פרוטוקול זה מתאר את הסינתזה של פפטידים מחזוריים החודרים לתאים עם קישורים צולבים ארומטיים ואת הערכת החדירות שלהם על פני מחסומים ביולוגיים.
סרטן היה אתגר גדול בבריאות העולמית. עם זאת, המיקרו-סביבה המורכבת של הגידול בדרך כלל מגבילה את הגישה של טיפולים לתאי גידול עמוקים יותר, מה שמוביל להישנות הגידול. כדי להתגבר על החדירה המוגבלת של מחסומים ביולוגיים, פפטידים חודרי תאים (CPPs) התגלו עם יכולת טרנסלוקציה מעולה של הממברנה והתגלו כמובילים מולקולריים שימושיים להעברת מטענים שונים לתאים. עם זאת, CPPs ליניאריים קונבנציונליים מראים בדרך כלל יציבות פרוטאוליטית פגומה, מה שמגביל את החדירות שלהם על פני מחסומים ביולוגיים. לפיכך, הפיתוח של טרנספורטרים מולקולריים חדשניים שיכולים לחדור מחסומים ביולוגיים ולהפגין יציבות פרוטאוליטית משופרת הוא רצוי מאוד כדי לקדם יעילות אספקת תרופות ביישומים ביו-רפואיים. בעבר סינתזנו פאנל של CPPs מחזוריים קצרים עם קישורים צולבים ארומטיים, שהציגו חדירות מעולה בתאים וברקמות סרטניים בהשוואה למקביליהם הליניאריים. כאן, פרוטוקול תמציתי מתואר לסינתזה של פפטיד פוליארגינין R8 מחזורי המסומן פלואורסצנטית ומקבילו הלינארי, כמו גם שלבי מפתח לחקר חדירות התא שלהם.
בעשורים האחרונים חלה התקדמות מהירה בפיתוח פפטידים חודרי תאים (CPP) לאספקת תרופות. CPPs נמצאים בשימוש נרחב כמובילים מולקולריים לטיפול במגוון מחלות מסכנות חיים, כולל הפרעות נוירולוגיות1,2, מחלות לב3, סוכרת4, דרמטוזיס5 וסרטן 6,7. מחלת הסרטן נותרה נטל בריאותי עולמי המלווה בשיעור גבוה של תחלואה ותמותה למרות מאמצי מחקר נרחבים8. מכשול רציני לטיפול בסרטן הוא הגישה המוגבלת של טיפולים לתאי גידול עמוקים יותר עקב מחסומים פיזיולוגיים כגון מטריצה חוץ-תאית קומפקטית (ECM), כלי דם גידוליים חריגים, מחסומי ממברנות מרובים ולחץ נוזל אינטרסטיציאלי גבוה (IFP)9. לפיכך, פיתוח CPPs חדשניים עם יכולת מעולה להעביר מטענים מעבר למחסומים ביולוגיים נחשב אסטרטגיה חיונית לטיפול בסרטן10,11.
ניתן לסווג CPPs לקטיון, אמפיפתי והידרופובי במונחים של התכונות הפיזיקוכימיות שלהם12. בין אלה, פפטיד HIV-TAT טעון חיובי ופוליארגינין סינתטי הם בעלי חשיבות רבה במחקר ביו-רפואי ונחקרו בהרחבה כדי להקל על מתן תרופות תוך תאיות13. טונמן ועמיתיו דיווחו כי אורך מינימלי של שמונה ארגינינים חיוני לחדירה יעילה של פפטידים פוליארגינין סינתטיים, בהתבסס על מחקר חדירות תאים שנערך באמצעות פפטידים R3 עד R1214. עם זאת, ל-CPPs אלה יש בדרך כלל זמן מחצית חיים קצר בפלזמה בשל ההידרוליזה המהירה שלהם in vivo. בנוסף, מעט ידוע על אופטימיזציה של המבנה הכימי של CPPs כדי להגדיל את יכולת מחסום הטרנס שלהם, שכן זה מאתגר לחדור קרומי תאים מרובים15. לפיכך, פיתוח של טרנספורטרים מולקולריים חדשניים המסוגלים לחדור מחסומים ביולוגיים רצוי מאוד כדי לשפר את יעילות אספקת התרופות. בשנת 2020, Komin et al.16 גילו CPP בשם CL peptide, המכיל מוטיב סליל (RLLRLLR) וזנב פוליארגינין (R7) לחציית חד-שכבה אפיתלית. קבוצה של גרסאות פפטיד CL סונתזו גם על ידי שינוי התבנית הסלילית. מחקר זה יכול להיות מדריך משמעותי לפיתוח CPPs חדשניים להובלת מטענים מעבר למחסומים ביולוגיים. יתר על כן, דיטריך ועמיתיו ייעלו את חדירות התאים של פפטיד StAX, ועיכבו את מסלול האיתות Wnt/β-catenin על ידי הגדלת ההידרופוביות הכוללת של הפפטידים17.
הגבלה קונפורמטיבית של פפטידים ליניאריים לא מובנים על ידי מחזוריות היא דרך יעילה לשפר את היציבות והחדירות הפרוטאוליטית שלהם18,19,20. החיזוק המבני מגביר את עמידות הפרוטאז של פפטידים מחזוריים, מה שהופך אותם ליציבים יותר ב-vivo בהשוואה למקביליהם הלינאריים. בנוסף, מחזוריות של פפטידים יכולה באופן פוטנציאלי להסוות את עמוד השדרה של הפפטידים הקוטביים על ידי קידום קשרי מימן תוך-מולקולריים, ובכך להגדיל את חדירות הממברנה של הפפטידים21. בשני העשורים האחרונים, שיטות מחזוריות כימוסלקטיביות הפכו לאסטרטגיות יעילות לבניית פפטידים מחזוריים עם ארכיטקטורות שונות, כגון כל-פחמימנים, לקטם, טריאזול, m-xylene, perfluoroaryl, וקישורים צולבים אחרים22,23. המחסום הביולוגי שמטילה המיקרו-סביבה המתוחכמת של הגידול יכול להפחית את חדירת התרופות בגידולים מוצקים24. מצאנו בעבר כי CPPs מחזוריים הפגינו עמידות עדיפה לעיכול אנזימטי על פני עמיתיהם הליניאריים20. יתר על כן, ההידרופוביות הכוללת של הפפטידים היא קריטית לחדירות התאים המשופרת שלהם22. בהתבסס על המחקרים שנדונו לעיל, ניתן לשער כי השילוב של דפוס טעון חיובי, הידרופוביות כללית מוגברת ויציבות פרוטאוליזה משופרת מגביר את החדירות של CPPs על פני מחסומים ביולוגיים. במחקר שנערך לאחרונה, זיהינו שני CPPs מחזוריים עם קישורים ארומטיים במיקומים i ו- i+7 המציגים חדירות משופרת בתאים וברקמות של הגידול בהשוואה למקביליהם הליניאריים15. כאן, פרוטוקול סינתטי תמציתי לסינתזה של CPPs מחזוריים מסומנים פלואורסצנטית ואת השלבים העיקריים כדי לחקור את החדירות שלהם מוצגים.
הייצוב הכימי של הפפטידים על ידי שילוב אילוצי קונפורמציה הוכח כאסטרטגיה יעילה לשיפור היציבות והחדירות התאית של הפפטיד26. בפרוטוקול זה, מתואר הליך שלב אחר שלב לסינתזה של CPPs מחזוריים עם קישורים צולבים ארומטיים והערכת החדירות שלהם על פני מחסומים ביולוגיים. בהשוואה לקישורים הצול?…
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו נתמכת על ידי הקרן למדעי הטבע של סין (21708031), הקרן למדע פוסט-דוקטורט בסין (BX20180264, 2018M643519), וקרנות המחקר הבסיסיות לאוניברסיטאות המרכזיות (2682021ZTPY075).
1,2-ethanedithiol | Aladdin | K1722093 | stench |
2-(7-Azobenzotriazole)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate (HATU) | HEOWNS | A-0443697 | |
4,4'-bis(bromomethyl)biphenyl | TCI | B1921 | |
4T1 cells | ATCC | 4T1 cells were cultured in DMEM medium supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
Acetonitrile | Adamas | 1484971 | toxicity |
Dichloromethane | Energy | W330229 | skin harmful |
Diethyl ether | Aldrich | 673811 | flammable |
Dimethyl sulfoxide | Beyotime | ST038 | skin harmful |
Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco | ||
Electrospray Ionization Mass Spectrometer | Waters | G2-S Tof | |
Ethylene Diamine Tetraacetic Acid (EDTA) | BioFroxx | 1340 | |
Fetal bovine serum (FBS) | HyClone | ||
Flow cytometer | Beckman Coulter | CytoFLEX | |
Fluorescein isothiocyanate isomer (FITC) | Energy | E0801812500 | |
Fluorescent microscope | Carl Zeiss | Axio Observer 7 | |
Fmoc-Arg(Pbf)-OH | HEOWNS | F-81070 | |
Fmoc-Cys(Trt)-OH | GL Biochem | GLS201115-35202 | |
Fmoc-βAla-OH | Adamas | 51341C | |
HeLa cells | ATCC | HeLa cells were cultured in DMEM supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
High-Performance Liquid Chromatography | Agilent | Agilent 1260 | |
High-Performance Liquid Chromatography column | Agilent | Poroshell EC-C18 120, 4.6 × 150 mm (pore size 120 Å, particle size 4 μm) | |
Lyophilizer | SP Scientific | Vir Tis | |
Methanol | Aldrich | 9758 | toxicity |
Microtiter plate | Thermo μdrop plate | N12391 | |
Morpholine | HEOWNS | M99040 | irritant |
Multi-technology microplate reader | Thermo | VARIOSKAN LUX | |
N,N-Diisopropylethylamine | HEOWNS | E-81416 | irritant |
N,N-Dimethyl formamide | Energy | B020051 | harmful to skin |
Poly-Prep column | Bio-Rad | 7321010 | polypropylene chromatography columns |
Rink Amide MBHA resin (0.572 mmol/g) | GL Biochem | GLS180301-49101 | |
Three-way stopcocks | Bio-Rad | 7328107 | |
Tissue culture plate insert | LABSELECT | 14211 | |
Trifluoroacetic acid | HEOWNS | T63278 | corrosive |
Triisopropylsilane | HEOWNS | T-0284475 | |
Trypsin | BioFroxx | 1004 | |
Vacuum manifold | Promega | A7231 |