 27250-018 | Used in soft trypsin |
Type I collagen solution (PureCol) | Advanced BioMatrix | 5005-B | Used in coating solution |
Universal container, PP, with PE screw cap | Avantor VWR | 216-2053 | Used in the protocol for the Protease XIV treatment of the bronchial ring |