Summary

eGFPの構成的発現を有する リーシュマニア 種株の開発

Published: April 21, 2023
doi:

Summary

ここでは、pLEXSYシステムを用いてeGFPの遺伝子を安定な統合導入遺伝子として発現するL. パナメンシス 株および L.ドノバニ 株を作製するために用いられる方法論について述べる。トランスフェクトされた寄生虫を限界希釈によってクローニングし、両方の種で最も高い蛍光強度を有するクローンを、薬物スクリーニングアッセイでさらに使用するために選択しました。

Abstract

リーシュマニア属の原虫寄生虫は、世界中の何百万人もの人々に影響を与えるさまざまな臨床症状を伴う疾患であるリーシュマニア症を引き起こします。L.ドノバニに感染すると、致命的な内臓疾患を引き起こす可能性があります。パナマ、コロンビア、コスタリカでは、L. panamensisが皮膚および粘膜皮膚リーシュマニア症の報告された症例のほとんどに関与しています。これまでに利用可能な方法論で多数の薬物候補を研究することは、細胞内形態の寄生虫に対する化合物の活性を評価するため、またはin vivoアッセイを実行するために非常に面倒であることを考えると、非常に困難です。この研究では、18S rRNA(ssu)をコードする遺伝子座に組み込まれた増強緑色蛍光タンパク質(eGFP)をコードする遺伝子の構成的発現を伴うL.パナメンシス株およびL.ドノバニ株の生成について説明します。eGFPをコードする遺伝子を市販のベクターから取得し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅して濃縮し、BglIIおよびKpnI酵素の制限部位を追加しました。eGFPアンプリコンをアガロースゲル精製により単離し、酵素BglIIおよびKpnIで消化し、同じ酵素セットで以前に消化したリーシュマニア発現ベクターpLEXSY-sat2.1にライゲーションしました。クローニングした遺伝子を有する発現ベクターを大腸菌内で増殖させ、精製し、インサートの存在をコロニーPCRにより検証した。精製したプラスミドを直鎖化し、L. donovaniおよびL. panamensis寄生虫のトランスフェクションに使用した。遺伝子の組み込み性はPCRによって検証された。eGFP遺伝子の発現をフローサイトメトリーにより評価した。蛍光寄生虫を限界希釈によってクローニングし、蛍光強度が最も高いクローンをフローサイトメトリーを用いて選択した。

Introduction

リーシュマニア属の原虫寄生虫は、広範囲の臨床症状を伴う疾患であるリーシュマニア症を引き起こす。この病気は98カ国で流行しており、年間発生率は0.9〜160万例と推定されています1。人間に病原性のあるリーシュマニア種は、2つの亜属、すなわちLに分けられます。(リーシュマニア)とL。(ヴィアンニア)。Lに属するいくつかの種による感染。L. donovaniL. ininftumなどの(リーシュマニア)亜属は、内臓リーシュマニア症(VL)を引き起こす可能性があり、治療せずに放置すると致命的です2Lに属する種。(Viannia)亜属は、中南米、特にパナマ、コロンビア、コスタリカの皮膚リーシュマニア症(CL)および粘膜皮膚リーシュマニア症(MCL)のほとんどの症例に関連しており、L.パナメンシスがこれらの臨床症状の主な病因物質です3,4

五価アンチモン、ミルテフォシン、アムホテリシンBなどの薬剤を含む既存の抗リーシュマニア化学療法は、毒性が高く、高価です。さらに、ここ数十年間の薬剤耐性の増加は、世界中の患者の効果的な治療を妨げる要因に追加されています5リーシュマニア属の種間、特に新世界と旧世界の種の間で、薬物感受性に関して実質的な違いが示されています6,7。これらの理由から、種固有のアプローチに特に注意を払いながら、新しい抗リーシュマニア薬の同定と開発に努力する必要があります。従来の方法論で医薬品候補の大規模なライブラリを研究することは、これらの方法論が細胞内アマスティゴテスに対する化合物の活性を評価するため、またはin vivo実験を実行するために非常に面倒であることを考えると、非常に困難です8。したがって、レポーター遺伝子の実装やハイコンテント表現型スクリーニングアッセイの開発など、これらの欠点を軽減する新しい技術を開発する必要がありました9。

レポーター遺伝子の使用は、ハイスループットおよびin vivoアッセイの開発を容易にするため、薬物スクリーニングプロセスの効率を高める可能性を示しています。いくつかのレポーター遺伝子を発現する組換えリーシュマニア寄生虫は、さまざまな研究グループによって生成されています。β-ガラクトシダーゼ、β-ラクタマーゼ、ルシフェラーゼなどのレポーター遺伝子は、エピソーマルベクターを用いていくつかのリーシュマニア種に導入されており、寄生虫の細胞外および細胞内形態での薬物スクリーニングには限られた有用性が示されています10,11,12,13,14,15.これらのアプローチには、エピソーム構築物の排除を避けるために培養中に強い選択圧が必要であること、およびレポーター遺伝子の活性を明らかにするための追加の試薬の使用が必要であるという制限があります。逆に、緑色蛍光タンパク質(GFP)およびその変異体である増強緑色蛍光タンパク質(eGFP)は、その柔軟性および感度、ならびにフローサイトメトリーまたは蛍光測定を用いたスクリーニングプロセスを自動化する可能性のために、in vitro薬物スクリーニングアッセイのための多数のトランスジェニックリーシュマニア株の生成に使用されてきた15 16、171819有望な結果にもかかわらず、これらのトランスジェニック株の培養物は、GFP遺伝子のコピー数がすべての寄生虫で同じではなかったため、蛍光レベルが非常に不均一でした。さらに、蛍光を維持するには、GFP遺伝子がエピソーム構築物に導入されたため、培養中の寄生虫に対して一定の選択圧が必要でした。

前述の理由から、多くの努力が安定した組換え株を生産するための新しい方法論の開発に焦点を合わせてきました。これらの努力は、リボソーム遺伝子のより高い転写率を利用して、リボソーム遺伝子座へのレポーター遺伝子の統合に大きく依存してきました20。β-ガラクトシダーゼ21、IFP 1.4、iRFP22、tdTomato23をコードする遺伝子を組み込んだL. infantumおよびL. amazonensis株を作製し、薬物スクリーニングアッセイにおける有用性を評価しています。さまざまなグループが、相同組換えを介してそのコード遺伝子を18SリボソームRNA遺伝子座(ssu遺伝子座)に組み込むことにより、GFPを構成的に発現するL.ドノバニ株を開発しました24,25;それらは、細胞内アマスティゴテスを含むトランスフェクトされた集団において安定した均一なGFP発現を示し24,25、そしてそれらは薬物スクリーニングアッセイ24,25,26において首尾よく実施された。Bolhassaniら27は、組み込み導入遺伝子としてGFPを発現するL.メジャーおよびL.インファンタムの株を開発しました。彼らは、もともとL.タレントラエを宿主として使用するシステムにおけるタンパク質のトランスジェニック発現のために設計された組み込みベクターpLEXSYを使用しました28。pLEXSY-GFPベクターは、GFP242527、2930を構成的に発現する異なるリーシュマニア株の生成に非常に効率的であることが示されています。これらの寄生生物において、蛍光は均質であり、細胞内形態で維持され、感染したマウスの足蹠病変において検出することができる27

本研究では、pLEXSYシステムを用いて、eGFPをコードする遺伝子を統合導入遺伝子として発現するL. パナメンシス 株および L.ドノバニ 株を作製するために使用される方法論について説明します。このプロセスで生成された菌株は、天然および合成起源の分子の潜在的な抗リーシュマニア活性を評価する薬物スクリーニングアッセイを実行するために私たちの研究室で使用されます。

Protocol

サンプルを無菌状態に保つために、寄生虫培養を含むすべてのステップは、バイオセーフティレベル2(BSL-2)フード内で、または地域の健康と安全の規制に従って実行する必要があります。このプロトコルの概要を 図1に示します。 図</strong…

Representative Results

pLEXSY-eGFPコンストラクトを構築し、コンピテント大腸 菌 細胞を形質転換した後、eGFPインサートを備えたコンストラクトを含むコロニーは、セクション1.2で説明されているコロニーPCRを実行した後、約859 bpの産物を生成します(図3A)。 SwaIを用いた陽性コロニーからの精製プラスミドの全消化は、ゲル電気泳動において2つの特徴的な断片、 すなわち大腸?…

Discussion

様々なレポーター遺伝子の長所と短所は、いくつかの原虫寄生虫で研究されています。その中で、GFPとeGFPは本質的に蛍光であり、定量とイメージングが容易です。これらのタンパク質の蛍光活性は、蛍光顕微鏡、蛍光測定、またはフローサイトメトリーを用いた最小限の操作で検出できます。GFP発現Lを生成するための研究はほとんど行われていない。(Viannia)株は、旧世界リ?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

この作業は、パナマ州の国立科学技術(SENACYT)(助成金番号NI-177-2016)およびパナマ州の国立調査事務局(SNI)(助成金番号SNI-169-2018、SNI-008-2022、およびSNI-060-2022)によって資金提供されました。

Materials

96 Well Microplates Corning CLS3340 Flat bottom clear, black polystyrene, sterile, lid
Agarose Sigma-Aldrich A4718
Ampicillin sodium salt Sigma-Aldrich A8351 BioXtra, suitable for cell culture
BglII restriction enzyme New England BioLabs R0144S 2,000 units. 10,000 units/mL
Cell Culture Flasks Corning CLS430168 Surface area 25 cm2, canted neck, cap (plug seal)
ChemiDoc Imaging System Bio-Rad 17001401
CyFlow Space Sysmex Not available
D-(+)-Glucose Sigma-Aldrich G7021 powder, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99.5%
Fetal Bovine Serum Sigma-Aldrich F7524
Gel Loading Buffer Sigma-Aldrich G2526  The rate of migration varies with gel composition. Dilute 1:3 to 1:6 with sample before loading.
Gene Pulser Xcell Electroporation System Bio-Rad 1652660 The system is composed of a main unit, two accessory modules, the capacitance extender (CE module) and the pulse controller (PC module), and a ShockPod cuvette chamber.
Gene Pulser/MicroPulser Electroporation Cuvettes Bio-Rad 1652086 Pkg of 50, 0.2 cm–gap sterile electroporation cuvette, for use with the Gene Pulser and MicroPulser Systems, for mammalian and other eukaryotic cells
Gentamicin solution Sigma-Aldrich G1397 50 mg/mL in deionized water, liquid, 0.1 μm filtered, BioReagent, suitable for cell culture
GoTaq Long PCR Master Mix Promega M4021
HEPES solution Sigma-Aldrich H0887 1 M, pH 7.0-7.6, sterile-filtered, BioReagent, suitable for cell culture
Inverted microscope Olympus IXplore Standard
KpnI-HF restriction enzyme New England BioLabs R3142S 4,000 units. 20,000 units/mL
LB Broth with agar Sigma-Aldrich L3147 Highly-referenced nutrient-rich microbial growth powder medium with Agar, suitable for regular E.coli culture.
LB Broth  Sigma-Aldrich L2542 Liquid microbial growth medium
Mini-Sub Cell GT Horizontal Electrophoresis System Bio-Rad 1640300 Mini horizontal electrophoresis system, includes 8- and 15-well combs, 7 cm x 10 cm UV-transparent tray
pEGFP-N1-1x Addgene 172281 Expressing eGFP mRNA fused with 1 tandem repeat of a 50-base sequence
pLEXSYcon2.1 expression kit Jena Bioscience EGE-1310sat Contains integrative constitutive expression vector pLEXSY-sat2.1. Antibiotic selection of transfectants with Nourseothricin (NTC, clonNAT). Contains all primers for diagnostic PCRs and sequencing.
Potassium Chloride Millipore 529552 Molecular Biology Grade – CAS 7447-40-7 – Calbiochem
PureYield Plasmid Miniprep System Promega A1222 Up to 15 μg of Transfection-Ready Plasmid from 3 mL cultures.
Schneider′s Insect Medium Sigma-Aldrich S0146 Medium used in our laboratory for culturing Leishmania.
SOC Medium Sigma-Aldrich S1797
Sodium chloride Sigma-Aldrich S3014 for molecular biology, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration)
Sodium phosphate dibasic Sigma-Aldrich RDD038 BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, ≥99.0%, free-flowing, Redi-Dri
SwaI restriction enzyme New England BioLabs R0604S 2,000 units. 10,000 units/mL
Syringe filters Corning CLS431212 regenerated cellulose membrane, diam. 4 mm, pore size 0.2 μm
T100 Thermal Cycler Bio-Rad 1861096 Thermal cycler system, includes 96-well thermal cycler, power cord, tube support ring
T4 DNA Ligase Promega M1801 Joins two DNA strands with cohesive or blunt ends
Tris-Borate-EDTA buffer Sigma-Aldrich T4415 BioReagent, suitable for electrophoresis, 10× concentrate
Wizard Genomic DNA Purification Kit Promega A1120
Wizard SV Gel and PCR Clean-Up System Promega A9285
XL10-Gold Ultracompetent Cells Agilent 200317 XL10-Gold Kanr Ultracompetent Cells, 10 x 0.1 mL. Features the kanamycin-resistance gene on the F' episome, for extremely demanding cloning in chloramphenicol-resistant vectors. Efficiency: > 5 x 10 9 transformants/µg pUC18 DNA.

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Carrasco, J., Chang, J. H., Pineda, L., Quintero, I., Giovani, R., Spadafora, C., Lleonart, R., Restrepo, C. M. Development of Leishmania Species Strains with Constitutive Expression of eGFP. J. Vis. Exp. (194), e64939, doi:10.3791/64939 (2023).

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