Bu çalışmada, standart besleyicisiz hPSC kültürlerini kullanarak basit ama sağlam bir kortikal organoid kültür sistemi için ayrıntılı bir teknik sunuyoruz. Bu, in vitro beyin yaşlanmasının yönlerini modelleyen organoidler üretmek için hızlı, verimli ve tekrarlanabilir bir protokoldür.
Beyin organoidleri, gelişmekte olan insan beyninin üç boyutlu modelleridir ve hastalık modellemesi ve büyük ölçekli genomik ve ilaç taraması için zorlayıcı, son teknoloji bir platform sağlar. Beyin organoidlerindeki hücrelerin kendi kendini organize eden doğası ve nesilleri için mevcut protokollerin artan yelpazesi nedeniyle, organoidler arasındaki heterojenlik ve değişkenlik ile ilgili sorunlar tespit edilmiştir. Bu protokol makalesinde, bu sorunların büyük ölçüde üstesinden gelen ve 1 ay içinde nöroektodermal progenitörlerden kortikal organoidler üreten ve 1 yıldan fazla bir süre boyunca korunabilen sağlam ve tekrarlanabilir bir protokolü tanımlamaktayız. Bu yüksek oranda tekrarlanabilir protokol, standart bir doku kültürü odasında kolayca gerçekleştirilebilir ve tipik olarak gelişmekte olan insan korteksinde bulunan zengin bir hücre tipi çeşitliliğine sahip organoidlerle sonuçlanır. Erken gelişimsel yapılarına rağmen, nöronlar ve diğer insan beyin hücresi tipleri, uzun süreli in vitro kültürden sonra nöronal hücrelerde tipik yaşlanma belirtileri göstermeye başlayacak ve bu da onları yaşlanma ile ilgili nöronal süreçleri incelemek için değerli ve yararlı bir platform haline getirecektir. Bu protokol ayrıca, yaşlanma ile ilişkili beta-galaktosidaz boyamasını kullanarak kortikal beyin organoidlerinde bu tür yaşlanan hücreleri tespit etmek için bir yöntem özetlemektedir.
İnsan beyni hakkındaki mevcut bilgimiz büyük ölçüde hayvan modellerine ve ölüm sonrası beyin örneklerine dayanmaktadır. Kök hücre biyolojisi, insan beyni gelişiminin temel biyolojisine ve insan beyin bozukluklarının patolojik sürücülerine yeni bakış açıları sağlayan hızla ilerleyen bir alandır. İnsan pluripotent kök hücreleri (hPSC’ler), insan beynini organoidlerin oluşumu, tipik olarak gelişimsel yörüngeleri, hücresel yapıyı ve gelişmekte olan insan beyninin mimarisini özetleyen organ benzeri üç boyutlu (3D) doku yoluyla modellemek için paha biçilmez bir araçtır. Beyin organoidleri kendi kendine monte edilir ve nöral kök hücrelerden, belirtilen nöral progenitörlerden, olgun nöronlardan ve glial hücre tiplerinden oluşur. Bu nedenle organoidler, doğrudan deney için genellikle erişilemeyen ancak aynı zamanda vaskülatür ve bağışıklık sisteminin yokluğu gibi içsel sınırlamaları olan erken insan beynini incelemek için eşsiz bir fırsat sunar.
Beyin organoidleri üretme metodolojileri iki farklı şekilde takip edilmiştir: rehbersiz ve rehberli farklılaşma. Yönlendirilmemiş beyin organoid yöntemleri, doku morfogenezi 1,2’yi yönlendiren kök hücrelerin spontan içsel farklılaşma kapasitelerine dayanır ve ön beyin, orta beyin ve arka beyinden koroid pleksus, retina ve mezoderme kadar çeşitli hücre soy kimliklerinin ortaya çıkmasına izin verir. Buna karşılık, yönlendirilmiş beyin organoid yöntemleri, hPSC’leri medial gangliyonik eminans3, ön beyin4, orta beyin5, hipotalamus6, beyincik7 ve koroid pleksus8 gibi bir beyin bölgesi tipini temsil eden nöronal soyların istenen modeline yönlendirmek için dış faktörlerin önemli ölçüde kullanılmasını gerektirir. Farklı hücre soylarına sahip farklı beyin bölgeleri üretme yeteneği ve bunları istediği zaman birleştirme potansiyeli, beyin organoidlerini insan beyni gelişimini araştırmak ve beyinle ilgili hastalıkların altında yatan mekanizmaları deşifre etmek için mükemmel bir model haline getirir. Beyin organoidleri üretmek için bu yöntemler insan beyni bölgelerinin modellenmesinde bir atılım sunsa da, organoidler arasındaki değişkenlik ve heterojenlik, ilaç taraması gibi sistematik ve nicel çalışmalar için önemli bir sınırlama olmaya devam etmektedir.
Mevcut protokol, son makalemiz9’da geliştirilen bir yönteme dayanmaktadır ve hPSC kolonilerinin, FGF2 sinyallemesinin etkisi altında 3D nöroepitel sferoidlerine 4 gün içinde kendi kendini organize etme yeteneğine sahip olan çift SMAD inhibitörleri (SB-431542 ve LDN 193189) ile nöroektoderm (NEct) kimliğine doğru seçici farklılaşmasını içerir. Bu nöroepitel sferoidleri, farklılaşmadan sonraki 4 hafta içinde in vivo benzeri bir hücresel bileşime sahip homojen kortikal organoidleri güvenilir bir şekilde üretir. Burada açıklanan protokol, ikili SMAD (Dekapentaplejik’e Karşı Annelerin Baskılayıcısı) sinyallemesinin inhibisyonunun, hPSC’lerin nöroektodermal progenitörlerden türetilen rostral nöral kök hücrelere doğru farklılaşmasını teşvik ettiğini gösteren önceki bulgularımız üzerine inşa edilmiştir10 , diğerlerinin yanı sıra, endodermal, mezodermal ve trofektoderm hücre kaderi seçimini inhibe ederek11 . Ayrıca, nöroepitel sferoidlerinin hESC nitelikli bazal membran matrisine gömülmesi, nöroepitelinin önemli ölçüde tomurcuklanmasını tetikleyerek apikobazal polariteli ventriküller oluşturur. Büyük ölçekli kültür, kortikal organoidlerin hücre hatlarından, klonlardan veya partilerden bağımsız olarak tekrarlanabilirliğini ve homojenliğini gösterdi ve böylece in vitro sağlık ve hastalıkta erken insan kortikal gelişimini taklit etmek için güvenilir ve istikrarlı bir kök hücre sistemini temsil etti. Ayrıca, uzun süre kültürlenmiş olan hPSC’lerden türetilmiş kortikal beyin organoidlerinde yaşlanan nöronal hücre belirteçlerini tespit etmek için bir protokol hazırladık.
hPSC’leri% 20-30’luk bir tohumlama yoğunluğunda kapladıktan sonra, hücreler hPSC kolonilerini nöroektodermal kolonilere doğru ayırt etmek için 3 gün boyunca çift SMAD inhibitörleri ile muamele edilir. Bu koloniler daha sonra dispase ile nazikçe kaldırılır ve FGF2 ile desteklenmiş ultra düşük ataşman 6 delikli plakalara ekilir. Yüzen 2D koloniler, bir gecede 3D nöroektodermal sferoidlere kendi kendini organize eder ve günlük olarak FGF2 ile desteklenen N2 ortamında 4 gün boyunca korunur. Sferoidler nöroepitelyal tabakayı kurduktan sonra, bazal membran matrisine gömülebilirler. Rutin olarak taze terminal farklılaşma ortamı ekleyerek, araştırmacılar kortikal organoidlerde nöroepitelinin ilerleyici genişlemesini ve tomurcuklanmasını gözlemleyeceklerdir. Araştırmacılar, transkripsiyonel ve proteomik profilleme yapmak için bu organoidleri ayırmak isteyebilirler. Ek olarak, kortikal organoidlerin kalitesini izlemek için parlak alan görüntüleme önerilir. Analiz fiksasyon, kriyoseksiyon ve immün boyama ile yapılabilir. Bu teknikler için açıklamalar ve yöntemler daha önce tanımlanmıştır12. Nihayetinde, bu protokol, araştırmacıların gelişmekte olan insan kortikal beynini modellemek için, düşük maliyetli ve sınırlı ekipmanla homojen kortikal beyin organoidlerini hızlı ve sağlam bir şekilde üretmelerini ve bu makalede belirtildiği gibi hücresel nöronal yaşlanmanın yönlerini incelemelerini sağlar.
İlaç taraması ve hastalık modellemesinde hPSC türevi beyin organoidlerinin kullanılmasını sağlamak için, tekrarlanabilir ve güvenilir bir protokol15’i izleyerek organoidler yapmak çok önemlidir. Beyin organoidleri genellikle hPSC’lerden türetilen embriyoid cisimlerden üretilir ve daha sonra doku genişlemesini ve sinirsel farklılaşmayı destekleyen hücre dışı bir matrise gömülür. Lancaster’ın 1,16,17 ve Velasco18 gibi embriyoid cisimlerden başlayan ve gelişmekte olan organoidler tarafından varsayılan bir farklılaşma yolunun izlenmesine izin veren protokollerle karşılaştırıldığında, kortikal beyin organoid oluşumunun embriyoid cisimleri yerine insan NEct hücreleri ile başlamasının kortikal beyin organoid oluşumunun tutarlılığını artırdığını bulduk. Sonuç olarak, ilaç ve fenotipik tarama için gerekli ölçeklemeye de izin verir. İnsan NEct hücreleri sadece önemli miktarlara genişletilebildiği için değil, aynı zamanda kolayca kriyoprezerve edilebildiği için, bu yaklaşım deneyler arasında tekrarlanabilirliği de geliştirir. Ayrıca, Biyoreaktörlerin ve benzer teknolojilerin kullanımını benimseyen diğer protokollerle karşılaştırıldığında, bu protokol için özel bir ekipman gerekmediği ve bu da onu herhangi bir laboratuvar6 için uygun hale getirdiği belirtilmelidir. Son olarak, SATB2 gibi kortikal tabaka belirteçleri için pozitif olan olgun organoidler üretmek için gereken süre, hem Lancaster 1 hem de biyoreaktör protokolleri 6,19’a kıyasla azaltılmıştır ve bu da onu sağlık ve hastalıklarda insan kortikal gelişiminin gelişimsel yörüngesini incelemek için daha uygun hale getirmektedir 1,6,16.
Ayrıca, beyinde patogeneze katkıda bulunan yaşlanan hücre tiplerindeki artışla ilişkili olan demans gibi yaşlanmaya bağlı hastalıkların sürekli büyüyen küresel sağlık hizmetleri etkisi göz önüne alındığında, beyin yaşlanmasını iyileştirebilecek bileşikleri tanımlama ve test etme yeteneği büyük ilgi çekicidir. hPSC’lerin yeniden programlama süreci20 sırasında epigenetik olarak gençleştirildiği bilinmesine rağmen, uzun süre kültürlenen kortikal beyin organoidlerinde yaşlanan hücrelerde sağlam artışlar buluyoruz. Bu, şimdi bu tür yaşlanan hücreleri beyinden (senolitik bilimler) ortadan kaldıran veya bu süreci yavaşlatan (senostatikler) ilaçların taranmasını sağlayan umut verici bir gelişmedir.21. İnsan NEct kaynaklı kortikal beyin organoidleri insan kökenli olduğundan, bu yaklaşım muhtemelen bu tür yeni terapötikleri pazarlamanın geleneksel yolunu kısaltacaktır.
Bu protokolde iki kritik adım vardır. Birincisi, farklılaşma sırasında hPSC kolonilerinin doğru akıcılık seviyesidir. hPSC kolonileri, üretilen NEct kolonilerinin komşu kolonilerle kaynaşmamasını ve bireysel organoidlerin klonal olarak yönlendirilmesini sağlamak için en fazla% 30 oranında kaynaşmalıdır. İkinci kritik adım, NEct kolonilerini kaldırmak ve nöral sferoidleri üretmek için dispasın doğru kullanımını içerir. Dispase ile inkübasyonun zamanlaması, üretilen nöral sferoidlerin nihai kalitesi için kritik öneme sahiptir. Bunun nedeni, dispaslı kolonilerin aşırı maruz kalmasının hücreler için toksik olmasıdır22 ve sonunda üretilen organoidlerin kalitesini etkiler. Bu protokolün sınırlaması, nöral sferoidlerin boyutunu kontrol etmenin zor olmasıdır, çünkü dispase ile kaldırılan ilk kolonilerin büyüklüğüne bağlıdır. Bununla birlikte, bu sorun, gömme aşamasına geçerken benzer boyutta olan nöral sferoidler seçilerek aşılabilir.
Son olarak, gelecekteki uygulamalar, bu tekrarlanabilir kortikal organoidlerin robotik analizde ve tipik olarak bu endüstride kullanılan biyofarmasötik tarama yaklaşımlarında kullanılmasına kadar uzanabilir. Bu, laboratuvarımızdan elde edilen ve insan NEct hücrelerinden kortikal beyin organoidlerinin üretilmesinin kolayca otomatikleştirilebileceğini ve bu yaklaşımlarla uyumlu hale getirilebileceğini gösteren ön verilerle desteklenmektedir.
The authors have nothing to disclose.
Bu çalışma, Tıbbi Araştırma Gelecek Fonu Hızlandırılmış Araştırma, Lökodistrofi amiral gemisi Massimo’nun Misyonu (EPCD000034), Tıbbi Araştırma Gelecek Fonu-Kök Hücre Misyonu (APP2007653) tarafından desteklenmektedir. Yazarlar, Ek Video 1’de veri ürettiği için Dr. Ju-Hyun Lee’ye (Kore Üniversitesi) teşekkür eder.
16% Formaldehyde (W/V) Methanol-free | Thermo Fisher Scientific | 28908 | 4% of PFA are diluted in 1x PBS |
2-Mercaptoethanol 50 mL(1000x) | Life Technologies Australia (TFS) | 21985023 | Used in NM and DM media |
B 27 Supplement 10 mL | Life Technologies Australia (TFS) | 17504044 | Used in NM and DM media |
CKX53 microscope with SC50 camera | Olympus | ||
Corning Costar 6 well cell culture plates | Sigma Aldrich Pty Ltd | CLS3516-50EA | |
Dispase II powder | Thermo Fisher Scientific | 17105041 | Powder is dissolve in HBSS, filtered through 0.22 µm filter, aliquote at 10 mL and store at -20 °C |
DMEM Nutrient Mix F12 10x 500 mL (DMEM/F-12) | Thermofisher | 11320082 | Used in NM and DM media |
DMSO Dimethyl Sulfoxide | Sigma Aldrich Pty Ltd | D2650-100ML | |
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline | Sigma Aldrich Pty Ltd | D1408-500ML | |
Falcon Matrigel hESC-qualified Matrix | In Vitro Technologies Pty Ltd | FAL354277 | Make aliquotes of 100 µL and stored at -20 °C |
GlutaMAX Supplement 100x | Thermo Fisher Scientific | 35050061 | Used in NM and DM media |
Hanks Balanced Salt Solution | Sigma Aldrich Pty Ltd | H8264 | |
Human induced pluripotent stem cells (EU79) | In-house reporogrammed from skin fibroblast | ||
Human induced pluripotent stem cells (G22) | Genea Biocells | Obtained from Genea Biocells (San Diego, United States) | |
Human induced pluripotent stem cells (WTC) | Gift from Professor Bruce Conklin | ||
InSolution TGF-Β RI Kinase Inhibitor VI, SB431542 | Merck | US1616464-5MG | |
Insulin Solution Human Recombinant | Sigma Aldrich Pty Ltd | I9278 | Used in NM and DM media |
LDN193189 Dihydrochloride | Sigma Aldrich Pty Ltd | SML0559-5MG | Used during differentiation |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x) | Thermo Fisher Scientific | 11140050 | Used in NM and DM media |
mTeSR Plus | STEMCELL TECHNOLOGIES | 100-0276 | Used to maintain hiPSC colonies prior to differentiation with NM media |
N2 Supplement 5 mL (100x) | Life Technologies Australia Pty Ltd | 17502048 | Used in NM and DM media |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | 21103049 | Used in DM media |
OCT Embedding Compound Sakura Clear (118 mL/Bottle) | Tissue Tek | 4583 | |
Parafilm M Roll Size 4 in. x 125 Ft | Sigma Aldrich Pty Ltd | P7793 | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | Used in NM and DM media |
Potassium Hexacyanoferrate (II) Trihydrate | Sigma Aldrich Pty Ltd | CP1087 | |
Potassium hexacyanoferrate(III) | Sigma Aldrich Pty Ltd | 455946 | |
Prolong Glass Antifade Mountant | Life Technologies Australia (TFS) | P36980 | |
Recombinant Human FGF basic | R&D Systems | 233-FB-01M | Aliquotes are made at 20 µg/mL and stored at -20 °C |
SB431542 | Tocris | 1614 | Used during differentiation |
Sucrose | Sigma Aldrich Pty Ltd | PHR1001-1G | 30% of sucrose are diluted in 1x PBS |
Ultra-Low attachment multiwell plates , 24 well plate, polystyrene | Sigma Aldrich Pty Ltd | CLS3473-24EA | |
X-GAL EA | Life Technologies Australia (TFS) | R0404 | Make aliquotes of 20 mg/mL and storde at -80 °C |