Het huidige protocol beschrijft transmissie-elektronenmicroscoop (TEM) modificaties met een lichtverlichtingssysteem, de fabricage van vloeibare cellen en in situ TEM-waarnemingen van door licht geïnduceerde interacties tussen bacteriële cellen en een fotosensitizer. De monstervoorbereidingsmethoden, elektronenbundelschade en beeldvorming worden ook besproken.
Het huidige protocol beschrijft de modificaties van de transmissie-elektronenmicroscoop (TEM) opstelling voor in situ licht-geïnduceerde waarnemingen. Een glasvezel die in de elektronenkolom boven het objectieflenspaalstuk werd gestoken en een laser, een instelbare lichtbron, werd gebruikt om het apparaat te fabriceren. Nadat de illuminator is gekalibreerd met behulp van een extern meetsysteem, kan men de intensiteit van de verlichting aanpassen aan de behoeften van het waargenomen proces. Dit verlichtingssysteem werd gebruikt om antimicrobiële fotodynamische therapieverschijnselen in beeld te brengen, die momenteel het onderwerp zijn van intensief onderzoek. Het monster werd bereid door een suspensie van bacteriën op een koolstof-, grafeen- of siliciumnitridesubstraat te spotten, de overtollige oplossing te deppen, de fotosensitizeroplossing te spotten, de overtollige vloeistof opnieuw te deppen en vervolgens de vloeibare cel samen te stellen met een tweede substraat of grafeenfilm. Het proces van het beeldvormingsexperiment zelf omvat het kiezen van de juiste plaats voor observatie met behulp van een lage vergroting en een minimale dosis elektronen, en vervolgens cyclische activering van de lichtbron om volgende beelden met gespecificeerde intervallen vast te leggen met de minimale hoeveelheid elektronen die nodig is. De elektronendosis van elke blootstelling en de tijd en intensiteit van de gebruikte verlichting moeten zorgvuldig worden geregistreerd vanwege de complexiteit van de waargenomen verschijnselen, omdat het proces tegelijkertijd zowel licht- als elektronengestuurd is. Nadat het eigenlijke experiment is uitgevoerd, moeten aanvullende controlewaarnemingen worden gedaan, waarbij dezelfde doses elektronen worden gebruikt, maar zonder extra lichtinvloed en kleinere doses elektronen worden gebruikt voor hogere doses licht. Dit maakt het mogelijk om door licht geïnduceerde microstructurele effecten te onderscheiden van die veroorzaakt door elektronen op zowel het gebied van het leven als de materiaalkunde.
Lichtgeïnduceerde verschijnselen in hoge resolutie zijn interessant op vele gebieden, zoals nano-engineering 1,2,3, katalyse 4,5 en biofotonica6. Enkele originele ontwerpen die dergelijke experimenten mogelijk maken, zijn te vinden in de literatuur, inclusief modificaties van de monsterhouders 1,4,7,8,9 en de optische vezel bevestigd aan de microscoop10,11.
De combinatie van lichtverlichting, een vloeibare omgeving en transmissie-elektronenmicroscopie (TEM) biedt een geweldige kans voor gedetailleerde, dynamische studies van foto-geïnduceerde processen. De hoogvacuümconditie in de microscoop is echter nogal ongunstig voor veel vloeistoffen, vooral wateroplossingen. Vloeibare inkapseling, die het beschermt tegen de omgeving, kan worden bereikt met behulp van een paar technieken die voornamelijk zijn gebaseerd op grafeen12, siliciumnitride13 of koolstof14 substraten. Naast onderzoek in materiaalkunde2 bieden zogenaamde vloeibare cellen mogelijkheden voor het uitvoeren van onconventionele microscopische waarnemingen op biologische specimens in de buurt van hun oorspronkelijke omstandigheden15. Dergelijke waarnemingen zijn uiterst veeleisend, vooral voor levende micro-organismen zoals bacteriële cellen. De elektronenbundel als ioniserende straling veroorzaakt onomkeerbare schade aan de gehydrateerde monsters, dus de elektronendosis moet wordengespecificeerd 16. Dit is nodig om ongunstige effecten te minimaliseren, de schade te beheersen en verwarrende artefacten te voorkomen. De optimale maximale elektronendosis die waarnemingen van levende cellen mogelijk maakt is nog een twijfelachtig onderwerp16, maar de dosis van 30 e−/nm2 lijkt de drempelwaarde te zijn, althans voor bacteriën17.
Enkele van de onderwerpen die van belang zijn voor dergelijke microscopische studies zijn processen tijdens antimicrobiële fotodynamische therapie (APDT)18. Kortom, de therapie verloopt als volgt. De bacteriële cellen worden omringd door de lichtgevoelige vloeistof genaamd photosensitizer. Wanneer lichtverlichting wordt gegeven op een specifieke golflengte, worden de cytotoxische reactieve zuurstofsoorten (ROS) gegenereerd uit energie- of ladingsoverdracht van de geëxciteerde fotosensitizermoleculen naar de zuurstof die van nature in de oplossing aanwezig is. Pathogenen blootgesteld aan ROS worden snel geïnactiveerd met een zeer hoge efficiëntie, zonder bijwerkingen19. De respons op de therapie varieert voor verschillende microben – de impact van dezelfde fotosensitizer kan bijvoorbeeld heel anders zijn voor Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën20. In het algemeen is vastgesteld dat het belangrijkste doelwit van ROS de buitenste structuren van cellen zijn, waar schade resulteert in functionele stoornissen van het celmembraan en bijgevolg leidt tot de dood van bacteriën21,22. Schade aan nucleïnezuren en eiwitten kan echter ook worden beschouwd als een oorzaak van inactivatie18, dus het is nog onbekend welke celstructuren de belangrijkste doelwitten zijn tijdens dit proces19. Een dieper inzicht in de schadelijke processen zou kunnen helpen om deze definitieve therapie te verbeteren. Vergeleken met de lichtmicroscopiemethoden die in APDT-onderzoek23 worden gebruikt, geven TEM-technieken meer mogelijkheden om naar het APDT-mechanisme te kijken met een hogere resolutie en vergroting24. TEM is al met succes gebruikt voor celobservatie tijdens de lopende therapie, waardoor we Gram-positieve bacterieschade konden bestuderen en de veranderingen in de celwand in detail konden beschrijven 6,25.
Het huidige protocol presenteert een geschikte experimentele opstelling voor beeldvorming met hoge resolutie van door licht geïnduceerde bacteriën inactivatie met behulp van TEM, wat een goed lichtverlichtingssysteem, de inkapseling van cellen met een vloeistof en strikte elektronendosiscontrole vereist. De bacteriën die voor de observatie werden gebruikt , waren Staphylococcus aureus en een methyleenblauwoplossing werd gebruikt als fotosensitizer. De speciale lichtverlichtingsopstelling bestaat uit een instelbare halfgeleiderlaser die rechtstreeks op de microscoopkolom is aangesloten met behulp van de lichtvezel. Dit ontwerp biedt een uniforme bestraling in het hele monster vanwege de bijna parallelle plaatsing van de optische vezel op de microscoopas. Monochroom licht van hoge intensiteit gegenereerd door de laser kan vervolgens worden gebruikt om verschillende fotochemische effecten te bestuderen. Het licht dat in het experiment werd gebruikt, had een golflengte gelijk aan 660 nm omdat methyleenblauw in het zichtbare gebied absorptiepieken heeft bij 613 nm en 664 nm26. Het protocol voor vloeibare inkapseling is gebaseerd op koolstofsubstraten, waardoor de procedure snel en ongecompliceerd is. Ten slotte wordt een methode voor lage dosis in situ TEM-observatie van cellen in vloeistof gepresenteerd. De moeilijkheden met betrekking tot de monstervoorbereiding, de elektronendosiseffecten op het gevoelige monster en een redelijke beeldinterpretatie worden besproken.
De installatie en inbedrijfstelling van de verlichting vereisen basiskennis van de service en kunnen de microscoop beschadigen. De eenvoudigste manier om het licht aan de microscoop te introduceren, is door de optische vezel vanaf de bovenkant van de objectieflens aan te sluiten, waar meestal ruimte is voor de TEM-afbuigspoelen en extra detectoren. Meer vrije ruimte kan ook worden verwacht van oudere top-entry-apparaten, waar dezelfde locatie het monstervacuümslot en het monsterinstallatiemechanisme herbergt. Deze confi…
The authors have nothing to disclose.
Het onderzoek werd ondersteund door de Miniatura-subsidie (2019/03/X/NZ3/02100, National Science Center, Polen).
Carbon film on 200 mesh copper grid | Agar Scientific | AGS160 | The standard TEM grids for observations and liquid cell preparation |
Crossover Tweezers | Dumont | N5 | The tweezers are neecesarry for liquid cell preparation |
Photodiode Power Sensor | ThorLabs | S130C | The sensor used for light intensity measurement |
Polyimide-Coated Multimode Fiber | Thorlabs | FG400UEP | Must be built into the microscope using the on-site built adapter, according to the 10.1016/j.ultramic.2021.113388 |
Transmission Electron Microscope | Hitachi | H-800 | Can be replaced with any side-entry microscope, available for modification |
Tuneable Diode Laser | CNI | MRL-III-660D | The light wavelength must be chosen basing on photosensitizer's absorption spectrum |