Om de beperkingen te vermijden die gepaard gaan met het enzymatisch of mechanisch passeren van menselijke embryonale stamcellen (hESC’s) en door mensen geïnduceerde pluripotente stamcellen (hiPSC’s) gekweekt op feedercellen, hebben we een snelle, effectieve, kostenefficiënte methode met een hoge opbrengst ontwikkeld voor het oogsten van hESC- of hiPSC-kolonies die worden onderhouden op een voedingscellaag van menselijke voorhuidfibroblasten met behulp van EDTA-gemedieerde kkleefkracht.
Menselijke pluripotente stamcellen (menselijke embryonale stamcellen, hESC’s en door mensen geïnduceerde pluripotente stamcellen, hiPSC’s) werden oorspronkelijk gekweekt op verschillende soorten voedingscellen voor onderhoud in een ongedifferentieerde toestand in langdurige kweek. Deze aanpak is voor een groot deel verdrongen door feedervrije kweekprotocollen, maar deze omvatten duurdere reagentia en kunnen een overgang naar een geprimeerde toestand bevorderen, wat de differentiatiecapaciteit van de cellen beperkt. Zowel in voeder- als in voedervrije omstandigheden is het oogsten van hESC- of hiPSC-kolonies voor passage een noodzakelijke procedure voor het uitbreiden van de culturen.
Om een eenvoudige procedure met een hoog rendement te bieden voor het passeren van hESC’s/hiPSC’s die op voedingscellen worden gekweekt, hebben we een oogstmethode ontwikkeld met behulp van onthechting die wordt opgewekt door het calciumchelatorethyleendiaminetetra-azijnzuur (EDTA). We hebben de opbrengst en kwaliteit van de resulterende gepassagede cellen beoordeeld door deze benadering te vergelijken met de oorspronkelijke mechanische oogstbenadering, waarbij kolonies worden geïsoleerd met een scalpel onder een microscoop (mechanisch oogsten werd gekozen als vergelijkingsmiddel om de variabiliteit van reagens geassocieerd met enzymatisch oogsten te vermijden).
In één reeks experimenten werden twee verschillende hESC-lijnen gehandhaafd op een voedingscellaag van menselijke voorhuidfibroblasten. Elke lijn werd onderworpen aan meerdere passages met behulp van EDTA-gebaseerde of mechanische oogst en beoordeeld op koloniegrootte en morfologie, celdichtheid, expressie van stammarkers, differentiatie naar de drie kiemlagen in embryoïde lichamen en genomische afwijkingen. In een andere reeks experimenten gebruikten we EDTA-gebaseerde oogst op twee verschillende hiPSC-lijnen en verkregen we vergelijkbare resultaten. EDTA-geïnduceerde onthechting bespaarde tijd en gaf een hogere opbrengst van kolonies met een gunstigere grootte en een meer uniforme morfologie in vergelijking met mechanisch oogsten. Het was ook sneller dan enzymatisch oogsten en niet vatbaar voor variabiliteit van enzymbatches. De EDTA-geïnduceerde onthechtingsmethode vergemakkelijkt ook de overdracht van hESC/hiPSC-lijnen van op feedercellen gebaseerde cultuur naar feedervrije omstandigheden, indien gewenst voor stroomafwaarts gebruik en analyse.
Het juiste onderhoud van hESC’s en hiPSC’s in vitro is een fundamentele en handige methodologie voor verschillende onderzoeksrichtingen in de menselijke cel- en ontwikkelingsbiologie. Vanwege de inherente drang van hESC’s en hiPSC’s om te differentiëren, vereist het handhaven van de ongedifferentieerde toestand in vitro bijzondere zorg en aandacht. Het ontwikkelen van kostenefficiënte protocollen voor het onderhoud en de doorgifte van hESC’s en hiPSC’s met zo min mogelijk methodologische variabiliteit is dus van groot algemeen nut.
Oorspronkelijk werden hESC’s en hiPSC’s gekweekt op verschillende soorten voedingscellen om te helpen bij de kweek op lange termijn en het behoud van de ongedifferentieerde toestand 1,2,3. Meer recentelijk is kweek onder feedervrije omstandigheden de norm geworden, omdat het omgaan met feedercellen helemaal wordt vermeden4. Sommige laboratoria en kernfaciliteiten kweken echter nog steeds hESC’s of hiPSC’s op feedercellen. Feedervrije kweek is duurder omdat het gebruik van kweekmedia met speciale samenstellingen en een of andere vorm van coating van het kweekoppervlak vereist om de hechting van de kolonie te garanderen (belangrijke extracellulaire matrix [ECM]-componenten of een commerciële ECM-verbinding, of het gebruik van in de handel verkrijgbare gecoate platen). De kosten zijn niet triviaal en vormen een potentiële financiële belemmering voor sommige laboratoria die geïnteresseerd zijn in het nastreven van hESC- of hiPSC-gebaseerd onderzoek en ontwikkeling. Bovendien heeft kweek onder voedervrije omstandigheden de neiging om de hESC’s en hiPSC’s in een minder naïeve toestand te brengen dan op voedercellenwordt gehandhaafd 5, en dit kan de latere differentiatie in gevaar brengen en leiden tot genetische variaties6.
Historisch gezien ging het passeren van hESC’s en hiPSC’s die op voedercellen werden gekweekt gepaard met mechanische oogst – met behulp van een scalpel om kolonies onder een microscoop te snijden7 – maar dit werd later grotendeels verdrongen door enzymatische vertering met of zonder zacht schrapen om kolonies of gedissocieerde cellen te isoleren. Mechanisch oogsten is vervelend en vereist precisiemicrochirurgie. Enzymatisch oogsten kan variëren in efficiëntie als gevolg van enzymverschillen van batch tot batch en neigt naar volledige dissociatie, wat celdood bevordert, tenzij het wordt tegengegaan door ROCK-remmers 8,9 en de incidentie van abnormale karyotypen verhoogt9.
Om te profiteren van de lagere kosten en het grotere differentiatiepotentieel van het kweken van hESC’s en hiPSC’s op voedingscellen en tegelijkertijd de nadelen van mechanisch en enzymatisch oogsten te vermijden, hebben we een snelle, effectieve, kostenefficiënte methode met een hoge opbrengst ontwikkeld voor het oogsten van hESC- en hiPSC-kolonies die worden onderhouden op een voedingslaag van menselijke voorhuidfibroblasten met behulp van EDTA-gemedieerde kleven. We hebben de opbrengst, variabiliteit en stamcelkwaliteit vergeleken met die verkregen met mechanisch oogsten (we hebben niet vergeleken met enzymatische vertering vanwege de extra variabiliteit die deze aanpak met zich meebrengt). We merken op dat EDTA-gemedieerde onthechting ook goed werkt voor het overbrengen van kolonies van op feeder gebaseerde cultuur naar feedervrije omstandigheden, indien gewenst voor stroomafwaarts gebruik en analyses. Deze methode biedt een overgang met een consistente passaging-methode, aangezien EDTA-geïnduceerde dis-adhesie een populaire benadering is die wordt gebruikt voor feedervrije culturen.
We hebben een snelle en kostenefficiënte methode beschreven voor het oogsten van hESC’s en hiPSC’s gekweekt op feedercellen met behulp van EDTA-gemedieerde kkleefkracht en vergeleken dit voornamelijk met de conventionele methode van mechanisch oogsten met behulp van een scalpel. We vergeleken ook EDTA-gebaseerde oogst met enzymatisch oogsten met betrekking tot de snelheid van de methode, maar niet met betrekking tot aspecten van de resulterende koloniekwaliteit. De reden hiervoor is dat enzymatische oogst inherent variabeler is en in verband is gebracht met een hogere prevalentie van genomische aberraties5, wat de verschillen tussen de methoden zou kunnen verdoezelen.
We tonen aan dat oogsten op basis van EDTA sneller en efficiënter is dan elk van de andere methoden en kleinere en morfologisch homogenere kolonies genereert dan mechanisch oogsten. Dit laatste kenmerk is gunstig voor de overleving van cellen, aangezien de grotere klonten die worden verkregen met mechanisch oogsten vatbaar zijn voor centrale necrose, terwijl enzymatische vertering de neiging heeft om geïsoleerde hESC’s en hiPSC’s te genereren, die vatbaarder zijn voor apoptose en extra behandeling vereisen, bijvoorbeeld met ROCK-remmers, om te overleven. Oogsten op basis van EDTA kan worden gebruikt voor ten minste 20 passages. De op EDTA gebaseerde en mechanische oogstmethoden zijn vergelijkbaar als het gaat om kolonieceldichtheid, mRNA- en eiwitexpressie van stamgenen, differentiatie van de drie kiemlagen in embryoïde lichamen en genomische afwijkingen. Als het doel efficiëntie, hogere opbrengst, minder variabiliteit en een zachtere behandeling van de hESC’s en hiPSC’s is, verdient oogsten op basis van EDTA de voorkeur.
We merken ook op dat het oogsten op basis van EDTA van hESC’s en hiPSC’s die op feedercellen zijn gekweekt, een goedkope manier is om een meer naïeve toestand te behouden en zorgt voor een soepele overgang van feeder-gebaseerde naar feeder-vrije cultuur waar dit wenselijk is.
Kritische stappen binnen het protocol
De meest kritieke stappen van EDTA-gemedieerde dis-adhesie zijn protocolsectie 3 (incubatie in de EDTA-oplossing) en sectie 4 (trituratie). Als de blootstelling aan de EDTA-oplossing langer dan 1 minuut duurt, neemt het risico op volledige dissociatie van afzonderlijke cellen toe. Dit kan ook gebeuren als de trituratie te lang of te hard is. Dit laatste wordt beïnvloed door de grootte van de pipetpunt. Het gebruik van celkweekpipetten van 1 ml zoals hier beschreven is ideaal. Het gebruik van een ander type pipet met een kleinere tipdiameter is riskant.
Probleemoplossing
Als de voedingscellen zich blijven vermenigvuldigen, is mitotische arrestatie niet effectief geweest en moet een nieuwe batch worden genomen en moet de procedure opnieuw worden gestart. Als de kolonies niet loskomen van de voedingscellaag, moet men ervoor zorgen dat er geen Ca2+ in de EDTA zit en dat het kweekschaaltje met de kolonies goed wordt gespoeld met PBS om eventueel achtergebleven celkweekmedium te verwijderen voordat de EDTA wordt toegevoegd. Te veel dissociatie, die geïsoleerde cellen of te kleine celklonten genereert, kan ontstaan als gevolg van overmatige trituratie en brengt de vestiging van nieuwe kolonies in gevaar. De mate van trituratie moet empirisch worden bepaald in proefruns van het protocol om te bevestigen dat de resulterende celklonten een diameter van ~60 μm hebben. Als de feederlaag spontaan loskomt van de kweekschaal, vooral voordat de hESC’s/hiPSC’s klaar zijn om te oogsten, kan het zijn dat de feedercellen niet binnen ~7 dagen na bereiding zijn gebruikt. Daarom moet het tijdsbestek van gebruik van de feedercellen zorgvuldig worden gecontroleerd. Als de voedingslaag dissocieert tijdens blootstelling aan EDTA (iets wat we nog nooit hebben waargenomen met de voedercellen die hier worden gebruikt), moet het type voedercel of hun kweekmethode worden gewijzigd.
Beperkingen van de techniek
De belangrijkste beperking van de techniek is dat het visuele inspectie van het khechtingsproces vereist om een succesvol resultaat te bereiken. Dit betekent dat gebruikers moeten leren hoe ze kunnen identificeren wanneer de kolonies loskomen van de feedercellaag en de feedercellaag loskomt van het substraat. Dit is echter niet moeilijk, en onze ervaring is dat nieuwe gebruikers van de techniek deze binnen een paar proeven onder de knie kunnen krijgen.
Er is ook een inherente mogelijkheid dat de geoogste hESC’s of hiPSC’s besmet zijn door enkele voedercellen. Als het de bedoeling is om over te gaan naar niet-feederomstandigheden of om de hESC’s of hiPSC’s te isoleren voor tests, zou een dergelijke verontreiniging de zuiverheid in gevaar brengen. We merken op dat het met de hier gebruikte voedingscellen (menselijke voorhuidfibroblasten) uiterst moeilijk is om de voedingscellaag te dissociëren, zelfs met enzymatische vertering (niet afgebeeld). Aangezien de niet-gedissocieerde voedingscellaag in zijn geheel wordt verwijderd, is de besmetting van de geoogste hESC’s of hiPSC’s waarschijnlijk verwaarloosbaar. Omdat de voedingscellen bovendien mitotisch worden gestopt, zou elke besmetting uiteindelijk tot nul afnemen bij verdere passaging van de hESC’s of hiPSC’s.
Betekenis ten opzichte van bestaande methoden
De huidige norm voor het kweken van hESC’s en hiPSC’s is om dit te doen onder voedervrije omstandigheden, waarvoor het gebruik van EDTA voor passaging wijdverbreid is. Feedervrije kweek is afhankelijk van het gebruik van speciaal samengestelde media en kweeksubstraten die hechting garanderen. Deze reagentia brengen extra kosten met zich mee die sommige laboratoriumbudgetten kunnen overschrijden. Bovendien is kweek onder voedervrije omstandigheden in verband gebracht met een verstoord differentiatiepotentieel als gevolg van het ontbreken van specifieke factoren in de voedervrije kweekmedia en een daaruit voortvloeiende overgang van de naïeve toestand naar de geprimeerde toestand. Groei op mitotisch gestopte voedingscellen vermijdt deze overgang en kan de totale kosten terugbrengen tot een beheersbaar niveau, waardoor het bredere gebruik van pluripotente stamcellen in laboratoriumonderzoek wordt vergemakkelijkt.
The authors have nothing to disclose.
We danken Lars Moen voor zijn hulp bij voorbereidende experimenten en de Noorse kernfaciliteit voor menselijke pluripotente stamcellen van het Noorse Centrum voor Stamcelonderzoek, het Universitair Ziekenhuis van Oslo, voor het gebruik van de faciliteiten. De H9 hESC-lijn werd verkregen van WiCell en de HS429 hESC-lijn werd verkregen van Outi Hovatta van het Karolinska Instituut. Beide werden gebruikt in overeenstemming met Material Transfer Agreements. De hiPSC-lijnen NCS001 en NCS002 zijn gegenereerd door de Norwegian Core Facility for Human Pluripotent Stem Cells. Die herprogrammering en al het werk dat hier wordt gerapporteerd, werden uitgevoerd met de goedkeuring van de regionale ethische commissie van Zuidoost-Noorwegen (goedkeuring REK 2017/110).
0.5 M EDTA pH 8.0 | Invitrogen | 15575020 | |
15 mL centrifuge tubes | Sarstedt | 62.554.502 | |
2-mercaptoethanol | Gibco | 31350-010 | |
50 mL centrifuge tubes | Sarstedt | 62.547.254 | |
Basic fibroblast growth factor (bFGF) | PeproTech | AF-100-18B-250UG | |
Brand Bürker Chamber | Fisher Scientific | 10628431 | |
Disposable scalpels no.15 | Susann-Morton | 505 | |
DPBS (1x) without Ca/Mg | Gibco | 14190-094 | |
Easy Grip tissue culture dish, 35 x 10 mm | Falcon | 353001 | |
Eppendorf pipette 1 mL | Eppendorf | ||
Eppendorf pipette 200 μL | Eppendorf | ||
FBS (Fetal Bovine Serum) | Gibco | 10270-106 | |
Filter tip 1,000 μL | Sarstedt | 70.1186.210 | |
Filter tip 200 μL | Sarstedt | 70.760.211 | |
Gamma Cell 3000 ELAN irradiation machine (alternatively, use Mitomycin C to arrest proliferation) | Best Theratronics | BT/MTS 8007 GC3000E | |
Glutamax 100x | Gibco | 35050-038 | |
Growth Factor Reduced Matrixgel | Corning | 734-0269 | |
H9 hESC line | WiCell | WAe009-A | |
hPSC Genetic Analysis Kit | Stem Cell Technologies | #07550 | |
HS429 hESC line | ECACC | KIe024-A | |
Human Foreskin Fibroblasts -CRL2429 line | ATTC | CRL2429 | |
IMDM (1x) | Gibco | 21980-032 | |
iPSC lines | Norwegian Core Facility for Human Pluripotent Stem Cells | NCS001 & NCS002 | |
Knockout DMEM | Gibco | 10829-018 | |
Laser Scanning Confocal Microscope or equivalent (we use the LSM 700 from Zeiss) | Zeiss | ||
Microscope | CETI | ||
Mitomycin C | Sigma Aldrich | M4287 | |
Non-essential amino acids (NEAA) | Gibco | 11140.035 | |
Pipettes, plastic 10 mL | Sarstedt | 86.1254.001 | |
Pipettes, plastic, 5 mL | Sarstedt | 86.1253.001 | |
Serum Replacement (SR) | Gibco | 10828-028 | |
Sterile filters 0.22 um | Sarstedt | 83.1826.102 | |
T-75 culture flask | ThermoScientific | 156499 | |
Trypan Blue Stain (0.4 %) | Gibco | 15250-061 | |
Trypsin-EDTA, 500 mL | Gibco | 25300062 |