Un profileur de microdialyse est décrit pour échantillonner les solutés d’eau interstitielle dissous à travers une interface sol-eau oxique-anoxique in situ avec un minimum de perturbation. Ce dispositif est conçu pour capturer les changements rapides dans les profils concentration-profondeur induits par les perturbations à l’interface sol-eau et au-delà.
Les processus biogéochimiques se déplacent rapidement dans les dimensions spatiales (échelle millimétrique) et temporelles (échelle horaire à échelle journalière) à l’interface oxique-anoxique en réponse à des perturbations. Déchiffrer les changements biogéochimiques rapides nécessite des outils in situ, peu invasifs avec une résolution d’échantillonnage spatiale et temporelle élevée. Cependant, les dispositifs d’échantillonnage passif disponibles ne sont pas très utiles dans de nombreux cas, soit en raison de leur nature jetable, soit en raison de la complexité et de la charge de travail considérable pour la préparation des échantillons.
Pour résoudre ce problème, un profileur de microdialyse avec 33 tubes individuels de nanomembrane de polyéthersulfone (semi-perméables, taille des pores de <20 nm) intégrés dans le squelette unidimensionnel (60 mm) a été établi pour échantillonner de manière itérative les composés dissous dans l’eau interstitielle à travers l’interface sol-eau à une haute résolution de 1,8 mm (diamètre extérieur plus un espacement, c’est-à-dire 0,1 mm entre les sondes). Le mécanisme d’échantillonnage est basé sur le principe de diffusion du gradient de concentration. Le chargement automatique de l’eau dégazée permet de perturber le moins possible les espèces chimiques à travers l’interface oxique-anoxique.
Ce document décrit quotidiennement les procédures de configuration des dispositifs et d’échantillonnage continu des eaux interstitielles à travers l’interface sol-eau. Les profils concentration-profondeur ont été mesurés sélectivement avant (le jour 6) et après (le jour 7) les perturbations induites par l’irrigation. Les résultats ont montré que les profils concentration-profondeur subissaient des changements rapides, en particulier pour les éléments sensibles au redox (c.-à-d. le fer et l’arsenic). Ces protocoles peuvent aider à étudier les réponses biogéochimiques à travers l’interface sol-eau sous diverses perturbations causées par des facteurs physiques, chimiques et biologiques. Le document examine en détail les avantages et les inconvénients de cette méthode pour une utilisation potentielle dans les sciences de l’environnement.
Une interface oxique-anoxique est une caractéristique générale de la biosphère qui est vitale pour le cycle biogéochimique1. Cette interface est très hétérogène, la portée spatiale s’étendant du millimètre dansl’interface sédiment/sol-eau 1,2 à des milliers de mètres dans la zone anoxique océanique 3,4. Cette interface est un habitat idéal pour étudier la complexité de la biogéochimie élémentaire.
Les interfaces sol-eau ont une caractéristique typique de gradient oxique-anoxique de quelques centimètres et sont faciles à établir dans les expériences de mésocosme. À partir de la consommation d’oxygène moléculaire provenant des eaux de surface, les communautés microbiennes fonctionnelles stratifiées entraînent le développement de divers gradients, tels que les gradientsO2, pH et Eh, à l’échelle millimétrique1. Le cycle biogéochimique à l’interface oxique-anoxique est sensible à diverses perturbations dans la nature 5,6. Dans le cas des sédiments et des rizières, l’apport de matière organique fraîche comme la litière et la paille, les inondations et le drainage périodiques, les fluctuations et les extrêmes de température et la bioturbation peuvent entraîner des changements dans le cycle biogéochimique à l’interface oxique-anoxique, entraînant probablement des impacts durables, tels que les émissions de gaz à effet de serre, l’eutrophisation et la contamination à un endroit donné. Par conséquent, le gradient oxique-anoxique à l’interface sol-eau fournit une fenêtre pour l’étude des cycles biogéochimiques globaux à grande échelle. L’échantillonnage spatio-temporel et l’analyse des substances dissoutes le long de l’interface sol-eau à haute résolution ont toujours été intéressants; toutefois, peu de progrès ont été réalisés en ce qui concerne la méthodologie.
Contournant les inconvénients de l’extraction destructive de l’eau interstitielle, l’échantillonnage passif non destructif est de plus en plus utilisé pour éviter les changements dans la chimie de l’eau interstitielle et remédier à la complexité de la préparation des échantillons7. Plusieurs appareils capables d’effectuer des échantillonnages in situ de haute précision (de l’échelle micrométrique à l’échelle centimétrique) ont été largement utilisés, notamment les échantillonneurs de dialyse in situ (appelés peepers)8, l’équilibration diffusive en couches minces (DET)9 et le gradient diffusif en couches minces (DGT)10. Les substances dissoutes sont échantillonnées passivement par le mécanisme des processus de diffusion et d’adsorption. Bien qu’ils se soient révélés utiles pour décrire les profils chimiques oxico-anoxiques, ils sont toujours à usage unique, ce qui limite leur application plus large.
Récemment, la technique de microdialyse est apparue comme un outil sensible qui peut être utilisé pour surveiller la dynamique des composés solubles dans le sol à des échelles temporelles de minutes à jours11,12,13,14. Pour un scénario typique utilisant la microdialyse en sciences médicales et environnementales, une sonde miniature de type concentrique constituée d’une membrane tubulaire semi-perméable (c.-à-d. un microdialyseur) est utilisée pour sonder le liquide interstitiel ou les solutions du sol afin de prévenir des perturbations importantes sur les processus métaboliques et la spéciation chimique15,16. L’un des plus grands avantages inhérents à la microdialyse est la capture in situ des changements de concentration en fonction du temps dans le sol ou les tissus biologiques15,16.
Sur la base du concept de microdialyse, nous avons développé un profileur de microdialyse plus facile à utiliser, précédemment appelé profileur intégré d’injection d’eau interstitielle (IPI), qui peut effectuer une dialyse d’équilibre continue des solutés d’eau interstitielle basée sur le principe de diffusion du gradient de concentration2. Le dispositif de microdialyse utilise des tubes à nanomembrane creuss pour la précharge active du perfusat et la diffusion passive des solutés dissous, ce qui est différent de la diffusion en vrac de l’eau interstitielle utilisée dans les peepers, les filtres à pression tels que l’échantillonneur Rhizon et le DGT basé sur l’accumulation. Le dispositif a été testé et validé dans l’échantillonnage temporel et spatial d’éléments cationiques et anioniques dans les sols montagneux et inondés (Figure 1A-1)13,15,16. La microdialyse simple à pompe minimise le nombre d’étapes de préparation des échantillons 2,15.
Nous avons fabriqué un profileur de microdialyse en intégrant un ensemble d’échantillonneurs sur un squelette de support unidimensionnel, et ce profileur a obtenu un échantillonnage à haute résolution à l’interface sol-eau et à la rhizosphère 2,15,17. Dans cette étude, des modifications considérables ont été apportées au dispositif d’échantillonnage et à la méthode d’échantillonnage pour permettre le prélèvement de 33 échantillons d’eau interstitielle à l’interface sol-eau (profondeur verticale de 60 mm) avec une perturbation minimale pour l’analyse élémentaire en aval. L’ensemble de la procédure d’échantillonnage prend ~15 min. Étant donné que le profileur de microdialyse est nouveau dans la communauté des sciences de l’environnement, nous présentons les détails des composants de l’appareil et des procédures d’échantillonnage pour indiquer le potentiel de la microdialyse dans la surveillance des changements dans les signaux chimiques à l’interface sol-eau.
Description du profileur de microdialyse
Le dispositif de profilage de microdialyse, avec les modifications appropriées de la conception précédente2, est illustré à la figure 1. La taille effective des pores de la nanomembrane (Figure 1C-1) est estimée à seulement quelques nanomètres pour empêcher la diffusion de grosses molécules et de cellules microbiennes. Un essai antérieur a suggéré qu’une incubation inondée de 6 mois n’avait entraîné aucun dépôt de fer à l’intérieur ou à l’extérieur de la surface du tube15. Un squelette incurvé et creux a été conçu (Figure 1C-2) et imprimé en 3D à l’aide d’un matériau en nylon stable. Au total, 33 tubes nanomembranaires (polyéthersulfone; taille des pores de surface: 0-20 nm; diamètre intérieur x diamètre extérieur x longueur effective d’échantillonnage: 1,0 mm x 1,7 mm x 54 mm; volume théorique: 42,4 μL) reliés à des tuyaux en polytétrafluoroéthylène (PTFE) adaptés (longueur: 18 cm x 2 cm de diamètre figure 1C-1) ont été installés sur le squelette et sur un côté d’un contenant en PVC (figure 1B). Pour ce dispositif, l’élément de prélèvement (figure 1B-1) se trouve à 2 cm de la paroi latérale du récipient en PVC. Pour le côté injection (figure 1B-4), tous les tubes ont été reliés à un connecteur un-à-plusieurs, qui a été fixé dans un récipient tampon de manière étanche à l’air (figure 1B-7). Une poche de perfusion médicale (figure 1B-11) a été utilisée pour se connecter au récipient tampon par une valve à trois voies. L’étanchéité à l’air du système a été soigneusement examinée dans l’eau avant d’autres opérations expérimentales. L’eau préchargée (18,2 MΩ, 500 mL) dans la poche de perfusion médicale est toujours exempte d’oxygène (figure 1C-8). La configuration détaillée de l’appareil et l’échantillonnage de l’eau interstitielle sont décrits ci-dessous.
D’après les expériences et les pratiques antérieures2, certaines considérations nécessitent une attention particulière lors de l’assemblage du profileur de microdialyse et de l’échantillonnage des eaux interstitielles. Tout d’abord, le tube à nanomembrane et le tube de connexion doivent être soigneusement connectés pour éviter les blocages ou les fuites au niveau de la connexion. Lorsque le sol est incubé dans des conditions inondées, l’introduction d’oxygène s’oxyde rapidement et précipite le fer ferreux dans la tubulure de dialyse (figure 4). Pour cette raison, avant d’assembler le profileur de microdialyse, chaque tube de microdialyse doit être vérifié pour l’intégrité (aucun dommage), l’étanchéité à l’air des connexions et la perméabilité de la tubulure. De même, la connexion du cadre de support à la paroi latérale du conteneur d’incubation doit être effectuée avec soin pour éviter les fuites. Avant les expériences formelles, les contrôles d’étanchéité aux différents emplacements de connexion sont toujours une priorité. Deuxièmement, le perfusat dans le sac anaérobie doit être désoxygéné de manière adéquate. Sinon, le fer ferreux dans l’eau interstitielle réagira avec l’oxygène du perfusat pour former des précipités insolubles (Figure 4). Cela modifiera gravement la spéciation et la concentration du soluté et les processus de diffusion vers les tubes à nanomembrane. Troisièmement, une faible fréquence d’échantillonnage (jours et semaines) entraînera la diffusion du soluté dans la région tampon. Cela peut contaminer l’ensemble de l’échantillon de profil. Pour résoudre ce problème, trois solutions possibles peuvent être envisagées : (1) l’échantillonnage à une fréquence élevée, par exemple une fois par jour (cependant, cela peut entraîner une déplétion du soluté près de l’échantillonneur de dialyse lorsque plusieurs prélèvements sont effectués); 2° prolonger la longueur du tuyau de raccordement dans la zone d’injection au besoin; (3) la refonte du pipeline d’échantillonnage afin d’obtenir un contrôle unique d’un seul pipeline. Ce sont également des directions pour l’amélioration de l’appareil à l’avenir. Quatrièmement, pendant le processus d’échantillonnage, il faut s’assurer que le niveau de la surface de l’eau dans le sac anaérobie, le sol inondé et le tuyau d’échantillonnage sont approximativement à la même hauteur pour équilibrer la pression de l’eau. Sinon, une différence de potentiel d’eau à l’intérieur et à l’extérieur du tube à membrane entraînera une diminution ou une augmentation de la diffusion du soluté.
Limitations
Premièrement, étant donné que le profileur de microdialyse n’est pas disponible dans le commerce, la méthode reste chronophage en termes de préparation de l’appareil. Il a fallu des jours pour préparer un seul tube de dialyse, y compris l’impression du squelette de support, l’assemblage de l’appareil et le nettoyage. Mais les fonctionnalités réutilisables ultérieures comblent complètement cette lacune. Deuxièmement, il existe certaines limites dans l’application de l’appareil à des scénarios de sol non inondé, qui peuvent être utilisés pour18. En raison de la différence importante de potentiel hydrique entre l’intérieur et l’extérieur du tube à membrane dans un sol sec, la solution préchargée subit une perte de diffusion; En effet, diverses récupérations de volume d’échantillonnage de l’ordre de 10 % à 36 % ont été observées lors de l’essai préliminaire (données détaillées non présentées), ce qui crée une incertitude quant aux résultats.
Comparaison de la méthode avec des méthodes existantes ou alternatives
La méthode tient compte en partie du fait que les échantillonneurs passifs existants ne peuvent pas échantillonner à plusieurs reprises et minimise la charge de travail liée à la préparation des échantillons, en particulier pour l’échantillonnage et la conservation des eaux interstitielles anoxiques2. Les changements instantanés de concentration et de spéciation des solutés dialysés peuvent refléter de manière sensible la réponse de l’interface oxique-anoxique à toute perturbation de l’environnement. Théoriquement, l’échantillonnage à une fréquence de minutes, d’heures ou de jours permet de capturer les processus qui changent rapidement à l’interface. Pour les échantillonneurs passifs qui doivent être en déploiement pendant des jours, certains moments chauds et points chauds peuvent être manqués 6,19.
Importance et applications potentielles dans les sciences de l’environnement
Cette approche pourrait faire progresser les études biogéochimiques aux interfaces oxique-anoxique, par exemple, pour trouver des moments chauds et des points chauds des processus biogéochimiques dans des conditions spécifiques Eh-pH. Le processus redox est le processus de base des activités de la vie1. Les micro-organismes, en particulier, nécessitent des conditions de vie optimales et sont très sensibles aux perturbations environnementales1. Il en résulte un développement très dynamique des communautés microbiennes et des processus biogéochimiques dans des environnements hétérogènes20. L’échantillonnage direct, sans tenir compte de la grande hétérogénéité, tend à obtenir un échantillon mixte à partir de diverses conditions environnementales. Cela provoque des incohérences entre les informations chimiques mesurées et les micro-organismes clés20. À quelques centimètres de la couche superficielle de sol ou de sédiments dans une rizière inondée typique, il existe des gradients redox, ainsi que divers gradients physiques, chimiques21 et biologiques1. La technologie doit être capable de capter des signaux biogéochimiques à l’échelle millimétrique; Sinon, les données qui ne correspondent pas à l’échelle réelle peuvent conduire à des conclusions ambiguës. Le profileur de microdialyse est capable de surveiller les signaux biochimiques à l’échelle millimétrique à l’interface sol-eau en quelques jours ou heures avec un minimum de perturbations. Dans cette étude, la dynamique spatio-temporelle de différents éléments sur une période de 48 h a été observée, peut-être liée à la perturbation de la reconstitution de l’eau. Par conséquent, une application plus large du profileur de microdialyse peut aider à comprendre comment les perturbations affectent les processus biogéochimiques clés dans un monde en évolution.
The authors have nothing to disclose.
Ce travail est financé par la Fondation nationale des sciences naturelles de Chine (41977320, 41571305) et le Fonds spécial du programme clé de XJTLU (KSF-A-20).
3D Printer | Snapmaker, United States | Snapmaker 2.0 | Model: A250 |
3M DP190 Scotch-Weld Gray | 3M United States | 489-483 | Gray |
Centrifuge tube | Titan, China | SWLX-JZ050-ZX | 50 mL, Sterilized DNASE/RNASE/Protease/Pyrogen Free |
Ceramic knife | R felngli, China | N.A. | General |
EDTA FREE ACID | Sigma-Aldrich | CAS 60-00-4 | Sigma-Aldrich#EDS-1KG |
Ethanol | Adamas | CAS 64-17-5 | Water ≤ 50 ppm (by K.F.), 99.5%, SafeDry, with molecular sieves, Safeseal |
Hot melt adhesive | Magic Dragon, China | N.A. | JTWJRRJB001 |
Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry | PerkinElmer, Inc., Shelton, CT USA | N.A. | Model: NexION 350X |
Medical Infusion Bag | Hunan Kanglilai Medical Equipment Co., Ltd | N.A. | 250 Ml, Sterlized |
Milli-Q water system | Mingche, Inc., China | N.A. | 18.3 MΩ, water purification system model: 24UV |
Nanomembrane Tube (polyethersulfone) | Motimo Membrane Technology Co., Ltd., Tianjin, China | N.A. | Polyethersulfone, inner diameter 1 mm, poresize <20 nm, pretreated with ethanol (99.5%) |
Nitrogen gas | Suzhou Gas, Chuina | N.A. | High puriety |
Nitrotic acid (Concentrated) | Adamas | CAS 7697-37-2 | 69%,Single Metal < 50 ppt, PFA Bottle |
Nylon Fiber | Soumiety | 10052076600273 | For 3D-printing |
Pipette | Bond A3 Pipette | N.A. | 200 μL |
Pipette Tip | Titan | T2-H-T0200 | 200 μL, 300 μL Tip Box Non-sterile|200 μL|Titan |
Polytetrafluoroethylene Tube | ROHS, China | CJ-TTL | Out diameter 1 mm |
Sample vial | Titan, China | EP0060-B-N | 0.6 mL, Sterilized DNASE/RNASE/Protease/Pyrogen Free |
Silicon cap | Fuchenxiangsu, China | N.A. | Inner diameter 1 mm, length 1 cm |
Sonicator | Elma | N.A. | model:E120H |
Square PVC water pipe | Taobao.com | N.A. | hight x width, 12 cm x 15 cm |
Three-way valve for infusion | OEM, China | N.A. | Medical level; Valve body: PC material; valve core: PE material; screw cap: ABS material |