Чтобы избежать ограничений, связанных с ферментативным или механическим пассажем эмбриональных стволовых клеток человека (чЭСК) и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека (ИПСК), культивируемых на фидерных клетках, мы разработали быстрый, эффективный, экономичный и высокопродуктивный метод сбора колоний чЭСК или ИПСК, поддерживаемых на слое фидерных клеток фибробластов крайней плоти человека, с использованием ЭДТА-опосредованной спайки.
Плюрипотентные стволовые клетки человека (эмбриональные стволовые клетки человека, чЭСК и индуцированные плюрипотентные стволовые клетки человека, ИПСК) первоначально культивировались на различных типах фидерных клеток для поддержания в недифференцированном состоянии при длительном культивировании. Этот подход был в значительной степени вытеснен протоколами культивирования без фидеров, но они включают в себя более дорогостоящие реагенты и могут способствовать переходу в праймированное состояние, которое ограничивает способность клеток к дифференцировке. Как в фидерных, так и в безпитательных условиях сбор геполий hESC или hiPSC для пассажа является необходимой процедурой для выращивания культур.
Чтобы обеспечить простую и высокопроизводительную процедуру пропускания чЭСК/ИПСК, культивируемых на фидерных клетках, мы разработали метод сбора с использованием распайки, вызванной этилендиаминтетрауксусной кислотой (ЭДТА) на основе хелатора кальция. Мы оценили выход и качество полученных пассированных клеток, сравнив этот подход с оригинальным подходом механического забора, при котором колонии выделяют скальпелем под микроскопом (механический забор был выбран в качестве компаратора, чтобы избежать изменчивости реагентов, связанной с ферментативным забором).
В одной серии экспериментов две различные линии чЭСК поддерживались на слое фидерных клеток фибробластов крайней плоти человека. Каждая линия была подвергнута многократным пассажам с использованием ЭДТА или механического сбора и оценена по размеру и морфологии колонии, плотности клеток, экспрессии маркеров стволовости, дифференцировке к трем зародышевым слоям в эмбриоидных телах и геномным аберрациям. В другой серии экспериментов мы использовали сбор на основе ЭДТА на двух разных линиях ИПСК и получили аналогичные результаты. Индуцированная ЭДТА расклеивающаяся адгезия экономила время и давала более высокий выход колоний более благоприятного размера и более однородной морфологии по сравнению с механическим сбором. Он также был быстрее, чем ферментативный сбор, и не был подвержен изменчивости ферментных партий. Метод адгезии, индуцированной ЭДТА, также облегчает перенос линий hESC/hiPSC из культуры на основе фидерных клеток в условия без фидера, если это необходимо, для последующего использования и анализа.
Надлежащее поддержание чЭСК и ИПСК in vitro является базовой и удобной методологией для нескольких направлений исследований в области клеточной биологии человека и биологии развития. Из-за присущей чЭСК и ИПСК способности к дифференцировке, поддержание недифференцированного состояния in vitro требует особой осторожности и внимания. Таким образом, разработка экономически эффективных протоколов для поддержания и передачи чЭСК и ИПСК с минимально возможной методологической вариативностью имеет большую общую полезность.
Первоначально чЭСК и ИПСК культивировали на различных типах фидерных клеток для содействия длительному культивированию и поддержанию недифференцированного состояния 1,2,3. В последнее время культивирование в условиях отсутствия кормушки стало нормой, так как оно вообще позволяет избежать работы с питательными клетками4. Тем не менее, некоторые лаборатории и основные учреждения до сих пор культивируют чЭСК или ИПСК на фидерных клетках. Безпитательная культура является более дорогой, поскольку требует использования питательных сред специального состава и некоторой формы покрытия поверхности культуры для обеспечения адгезии колонии (основные компоненты внеклеточного матрикса [ВКМ] или коммерческое соединение ВКМ, или использование коммерчески доступных пластин с покрытием). Эти расходы нетривиальны и представляют собой потенциальное финансовое препятствие для некоторых лабораторий, заинтересованных в проведении исследований и разработок на основе чЭСК или ИПСК. Более того, культивирование в условиях без питания имеет тенденцию приводить чЭСК и ИПСК в менее наивное состояние, чем то, которое поддерживается в фидерных клетках5, и это может поставить под угрозу последующую дифференцировку и привести к генетическимвариациям6.
Исторически сложилось так, что передача чЭСК и ИПСК, культивируемых на фидерных клетках, включала механический сбор – использование скальпеля для вырезания колоний под микроскопом7 – но позже это было в значительной степени вытеснено ферментативным расщеплением с мягким соскабливанием или без него для выделения колоний или диссоциированных клеток. Механический сбор урожая утомителен и требует точной микрохирургии. Ферментативный сбор может варьироваться по эффективности из-за различий ферментов от партии к партии и, как правило, способствует полной диссоциации, что способствует гибели клеток, если не противодействовать ингибиторам РОК 8,9, и увеличивает частоту аномальных кариотипов9.
Чтобы воспользоваться преимуществами более низких затрат и большего потенциала дифференцировки культивирования чЭСК и ИПСК на фидерных клетках, избегая при этом недостатков механического и ферментативного сбора, мы разработали быстрый, эффективный, экономичный и высокопродуктивный метод сбора колоний чЭСК и ИПСК на фидерном слое фибробластов крайней плоти человека с использованием ЭДТА-опосредованной спайки. Мы сравнили урожайность, изменчивость и качество стволовых клеток с теми, которые получены при механическом сборе (мы не сравнивали с ферментативным сбраживанием из-за дополнительной изменчивости, которую влечет за собой этот подход). Мы отмечаем, что ЭДТА-опосредованная распайка также хорошо работает для переноса колоний из питательных культур в безпитательные условия, если это необходимо для последующего использования и анализа. Этот метод обеспечивает переход с последовательным методом пассажа, поскольку индуцированная ЭДТА рассеивание является популярным подходом, используемым для культур без корма.
Мы описали быстрый и экономичный метод сбора чЭСК и ИПСК, культивируемых на фидерных клетках, с использованием ЭДТА-опосредованной распайки, и сравнили его в первую очередь с традиционным методом механического сбора с использованием скальпеля. Мы также сравнили сбор на основе ЭДТА с ферментативным сбором в отношении скорости метода, но не аспектов результирующего качества колоний. Причина этого заключается в том, что ферментативный сбор по своей природе более вариабельен и связан с более высокой распространенностью геномных аберраций5, что может скрыть различия между методами.
Мы демонстрируем, что сбор на основе ЭДТА является более быстрым и эффективным, чем любой из других методов, и создает более мелкие и морфологически более однородные колонии, чем механический сбор. Эта последняя особенность полезна с точки зрения выживания клеток, поскольку более крупные скопления, полученные с помощью механического сбора, склонны к центральному некрозу, в то время как ферментативное расщепление имеет тенденцию генерировать изолированные чЭСК и ИПСК, которые более склонны к апоптозу и требуют дополнительного лечения, например, ингибиторами ROCK, для выживания. Сбор урожая на основе ЭДТА может быть использован не менее чем для 20 проходов. Методы сбора на основе ЭДТА и механического сбора сопоставимы, когда речь идет о плотности клеток колонии, экспрессии мРНК и белков генов стволовости, дифференцировке трех зародышевых слоев в эмбриоидных телах и геномных аномалиях. Если целью является эффективность, более высокая урожайность, меньшая изменчивость и более щадящее обращение с чЭСК и ИПСК, предпочтительнее сбор урожая на основе ЭДТА.
Мы также отмечаем, что сбор ЭСК и ИПСК на основе ЭДТА, культивируемых на фидерных клетках, является недорогим способом поддержания более наивного состояния и обеспечивает плавный переход от культуры на основе фидера к культуре без фидера там, где это желательно.
Критические шаги в рамках протокола
Наиболее важными этапами ЭДТА-опосредованной распайки являются раздел протокола 3 (инкубация в растворе ЭДТА) и раздел 4 (растирание). Если воздействие раствора ЭДТА длится дольше 1 мин, возрастает риск полной диссоциации на единичные клетки. Это также может произойти, если растирание слишком затяжное или слишком резкое. На последнее влияет размер наконечника пипетки. Идеальным вариантом является использование пипеток для клеточных культур объемом 1 мл, как описано здесь. Использование другого типа пипетки с меньшим диаметром наконечника рискованно.
Устранение неполадок
Если питающие клетки продолжают размножаться, митотическая остановка не была эффективной, и необходимо взять новую партию и начать процедуру заново. Если колонии не отделяются от слоя питательных клеток, необходимо убедиться, что в ЭДТА нет Ca2+ и что культуральная чашка, содержащая колонии, хорошо промыта PBS, чтобы удалить оставшуюся клеточную культуральную среду перед добавлением ЭДТА. Из-за чрезмерного растирания может возникнуть слишком сильная диссоциация, которая приводит к образованию изолированных клеток или слишком маленьких скоплений клеток, что ставит под угрозу образование новых колоний. Степень трения должна быть определена эмпирически в пробных запусках протокола, чтобы подтвердить, что результирующие клеточные скопления имеют диаметр ~60 мкм. Если питательный слой самопроизвольно отделяется от чашки для культивирования, особенно до того, как чЭСК/ИПСК будут готовы к сбору, это может быть связано с тем, что питательные клетки не использовались в течение ~7 дней после приготовления. Поэтому следует тщательно следить за временными рамками использования фидерных ячеек. Если питательный слой диссоциирует во время воздействия ЭДТА (чего мы никогда не наблюдали с используемыми здесь фидерными клетками), необходимо изменить либо тип фидерной клетки, либо метод ее культивирования.
Ограничения методики
Основным ограничением методики является то, что она требует визуального осмотра процесса рассеивания для достижения успешного результата. Это означает, что пользователи должны научиться определять, когда колонии высвобождаются из слоя питательных клеток, а слой питательных клеток ослабевает от субстрата. Однако это не сложно, и, по нашему опыту, новые пользователи методики могут освоить ее в течение пары проб.
Существует также неотъемлемая вероятность того, что собранные чЭСК или ИПСК могут быть загрязнены несколькими фидерными клетками. Если намерение состоит в том, чтобы перейти в условия, не связанные с подачей, или изолировать чЭСК или ИПСК для анализов, такое загрязнение может поставить под угрозу чистоту. Отметим, что с используемыми здесь фидерными клетками (фибробластами крайней плоти человека) крайне сложно диссоциировать слой фидерных клеток, даже при ферментативном расщеплении (не показано). Поскольку недиссоциированный слой фидерных клеток удаляется in toto, загрязнение собранных чЭСК или ИПСК, вероятно, будет незначительным. Кроме того, поскольку питающие клетки митотически остановлены, любое загрязнение в конечном итоге уменьшается до нуля при дальнейшем прохождении чЭСК или ИПСК.
Значимость по отношению к существующим методам
В настоящее время нормой культивирования чЭСК и ИПСК является проведение культивирования в условиях без фидера, для чего широко распространено использование ЭДТА для пассажа. Культивирование без фидеров зависит от использования специально разработанных сред и культуральных субстратов, которые обеспечивают прилегание. Эти реагенты влекут за собой дополнительные расходы, которые могут превышать бюджеты некоторых лабораторий. Кроме того, культивирование в условиях без фидера ассоциировалось с нарушенным дифференцирующим потенциалом из-за отсутствия специфических факторов в свободных питательных питательных средах и, как следствие, перехода от наивного состояния к праймированному. Рост на митотически остановленных фидерных клетках позволяет избежать этого перехода и может снизить общие затраты до управляемого уровня, тем самым способствуя более широкому использованию плюрипотентных стволовых клеток в лабораторных исследованиях.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим Ларса Моэна за помощь в проведении предварительных экспериментов и Норвежский центр по изучению плюрипотентных стволовых клеток человека при Норвежском центре исследований стволовых клеток при Университетской больнице Осло за использование оборудования. Линия H9 hESC была получена от WiCell, а линия HS429 hESC была получена от Outi Hovatta из Каролинского института. Оба использовались в соответствии с Соглашениями о передаче материалов. Линии hiPSC NCS001 и NCS002 были сгенерированы Норвежским центром плюрипотентных стволовых клеток человека. Это перепрограммирование и вся работа, о которой здесь сообщается, были выполнены с одобрения Регионального комитета по этике Юго-Восточной Норвегии (утверждение REK 2017/110).
0.5 M EDTA pH 8.0 | Invitrogen | 15575020 | |
15 mL centrifuge tubes | Sarstedt | 62.554.502 | |
2-mercaptoethanol | Gibco | 31350-010 | |
50 mL centrifuge tubes | Sarstedt | 62.547.254 | |
Basic fibroblast growth factor (bFGF) | PeproTech | AF-100-18B-250UG | |
Brand Bürker Chamber | Fisher Scientific | 10628431 | |
Disposable scalpels no.15 | Susann-Morton | 505 | |
DPBS (1x) without Ca/Mg | Gibco | 14190-094 | |
Easy Grip tissue culture dish, 35 x 10 mm | Falcon | 353001 | |
Eppendorf pipette 1 mL | Eppendorf | ||
Eppendorf pipette 200 μL | Eppendorf | ||
FBS (Fetal Bovine Serum) | Gibco | 10270-106 | |
Filter tip 1,000 μL | Sarstedt | 70.1186.210 | |
Filter tip 200 μL | Sarstedt | 70.760.211 | |
Gamma Cell 3000 ELAN irradiation machine (alternatively, use Mitomycin C to arrest proliferation) | Best Theratronics | BT/MTS 8007 GC3000E | |
Glutamax 100x | Gibco | 35050-038 | |
Growth Factor Reduced Matrixgel | Corning | 734-0269 | |
H9 hESC line | WiCell | WAe009-A | |
hPSC Genetic Analysis Kit | Stem Cell Technologies | #07550 | |
HS429 hESC line | ECACC | KIe024-A | |
Human Foreskin Fibroblasts -CRL2429 line | ATTC | CRL2429 | |
IMDM (1x) | Gibco | 21980-032 | |
iPSC lines | Norwegian Core Facility for Human Pluripotent Stem Cells | NCS001 & NCS002 | |
Knockout DMEM | Gibco | 10829-018 | |
Laser Scanning Confocal Microscope or equivalent (we use the LSM 700 from Zeiss) | Zeiss | ||
Microscope | CETI | ||
Mitomycin C | Sigma Aldrich | M4287 | |
Non-essential amino acids (NEAA) | Gibco | 11140.035 | |
Pipettes, plastic 10 mL | Sarstedt | 86.1254.001 | |
Pipettes, plastic, 5 mL | Sarstedt | 86.1253.001 | |
Serum Replacement (SR) | Gibco | 10828-028 | |
Sterile filters 0.22 um | Sarstedt | 83.1826.102 | |
T-75 culture flask | ThermoScientific | 156499 | |
Trypan Blue Stain (0.4 %) | Gibco | 15250-061 | |
Trypsin-EDTA, 500 mL | Gibco | 25300062 |