Summary

Indagine sull'interazione spaziale tra astrociti e neuroni nel cervello eliminato

Published: March 31, 2022
doi:

Summary

La combinazione della trasduzione del vettore virale e della compensazione del cervello utilizzando il metodo CLARITY consente lo studio di un gran numero di neuroni e astrociti contemporaneamente.

Abstract

La combinazione della trasduzione del vettore virale e della compensazione dei tessuti utilizzando il metodo CLARITY consente di studiare contemporaneamente diversi tipi di cellule cerebrali e le loro interazioni. La trasduzione del vettore virale consente la marcatura di diversi tipi di cellule in diversi colori di fluorescenza all’interno dello stesso tessuto. Le cellule possono essere identificate geneticamente per attività o proiezione. Utilizzando un protocollo CLARITY modificato, la dimensione potenziale del campione di astrociti e neuroni è cresciuta di 2-3 ordini di grandezza. L’uso di CLARITY consente l’imaging di astrociti completi, che sono troppo grandi per adattarsi nella loro interezza a fette, e l’esame dei somata con tutti i loro processi. Inoltre, offre l’opportunità di studiare l’interazione spaziale tra astrociti e diversi tipi di cellule neuronali, vale a dire, il numero di neuroni piramidali in ciascun dominio astrocitico o la vicinanza tra astrociti e specifiche popolazioni di neuroni inibitori. Questo documento descrive, in dettaglio, come questi metodi devono essere applicati.

Introduction

Negli ultimi anni, la conoscenza della funzione degli astrociti e di come interagiscono con i circuiti neuronali è aumentata drasticamente. Gli astrociti possono influenzare la plasticità 1,2, aiutare nel recupero neuronale post-infortunio 3,4 e persino indurre un potenziamento neuronale de novo, con studi recenti che mostrano l’importanza degli astrociti nell’acquisizione e nella ricompensa della memoria, precedentemente considerate come funzioni puramente neuronali 5,6,7 . Una caratteristica di particolare interesse nella ricerca sugli astrociti è la disposizione spaziale delle cellule, che mantengono organizzazioni spaziali uniche nell’ippocampo e in altre strutture cerebrali 8,9,10. A differenza dei dendriti neuronali che si intrecciano tra i somata cellulari, gli astrociti ippocampali abitano territori visivamente distinguibili con una leggera sovrapposizione tra i loro processi, creando domini distinti 8,11,12,13. Le prove a sostegno della partecipazione degli astrociti nei circuiti neuronali non supportano la mancanza di una descrizione anatomica dettagliata di tali popolazioni e dei neuroni nei loro domini14.

Le procedure di trasduzione del vettore virale, insieme agli animali transgenici (TG), sono state rese popolari come set di strumenti per studiare le strutture cerebrali, le funzioni e le interazioni cellulari15,16. L’utilizzo di diversi promotori consente il targeting di cellule specifiche in base alle loro proprietà genetiche, ai livelli di attivazione17,18 o agli obiettivi di proiezione. Virus diversi possono esprimere fluorofori di colore diverso in diverse popolazioni. Un virus può essere combinato con l’espressione endogena di fluorofori in TG, oppure gli animali TG possono essere utilizzati senza la necessità di virus. Queste tecniche sono ampiamente utilizzate per la marcatura neuronale e alcuni laboratori hanno iniziato a utilizzarle con modifiche specializzate per il targeting di altri tipi di cellule, come gli astrociti 5,9,19.

La tecnica CLARITY, descritta per la prima volta nel 201320,21, consente lo studio di spesse fette di cervello rendendo trasparente l’intero cervello lasciando intatte le strutture microscopiche. Combinando i due metodi – trasduzione virale del vettore e pulizia dei tessuti – è ora disponibile l’opzione di esaminare le interazioni spaziali tra diverse popolazioni di tipi cellulari. La maggior parte degli studi di interazione astrociti-neuroni sono stati eseguiti su fette di cervello sottili, con conseguente immagine di astrociti incompleti a causa dei loro grandi domini, limitando così radicalmente il numero di cellule analizzate. L’uso della tecnica CLARITY consente la caratterizzazione simultanea della risoluzione di singole cellule di popolazioni cellulari in volumi su larga scala. L’imaging di popolazioni cellulari con tag fluorescenti in cervelli chiari non fornisce una risoluzione sinaptica, ma consente una caratterizzazione approfondita delle interazioni spaziali tra astrociti e una varietà di tipi di cellule neuronali.

Per questo motivo, abbiamo sfruttato queste tecniche all’avanguardia per studiare le proprietà degli astrociti in tutto il CA1 dorsale, immaginando tutte le lamina (Stratum Radiatum, strato piramidale e Stratum Oriens). Abbiamo misurato decine di migliaia di astrociti (con penetranza virale di >96%5), analizzando così le informazioni dell’intera popolazione astrocitica intorno a CA1. Con un’efficace penetranza dei marcatori neuronali, abbiamo potuto registrare le interazioni tra l’intera popolazione di astrociti CA1 e i quattro tipi di cellule neuronali: parvalbumina (PV), somatostatina (SST), neuroni inibitori VIP e cellule piramidali eccitatorie9.

Diversi esperimenti sono stati eseguiti utilizzando una combinazione di fluorescenza da animali TG e vettori virali di colore diverso (tutte le cellule inibitorie), mentre altri (eccitatori) hanno utilizzato due vettori virali che esprimono diversi fluorofori sotto diversi promotori9. Questo documento presenta un protocollo dettagliato, che include l’etichettatura delle cellule desiderate nel cervello, rendendo il cervello trasparente utilizzando una procedura CLARITY modificata, nonché l’imaging e l’analisi di strutture cerebrali complete, utilizzando varie procedure e software.

Protocol

I protocolli sperimentali sono stati approvati dal Comitato per la cura e l’uso degli animali dell’Università ebraica e hanno soddisfatto le linee guida della Guida dell’Istituto Nazionale di Salute per la cura e l’uso degli animali da laboratorio. 1. Trasduzione del vettore virale NOTA: La trasduzione del vettore virale viene utilizzata per esprimere fluorofori nel cervello. Utilizzare un atlante (ad esempio, Allen Brain Atlas) per indiv…

Representative Results

La corretta eliminazione di spesse fette di tessuto cerebrale si traduce in una nuova gamma di domande che possono essere poste riguardo alle proprietà di grandi popolazioni cellulari rispetto alle proprietà di singole cellule o gruppi vicini di cellule. Per ottenere risultati di successo, si dovrebbe rispettare rigorosamente il protocollo CLARITY, in quanto esiste una vasta gamma di parametri che devono essere considerati per ridurre la varianza tra i campioni (ad esempio, percentuale di chiarezza, informazioni sulla …

Discussion

I metodi di compensazione dei tessuti rappresentano uno strumento rivoluzionario nella ricerca sul cervello, invitando a domande che in precedenza non avrebbero potuto essere poste. Dal targeting delle proprietà di un piccolo gruppo di cellule, una singola cellula o anche una singola sinapsi, CLARITY ora consente il targeting di popolazioni cellulari totali o funzionalità di connettività a lungo raggio utilizzando fluorofori pertinenti.

Il risultato dell’espressione del fluoroforo e della c…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Questo progetto ha ricevuto finanziamenti dal Consiglio europeo della ricerca (CER) nell’ambito del programma di ricerca e innovazione Horizon 2020 dell’Unione europea (convenzione di sovvenzione n. 803589), dalla Israel Science Foundation (sovvenzione ISF n. 1815/18) e dalle sovvenzioni Canada-Israele (CIHR-ISF, sovvenzione n. 2591/18). Ringraziamo Nechama Novick per aver commentato l’intero manoscritto.

Materials

AAV1-GFAP::TdTomato ELSC Vector Core Facility (EVCF) viral vector used to detect astrocytes
AAV5-CaMKII::eGFP ELSC Vector Core Facility (EVCF) viral vector used to detect neurons
AAV5-CaMKII::H2B-eGFP ELSC Vector Core Facility (EVCF) viral vector used to detect neuronal nuclei
AAV5-CaMKII::TdTomato ELSC Vector Core Facility (EVCF) viral vector used to detect neurons
Acrylamide (40%) Bio-rad #161-0140
Bisacrylamide (2%) Bio-rad #161-0142
Boric acid Sigma #B7901 Molecular weight – 61.83 g/mol
Confocal microscope, scanning, FV1000 Olympus 4x objective (UPlanSApo, 0.16 NA)
Imaris software Bitplane, UK A software that allows 3D analysis of images
NaOH Sigma #S5881
PBS
PFA 4% EMS #15710
RapiClear SunJin lab #RC147002
RapiClear CS SunJin lab #RCCS002
SDS Sigma #L3771
SyGlass software A software that allows 3D analysis of images using virtual reality
Tris base 1 M Bio-rad #002009239100 Molecular weight – 121.14 g/mol
Triton X-100 ChemCruz #sc-29112A
Two photon microscope Neurolabware Ti:sapphire laser (Chameleon Discovery TPC, Coherent), GaAsP photo-multiplier tubes (Hamamatsu, H10770-40) , bandpass filter (Semrock), water immersion 16x objective (Nikon, 0.8 NA) 
VA-044 Initiator Wako #011-19365

References

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Cite This Article
Refaeli, R., Goshen, I. Investigation of Spatial Interaction Between Astrocytes and Neurons in Cleared Brains. J. Vis. Exp. (181), e63679, doi:10.3791/63679 (2022).

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