Ce protocole décrit la synthèse de peptides cycliques pénétrant dans les cellules avec des réticulations aromatiques et l’évaluation de leur perméabilité à travers les barrières biologiques.
Le cancer a été un grand défi pour la santé mondiale. Cependant, le microenvironnement tumoral complexe limite généralement l’accès des thérapies aux cellules tumorales plus profondes, conduisant à une récidive tumorale. Pour vaincre la pénétration limitée des barrières biologiques, des peptides pénétrant dans les cellules (CPP) ont été découverts avec une excellente capacité de translocation membranaire et sont apparus comme des transporteurs moléculaires utiles pour délivrer diverses cargaisons dans les cellules. Cependant, les CPP linéaires conventionnels présentent généralement une stabilité protéolytique compromise, ce qui limite leur perméabilité à travers les barrières biologiques. Ainsi, le développement de nouveaux transporteurs moléculaires capables de pénétrer les barrières biologiques et de présenter une stabilité protéolytique améliorée est fortement souhaité pour promouvoir l’efficacité de l’administration de médicaments dans des applications biomédicales. Nous avons déjà synthétisé un panel de CPP cycliques courts avec des réticulations aromatiques, qui ont montré une perméabilité supérieure dans les cellules et les tissus cancéreux par rapport à leurs homologues linéaires. Ici, un protocole concis est décrit pour la synthèse du peptide cyclique polyarginine R8 marqué par fluorescence et de son homologue linéaire, ainsi que des étapes clés pour étudier leur perméabilité cellulaire.
Les dernières décennies ont vu des progrès rapides dans le développement de peptides pénétrant dans les cellules (CPP) pour l’administration de médicaments. Les CPP ont été largement utilisés comme transporteurs moléculaires pour le traitement d’une gamme de maladies potentiellement mortelles, notamment les troubles neurologiques1,2, les maladies cardiaques3, le diabète4, la dermatose5 et le cancer 6,7. Le cancer reste un fardeau sanitaire mondial accompagné d’un taux élevé de morbidité et de mortalité malgré les efforts de recherche généralisés8. Un obstacle sérieux au traitement du cancer est l’accès limité des thérapies aux cellules tumorales plus profondes en raison de barrières physiologiques telles que la matrice extracellulaire compacte (ECM), le système vasculaire tumoral anormal, les barrières membranaires multiples et la pression élevée du liquide interstitiel (IFP)9. Ainsi, le développement de nouveaux CPP ayant une capacité supérieure à livrer des cargaisons à travers les barrières biologiques est considéré comme une stratégie essentielle pour le traitement du cancer10,11.
Les CPP peuvent être classés en CPP cationiques, amphipathiques et hydrophobes en termes de propriétés physico-chimiques12. Parmi ceux-ci, le peptide VIH-TAT chargé positivement et la polyarginine synthétique sont d’une importance considérable dans la recherche biomédicale et ont été largement étudiés pour faciliter l’administration intracellulairede médicaments 13. Tunnemann et al. ont rapporté qu’une longueur minimale de huit arginines est essentielle pour une pénétration cellulaire efficace des peptides synthétiques de polyarginine, sur la base d’une étude de perméabilité cellulaire menée à l’aide de peptides R3 à R1214. Cependant, ces CPP ont généralement des demi-vies plasmatiques courtes en raison de leur hydrolyse rapide in vivo. En outre, on sait peu de choses sur l’optimisation de la structure chimique des CPP afin d’augmenter leur capacité de trans-barrière, car il est difficile de pénétrer dans plusieurs membranes cellulaires15. Ainsi, le développement de nouveaux transporteurs moléculaires capables de pénétrer les barrières biologiques est fortement souhaité pour améliorer l’efficacité de l’administration des médicaments. En 2020, Komin et al.16 ont découvert un CPP appelé peptide CL, qui contient un motif hélicoïdal (RLLRLLR) et une queue de polyarginine (R7) pour traverser la monocouche épithéliale. Un ensemble de variantes peptidiques CL ont également été synthétisées en modifiant le motif hélicoïdal. Cette exploration pourrait être un guide important pour le développement de nouveaux CPP pour la livraison de cargaisons à travers les barrières biologiques. De plus, Dietrich et al. ont optimisé la perméabilité cellulaire du peptide StAX, inhibant la voie de signalisation Wnt / β-caténine en augmentant l’hydrophobicité globale des peptides17.
La restriction conformationnelle des peptides linéaires non structurés par cyclisation est un moyen efficace d’améliorer leur stabilité protéolytique et leur perméabilité18,19,20. Le renforcement structurel augmente la résistance à la protéase des peptides cycliques, les rendant plus stables in vivo par rapport à leurs homologues linéaires. De plus, la cyclisation des peptides peut potentiellement masquer le squelette peptidique polaire en favorisant la liaison hydrogène intramoléculaire, augmentant ainsi la perméabilité membranaire des peptides21. Au cours des deux dernières décennies, les méthodes de cyclisation chimiosélective sont devenues des stratégies efficaces pour la construction de peptides cycliques avec différentes architectures, telles que tous les hydrocarbures, lactamines, triazoles, m-xylène, perfluoroaryl et autres réticulationscroisées 22,23. La barrière biologique imposée par le microenvironnement tumoral sophistiqué pourrait réduire la pénétration des médicaments dans les tumeurs solides24. Nous avons déjà constaté que les CPP cycliques présentaient une résistance supérieure à la digestion enzymatique par rapport à leurs homologues linéaires20. De plus, l’hydrophobicité globale des peptides est essentielle pour améliorer leur perméabilité cellulaire22. D’après les études mentionnées ci-dessus, on peut émettre l’hypothèse que la combinaison d’un profil chargé positivement, d’une hydrophobicité globale élevée et d’une stabilité accrue de la protéolyse augmente la perméabilité des CPP à travers les barrières biologiques. Dans une étude récente, nous avons identifié deux CPP cycliques avec des réticulations aromatiques aux positions i et i+7 qui présentent une perméabilité améliorée dans les cellules et les tissus tumoraux par rapport à leurs homologues linéaires15. Ici, un protocole synthétique concis pour la synthèse de CPP cycliques marqués par fluorescence et les étapes clés pour étudier leur perméabilité sont présentés.
La stabilisation chimique des peptides par l’incorporation de contraintes conformationnelles s’est avérée être une stratégie efficace pour améliorer la stabilité et la perméabilité cellulaire du peptide26. Dans ce protocole, une procédure étape par étape est décrite pour la synthèse de CPP cycliques avec des réticulations aromatiques et l’évaluation de leur perméabilité à travers les barrières biologiques. Par rapport aux réticulations hydrophiles lactamines ou triazoles<…
The authors have nothing to disclose.
Ce travail est soutenu par la Fondation des sciences naturelles de Chine (21708031), la Fondation chinoise des sciences postdoctorales (BX20180264, 2018M643519) et les Fonds de recherche fondamentale pour les universités centrales (2682021ZTPY075).
1,2-ethanedithiol | Aladdin | K1722093 | stench |
2-(7-Azobenzotriazole)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate (HATU) | HEOWNS | A-0443697 | |
4,4'-bis(bromomethyl)biphenyl | TCI | B1921 | |
4T1 cells | ATCC | 4T1 cells were cultured in DMEM medium supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
Acetonitrile | Adamas | 1484971 | toxicity |
Dichloromethane | Energy | W330229 | skin harmful |
Diethyl ether | Aldrich | 673811 | flammable |
Dimethyl sulfoxide | Beyotime | ST038 | skin harmful |
Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco | ||
Electrospray Ionization Mass Spectrometer | Waters | G2-S Tof | |
Ethylene Diamine Tetraacetic Acid (EDTA) | BioFroxx | 1340 | |
Fetal bovine serum (FBS) | HyClone | ||
Flow cytometer | Beckman Coulter | CytoFLEX | |
Fluorescein isothiocyanate isomer (FITC) | Energy | E0801812500 | |
Fluorescent microscope | Carl Zeiss | Axio Observer 7 | |
Fmoc-Arg(Pbf)-OH | HEOWNS | F-81070 | |
Fmoc-Cys(Trt)-OH | GL Biochem | GLS201115-35202 | |
Fmoc-βAla-OH | Adamas | 51341C | |
HeLa cells | ATCC | HeLa cells were cultured in DMEM supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
High-Performance Liquid Chromatography | Agilent | Agilent 1260 | |
High-Performance Liquid Chromatography column | Agilent | Poroshell EC-C18 120, 4.6 × 150 mm (pore size 120 Å, particle size 4 μm) | |
Lyophilizer | SP Scientific | Vir Tis | |
Methanol | Aldrich | 9758 | toxicity |
Microtiter plate | Thermo μdrop plate | N12391 | |
Morpholine | HEOWNS | M99040 | irritant |
Multi-technology microplate reader | Thermo | VARIOSKAN LUX | |
N,N-Diisopropylethylamine | HEOWNS | E-81416 | irritant |
N,N-Dimethyl formamide | Energy | B020051 | harmful to skin |
Poly-Prep column | Bio-Rad | 7321010 | polypropylene chromatography columns |
Rink Amide MBHA resin (0.572 mmol/g) | GL Biochem | GLS180301-49101 | |
Three-way stopcocks | Bio-Rad | 7328107 | |
Tissue culture plate insert | LABSELECT | 14211 | |
Trifluoroacetic acid | HEOWNS | T63278 | corrosive |
Triisopropylsilane | HEOWNS | T-0284475 | |
Trypsin | BioFroxx | 1004 | |
Vacuum manifold | Promega | A7231 |