Recente ontwikkelingen in door de mens geïnduceerde pluripotente stamceldifferentiatieprotocollen maken de stapsgewijze afleiding van orgaanspecifieke celtypen mogelijk. Hier geven we gedetailleerde stappen voor het onderhoud en de uitbreiding van iPSC-afgeleide luchtwegbasale cellen en hun differentiatie in een mucociliair epitheel in lucht-vloeistof interfaceculturen.
Ziekten van de geleidende luchtwegen zoals astma, cystische fibrose (CF), primaire ciliaire dyskinesie (PCD) en virale luchtweginfecties zijn wereldwijd belangrijke oorzaken van morbiditeit en mortaliteit. In vitro platforms met behulp van menselijke bronchiale epitheelcellen (HBECs) zijn instrumenteel geweest voor ons begrip van het luchtwegepitheel in gezondheid en ziekte. Toegang tot HBECs van personen met zeldzame genetische ziekten of zeldzame mutaties is een knelpunt in longonderzoek.
Geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSC’s) worden gemakkelijk gegenereerd door somatische cellen te “herprogrammeren” en behouden de unieke genetische achtergrond van de individuele donor. Recente ontwikkelingen maken de gerichte differentiatie van iPSC’s naar longepitheelvoorlopercellen, alveolaire type 2-cellen, evenals de cellen van het geleidende luchtwegepitheel via basale cellen, de belangrijkste luchtwegstamcellen, mogelijk.
Hier schetsen we een protocol voor het onderhoud en de uitbreiding van van iPSC afgeleide luchtwegbasale cellen (hierna iBC’s) en hun trilineaire differentiatie in lucht-vloeistof interface (ALI) culturen. iBC’s worden onderhouden en uitgebreid als epitheliale bollen gesuspendeerd in druppels van extracellulaire matrix gekweekt in een primair basaal celmedium aangevuld met remmers van TGF-ß en BMP signaalroutes. iBC’s in deze epitheliale bollen drukken belangrijke basale markers TP63 en NGFR uit, kunnen worden gezuiverd door fluorescentie geactiveerde celsortering (FACS) en wanneer ze op poreuze membranen in standaard ALI-cultuuromstandigheden worden geplaatst, differentiëren ze tot een functioneel luchtwegepitheel. ALI-culturen afgeleid van gezonde donoren zijn samengesteld uit basale, secretoire en multiciliated cellen en vertonen epitheliale barrière-integriteit, beweeglijke trilharen en slijmafscheiding. Culturen afgeleid van personen met CF of PCD recapituleren het disfunctionele CFTR-gemedieerde chloridetransport of immoele trilharen, de respectieve ziekteverwekkende epitheliale defecten.
Hier presenteren we een protocol voor het genereren van menselijke cellen dat kan worden toegepast voor het modelleren en begrijpen van luchtwegaandoeningen.
Chronische longziekten zorgen wereldwijd voor een grote last van morbiditeit en mortaliteit1. Aandoeningen die de geleidende luchtwegen beïnvloeden, zoals astma, cystische fibrose (CF), primaire ciliaire dyskinesie (PCD) en virale infecties vertegenwoordigen zowel veel voorkomende als zeldzamere ziekten, verworven en genetisch, die bijdragen aan deze wereldwijde last. De belangrijkste functies van de geleidende luchtwegen zijn: 1) fungeren als een kanaal voor de laminaire luchtstroom en 2) zorgen voor mucociliaire klaring van pathogenen en puin. Secretoire, multiciliated en basale cellen vertegenwoordigen de belangrijkste epitheelceltypen van de geleidende luchtweg. Zeldzamere epitheelceltypen omvatten ionocyten, plukjecellen en neuro-endocriene cellen en zijn elders beoordeeld2.
Over het algemeen is een belangrijke barrière voor het begrijpen van ziektemechanismen en het bevorderen van therapeutische benaderingen een consistent gebrek aan menselijk primair weefsel voor gebruik in preklinische modellen. HBECs worden over het algemeen beschouwd als het gouden standaard in vitro model van menselijke luchtwegepitheelbiologie en hebben een sleutelrol gespeeld in CF-onderzoek in het bijzonder3. Ze worden echter meestal geïsoleerd uit bronchoscopische biopsieën, uit longweefsel na een operatie of uit longen die zijn afgewezen voor transplantatiedoeleinden. Toegang tot HBECs van personen met genetische ziekten, inclusief de onderzoeksprioriteiten van CF en PCD, is zeldzaam en onvoorspelbaar. Het overwinnen van dit knelpunt voor patiënt-afgeleide luchtwegepitheelcellen is nodig. iPSC’s worden gemakkelijk gegenereerd door elk individu, ze behouden de unieke genetische achtergrond van de donor en hebben een opmerkelijk vermogen om zich te vermenigvuldigen en op lange termijn te overleven in celkweekomstandigheden 4,5,6. Door belangrijke embryologische stappen samen te vatten, ondergaan iPSC’s “gerichte differentiatie” in orgaanspecifieke celtypen. Wij en anderen hebben protocollen ontwikkeld om iPSC-afgeleide longvoorlopercellen, alveolaire type 2-cellen 7,8 en de cellen van de geleidende luchtweg inclusief luchtwegbasale cellen 9,10,11,12 te genereren.
De luchtwegbasale cel is de stamcel van de geleidende luchtweg13. In eerder gepubliceerd werk heeft onze groep iPSC-afgeleide luchtwegepitheelcellen gegenereerd, waaronder een subset (iBC’s) die canonieke basale celmarkers uitdrukt, waaronder TP63, KRT5 en NGFR. Na aanwijzingen uit de volwassen basale celbiologie leidt remming van dubbele SMAD-pathways (TGF-β en BMP) tot upregulatie van NGFR+ iBC’s11,14. NGFR+ iBC’s worden geresuspendeerd als enkele cellen in druppels extracellulaire matrix en gekweekt in een basaal celmedium. Ze vernieuwen zichzelf om een iBC-populatie in stand te houden en epitheliale sferoïden te vormen; een deel differentieert echter ook in secretoire cellen in dit formaat (aangeduid als 3D-cultuur). In het volgende protocol beschrijven we de stappen om deze iBC’s in 3D-cultuur te behouden en uit te breiden, evenals de stappen die nodig zijn om een functionele 2D-mucociliaire ALI-cultuur te genereren.
De eerste stappen van dit differentiatieprotocol zijn eerder gepubliceerd en zullen hier niet worden besproken11,12. Dit manuscript zal zich richten op de uitbreiding en zuivering van iBC’s en hun daaropvolgende differentiatie in functionele secretoire en multiciliated cellen in ALI-cultuur.
HBECs zijn het gouden standaard celtype om ziekten van het luchtwegepitheel te bestuderen. Vanwege hun beperkingen (waaronder toegankelijkheid en moeilijkheid om genetisch te manipuleren), hebben we een protocol gegenereerd voor de afleiding van iBC’s en ALI-culturen. Deze cellen kunnen worden afgeleid van elke donor en behouden hun unieke genetische achtergrond, waardoor basisontwikkelingsstudies, ziektemodellering en nieuwe therapeutische ontwikkeling mogelijk zijn.
Hoewel elke afzonderlijke stap van het beschreven protocol noodzakelijk is, zijn er verschillende die extra vermelding verdienen. Ten eerste is het bij elke stap die dissociatie van sferoïden in afzonderlijke cellen vereist, van cruciaal belang om overmatig pipetteren te voorkomen; enzymatische spijsvertering (met dispase of trypsine) bevordert een betere celoverleving, terwijl overmatig pipetteren leidt tot aanzienlijke celdood. Ten tweede is bij het zuiveren van NGFR+ iBC’s het gebruik van de isotypecontrole cruciaal en raden we aan om te selecteren op de hoogst tot expressie brengende NGFR+ cellen met FACS (figuur 3). Deze aanpak resulteert in optimale ALI-culturen met de juiste mucociliaire differentiatie. Ten slotte is de bereiding en het zaaien van poreuze membranen, precies zoals gedocumenteerd in het protocol, van fundamenteel belang voor de overleving van de ALI-cultuur. Hoewel we meestal 30.000-60.000 cellen per insert zaaien, hebben we succes gehad met slechts 20.000 cellen. Hoewel succesvolle culturen kunnen worden gegenereerd met behulp van de menselijke embryonale stamcel-gekwalificeerde matrixcoating, hebben we meer recentelijk humane recombinant laminine-521 gebruikt met een aanzienlijk hogere duurzaamheid van de ALI-culturen.
Zeer zelden kunnen iPSC-differentiaties er niet in slagen om een adequaat percentage NGFR+ iBC’s te upreguleren. In dit geval kan seriële passaging van iBC’s (in 3D-cultuur) resulteren in een verhoogde NGFR-frequentie in de loop van de tijd. Beperkingen van dit protocol zijn onder meer de tijd, kosten en expertise die nodig is om deze cellen te genereren. Bovendien erkennen we dat veel onderzoekers geïnteresseerd zijn in de minder voorkomende celtypen van het luchtwegepitheel (bijv. Ionocyten, neuro-endocriene cellen). Hoewel we enkele van deze zeldzamere celtypen hebben gedetecteerd, zoals in primaire HBEC-culturen, zijn ze niet reproduceerbaar geïdentificeerd, waarschijnlijk als gevolg van onvolledige kennis over de ontwikkelingssignalen die nodig zijn om deze cellen te genereren.
Zoals het is geschreven, begint het bovenstaande protocol met het ontdooien van reeds gecryopreserveerde iBC’s. De details voorafgaand aan deze cryopreservatie zijn eerder beschreven en vallen buiten het bestek van dit manuscript11,12.
Onze luchtwegepitheel ALI-kweekmethode maakt het mogelijk om functionele luchtwegepitheelcellen van bijna elke donor te genereren. Dit verhoogt de toegankelijkheid van kostbare genetisch gecontroleerde luchtwegepitheelcellen die kunnen worden gebruikt voor ziektemodellering, medicijnscreening, toekomstige celgebaseerde therapieën en om het begrip van de ontwikkelingspatronen in het luchtwegepitheel te verbeteren.
The authors have nothing to disclose.
We bedanken de leden van de Hawkins, Kotton en Davis laboratoria voor hun nuttige input door de jaren heen met betrekking tot deze en andere projecten. We zijn ook dank verschuldigd aan Brian Tilton (BU Cell Sorting Director) voor zijn toewijding en technische expertise, en we zijn Greg Miller en Marianne James van het Boston University Center for Regenerative Medicine (CReM) dankbaar voor hun ondersteuning en technische expertise in onderhoud en karakterisering van patiëntspecifieke iPSC’s, ondersteund door NIH-subsidies NO1 75N92020C00005 en U01TR001810. Dit werk werd ondersteund door NIH-subsidies U01HL148692, U01HL134745, U01HL134766 en R01HL095993 aan D.N.K, R01HL139876 aan B.R.D, R01 HL139799 aan F.H., en Cystic Fibrosis Foundation (CFF) subsidies CFF 00987G220 en CFF WANG20GO aan D.N.K, CFF DAVIS15XX1, DAVIS17XX0, DAVIS19XX0 aan B.R.D, CFF SUZUKI19XX0 aan S.S, CFF BERICA2010 aan A.B., en CFF HAWKIN20XX2 naar F.H.
12-well tissue culture treated plate | Corning | 3515 | flat bottom |
3-D growth factor reduced Matrigel | Corning | 356230 | |
A83-01 | ThermoFisher Scientific | 293910 | |
Cell culture inserts (Transwell) | Corning | 3470 | 6.5mm diameter; 0.4μm pore size |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma | D8418 | |
Dispase II, Powder | ThermoFisher Scientific | 17105-041 | |
DMH1 | ThermoFisher Scientific | 412610 | |
Dulbecco's Modified Eagle Medium/Nutrient Mixture (DMEM):F-12 | ThermoFisher Scientific | 11330-032 | |
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline (PBS) (1X) | Gibco | 14190-144 | |
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution (EDTA) | Sigma | E7889 | |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Fisher | SH3007003E | |
Hanks' Balanced Salt Solution (HBSS) | ThermoFisher Scientific | 14175-079 | |
HEPES | Sigma | H3375 | |
hESC-qualified Matrigel | Corning | 354277 | |
Mouse IgG1kappa isotype control, APC-conjugated | Biolegend | 400122 | |
Mouse monoclonal anti-human CD271/NGFR, APC-conjugated | Biolegend | 345108 | |
PneumaCult-ALI Medium (ALI Differentiation Medium) | StemCell Technologies | 05001 | |
PneumaCult-Ex Plus Medium (Basal Cell Base Medium) | StemCell Technologies | 05040 | |
Primocin | InvivoGen | ant-pm-2 | |
rhLaminin-521 | ThermoFisher Scientific | A29248 | Final Concentration: 10ug/mL |
Trypsin-EDTA Solution, 0.05% | Invitrogen | T3924 | |
Y-27632 | Tocris | 1254 |