Dit protocol beschrijft de studie van neutrofiel-biofilm interacties. Staphylococcus aureus biofilms worden in vitro vastgesteld en geïncubeerd met perifere bloed-afgeleide menselijke neutrofielen. De oxidatieve burst-respons van neutrofielen wordt gekwantificeerd en de neutrofiellokalisatie in de biofilm wordt bepaald door microscopie.
Neutrofielen zijn de eerste verdedigingslinie die door het immuunsysteem wordt ingezet tijdens microbiële infectie. In vivo worden neutrofielen gerekruteerd naar de plaats van infectie waar ze processen zoals fagocytose, productie van reactieve zuurstof- en stikstofsoorten (RESPECTIEVELIJK ROS, RNS), NETosis (neutrofiele extracellulaire val) en degranulatie gebruiken om microben te doden en de infectie op te lossen. Interacties tussen neutrofielen en planktonische microben zijn uitgebreid bestudeerd. Er zijn de laatste jaren opkomende interesses in het bestuderen van infecties veroorzaakt door biofilms. Biofilms vertonen eigenschappen, waaronder tolerantie voor het doden door neutrofielen, verschillend van hun planktonische tegenhangers. Met de succesvolle opstelling van zowel in vitro als in vivo biofilmmodellen kunnen interacties tussen deze microbiële gemeenschappen met verschillende immuuncellen nu worden onderzocht. Hier worden technieken die een combinatie van traditionele biofilmmodellen en gevestigde neutrofiele activiteitstests gebruiken, specifiek afgestemd op het bestuderen van neutrofiele en biofilminteracties. Wide-field fluorescentiemicroscopie wordt gebruikt om de lokalisatie van neutrofielen in biofilms te controleren. Deze biofilms worden gekweekt in statische omstandigheden, gevolgd door de toevoeging van neutrofielen afkomstig van menselijk perifeer bloed. De monsters worden gekleurd met de juiste kleurstoffen voordat ze onder de microscoop worden gevisualiseerd. Bovendien wordt de productie van ROS, een van de vele neutrofiele reacties tegen pathogenen, gekwantificeerd in de aanwezigheid van een biofilm. De toevoeging van immuuncellen aan dit gevestigde systeem zal het begrip van gastheer-pathogeeninteracties vergroten en tegelijkertijd het gebruik van gestandaardiseerde en geoptimaliseerde omstandigheden garanderen om deze processen nauwkeurig te meten.
Een biofilm is een gemeenschap van oppervlakte-geassocieerde microben of niet-gehechte aggregaten omhuld in een extracellulaire polymere stof (EPS)1,2. Deze gemeenschappen beschermen de ingekapselde micro-organismen tegen omgevingsstressoren, waaronder tolerantie voor antimicrobiële stoffen en het immuunsysteem3. Verschillende pathogene microbiële soorten vormen biofilms die in verband zijn gebracht met chronische infecties4. De ontwikkeling van biofilms is een ingewikkeld proces waarbij hechting aan oppervlakken, EPS-productie, celproliferatie, biofilmstructurering en celloslating5. Zodra cellen zich verspreiden om een biofilm te vormen, blijven ze mentonisch of transloceren ze naar een nieuw substraat en starten ze opnieuw de ontwikkeling van de biofilm6.
Staphylococcus aureus, een opportunistische ziekteverwekker, volgt een algemeen schema van biofilmontwikkeling, inclusief aanhechting, proliferatie, rijping en verspreiding7. Het hechtingsproces in S. aureus-biofilms wordt bepaald door hydrofobe interacties, teichoëzuren en microbiële oppervlaktecomponenten die kleefmatrixmoleculen (MSCRAMMs) herkennen 8,9. Naarmate de proliferatie van S. aureus begint, wordt EPS, dat voornamelijk bestaat uit polysacchariden, eiwitten, extracellulair DNA en teichoëzuren, geproduceerd5. Naarmate EPS-componenten worden geproduceerd, worden ook verschillende exo-enzymen en kleine moleculen geproduceerd, die bijdragen aan de biofilm 3-dimensionale structuur en helpen bij het losmaken5. S. aureus maakt gebruik van deze sterk gecoördineerde levensstijl om verschillende chronische infecties vast te stellen, waaronder infecties als gevolg van de inwoning van medische hulpmiddelen10.
Methicilline-resistente S. aureus (MRSA) is een van de belangrijkste oorzaken van infecties die verband houden met inwonende medische hulpmiddelen, zoals centraal veneuze en urinekatheters, prothetische gewrichten, pacemakers, mechanische hartkleppen en intra-uteriene apparaten11. Tijdens dergelijke infecties zijn neutrofielen de eerste gastheer-immuuncellen die naar de infectieplaats worden gerekruteerd om pathogenen te bestrijden via meerdere strategieën12. Deze omvatten fagocytose, degranulatie, productie van reactieve zuurstof- en stikstofsoorten (ROS / RNS) of het vrijkomen van neutrofiele extracellulaire vallen (NET’s) om pathogenen te elimineren13.
Generatie van ROS op fagocytose van microben is een van de belangrijkste antimicrobiële reacties die neutrofielen vertonen14. Fagocytose wordt versterkt als microben worden gecoat met opsoninen, met name immunoglobulinen en complementcomponenten die worden aangetroffen in serum15. De geopsoniseerde microben worden vervolgens herkend door celoppervlakreceptoren op neutrofielen en overspoeld, waardoor een compartiment wordt gevormd dat het fagosoom15 wordt genoemd. Neutrofielen genereren en geven ROS af in het fagosoom via het membraan-geassocieerde NADPH-oxidase16. Dit meercomponenten enzymcomplex genereert superoxide-anionen door elektronen over te brengen naar moleculaire zuurstof16. Bovendien genereren neutrofielen ook RNS door de expressie van induceerbare stikstofmonoxidesynthase (iNOS)17. Deze hoge superoxide- en stikstofmonoxideradicalen in het fagosoom hebben brede antimicrobiële activiteiten. Ze kunnen interageren met metaalcentra in enzymen en nucleïnezuren, eiwitten en celmembranen van de ziekteverwekker 18,19,20,21 beschadigen. Talrijke microben nemen een biofilmlevensstijl aan en gebruiken verschillende strategieën om het doden met ROS22,23 te ontwijken. Gestandaardiseerde testen die biofilms koppelen aan neutrofielen om ROS te kwantificeren, zijn dus gunstig voor consistente resultaten.
Hoewel assays, zoals het kwantificeren van neutrofielen ROS-productie, informatie verschaffen over de reacties van neutrofielen op biofilms, kan het vermogen om de interacties van neutrofielen binnen een biofilm te visualiseren ook dienen als een krachtig hulpmiddel. Het gebruik van fluorescerende kleurstoffen voor microscopie vereist vaak optimalisatie om beelden van hoge kwaliteit te verkrijgen die kunnen worden gebruikt voor microscopiebeeldvormingsanalyse. De flexibiliteit om sommige aandoeningen te optimaliseren is beperkt omdat neutrofielen celdood kunnen ondergaan na isolatie. Bovendien worden biofilms meestal gewassen om de planktonpopulatie uit de experimentele opstelling te verwijderen voordat neutrofielen worden toegevoegd. Tijdens het wassen kan variabiliteit tussen replicerende biofilms ontstaan als gevolg van verlies van gedeeltelijke biomassa als biofilms losjes aan het oppervlak worden gehecht.
In grote lijnen omvatten de huidige methoden in het veld om interacties tussen neutrofielen en biofilms te analyseren voornamelijk microscopie, flowcytometrie en kolonievormende eenheden (CFU) opsomming 24,25,26,27. Microscopie omvat het gebruik van kleurstoffen die ofwel direct de neutrofielen en biofilms kleuren, of zich richten op verschillende neutrofiele reacties tegen microben zoals NET-vorming, degranulatie en celdood25,28. Een subset van deze reacties, zoals neutrofiele celdood en degranulatie, kan ook worden geanalyseerd via flowcytometrie, maar vereist dat neutrofielen bij voorkeur niet geassocieerd worden met grote aggregaten microben in een biofilm28,29. Flowcytometrie kan ook enkele biofilmparameters kwantificeren, zoals cel levensvatbaarheid27. Deze processen vereisen echter verstoring van de biofilmbiomassa en zouden niet nuttig zijn om andere belangrijke interacties te visualiseren, zoals de ruimtelijke verdeling van neutrofielen en hun componenten binnen een biofilm 27,29,30.
Het huidige protocol richt zich op het aanpassen van enkele van de traditioneel gebruikte methoden om neutrofiel-biofilminteracties op biofilms te bestuderen die zijn geoptimaliseerd om minimale variabiliteit tijdens de hantering te bieden. Dit protocol biedt dus gestandaardiseerde methoden om biofilms te laten groeien en kwantificeren, primaire menselijke neutrofielen uit perifeer bloed te isoleren, ROS-productie te kwantificeren en biofilm-neutrofiele interacties via microscopie te visualiseren. Dit protocol kan worden aangepast aan verschillende systemen om biofilm-neutrofiele interacties te begrijpen, rekening houdend met de heterogeniteit tussen donorpools.
Er zijn talloze inspanningen geleverd om robuuste en reproduceerbare S. aureus-biofilms te kweken voor downstream-experimenten in vitro 48,49,50. Er wordt een gestandaardiseerd protocol geschetst dat gebruik maakt van de kationische aard van PLL, evenals het aanvullen van de media met glucose voor de groei van robuuste in vitro S. aureus biofilms. De toevoeging van PLL zorgt voor een betere hechting van de negatief geladen bacteriële cel aan de positief geladen PLL-gecoate oppervlakken. Het is belangrijk op te merken dat PLL bij een concentratie van 10 μg / ml antimicrobiële activiteit heeft tegen Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli en S. aureus wanneer geïncubeerd gedurende 24 h51. Dezelfde concentratie wordt gebruikt om oppervlakken te coaten; overtollige PLL wordt echter aangezogen, waardoor de concentratie PLL lager is dan 10 μg/ml bij het zaaien voor biofilmgroei.
Het is belangrijk op te merken dat PLL alleen heeft gewerkt in specifieke groeimedia zoals MEMα met 2% glucose, waar werd waargenomen dat S. aureus robuuste biofilms produceerde met minimale variabiliteit (figuur 2A). PLL-concentratie die in combinatie met andere mediatypen kan worden gebruikt, vereist verdere optimalisatie, zoals het gebruik van een verhoogde concentratie PLL om de putten te coaten. Bovendien zijn deze omstandigheden geoptimaliseerd voor een monospecies S. aureus biofilm. Hoewel chronische wondbiofilms vaak polymicrobiaal zijn, is het standaardiseren van assays om monospecies biofilm en zijn interacties met neutrofielen en andere immuuncellen te bestuderen de sleutel tot het begrijpen van hun bijdrage aan pathogenese52. Deze gestandaardiseerde protocollen kunnen verder worden geoptimaliseerd om polymicrobiële biofilms en hun interacties met neutrofielen te ondersteunen en te bestuderen.
Er werd ook waargenomen dat rijke bacteriële kweekmedia, zoals TSB, leidden tot een verlies van levensvatbaarheid van neutrofielen (figuur 1). Daarom werden de groeicondities van S. aureus-biofilms in MEMα, gebruikt voor celculturen van zoogdieren, geoptimaliseerd. Voor studies met neutrofielen ondersteunt dit medium de levensvatbaarheid van neutrofielen en bevordert het de groei van S. aureus . Hoewel werd waargenomen dat media de levensvatbaarheid van neutrofielen beïnvloeden, is het ook belangrijk om te overwegen dat neutrofielen geïsoleerd uit perifeer menselijk bloed ex vivo apoptose ondergaan met ongeveer 70% apoptotische neutrofielen tegen 20 h53. Dit vereist een goede behandeling, zoals het opslaan van de neutrofielen op ijs bij de voorbereiding op experimenten, het gebruik van endotoxinevrije reagentia en het voorkomen van activering van neutrofielen door vortexing van monsters met neutrofielen te voorkomen.
De beoordeling van oxidatieve uitbarstingen bij neutrofielen wordt routinematig uitgevoerd om het dodende effect van neutrofielen op de ziekteverwekker 14,54,55 te bepalen. Deze studies worden vaak uitgevoerd met planktonische bacteriën waar neutrofielen worden toegevoegd, en de oxidatieve burst-respons wordt gekwantificeerd met behulp van luminol-versterkte chemiluminescentie die superoxide-anionen detecteert die door neutrofielen worden geproduceerd. Het huidige protocol wordt aangepast door planktonische bacteriën te vervangen door statisch gekweekte 18 h S. aureus biofilm. Als zodanig kunnen neutrofielen direct aan de biofilm worden toegevoegd om hun activering te beoordelen. Aan de andere kant produceren bacteriën in biofilms enzymen, zoals catalase en superoxide dismutase om ROS23,56 te ontgiften. Staphylococcus epidermidis biofilms produceren hogere catalase dan zijn plankton tegenhanger onder stress57. De totale chemiluminescentie van PMA-gestimuleerde neutrofielen in een S. aureus biofilm is significant lager dan de PMA-gestimuleerde neutrofielen waar biofilm afwezig is (figuur 2). Dit kan te wijten zijn aan de activiteit van deze ontgiftende enzymen. Bovendien produceren S. aureus-biofilms verschillende porievormende toxines die leukocidanen worden genoemd en die neutrofielen doden58. De verminderde burst-respons is waarschijnlijk ook te wijten aan de verminderde levensvatbaarheid van neutrofielen in aanwezigheid van S. aureus-biofilm. Hoewel deze studie luminol gebruikt dat de totale ROS detecteert die zowel binnen als buiten de cellen wordt geproduceerd, moeten andere reagentia, zoals CM-H2DCFDA (5-(en-6)-chloormethyl-2’7′-dichloordibutafluoresceïnediacetaat) of isoluminol, worden overwogen als het doel van het werk is om intracellulaire of extracellulaire ROS-productie 14,53,54 specifiek te bestuderen.
Het vermogen om neutrofiel-biofilminteracties via microscopie te visualiseren, kan informatief zijn over het gedrag van neutrofielen en biofilms in aanwezigheid van elkaar. De excitatie- en emissiespectra van de fluorescerende kleurstoffen en eiwitten vertegenwoordigen een momentopname van de interactie tussen een 18 h S. aureus biofilm en neutrofielen na een incubatie van 30 minuten. Om signalen van gekleurde cellen effectief op te vangen, is het belangrijk om de blootstelling van de monsters aan lichtbronnen te beperken terwijl de monsters worden ingesteld voor microscopie. Tijdens de beeldvorming werd snelle fotobleaching van de monsters vermeden door de intensiteit van de lichtbron te verlagen bij het aanpassen van alle parameters zoals Z-stackhoogte en belichtingstijd voor verschillende kanalen.
Deze eenvoudige praktijken maakten een goede microscopiebeeldvorming mogelijk waarbij werd waargenomen dat weinig neutrofielen gelokaliseerd zijn in de biofilm (figuur 4A). Dit kan te wijten zijn aan ruimtes in de biofilm als 18 h S. aureus biofilm gekweekt in MEMα met 2% glucose bedekt het oppervlak niet gelijkmatig (figuur 4B). Het gebruik van rijke media door andere studies heeft echter een uniform gazon van S. aureus biofilmgroei en leukocyten aangetoond die door de biofilm doordringen30,58. Verder wordt ook waargenomen dat er neutrofiele celdood was na 30 minuten incubatie met S. aureus biofilms als gevolg van S. aureus biofilm-geproduceerde leukocidines die neutrofielen lyseren58 (Figuur 4A,D). Toevoeging van een wasstap om niet-gehechte neutrofielen te verwijderen na het incuberen met biofilm gedurende 30 minuten verwijderde ~ 15% van de dode neutrofielen uit het systeem in vergelijking met de ongewassen groep, waarbij microscopie onmiddellijk na 30 minuten incubatie werd uitgevoerd (figuur 4D). Neutrofielen die interageren met S. aureus werden ook waargenomen (figuur 4C). Verdere experimenten zijn nodig om te beoordelen of S. aureus wordt overspoeld door neutrofielen of wordt gehecht aan het celoppervlak van neutrofielen54. Het in beeld brengen van neutrofielen en biofilms is de eerste stap om verschillende neutrofiele functionaliteiten stroomafwaarts te evalueren, zoals fagocytose en NETosis54,59. Het effect van neutrofielen op biofilms kan ook worden beoordeeld door de biofilmbiomassa, structurele veranderingen van de biofilm en de levensvatbaarheid van biofilms te kwantificeren, naast vele andere, met behulp van beeldanalysetools die in stap 5.6 worden vermeld. Ten slotte bestaat donor-tot-donorvariabiliteit bij neutrofielen; daarom wordt aanbevolen om ten minste drie verschillende donoren te gebruiken voor studies met neutrofielen.
Over het algemeen werden gestandaardiseerde in vitro assays gecombineerd om interacties tussen neutrofielen en biofilms te beoordelen. Hoewel deze testen S. aureus gebruiken, kunnen de beschreven protocollen gemakkelijk worden aangepast om andere pathogenen te bestuderen. Hoewel er verschillende in vivo modellen zijn om gastheer-pathogeen interacties te bestuderen, kunnen ze duur en arbeidsintensief zijn, vooral als de omstandigheden niet zijn geoptimaliseerd. Werken met gestandaardiseerde in vitro assays stelt u in staat om experimentele omstandigheden te optimaliseren en waarnemingen te bevestigen voordat men naar een in vivo systeem gaat. Ten slotte zijn verschillende dierinfectiemodellen gebruikt om biofilm-neutrofiele interacties in vivo te bestuderen. Het is echter belangrijk om immunologische verschillen tussen mens en dier te overwegen 60,61,62,63. Dit vereist het gebruik van neutrofielen afkomstig van mensen om deze complexe gastheer-pathogeen interacties te bestuderen.
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd gefinancierd door het National Institute of Allergy and Infectious Diseases (R01AI077628) aan DJW en een American Heart Association Career Development Award (19CDA34630005) aan ESG. We danken Dr. Paul Stoodley voor het verstrekken van USA 300 LAC GFP-stam. Bovendien erkennen we bronnen van de Campus Microscopy and Imaging Facility (CMIF) en het OSU Comprehensive Cancer Center (OSUCCC) Microscopy Shared Resource (MSR), de Ohio State University. We bedanken ook Amelia Staats, Peter Burback en Lisa Coleman van het Stoodley-lab voor het uitvoeren van bloedafnames.
0.9% sodium chloride irrigation, USP | Baxter | 2F7124 | Endotoxin-free; Used for isolation of neutrophils |
150 mL rapid-flow filter unit | Thermo Scientific | 565-0020 | |
200 proof ethanol | VWR | 89125-188 | |
3 mL syringe | BD | 309657 | Used for blood draw |
50 mL conical centrifuge tubes | Thermo Scientific | 339652 | |
60 mL syringe | BD | 309653 | Used for blood draw |
Agar | Fisher Bioreagents | BP1423-2 | |
Alcohol swab | BD | Used for blood draw | |
Band-aids | Used for blood draw | ||
BD Bacto Tryptic Soy Broth | BD | DF0370-07-5 | Combine with 1.5% agar to make Tryptic Soy Agar |
Cell counter | Bal Saupply | 202C | |
CellTracker blue CMCH | Invitrogen | C2111 | Blue CMAC Dye (BCD) |
Clear bottom 96-well flat bottom polystyrene plates | Costar | 3370 | |
Cotton gauze | Fisherbrand | 13-761-52 | Used for blood draw |
Crystal violet | Acros Organic | 40583-0250 | |
Culture tubes | Fisherbrand | 14-961-27 | Borosilicate Glass 13 x 100 mm |
D-(+)-glucose | Sigma | G-8270 | |
Dextran from Leuconostoc spp. | Sigma | 31392-250G | Used for isolation of neutrophils |
Dulbecco's phosphate buffered saline (DPBS) 1x | Gibco | 14190-144 | |
Ethidium homodimer-1 | Invitrogen | L3224 B | |
Ficoll-Paque plus | Cytiva | 17144003 | Used for isolation of neutrophils (density gradient medium) |
Hanks' balanced salt solution (HBSS) 1x | Corning cellgro | 21-022-CV | without calcium, magnesium, and phenol red |
Hemacytometer | Bright Line | ||
Heparin | Novaplus | NDC 63323-540-57 | 1000 USP units/mL, Used for blood draw |
IMARIS 9.8 | Oxford Instruments | Microscopy image analysis software | |
Luminol | Sigma | A8511-5G | |
Minimal essential media (MEM) Alpha 1x | Gibco | 41061-029 | |
Needle (23 G1) | BD | 305145 | Used for blood draw |
Nikon Eclipse Ti2 | Nikon | ||
NIS-Elements | Nikon | Quantification of dead neutrophils | |
Normal human serum | Complement Technology | NHS | |
Petri Dish (100 x 15 mm) | VWR | 25384-342 | |
Phorbol 12-myristate 13-acetate | |||
Poly-L-lysine solution | Sigma | P4707-50ML | |
Sodium chloride | Fisher Bioreagents | BP358-10 | Used for neutrophil isolation |
SoftMax Pro Software | Molecular Devices | Microplate reader software used for data acquisition | |
SpectraMax i3x | Molecular Devices | Microplate reader | |
Sterile water for irrigation, USP | Baxter | 2F7114 | Endotoxin-free; Used for neutrophil isolation |
Surflo winged infusion set | Terumo | SC*19BLK | 19 G x 3/4", used for blood draw |
Trypan blue stain (0.4%) | Gibco | 15250-061 | |
Turnicate | Used for blood draw | ||
UltraPure distilled water | Invitrogen | 10977015 | |
White opaque 96-well plates | Falcon | 353296 | Tissue culture treated and flat bottom plate |
μ-Slide VI 0.4 | Ibidi | 80601 | μ-channel slide |