Summary

Motilidad de moléculas individuales y grupos de cinesina-5 cin8 bidireccional purificada a partir de células de S. cerevisiae

Published: February 02, 2022
doi:

Summary

La kinesina-5 Cin8 mitótica bidireccional se acumula en grupos que se dividen y fusionan durante su motilidad. La acumulación en grupos también cambia la velocidad y direccionalidad de Cin8. Aquí, se describe un protocolo para ensayos de motilidad con Cin8-GFP purificado y análisis de propiedades móviles de moléculas individuales y grupos de Cin8.

Abstract

Los motores mitotic bipolares kinesina-5 realizan funciones esenciales en la dinámica del huso. Estos motores exhiben una estructura homo-tetramérica con dos pares de dominios motores catalíticos, ubicados en extremos opuestos del complejo activo. Esta arquitectura única permite que los motores de kinesina-5 se entrecrucen y deslicen los microtúbulos (TM) del husillo antiparalelo, proporcionando así la fuerza dirigida hacia afuera que separa los polos del husillo. Anteriormente, se creía que los motores de kinesina-5 estaban dirigidos exclusivamente al extremo superior. Sin embargo, estudios recientes revelaron que varios motores fúngicos de quinesina-5 son de extremo negativo dirigidos al nivel de una sola molécula y pueden cambiar de direccionalidad bajo diversas condiciones experimentales. La quinasina-5 Cin8 de Saccharomyces cerevisiae es un ejemplo de dicha proteína motora bidireccional: en condiciones de alta fuerza iónica, las moléculas individuales de Cin8 se mueven en la dirección del extremo inferior de los MT. También se demostró que Cin8 forma cúmulos móviles, predominantemente en el extremo inferior de los MT, y dicho agrupamiento permite que Cin8 cambie de direccionalidad y experimente una motilidad dirigida lenta y más al final. Este artículo proporciona un protocolo detallado para todos los pasos de trabajo con kinesina-5 Cin8 marcada con GFP, desde la sobreexpresión de proteínas en células de S. cerevisiae y su purificación hasta el ensayo de motilidad de molécula única in vitro . Un método recientemente desarrollado que se describe aquí ayuda a diferenciar entre moléculas individuales y grupos de Cin8, en función de su intensidad de fluorescencia. Este método permite un análisis separado de la motilidad de moléculas individuales y grupos de Cin8, proporcionando así la caracterización de la dependencia de la motilidad de Cin8 en su tamaño de racimo.

Introduction

Un gran número de eventos de motilidad dentro de las células eucariotas están mediados por la función de las proteínas motoras moleculares. Estos motores se mueven a lo largo de los filamentos citoesqueléticos, filamentos de actina y microtúbulos (TM), y convierten la energía química de la hidrólisis de ATP en fuerzas cinéticas y mecánicas necesarias para impulsar la motilidad biológica dentro de las células. La S. cerevisiae Cin8 basada en MT es una proteína motora bipolar homotetramérica de quinesina-5 que se entrelaza y desliza las MT del huso1. Cin8 realiza funciones esenciales durante la mitosis, en el ensamblaje del huso 2,3,4 y el alargamiento del huso durante la anafase 5,6,7. Anteriormente, se había demostrado que Cin8 es un motor bidireccional, que cambia la direccionalidad bajo diferentes condiciones experimentales. Por ejemplo, en condiciones de alta resistencia iónica, los motores Cin8 individuales se mueven hacia el extremo inferior de los MT, mientras que en los grupos, en los ensayos de deslizamiento MT multimotor y entre los MT antiparalelos, los motores Cin8 se mueven principalmente hacia los extremos superiores de los MT 8,9,10,11,12 . Estos hallazgos fueron altamente inesperados debido a varias razones. En primer lugar, Cin8 lleva su dominio motor catalítico en el extremo amino y anteriormente se creía que tales motores estaban dirigidos exclusivamente al extremo más, mientras que se demostró que el Cin8 estaba dirigido al extremo inferior dirigido al nivel de una sola molécula. En segundo lugar, se creía que los motores de kinesina eran unidireccionales, ya sea de extremo inferior o de extremo más, mientras que se demostró que Cin8 era bidireccional, dependiendo de las condiciones experimentales. Finalmente, debido a la orientación MT en el huso mitótico, el papel clásico de los motores de kinesina-5 en la separación de los polos del husillo durante el ensamblaje del husillo y la anafase B solo podría explicarse por su motilidad dirigida de extremo superior en los MT que se entrecruzan 1,13. Después de los primeros informes sobre la bidireccionalidad de Cin8, se demostró que algunos otros motores de kinesina son bidireccionales 14,15,16, lo que indica que la motilidad bidireccional de los motores de quinesina puede ser más común de lo que se creía anteriormente.

Se ha informado previamente que en las células, Cin8 también se mueve de manera bidireccional8, apoyando la noción de que la motilidad bidireccional de algunos motores de quinesina-5 es importante para sus funciones intracelulares. Además, dado que los tres motores de quinesina-5 que se informó que eran bidireccionales son de células fúngicas, recientemente se ha propuesto un posible papel para la bidireccionalidad de los motores de quinesina-5 en tales células10. Según este modelo, en la mitosis cerrada de las células fúngicas, donde la envoltura nuclear no se descompone durante la mitosis, los motores de kinesina-5 proporcionan la fuerza inicial que separa los polos del huso antes del ensamblaje del huso. Para realizar esta tarea, antes de la separación de los polos del husillo, los motores de kinesina-5 se localizan cerca de los polos del husillo, por su motilidad dirigida de extremo negativo en MT nucleares individuales. Una vez en esta posición, los motores de kinesina-5 se agrupan, cambian la direccionalidad, capturan y entrecruzan los MT de los polos del husillo vecinos. Posteriormente, los motores de kinesina-5 proporcionan la separación inicial de los polos por motilidad dirigida de extremo más en los MT que se entrecruzan. Según este modelo, tanto la motilidad dirigida de extremo inferior en MT individuales como la motilidad dirigida de extremo más en MT reticuladas durante el deslizamiento antiparalelo son necesarias para que los motores de kinesina-5 fúngica desempeñen sus funciones en el ensamblaje del husillo 1,13.

El objetivo general del método descrito es obtener cin8 fúngico de alta pureza marcado con GFP Cin8 y realizar ensayos de motilidad de molécula única (Figura 1) mientras se analiza por separado la motilidad de moléculas individuales y grupos de Cin8. La separación entre moléculas individuales y clusters es importante ya que uno de los factores que se ha demostrado que afectan a la direccionalidad de Cin8 es su acumulación en clusters en los MTs10,12. Los ensayos de motilidad alternativos, como los ensayos de deslizamiento de superficie MT y deslizamiento MT no proporcionan información sobre la actividad de proteínas motoras individuales17,18. Los robustos métodos de ensayo y análisis de motilidad de una sola molécula descritos aquí se han aplicado con éxito para caracterizar diferentes aspectos de los motores de kinesina-5, Cin8 y Kip1 10,11,12,14,19,20.

Aquí, se presenta un protocolo detallado para la sobreexpresión y purificación de Cin8, la polimerización de MT y el ensayo de motilidad de molécula única. Además, también se describen los análisis para diferenciar entre moléculas individuales y grupos de Cin8, y para determinar las velocidades de un solo motor y de clúster mediante el análisis de desplazamiento medio (DM) y desplazamiento cuadrado medio (MSD). Este protocolo tiene como objetivo ayudar a los investigadores a visualizar todos los pasos de los procedimientos y ayudar con la solución de problemas de este tipo de ensayos.

Figure 1
Figura 1: Representación esquemática del ensayo de motilidad de una sola molécula. Los MT fluorescentes biotinilados se unen a la superficie del vidrio, recubiertos con Avidin que interactúa con el BSA biotinilado a la superficie. La flecha verde representa la dirección de movimiento de moléculas individuales de Cin8 en condiciones de alta resistencia iónica. +/- representa la polaridad de la MT. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Protocol

1. Preparación de tampones y reactivos Búferes -Mezcla de gotas de Leu aa: Mezclar 2 g cada uno de Adenina, Uracilo, Triptófano, Histidina, Lisina y Metionina y almacenar a temperatura ambiente. Medio selectivo de levadura con rafinosa (1 L): Mezcle 6,7 g de base de nitrógeno de levadura (con sulfato de amonio), 2 g de mezcla de gota de -Leu aa y 20 g de rafinosa en agua de doble destilación revolviendo (sin calentar) hasta que se disuelva por completo. Con un filtro de …

Representative Results

El experimento tiene como objetivo investigar las características de motilidad de la proteína motora bidireccional Cin8 de diferentes tamaños de grupo en TM individuales. La motilidad representativa de Cin8-GFP también es evidente en los kymographs de la Figura 5A, donde se muestra la posición espacial del motor a lo largo del tiempo. Para el análisis de las propiedades móviles de Cin8-GFP, primero, se asigna el tamaño del clúster (paso 4.3) a cada partí…

Discussion

En este trabajo se presenta un protocolo para el ensayo de motilidad monomolécula con la kinesina-5 Cin8 bidireccional y el análisis de motilidad. El Cin818 de longitud completa, incluida la señal de localización nuclear nativa (NLS) en el terminal C, se ha purificado del huésped nativo S. cerevisiae. Como el Cin8 es una proteína motora nuclear, la molienda de las células de S. cerevisiae bajo nitrógeno líquido se encuentra como el método más eficiente para la lisis ce…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Esta investigación fue apoyada en parte por la subvención de la Fundación de Ciencias de Israel (ISF-386/18) y la subvención de la Fundación Binacional de Ciencias de Israel (BSF-2019008), otorgada a L.G.

Materials

Adenine FORMEDIUM DOC0230
ATP Sigma A7699
Biotinylated-BSA Sigma A8549
Casein Sigma C7078
Catalase (C40) Sigma C40
Creatine-Kinase Sigma C3755
Dithiothreitol (DTT) Sigma D0632
EDTA Sigma E5134
EGTA Sigma E4378
Fluorescence filter set for GFP Chroma 49002: ET-EGFP (FITC/Cy2)
Fluorescence filter set for Rhodamine Chroma 49004: ET-CY3/TRITC
Fluorescence inverted microscope Zeiss Axiovert 200M
Galactose Tivan Biotech GAL02
Glucose Sigma G8270
Glucose Oxidase Sigma G7141
Glycerol Sigma G5516
GlycylGlycine Merck G0674
GMPCPP Jana Bioscience Nu-405L
GTB Cytoskeleton BST01-010
GTP Sigma G8877
Histidine Duchefa Biochemie H0710.0100
ImageJ-FIJI software https://imagej.net/plugins/trackmate/ version 2.1.0/1.53c; Java 1.8.0_172 [64-bit] for Windows 10
Imidazole Sigma I0125
InstantBlue Coomassie Protein Stain Abcam ab119211
Lens Zeiss 100x/1.4 oil DIC objective
Lysine FORMEDIUM DOC0161
Magnesium Chloride Sigma M8266
Methionine Duchefa Biochemie M0715.0100
Neo Andor Technologies sCMOS camera
NeutraAvidin Life A2666
Ni-NTA Agarose Invitrogen R901-15
Phospho-Creatine Sigma P1937
Pipes Sigma P1851
Pluronic acid F-127 (poloxamer) Sigma P2443
Potassium Chloride Sigma P9541
Raffinose Tivan Biotech RAF01
Size Exclusion chromatography instument GE Healthcare AKTA Pure
Spectrophotometer ThermoFisher Scientific NanoDrop
Superose-6 10/300 GL GE Healthcare 17-5172-01
Tris Roshe 10708976001
Triton X-100 Sigma T8787
Tryptophan Duchefa Biochemie T0720.0100
Tubulin protein Cytoskeleton T240
Tubulin, biotinylated Cytoskeleton T333P
Tubulin, TRITC Rhodamine Cytoskeleton TL530M
Uracil Sigma U0750-100G
Yeast nitrogen base FORMEDIUM CYN0401S
α-GFP antibody Santa Cruz Biotechnology SC8036
β-mercaptoethanol Sigma M3148

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Cite This Article
Pandey, H., Zvagelsky, T., Popov, M., Sadan, M., Yanir, N., Goldstein-Levitin, A., Siegler, N., Hershfinkel, S., Abraham, Y., Avraham, R., Gheber, L. A., Gheber, L. Motility of Single Molecules and Clusters of Bi-Directional Kinesin-5 Cin8 Purified from S. cerevisiae Cells. J. Vis. Exp. (180), e63425, doi:10.3791/63425 (2022).

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