الثقافة في المختبر هي طريقة للكشف المباشر عن وجود البكتيريا الحية. يصف هذا البروتوكول طرق استزراع اللولبيات البوريليا المتنوعة، بما في ذلك تلك الخاصة بمجمع بوريليا بورغدورفيري بالمعنى الواسع للكلمة، وأنواع بوريليا الحمى الانتكاسية، وبوريليا مياموتوي. هذه الأنواع سريعة وبطيئة النمو ولكن يمكن استزراعها.
يتكون Borrelia من ثلاث مجموعات من الأنواع ، تلك الخاصة بمجموعة Lyme borreliosis (LB) ، والمعروفة أيضا باسم B. burgdorferi sensu lato (s.l.) وأعيد تصنيفها مؤخرا إلى Borreliella ، ومجموعة الحمى الانتكاسية (RF) Borrelia ، ومجموعة ثالثة مرتبطة بالزواحف من اللولبيات. تظل الأساليب القائمة على الثقافة هي المعيار الذهبي للكشف المختبري عن الالتهابات البكتيرية لكل من البحث والعمل السريري ، حيث أن زراعة مسببات الأمراض من سوائل أو أنسجة الجسم تكتشف مباشرة تكاثر مسببات الأمراض وتوفر مادة مصدر للبحث. Borrelia و Borreliella spirochetes هي سريعة وبطيئة النمو ، وبالتالي لا يتم استزراعها عادة للأغراض السريرية. ومع ذلك ، فإن الثقافة ضرورية للبحث. يوضح هذا البروتوكول المنهجية والوصفات المطلوبة للنجاح في استزراع اللولبيات LB و RF ، بما في ذلك جميع الأنواع المعترف بها من مجمع B. burgdorferi s.l. بما في ذلك B. afzelii ، B. americana ، B. andersonii ، B. bavariensis ، B. bissettii / bissettiae ، B. burgdorferi sensu stricto (s.s.) ، B. californiensis ، B. carolinensis ، B. chilensis ، B. finlandensis ، B. garinii ، B. japonica ، B. kurtenbachii ، B. lanei ، B. lusitaniae ، B. maritima، B. mayonii، B. spielmanii، B. tanukii، B. turdi، B. sinica، B. valaisiana، B. yangtzensis، و RFspirochetes، B. anserina، B. coriaceae، B. crocidurae، B. duttonii، B. hermsii، B. hispanica، B. persica، B. recurrentis، و B. miyamotoi. الوسيلة الأساسية لزراعة اللولبيات LB و RF هي وسط Barbour-Stoenner-Kelly (BSK-II أو BSK-H) ، والذي يدعم بشكل موثوق نمو اللولبيات في الثقافات الراسخة. لتكون قادرة على زراعة عزلات بوريليا المعزولة حديثا من العينات المشتقة من القراد أو المضيف حيث يكون عدد spirochete الأولي منخفضا في اللقاح ، يفضل استخدام وسط Kelly-Pettenkofer المعدل (MKP). تدعم هذه الوسيلة أيضا نمو B. miyamotoi. يعتمد نجاح زراعة اللولبيات RF أيضا بشكل حاسم على جودة المكونات.
Borrelia هو جنس من البكتيريا spirochete التي تشمل ثلاث مجموعات رئيسية: مجموعة Lyme borreliosis (LB) ، ومجموعة الحمى الانتكاسية (RF) ، ومجموعة أقل تميزا على ما يبدو تقتصر على الزواحف. تصنيف بوريليا في حالة تغير مستمر مع ظهور المنهجيات الجزيئية التي تسمح بمقارنات الجينوم والبروتين ، كما هو الحال في معظم المجموعات التصنيفية الأخرى1،2،3،4،5،6،7. يطلق على مجموعة LB (وتسمى أيضا مجموعة مرض لايم) تقليديا اسم Borrelia burgdorferi sensu lato بعد عضوها الأفضل تميزا Borrelia burgdorferi بالمعنى الضيق. تستخدم هذه الورقة المصطلحات الأكثر استخداما حاليا: LB و RF والمجموعة المرتبطة بالزواحف ، وتصف بروتوكولات الاستزراع لمجموعات LB و RF.
كما هو متوقع لأحد أفراد عائلة Spirochaetaceae ، يمكن أن تتبنى Borrelia الشكل الحلزوني الطويل والرقيق المميز ، وعادة ما يكون طوله 20-30 ميكرومتر وعرضه 0.2-0.3 ميكرومتر. ومع ذلك ، فإن خلايا Borrelia متعددة الأشكال للغاية ويمكن أن تتبنى العديد من الأشكال الأخرى في كل من الثقافة وفي الجسم الحي 1,8 نتيجة لتركيبها الخلوي والجيني المعقد. في شكله اللولبسي ، ينتج مورفولوجيا الموجة الجيبية المستوية عن دوران السوط الداخلي المحوري في الفضاء المحيطي بين الأغشية الداخلية والخارجية. يتيح هذا الهيكل للخلايا أن تكون شديدة الحركة ، حيث يحتوي الغشاء الخارجي على بروتينات تمكن الخلية من التفاعل مع الأنسجة المضيفة 9,10. يتم تنظيم التعبير عن بروتينات الغشاء الخارجي بإحكام ولا يؤثر فقط على غزو أنسجة المضيف ولكن أيضا على التفاعل مع الجهاز المناعي المضيف11. يسمح هذا التعبير الجيني المعقد لخلايا بوريليا بالتنقل بين البيئات المختلفة جدا لمضيفات الفقاريات ونواقل اللافقاريات. جينوم بوريليا غير عادي بين بدائيات النوى ، ويتكون من كروموسوم خطي وليس دائري. بالإضافة إلى الكروموسوم الخطي ، تحتوي أنواع Borrelia على 7-21 بلازميدات ، بعضها خطي وبعضها دائري. تحتوي البلازميدات على غالبية الجينات اللازمة لتكيف المضيف وضراوته ، ويعتقد أن البلازميدات الدائرية المشتقة من النبوءات مسؤولة عن غالبية تدفق الجينات الأفقي بين الخلايا اللولبية12,13. تمشيا مع دور في تكيف المضيف ، يفقد بعض ، وربما العديد أو كل ، أعضاء مجموعة Lyme borreliosis البلازميدات في الثقافة14. تحتوي أفضل سلالة “متكيفة مختبريا” تمت دراستها من B. burgdorferi ، B31 ، على سبعة فقط من البلازميدات التسعة الموجودة في العزلات البرية لهذا النوع15. وبالمثل ، يفقد B. garinii البلازميدات في الثقافة16. أظهرت بعض الدراسات أن أنواع RF و B. miyamotoi تحتفظ بالبلازميدات عند استزراعها 14،17 ، لكن العمل الحديث يوضح تغير البلازميدات والعدوى مع الزراعة المختبرية طويلة الأجل18.
تظل الطرق القائمة على الثقافة هي المعيار الذهبي للكشف المختبري عن الالتهابات البكتيرية ، لكل من البحث والعمل السريري14,17. تكتشف ثقافة مسببات الأمراض من سوائل أو أنسجة الجسم بشكل مباشر تكاثر مسببات الأمراض وتوفر مادة مصدر للبحث14,17. يوضح هذا البروتوكول المنهجية والوصفات المطلوبة لاستزراع اللولبيات بنجاح لمجموعة LB وكذلك RF Borrelia و B. miyamotoi. الوسيلة الأساسية لزراعة اللولبيات Borrelia هي وسط Barbour-Stoenner-Kelly (BSK-II أو BSK-H المتاح تجاريا) ، مع أو بدون مضادات حيوية لتقليل نمو بدائيات النوى الملوثة. تم تكييف هذه الوسيلة من وسيط يستخدم في الأصل لدعم RF Borrelia19 ، وتم تعديله بواسطة Stoenner20 ثم بواسطة Barbour21. تم تطوير العديد من التعديلات منذ ذلك الحين ، ولكل منها تأثيرات على فسيولوجيا البكتيريا التي يمكن أن تؤثر على النمو والعدوى والإمراضية22. تدعم هذه الوسيلة بشكل موثوق نمو اللولبيات في الثقافات الراسخة وقد استخدمت لعزل اللولبيات من القراد والثدييات والعينات السريرية23. يمكن أن يوفر الشكل الذي تم تطويره مؤخرا ، وهو وسيط Kelly-Pettenkofer (MKP) المعدل ، نجاحا أفضل في العزل ، والتشكل ، والحركة عند عزل عزلات Borrelia الجديدة من العينات البيئية ، عندما يكون عدد اللولبيات الموجودة في العينة المتاحة لبذر الثقافة منخفضا23,24. وفي جميع الحالات، يعتمد نجاح الزراعة بشكل حاسم على الوسط الطازج واستخدام المكونات المناسبة؛ لا تنتج جميع المكونات التجارية وسطا عالي الجودة. يمكن تحضين المزارع الملقحة بسهولة دون اهتزازها في حاضنة تقليدية 32-34 درجة مئوية في وجود كمية صغيرة من الأكسجين المحيط المتبقي. Borrelia spirochetes هي لاهوائية ولكنها تتعرض بطبيعتها لتقلبات في تركيزات الأكسجين وثاني أكسيد الكربون وتستجيب للتغيرات في التعبير الجيني26،27،28،29. وبالتالي ، يجب أن يتحكم التعبير الجيني والنمو والدراسات الأيضية الأخرى في مستويات الأكسجين وثاني أكسيد الكربون باستخدام حاضنة يتحكم فيها الأكسجين أو غرفة لاهوائية. في الثقافة ، يتم فحص الثقافات أسبوعيا ، أو في كثير من الأحيان ، بحثا عن وجود اللولبيات إما باستخدام المجهر المظلم أو الفحص المجهري لتباين الطور. يمكن تلطيخ مسحات الثقافة إما بالبقع الفضية أو الكيمياء الهيستولوجية المناعية أو من خلال استخدام سلالات موسومة بالفلورسنت29,30. PCR متبوعا بتسلسل الحمض النووي هو طريقة حساسة ومحددة للكشف عن أنواع Borrelia 30،31،32،33 وتحديدها وراثيا أو تأكيدها.
توجد العديد من الاختلافات الطفيفة على BSK-II ، وبعضها متاح تجاريا. تم تكييف البروتوكول الموصوف هنا في القسم 1 من Barbour (1984)21. وسيط MKP السائل هو وسيط تم تطويره مؤخرا ويتم وصفه في القسم 2. يتم إعداده وفقا للبروتوكول33,34 الذي تم الإبلاغ عنه سابقا ، والذي يتكون ، على غرار وسيط BSK ، من خطوتين: إعداد الوسيط الأساسي وإعداد الوسط الكامل. يمكن تحضير وسط استزراع البوريليا بالمضادات الحيوية أو بدونها ، كما هو موضح في القسم 3 ؛ تعمل المضادات الحيوية على الحد من البكتيريا الملوثة التي يتم إدخالها عند التلقيح بعينات سريرية أو بيئية ، كما هو موضح في القسم 4 ؛ في حالة التلقيح باستخدام ثقافة Borrelia sp. النقية ، قد لا تكون هناك حاجة إلى المضادات الحيوية. غالبا ما يكون صنع أسهم Borrelia طويلة الأجل أمرا مهما ، ويتم وصف بروتوكول للقيام بذلك في القسم 5. يصف القسم 6 استخدام هذه الوسائط لعزل استنساخ Borrelia sensu lato النقي من العينات السريرية أو البيئية. هناك عدد من النهج الممكنة36 ؛ أدناه هو واحد وجد أن تكون فعالة. وسيط الطلاء المستخدم في هذا البروتوكول هو تعديل لوسط الطلاء BSK-II37 و MKPالمتوسط 34 (مع زيادة مصل الأرانب إلى 10٪ 38).
الثقافة المختبرية للبكتيريا هي نقطة انطلاق للبحث. تتجسد الميزة العميقة التي تمنحها القدرة على الثقافة في النضال ، على مدى أكثر من قرن من الزمان الذي بلغ ذروته مؤخرا في النجاح ، لثقافة اللولبية الشاحبة ، اللولبية التي هي العامل المسبب لمرض الزهري44. تشكل اللولبيات Borrelia</…
The authors have nothing to disclose.
تم دعم هذا العمل جزئيا من قبل مجلس أبحاث العلوم الطبيعية والهندسة في كندا والمؤسسة الكندية لمرض لايم (AB و VL) ، ومجلس البحوث السويدي (SB ، M-LF و IN) ، ومشروع TAČR GAMA 2 – “دعم التحقق من إمكانات التطبيق 2.0 في مركز البيولوجيا CAS” (TP01010022) (MG و NR) ، وبمنحة من وزارة الصحة في الجمهورية التشيكية NV19-05-00191 (MG و NR). نشكر S. Vranjes (2021 ، مختبر Rudenko) على الصورة في الشكل 4 و J. Thomas-Ebbett (2021 ، مختبر لويد) على الصور في الشكل 5. نشكر جميع الباحثين الذين ساهموا في هذا المجال ونعتذر لأولئك الذين لم نتمكن من الاستشهاد بعملهم بسبب قيود المساحة.
1.7 mL tubes | VWR | 87003-294 | Standard item – any supplier will do |
0.2 µm Sterile syringe filter | VWR | 28145-501 | Standard item – any supplier will do |
10 µL barrier pipette tip | Neptune | BT10XLS3 | Standard item – any supplier will do |
10 mL Serological pipettes | Celltreat | 229011B | Standard item – any supplier will do |
1000 µL barrier pipette tip | Neptune | BT1000.96 | Standard item – any supplier will do |
15 mL tube | Celltreat | 188261 | Standard item – any supplier will do |
20 µL barrier pipette tip | Neptune | BT20 | Standard item – any supplier will do |
20 mL Sterile syringe | BD | 309661 | Standard item – any supplier will do |
200 µL barrier pipette tip | Neptune | BT200 | Standard item – any supplier will do |
25 mL Screw Cap Culture Tubes | Fisher Scientific | 14-933C | Standard item – any supplier will do |
25 mL Serological pipettes | Celltreat | 229025B | Standard item – any supplier will do |
3 mL Sterile syringe | BD | 309657 | Standard item – any supplier will do |
35% BSA | Sigma | A-7409 | Source is important – see note |
5 mL Serological pipettes | Celltreat | 229006B | Standard item – any supplier will do |
50 mL tube | Celltreat | 229421 | Standard item – any supplier will do |
6.5 ml MKP glass tubes | Schott | Schott Nr. 26 135 115 | Standard item – any supplier will do |
Amikacine | Sigma | PHR1654 | Standard item – any supplier will do |
Amphotericin B | Sigma | A9528-100MG | Standard item – any supplier will do |
Bactrim/rimethoprim/sulfamethoxazole | Sigma | PHR1126-1G | Standard item – any supplier will do |
BBL Brucella broth | BD | 211088 | Standard item – any supplier will do |
Biosafety Cabinet | Labconco | 302419100 | Standard item – any supplier will do |
Blood collection tubes (yellow top – ACD) | Fisher Scientific | BD Vacutainer Glass Blood Collection Tubes with Acid Citrate Dextrose (ACD) | Standard item – any supplier will do |
BSK-H Medium [w 6% Rabbit serum] | Darlynn biologicals | BB83-500 | Standard item – any supplier will do |
centrifuge | Eppendorf | model 5430 | Standard item – any supplier will do |
Citric acid TrisodiumSaltDihydrate | Sigma | C-8532 100 g | Standard item – any supplier will do |
CMRL | Gibco BRL | 21540 500 mL | Standard item – any supplier will do |
CMRL-1066 | Gibco | 21-510-018 | Standard item – any supplier will do |
Cryogenic Tubes (Nalgene) | Fisher Scientific | 5000-0020 | Standard item – any supplier will do |
Deep Petri with stacking ring 100 mm × 25 mm | Sigma | P7741 | Standard item – any supplier will do |
Digital Incubator | VWR | model 1545 | Standard item – any supplier will do |
DMSO | ThermoFisher | D12345 | Standard item – any supplier will do |
Filters for filter sterilization | Millipore 0.22μm GPExpressPLUS Membrane | SCGPU05RE | Standard item – any supplier will do |
Gelatin | Difco BD | 214340 500 g | Standard item – any supplier will do |
Glass Culture Tubes | Fisher Scientific | 99449-20 | Standard item – any supplier will do |
Glucose | Sigma | G-7021 1 kg | Standard item – any supplier will do |
Glycerol | Sigma | G5516 | Standard item – any supplier will do |
Hemafuge (Hematocrit & Immuno hematology centrifuge ) | Labwissen | Model 3220 | Standard item – any supplier will do |
HEPES | Sigma | H-3784 100 g | Standard item – any supplier will do |
N-acetylglucoseamine | Sigma | A-3286 25 g | Standard item – any supplier will do |
Neopeptone | Difco BD | 211681 500 g | Standard item – any supplier will do |
Neubauer Hematocytometer | Sigma | Z359629 | Standard item – any supplier will do |
Phase contrast microscope | Leitz | Standard item – any supplier will do | |
Phosphomycin | Sigma | P5396-1G | Standard item – any supplier will do |
Phosphomycine | Sigma | P5396 | Standard item – any supplier will do |
Pipetboy | Integra | Standard item – any supplier will do | |
Precision Standard Balance | OHAUS | model TS200S | Standard item – any supplier will do |
Pyruvic acid (Na salt) | Sigma | P-8574 25 g | Standard item – any supplier will do |
Rabbit Serum | Gibco | 16-120-032 | Source is important |
Rabbit Serum | Sigma | R-4505 100 mL | Source is important |
Rifampicin | Sigma | R3501-1G | Standard item – any supplier will do |
Sodium bicarbonate | Sigma | S-5761 500 g | Standard item – any supplier will do |
Sufametaxazole | Sigma | PHR1126 | Standard item – any supplier will do |
TC Yeastolate | Difco BD | 255752 100 g | Standard item – any supplier will do |
Transfer Pipettes | VWR | 470225-044 | Standard item – any supplier will do |
Trimethoprim | Sigma | PHR1056 | Standard item – any supplier will do |