Hier beschrijven we de methodologie die wordt gebruikt voor het genereren van L. panamensis – en L. donovani-stammen die het gen voor eGFP tot expressie brengen als een stabiel geïntegreerd transgen met behulp van het pLEXSY-systeem. Getransfecteerde parasieten werden gekloond door verdunning te beperken en klonen met de hoogste fluorescentie-intensiteit in beide soorten werden geselecteerd voor verder gebruik in medicijnscreeningtests.
Protozoaire parasieten van het geslacht Leishmania veroorzaken leishmaniasis , een ziekte met variabele klinische manifestaties die miljoenen mensen wereldwijd treft. Infectie met L. donovani kan leiden tot fatale viscerale ziekte. In Panama, Colombia en Costa Rica is L. panamensis verantwoordelijk voor de meeste gemelde gevallen van cutane en mucocutane leishmaniasis. Het bestuderen van een groot aantal kandidaat-geneesmiddelen met de tot nu toe beschikbare methodologieën is vrij moeilijk, aangezien ze zeer bewerkelijk zijn voor het evalueren van de activiteit van verbindingen tegen intracellulaire vormen van de parasiet of voor het uitvoeren van in vivo assays. In dit werk beschrijven we de generatie van L. panamensis en L. donovani stammen met constitutieve expressie van het gen dat codeert voor een verbeterd groen fluorescerend eiwit (eGFP) geïntegreerd in de locus die codeert voor 18S rRNA (ssu). Het gen dat codeert voor eGFP werd verkregen uit een commerciële vector en versterkt door polymerasekettingreactie (PCR) om het te verrijken en restrictieplaatsen toe te voegen voor de BglII- en KpnI-enzymen. Het eGFP-amplicon werd geïsoleerd door agarosegelzuivering, verteerd met de enzymen BglII en KpnI en geligeerd in de Leishmania-expressievector pLEXSY-sat2.1 die eerder met dezelfde set enzymen werd verteerd. De expressievector met het gekloonde gen werd gepropageerd in E. coli, gezuiverd, en de aanwezigheid van de insert werd geverifieerd door kolonie-PCR. Het gezuiverde plasmide werd gelineariseerd en gebruikt om L. donovani en L. panamensis parasieten te transfecteren. De integratie van het gen werd geverifieerd door PCR. De expressie van het eGFP-gen werd geëvalueerd door flowcytometrie. Fluorescerende parasieten werden gekloond door verdunning te beperken en klonen met de hoogste fluorescentie-intensiteit werden geselecteerd met behulp van flowcytometrie.
Protozoaire parasieten van het geslacht Leishmania veroorzaken leishmaniasis, een ziekte met een breed scala aan klinische manifestaties. Deze ziekte komt voor in 98 landen en de jaarlijkse incidentie wordt geschat op 0,9 tot 1,6 miljoen gevallen1. Leishmania-soorten die pathogeen zijn voor de mens zijn verdeeld in twee subgenera, namelijk L. (Leishmania) en L. (Viannia). Infectie met sommige soorten die tot de L behoren. (Leishmania) subgenus, zoals L. donovani en L. infantum, kan leiden tot viscerale leishmaniasis (VL), die fataal is als het onbehandeld blijft2. Soorten die behoren tot de L. (Viannia) subgenus zijn geassocieerd met de meeste gevallen van cutane leishmaniasis (CL) en mucocutane leishmaniasis (MCL) in Midden- en Zuid-Amerika, met name in Panama, Colombia en Costa Rica, waarbij L. panamensis de belangrijkste etiologische verwekker is van deze klinische presentaties 3,4.
Bestaande anti-leishmania chemotherapie die geneesmiddelen zoals pentavalente antimonialen, miltefosine en amfotericine B omvat, is zeer giftig en duur. Bovendien is de toegenomen resistentie tegen geneesmiddelen in de afgelopen decennia toegevoegd aan de factoren die de effectieve behandeling van patiënten wereldwijd verstoren5. Er zijn aanzienlijke verschillen aangetoond tussen soorten van het geslacht Leishmania met betrekking tot de gevoeligheid voor geneesmiddelen, met name tussen nieuwe en oude wereldsoorten 6,7. Om deze redenen is het noodzakelijk om de inspanningen te richten op de identificatie en ontwikkeling van nieuwe geneesmiddelen tegen leishmania, met speciale aandacht voor soortspecifieke benaderingen. Het bestuderen van grote bibliotheken van kandidaat-geneesmiddelen met traditionele methodologieën is vrij moeilijk, aangezien deze methodologieën zeer arbeidsintensief zijn voor het evalueren van de activiteit van verbindingen tegen intracellulaire amastigoten of voor het uitvoeren van in vivo experimenten8; Daarom was het noodzakelijk om nieuwe technieken te ontwikkelen die deze nadelen verminderen, waaronder de implementatie van reportergenen en de ontwikkeling van fenotypische screeningstests met een hoog gehalte9.
Het gebruik van reportergenen heeft het potentieel aangetoond om de efficiëntie van het screeningproces van geneesmiddelen te verhogen, omdat het de ontwikkeling van high-throughput en in vivo assays vergemakkelijkt. Recombinante Leishmania-parasieten die verschillende reportergenen tot expressie brengen, zijn gegenereerd door verschillende onderzoeksgroepen. Reportergenen, zoals β-galactosidase, β-lactamase en luciferase, zijn geïntroduceerd in verschillende Leishmania-soorten met behulp van episomale vectoren, wat een beperkt nut aantoont voor geneesmiddelenscreening in extra- en intracellulaire vormen van de parasiet 10,11,12,13,14,15. Deze benaderingen hebben de beperking van het vereisen van een sterke selectieve druk in cultuur om de eliminatie van het episomale construct te voorkomen, evenals het gebruik van extra reagentia om de activiteit van het reportergen te onthullen. Omgekeerd zijn het groene fluorescerende eiwit (GFP) en zijn variant, het verbeterde groene fluorescerende eiwit (eGFP), gebruikt bij het genereren van een groot aantal transgene Leishmania-stammen voor in vitro screeningtests voor geneesmiddelen vanwege hun flexibiliteit en gevoeligheid, evenals de mogelijkheid om het screeningsproces te automatiseren met behulp van flowcytometrie of fluorometrie15, 16,17,18,19. Ondanks veelbelovende resultaten waren culturen van deze transgene stammen zeer heterogeen in hun fluorescentieniveaus, omdat het aantal kopieën van het GFP-gen niet bij alle parasieten hetzelfde was. Bovendien vereiste het handhaven van fluorescentie een constante selectieve druk op de parasieten in cultuur, omdat het GFP-gen werd geïntroduceerd in een episomale constructie.
Om de eerder genoemde redenen zijn veel inspanningen gericht op het ontwikkelen van nieuwe methoden voor het produceren van stabiele recombinante stammen. Deze inspanningen zijn meestal gebaseerd op de integratie van reportergenen in ribosomale loci, waarbij gebruik werd gemaakt van de hogere transcriptiesnelheden van ribosomale genen20. Stammen van L. infantum en L. amazonensis zijn gegenereerd met de integratie van de genen die coderen voor β-galactocidase 21, IFP 1.4, iRFP 22 en tdTomato 23, en ze zijn geëvalueerd op hun bruikbaarheid in medicijnscreeningtests. Verschillende groepen hebben L. donovani-stammen ontwikkeld die GFP constitutief tot expressie brengen door het coderende gen te integreren in de 18S ribosomale RNA-locus (ssu locus) door homologe recombinatie24,25; ze vertoonden stabiele en homogene GFP-expressie in de getransfecteerde populatie, waaronder intracellulaire amastigoten 24,25, en ze werden met succes geïmplementeerd in medicijnscreeningstests24,25,26. Bolhassani et al.27 ontwikkelden stammen van L. major en L. infantum die GFP tot expressie brachten als een geïntegreerd transgen. Ze gebruikten de integratievector pLEXSY, oorspronkelijk ontworpen voor de transgene expressie van eiwitten in een systeem met L. tarentolae als gastheer28. De pLEXSY-GFP-vector is zeer efficiënt gebleken voor het genereren van verschillende Leishmania-stammen die constitutief GFP 24,25,27,29,30 tot expressie brengen. Bij deze parasieten is fluorescentie homogeen en wordt het gehandhaafd in de intracellulaire vormen, waardoor het kan worden gedetecteerd in voetzoollaesies van geïnfecteerde muizen27.
In dit werk beschrijven we de methodologie die wordt gebruikt voor het genereren van L. panamensis – en L. donovani-stammen die het gen dat codeert voor eGFP tot expressie brengen als een geïntegreerd transgen met behulp van het pLEXSY-systeem. De stammen die door dit proces worden gegenereerd, worden in ons laboratorium gebruikt voor het uitvoeren van medicijnscreeningstests die de potentiële anti-leishmania-activiteit van moleculen van natuurlijke en synthetische oorsprong evalueren.
De voor- en nadelen van verschillende reportergenen zijn bestudeerd in verschillende protozoaire parasieten. Onder hen zijn GFP en eGFP intrinsiek fluorescerend en maken eenvoudige kwantificering en beeldvorming mogelijk. De fluorescerende activiteit van deze eiwitten kan worden gedetecteerd met minimale manipulatie met behulp van fluorescentiemicroscopie, fluorimetrie of flowcytometrie. Er zijn weinig studies uitgevoerd voor het genereren van GFP-expressing L. (Viannia) stammen, ondanks de aangetoonde …
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd gefinancierd door de Secretaría Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación (SENACYT), Panamá, subsidienummer NI-177-2016, en Sistema Nacional de Investigación (SNI), Panamá, subsidienummers SNI-169-2018, SNI-008-2022 en SNI-060-2022.
96 Well Microplates | Corning | CLS3340 | Flat bottom clear, black polystyrene, sterile, lid |
Agarose | Sigma-Aldrich | A4718 | |
Ampicillin sodium salt | Sigma-Aldrich | A8351 | BioXtra, suitable for cell culture |
BglII restriction enzyme | New England BioLabs | R0144S | 2,000 units. 10,000 units/mL |
Cell Culture Flasks | Corning | CLS430168 | Surface area 25 cm2, canted neck, cap (plug seal) |
ChemiDoc Imaging System | Bio-Rad | 17001401 | |
CyFlow Space | Sysmex | Not available | |
D-(+)-Glucose | Sigma-Aldrich | G7021 | powder, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99.5% |
Fetal Bovine Serum | Sigma-Aldrich | F7524 | |
Gel Loading Buffer | Sigma-Aldrich | G2526 | The rate of migration varies with gel composition. Dilute 1:3 to 1:6 with sample before loading. |
Gene Pulser Xcell Electroporation System | Bio-Rad | 1652660 | The system is composed of a main unit, two accessory modules, the capacitance extender (CE module) and the pulse controller (PC module), and a ShockPod cuvette chamber. |
Gene Pulser/MicroPulser Electroporation Cuvettes | Bio-Rad | 1652086 | Pkg of 50, 0.2 cm–gap sterile electroporation cuvette, for use with the Gene Pulser and MicroPulser Systems, for mammalian and other eukaryotic cells |
Gentamicin solution | Sigma-Aldrich | G1397 | 50 mg/mL in deionized water, liquid, 0.1 μm filtered, BioReagent, suitable for cell culture |
GoTaq Long PCR Master Mix | Promega | M4021 | |
HEPES solution | Sigma-Aldrich | H0887 | 1 M, pH 7.0-7.6, sterile-filtered, BioReagent, suitable for cell culture |
Inverted microscope | Olympus | IXplore Standard | |
KpnI-HF restriction enzyme | New England BioLabs | R3142S | 4,000 units. 20,000 units/mL |
LB Broth with agar | Sigma-Aldrich | L3147 | Highly-referenced nutrient-rich microbial growth powder medium with Agar, suitable for regular E.coli culture. |
LB Broth | Sigma-Aldrich | L2542 | Liquid microbial growth medium |
Mini-Sub Cell GT Horizontal Electrophoresis System | Bio-Rad | 1640300 | Mini horizontal electrophoresis system, includes 8- and 15-well combs, 7 cm x 10 cm UV-transparent tray |
pEGFP-N1-1x | Addgene | 172281 | Expressing eGFP mRNA fused with 1 tandem repeat of a 50-base sequence |
pLEXSYcon2.1 expression kit | Jena Bioscience | EGE-1310sat | Contains integrative constitutive expression vector pLEXSY-sat2.1. Antibiotic selection of transfectants with Nourseothricin (NTC, clonNAT). Contains all primers for diagnostic PCRs and sequencing. |
Potassium Chloride | Millipore | 529552 | Molecular Biology Grade – CAS 7447-40-7 – Calbiochem |
PureYield Plasmid Miniprep System | Promega | A1222 | Up to 15 μg of Transfection-Ready Plasmid from 3 mL cultures. |
Schneider′s Insect Medium | Sigma-Aldrich | S0146 | Medium used in our laboratory for culturing Leishmania. |
SOC Medium | Sigma-Aldrich | S1797 | |
Sodium chloride | Sigma-Aldrich | S3014 | for molecular biology, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration) |
Sodium phosphate dibasic | Sigma-Aldrich | RDD038 | BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, ≥99.0%, free-flowing, Redi-Dri |
SwaI restriction enzyme | New England BioLabs | R0604S | 2,000 units. 10,000 units/mL |
Syringe filters | Corning | CLS431212 | regenerated cellulose membrane, diam. 4 mm, pore size 0.2 μm |
T100 Thermal Cycler | Bio-Rad | 1861096 | Thermal cycler system, includes 96-well thermal cycler, power cord, tube support ring |
T4 DNA Ligase | Promega | M1801 | Joins two DNA strands with cohesive or blunt ends |
Tris-Borate-EDTA buffer | Sigma-Aldrich | T4415 | BioReagent, suitable for electrophoresis, 10× concentrate |
Wizard Genomic DNA Purification Kit | Promega | A1120 | |
Wizard SV Gel and PCR Clean-Up System | Promega | A9285 | |
XL10-Gold Ultracompetent Cells | Agilent | 200317 | XL10-Gold Kanr Ultracompetent Cells, 10 x 0.1 mL. Features the kanamycin-resistance gene on the F' episome, for extremely demanding cloning in chloramphenicol-resistant vectors. Efficiency: > 5 x 10 9 transformants/µg pUC18 DNA. |