Bu yazıda, canlı bir Clytia hemisphaerica medusa’nın epitelinde yara oluşturmak ve in vivo olarak yüksek çözünürlükte yara iyileşmesini görüntülemek için bir yöntem açıklanmaktadır. Ek olarak, yara iyileşmesi sırasında epitel hücrelerinde ve hücre dışı matrikste sinyal süreçlerini bozmak için boyalar ve ilaçlar tanıtmak için bir teknik sunulmaktadır.
Deriden gözlere ve bağırsaklara kadar tüm hayvan organları, onları enfeksiyondan korurken homeostazı sürdürmelerini sağlayan epitel hücreleri tabakaları ile kaplıdır. Bu nedenle, epitel yaralarını onarma yeteneğinin tüm metazoanlar için kritik olması şaşırtıcı değildir. Omurgalılarda epitelyal yara iyileşmesi, enflamatuar yanıtlar, vaskülarizasyon ve yeniden epitelizasyon dahil olmak üzere örtüşen süreçleri içerir. Bu süreçlerin düzenlenmesi, epitel hücreleri, komşu hücreler ve hücre dışı matris (ECM) arasındaki karmaşık etkileşimleri içerir; ECM yapısal proteinler, düzenleyici proteinler ve aktif küçük moleküller içerir. Bu karmaşıklık, çoğu hayvanın opak dokulara ve erişilemeyen ECM’lere sahip olmasıyla birlikte, yara iyileşmesinin canlı hayvanlarda incelenmesini zorlaştırmaktadır. Bu nedenle, epitelyal yara iyileşmesi üzerine yapılan birçok çalışma, doku kültürü sistemlerinde, yapay bir matris üzerinde tek katmanlı olarak kaplanmış tek bir epitel hücre tipi ile gerçekleştirilir. Clytia hemisphaerica (Clytia), bu çalışmalara benzersiz ve heyecan verici bir tamamlayıcı sağlar ve epitelyal yara iyileşmesinin otantik bir ECM ile bozulmamış bir hayvanda incelenmesine izin verir. Clytia’nın ektodermal epiteli, canlı hayvanlarda diferansiyel girişim kontrast (DIC) mikroskobu kullanılarak yüksek çözünürlüklü görüntülemeye izin veren tek bir büyük skuamöz epitel hücresi tabakasıdır. Göçmen fibroblastların, vaskülatürlerin veya inflamatuar yanıtların yokluğu, in vivo olarak yeniden epitelizasyonda kritik olayların diseksiyonunu mümkün kılar. Tek hücreli mikro yaralar, küçük ve büyük epitel yaraları ve bazal membrana zarar veren yaralar dahil olmak üzere çeşitli yara türlerinin iyileşmesi analiz edilebilir. Lamellipodia oluşumu, kese ipi kasılması, hücre gerilmesi ve kolektif hücre göçü bu sistemde gözlenebilir. Ayrıca, hücre: ECM etkileşimlerini ve hücresel süreçleri in vivo olarak değiştirmek için ECM aracılığıyla farmakolojik ajanlar tanıtılabilir. Bu çalışma, canlı Clytia’da yara oluşturma, iyileşme filmlerini yakalama ve reaktifleri ECM’ye mikroenjeksiyon yoluyla iyileşme mekanizmalarını araştırmak için yöntemler göstermektedir.
Epitel hücrelerinin tabakaları tüm metazoanların dış yüzeyini kaplar, iç organları hizalar ve hayvan vücudunu ayrı bölmelere böler. Epitel ayrıca iç vücudu dış ortamdan ayırır ve hasar ve enfeksiyondan korur. Bu nedenle, epitel tabakalarının ortaya çıkışı, çok hücreli hayvanların evriminin önemli bir parçasıydı ve epitel tabakaları, omurgalılardan en bazal metazoanlara kadar tüm hayvanlarda görülür1. Bazı organların epiteli, akciğer hava kesecikleri, kan damarları ve bağırsak2’de olduğu gibi, ayrıca planaria ve cnidarians3 gibi omurgasızların epidermisinde olduğu gibi tek bir tek katmandır. Omurgalıların deri4 ve kornea5 gibi diğer dokularda, epitel tabakalaşır, yani çoklu epitel hücre katmanları2 vardır. Her durumda, en bazal epitel tabakası, hücre dışı matrisin (ECM) özel bir bölgesini oluşturan bir protein tabakası olan bazal membrana yapıştırılır6,7,8.
Epiteldeki ihlaller, sürekli bir epitel tabakasını yeniden oluşturmak için hızla onarılmalıdır. Epitel hasarı, bağırsaktaki epitel hücrelerinin dökülmesi gibi doğal süreçler sırasında ortaya çıkar,9,10 ve iltihaplanma veya fiziksel travma sonucu ortaya çıkar. Tek bir epitel hücresi hasar gördüğünde, çevreleyen hücrelerin birbirine yapışmasına ve11,12 deliğini kapatmasına izin vermek için ya kendini onarmalı ya da ortadan kaldırılmalıdır. Tek bir hücrenin boyutundan daha büyük yaralarda, epitel hücreleri birbirlerine ulaşmak ve tabakayı onarmak için hareket etmelidir13. Bu, boşluklar küçükse hücre yayılımı ile sağlanabilir veya yara boşluğunu kapatmak için epitel hücrelerinin bir yaranın kenarlarından göçünü gerektirebilir; Bu son sürece yeniden epitelizasyondenir 14,15. Embriyonik dokularda, epitel hücreleri yayılır ve yakın yaralara göç eder veya yara kenarındaki hücreler arasında oluşan aktomiyozin kablolarının bir kese ipine benzeyen bir mekanizma içinde kasılması ile boşluk boyunca çekilir16. Birçok yetişkin dokuda, yeniden epitelizasyon, hücrelerin komşu hücrelerle kavşaklarını koruduğu tutarlı hücre tabakalarının göçünü içerir14,17,18. Diğer dokularda, hücre: hücre bağlantıları sökülür ve epitel hücreleri daha çok mezenkimal hücreler gibi davranır, yeniden epitelizasyon sırasında koordineli fakat bağımsız bir şekilde yara bölgesine hareket eder 14,19,20,21.
Epitel hücre hareketleri, göç eden hücreler arasındaki ve hücreler ile ECM arasındaki karmaşık etkileşimler tarafından düzenlenir. Epitel hücrelerinin yara aktivasyon mekanizmalarını ve ardından göçü ele alan muazzam miktarda deneysel literatür olmasına rağmen, hala keşfedilmeyi bekleyen çok şey var. Örneğin, bir yaraya yanıt olarak epitel hücrelerini göç etmek için aktive eden ilk sinyal kesin olarak tanımlanmamıştır 22 veya aktinin, yaraya en yakın epitel hücrelerinin yanında lamellipodia oluşturmak için nasıl yeniden konuşlandırıldığı tam olarak anlaşılamamıştır 22,23,24,25,26,27. Kolektif hücre göçü, yaradaki hücrelerden gelen bilgilerin yaraya distal hücrelerle paylaşılmasını gerektirir ve iletişim yolu hala belirsizdir28. Hücre: hücre kavşakları ve hücre: ECM ekleri, tabakadaki hücreler kendilerini yeniden düzenlerken sökülmeli ve yeniden düzenlenmelidir, ancak bu işlemin düzenlenmesi tam olarak anlaşılamamıştır14,29. Bu ve diğer ilgili sorularda ilerleme kaydetmek sadece temel bir biyolojik problem olarak değil, aynı zamanda doğru yara iyileşmesinin klinik önemi nedeniyle de önemlidir. Epitel hücrelerinin doğru göç etme yeteneğini tehlikeye atan hastalıklar kronik yaralara neden olur; Bir örnek, epitel hücrelerinin ECM’ye bağlanmasında rol oynayan genlerin mutasyona uğradığı ve soyulan ve kabarcıklanan kırılgan bir cilde neden olan genetik hastalık epidermolizis bülloza’dır. Doğal olarak yaşlanan dokularda yeniden epitelizasyon da tehlikeye girer30,31. Bu nedenle, yara iyileşmesi sonuçlarını iyileştirmek için müdahaleler geliştirmek için daha iyi bir anlayış şarttır.
Yara iyileşmesinde epitel hücre göçü hem in vitro yaklaşımlar hem de model organizmalar kullanılarak incelenmiştir. Yara iyileşmesi ve hücre göçü mekanizmaları ile ilgili çalışmaların çoğu, tek bir epitel hücre tipinin tek katmanlarının ECM’nin yerini alan bir substrat üzerinde yetiştirildiği doku kültüründe gerçekleştirilmiştir. Hücre tek katmanları, belirli şekil ve boyutlarda boşluklar oluşturmak için çizilir veya şablonlarla büyütülür ve daha sonra 32,33,34 olarak gözlemlenir. İn vitro model, hücre davranışının ideal bir şekilde görselleştirilmesinin yanı sıra, substratın niteliklerini değiştirme, hücreleri ilaçlara ve abiyotik ve biyotik faktörlere maruz bırakma ve çeşitli genleri ifade eden veya baskılayan yapılara sahip hücreleri transfekte etme fırsatına izin verir. Bununla birlikte, bu indirgemeci yaklaşım, çeşitli hücre tipleri arasındaki iletişim ve ECM11’de meydana gelen sinyal olayları da dahil olmak üzere, in vivo bağlamda epitel hücre davranışında yer alan bazı önemli parametreleri yakalamada başarısız olabilir. İn vivo modeller, birden fazla hücre tipi, çakışan sinyal yolları ve karmaşık bir ECM35 ile bir yaranın otantik bağlamını sağlar. Yara iyileşmesi çalışmaları için böyle bir model, son gelişmelerin araştırmacıların canlı hayvanlarda tam kalınlıktaki yaraların iyileşmesi sırasında epidermal hücreleri gözlemlemelerine izin verdiği fare19’dur 36. Bununla birlikte, fare ve diğer in vivo sistemler, yeniden epitelizasyonu incelemek için zorluklar ortaya koymaktadır. İlk olarak, hücre davranışını doğal bir bağlamda gözlemlemenin en büyük avantajı, kanın pıhtılaşması, bağışıklık hücrelerinin işe alınması ve iltihaplanma, fibroblastların işe alınması ve hücre farklılaşması, yeniden vaskülarizasyon ve ECM’nin yeniden şekillendirilmesi dahil olmak üzere omurgalı yara iyileşmesi sırasında meydana gelen geçici olarak örtüşen olayların karmaşıklığı ile dengelenir. Ayrıca, opak dokular görüntülemeyi zorlaştırır. Drosophila larva ve Zebrafish epidermis sistemleri 37,38, göreceli basitlikleri nedeniyle bu zorlukların bazılarının üstesinden gelmiştir39.
Laboratuvarımız yakın zamanda epitel yara iyileşmesini incelemek için yeni bir model tanıttı: hidrozoan cnidarian Clytia hemisphaerica’nın (Clytia) medusa (denizanası) formu40. Clytia, tam dizili ve açıklamalı genom41, tek hücreli RNAseq transkriptom 42 ve genom modifikasyonu için protokoller (mutagenez ve transgenez) 43,44,45 ile ortaya çıkan bir model organizmadır. Cnidarians, epitel katmanlarına sahip en eski mevcut soylardan biridir, bu nedenle cnidarian yara iyileşmesini anlamak, epitel bütünlüğünü sağlayan ataların yollarına dair içgörüler sağlar. Yaşam ağacı boyunca korunmuş olan yollar için Clytia, epitel hücre dinamiklerini ve in vivo yara iyileşmesinin fonksiyonel düzenlemesini incelemek için heyecan verici yeni bir sistem sunar.
Clytia medusa’nın (exumbrella) üst yüzeyini kaplayan epitel, yaklaşık 50 μm genişliğinde ve 1-2 μm kalınlığında şeffaf, skuamöz epitel hücrelerinin tek katmanlıdır (Şekil 1). Denizanasının “jölesi” olan mezoglea adı verilen bir ECM’ye bağlanırlar. Mezoglea, omurgalılar da dahil olmak üzere diğer hayvanlarda 46,47,48 bulunan ECM’ye bileşimsel olarak benzer, bir bazal membran 40’a sahiptir ve tamamen şeffaftır. Clytia medusa’daki epitel tabakası kolayca çizilebilir veya yaralanabilir (aşağıya bakınız). Epitel ve ECM’nin basitliği ve şeffaflığı, hücrelerin ve iyileşme sırasındaki hareketlerinin yüksek çözünürlüklü görüntülenmesini sağlar. Son zamanlarda, Kamran ve ark. Clytia epitelindeki küçük yaraların iyileşmesini ayrıntılı olarak karakterize ettiler40. Clytia’da iyileşmenin, lamellipodia tabanlı hücre taraması, hücre yayılımı ve kolektif hücre göçünün yanı sıra embriyonik sistemlere daha tipik olan cüzdan ipi kapanması yoluyla gerçekleştiği gösterilmiştir (daha önce kornea49 gibi yetişkin hayvan yapılarında görülmesine rağmen). Clytia yara iyileşmesi, enflamatuar yanıtı olmayan diğer sistemlerde görüldüğü gibi son derece hızlıdır40,50. Clytia exumbrella’da iyileşme tamamen mevcut epitel hücrelerinin hareketlerine bağlıdır – hiçbir hücre çoğalmaz veya ECM’den yara bölgesine göç etmez (Ek Film 1). Tüm bu bulgular, Clytia’nın epitel yara iyileşmesini incelemek için yararlı bir model sistem olduğunu göstermektedir. Gerçekten de, yara iyileşmesi sırasında Clytia’daki epitel hücrelerinin görüntülenmesinin kolaylığı, epitel hücreli lamellipodia’nın sağlam bir bazal membran olduğu sürece maruz kalan ECM alanlarına yayıldığını ve yayıldığını keşfetmeye yol açmıştır; Bazal membran hasar görürse, epitel iyileşmesi bir çanta ipi mekanizmasına geçer40. Bu, lamellipodia tabanlı sürünmeye karşı cüzdan ipi kapanması ile kapanma kararının altında yatan bir mekanizmanın ilk gösterimiydi ve spesifik hücre: ECM etkileşimlerinin iyileşmede ve hücreleri doğal bağlamlarında gözlemlemenin önemini vurguladı.
Aşağıda, tek hücreli mikro yaraların, öncelikle hücre yayılımı ile kapanan küçük yaraların ve kolektif hücre göçünün kapanmasını gerektiren büyük yaraların oluşturulması ve görüntülenmesi için protokoller açıklanmaktadır. Ayrıca, küçük moleküllerin ECM ve epitel hücrelerine sokulması için bir protokol tanımlanmıştır ve yara iyileşmesinin varsayılan düzenleyici yollarının deneysel bozulmalarına izin vermektedir.
Burada, nispeten yeni bir omurgasız model organizma olan Clytia’da in vivo yaraların görüntülenmesi için metodolojisunulmaktadır 40,43,58. Bu sistemi, yara iyileşmesi ve yeniden epitelizasyonu incelemek için kullanılan diğer modellerden farklı, benzersiz ve güçlü bir araştırma aracı yapan çeşitli faktörler vardır. İlk olarak, tek katmanlı epitel şeffaf bir ECM’ye bağlanır, bu nedenle in vitro doku kültürü tahlillerine benzer (Şekil 1, Şekil 2, Şekil 3, Şekil 4). İn vitro testlerde olduğu gibi, hücreler yüksek çözünürlükte görüntülenebilir. Bununla birlikte, doku kültüründen farklı olarak, otantik bir hücresel ortam ve ECM vardır, böylece yara iyileşmesi, canlı yaralı bir hayvanda meydana gelen karmaşık sinyal olayları bağlamında görülebilir. İkincisi, Clytia enflamatuar yanıtlardan, göçmen fibroblastlardan, vaskülatürden ve kandan yoksundur. Bu, yara iyileşmesi sırasında daha karmaşık yetişkin hayvanlarda meydana gelen örtüşen olayların yokluğunda yeniden epitelizasyon sürecinin in vivo olarak incelenmesini sağlar59. Üçüncüsü, ECM asellüler (Ek Film 1) ve büyüktür, mikroenjeksiyon iğnesi ile kolay erişim sağlar (Şekil 5 ve Şekil 6). Bu yaklaşımı kullanarak, araştırmacılar ECM yapısını veya sinyalini bozan farmakolojik reaktiflerin in vivo yara iyileşmesi üzerindeki etkisini test edebilirler. Reaktifler ayrıca epitel hücrelerine de sokulabilir ve in vivo yara iyileşmesi üzerindeki etkileri değerlendirilebilir. Dördüncüsü, Clytia sisteminde mutantlar ve transgenik hayvanlar yaratmak için var olan protokoller vardır42,43,44,45. Bu nedenle in vivo yara iyileşmesi, ilgilenilen genlerin ekspresyonunun arttığı/azaldığı hayvanlarda gözlenebilir.
Bu teknikte birkaç kritik adım vardır. İlk olarak, Şekil 3’te gösterildiği gibi, düz, şeffaf epitel hücreleri standart ışık mikroskobu ile neredeyse görünmez olduğundan, DIC mikroskobu için doğru şekilde yapılandırılmış bir mikroskop kullanmak gerekir. Hayvanları nazikçe yaralama becerisini geliştirmek de önemlidir, böylece epitel ECM’yi oyuklamadan zarar görür. Malzemelerin ECM’ye mikro enjekte edilmesi için benzer şekilde nazik bir dokunuş gereklidir, çünkü enjeksiyon sırasında hayvana verilen kapsamlı hasar, yara iyileşmesinin sonraki bir analizini tehlikeye atabilir. Bu tekniklerin bir öğrenme eğrisi olsa da, yeni başlayan öğrenciler bile Malamy laboratuvarında hızlı bir şekilde ustalaşmışlardır. Gerçekten de, bu protokoller Chicago Üniversitesi’ndeki lisans laboratuar derslerinde hücre göçünü göstermek için kullanılmıştır.
Optimum görüntüleme için, hayvanın hareket etmemesi ve seçilen yara alanının görüş alanının dışına kaymaması önemlidir. Hayvanlar nabız atıyorsa, tarif edildiği gibi Trikain ile tedavi çok etkilidir. Sürüklenme için, genellikle numuneyi manuel olarak yeniden konumlandırmak gerekir. Bu hareketler, FIJI/ImageJ’deki kayıt işlevi kullanılarak son filmden çıkarılabilir.
Bu sistemle ilgili bir sınırlama, burada açıklanan yöntemleri kullanarak yaralar hem şekil hem de boyut olarak değiştiğinden, aynı yaraları yaratmanın mümkün olmamasıdır. Bu nedenle, yara kapanmasının veya hücre göçünün kesin oranını ölçmek zor olabilir. Karbon taneleri gibi konumsal belirteçler, yaralı bir hayvanda maruz kalan ECM’ye yapışır ve büyük yaralarda kolektif hücre göçü oranını ölçmek için kullanılabilir (gösterilmemiştir). Küçük yara kapanma analizi için, değişken yara boyutu ve şekli olsa bile, bu boyuttaki yaralar arasında sınırlı bir kapanma oranı aralığı vardır (Şekil 4). Bu nedenle, promotive edici veya baskılayıcı farmakolojik reaktiflerin etkilerini nicel olarak tespit etmek mümkündür.
Bu çalışma sadece DIC mikroskobu kullanılarak yara iyileşmesinin karakterizasyonunu açıklarken, aynı yaklaşımlar floresan veya konfokal mikroskopi kullanılarak iyileşmeyi görüntülemek için kullanılabilir. Buna yardımcı olmak için, çeşitli hücresel ve hücre dışı proteinlerin floresan olarak etiketlendiği transgenik hayvanlar üretmek için protokoller mevcuttur. DIC ve floresan ile eşzamanlı görüntüleme, farmakolojik ajanlar veya mutant çizgiler kullanılarak yara iyileşmesinin bozulması ile birlikte, epiteldeki yara iyileşme sürecinin altında yatan mekanizmaları anlamak için güçlü bir yaklaşım olacaktır.
The authors have nothing to disclose.
E.E.L.L., Ulusal Bilim Vakfı PRFB 2011010’den bir hibe ile desteklenmektedir. Clytia kolonilerimizi kurmamıza yardımcı oldukları için Tsuyoshi Momose ve Evelyn Houliston’a, mikro yara iyileştirici görüntülerin toplanması için Jean-Baptiste Reynier’e, sahte kreisel tanklarının inşası için Harry Kyriazes’e ve Clytia habitatını korudukları için Elizabeth Baldo’ya teşekkür ederiz. Şekil 1B, BioRender.com ile oluşturulmuştur.
20500 ACE EKE Microscope Fiber Optic Light Source | Kramer Scientific Corporation | ||
AxioCam 506 mono | ZEISS | 426557-0000-000-MA285 | |
Capillary tubes | World Precision Instruments | TW1004 | |
Cytochalasin B | Abcam | ab143482 | |
Depression slides | Amscope | BS-C12 | |
DMR with DIC options and fluorescence halogen lamp | Leica | ||
Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate | Sigma Aldrich | E10521-10G | |
Fast Green FCF | Thermo Scientific | A16520-06 | |
FM1-43 | Biotium | 70022 | Excitation/Emission: 480/598 nm |
Hoechst 33342 | Thermo Scientific | 62249 | Excitation/Emission: 361/497 nm |
imageJ | NIH | ||
Microloader tips (0.5-10 μL /2-20 μL) | Eppendorf | 930001007 | |
Micromanipulator | World Precision Instruments | 3301R / M3301L | |
Microscope Cover Glass (22X40-1.5) | Fisherbrand | 12-544-BP | |
Petri Dish (60 mm x 15 mm) | Fisherbrand | FB085713A | |
PicoNozzle v2 | World Precision Instruments | 5430-ALL | |
Pipette puller | Sutter Instrument Co | P-97 | |
Pneumatic PicoPump | World Precision Instruments | PV820 | |
Polycarbonate vacuum, desiccator | Bel-art | F42025-0000 | |
Prism 9 | GraphPad | ||
STEMI Sv11 Dissection scope | ZEISS | STEMI SV11 | |
SYLGARD 184 | Dow Silicones | 1024001 | |
Transfer pipettes | Fisherbrand | 13-711-7M | |
Z-Hab mini system | Pentair | ||
ZEN Microscopy software | Zeiss |