Лекарственно-индуцированное повреждение печени (DILI) является основной причиной лекарственной недостаточности. Был разработан протокол для точного прогнозирования ответственности DILI соединения с использованием микрофизиологической системы печени (MPS). Модель печени использует кокультуру первичных печеночных клеток и трансляционно значимых конечных точек для оценки клеточных реакций на лечение.
DILI является основной причиной истощения в разработке лекарств с более чем 1000 одобренными FDA препаратами, которые, как известно, потенциально вызывают DILI у людей. К сожалению, DILI часто не обнаруживается до тех пор, пока лекарства не достигнут клинических стадий, что ставит под угрозу безопасность пациентов и приводит к значительным потерям для фармацевтической промышленности. Принимая во внимание, что стандартные 2D-модели имеют ограничения в обнаружении DILI, важно разработать модели in vitro, которые являются более прогностическими для улучшения переводимости данных. Чтобы детально понять причинно-следственную связь и механистические аспекты DILI, была разработана MPS печени человека, состоящая из первичных паренхиматозных и непаренхиматозных клеток печени человека (NPC) и культивируемая в 3D-микротизю на инженерном каркасе под перфузией. Криоконсервированные первичные человеческие гепатоциты (PHH) и клетки Купфера (HKCs) кокулировались в виде микротиз в платформе MPS в течение двух недель, и каждое интересующее соединение повторно дозировалось на микроткани печени при семи тестовых концентрациях в течение четырех дней. Были проанализированы функциональные специфические для печени конечные точки (включая клинические биомаркеры, такие как аланинаминотрансфераза, АЛТ) для оценки функции печени. Острое и хроническое воздействие соединений различной степени тяжести DILI может быть оценено путем сравнения реакций на одиночные и многодозированные микроткани. Методология была подтверждена широким набором тяжелых и умеренно гепатотоксических соединений. Здесь мы показываем данные по пиоглитазону и троглитазону, известным гепатотоксическим соединениям, изъятым с рынка для возникновения печеночной недостаточности. В целом, было показано, что модель MPS печени может быть полезным инструментом для оценки DILI и его связи с изменениями функции печени. Модель может быть дополнительно использована для оценки того, как новые соединения ведут себя в различных подгруппах пациентов и как на профили токсичности могут влиять состояния заболевания печени (например, вирусный гепатит, жировая болезнь печени).
DILI остается наиболее распространенной причиной острой печеночной недостаточности в США и Европе и является основной причиной истощения соединений в процессе разработки препарата1. Почти все классы лекарств могут вызывать гепатотоксичность, причем агенты центральной нервной системы и антибиотики являются наиболее распространенными методами лечения, которые вызывают DILI у пациентов2. Медикаментозная гепатотоксичность обусловлена сложным взаимодействием генетических, негенетических и экологических факторов, приводящих к гибели гепатоцитов и других типов клеток печени, включая холангиоциты и эндотелиальные клетки 1,3.
Агенты, вызывающие DILI, могут быть классифицированы двумя способами: те, которые вызывают предсказуемое дозозависимое повреждение печени, или те, которые вызывают идиосинкразический DILI, который является редким и развивается независимо от дозы препарата, или пути, или продолжительности введения, но отвечает за до шестой части всех острых печеночных недостаточностей в США только4. К сожалению, DILI часто не обнаруживается до тех пор, пока лекарства не достигнут клинических стадий процесса разработки лекарств. Ранг повреждения печени, вызванный лекарственными средствами (или DILIrank), состоит из более чем тысячи одобренных FDA лекарств, которые разделены на четыре класса в соответствии с их потенциалом вызывать DILI, и их использование у пациентов должно тщательно контролироваться5.
Изучение механизмов гепатотоксичности препарата остается очень сложным, и поэтому для изучения механизмов DILI было разработано множество доклинических моделей. Современные модели in vitro и in vivo, используемые для прогнозирования DILI в доклиническом развитии, имеют несколько ограничений для обеспечения понимания сложных, многогранных взаимодействий в живом человеческом теле. Раковые печеночные клеточные линии (т.е. HepG2, HepaRG), культивируемые в 2D, все еще используются на ранних стадиях разработки лекарств для оценки токсичности соединений-кандидатов6. Тем не менее, эти клеточные линии поступают от отдельных доноров и показывают аномальные уровни функции печени и не всегда проявляют высокую чувствительность к обнаружению DILI 7,8. В качестве альтернативы раковым печеночным клеточным линиям PHH лучше представляют физиологию печени человека, если их правильно культивировать in vitro, хотя с их культурой существует несколько ограничений, таких как короткое время инкубации с лекарствами, относительно короткая продолжительность жизни, потеря экспрессии генов печени и изменения метаболических функций лекарств 9,10,11 . PHH могут культивироваться на белках внеклеточного матрикса в стандартных 2D-пластинах клеточных культур, но в качестве недостатка быстрое снижение их функции означает, что они имеют низкую чувствительность (<50%) для прогноза DILI12.
С другой стороны, тестирование на животных моделях является медленным, дорогостоящим и нуждается в межвидовом переводе для экстраполяции прогнозирования на людей. Большинство недавно разработанных препаратов не получают одобрения, что делает этот процесс дорогостоящим и рискованным5. Кроме того, для тестирования новых специфических для человека модальностей животные модели менее подходят из-за последовательности генов или различий в иммунологическом ответе по сравнению с людьми13.
Следовательно, интерес к более продвинутым трехмерным (3D) моделям печени in vitro экспоненциально вырос. Культивирование PHH как сфероидальных структур, генерируемых гравитационной агрегацией в висячих каплях или на сверхнизких поверхностях крепления, представляет собой высокопроизводительный метод оценки сложных обязательств14. Сфероиды PHH использовались для оценки DILI в болезненном фоне (например, стеатоз и холестаз)15. Было разработано большое разнообразие моделей, включающих покрытые микроструктурированные кокультуры гепатоцитов со стромальными фибробластами16, 3D-биопечатные ткани печени17, 3D сфероидные культуры с печеночными непаренхимальными клетками15 или без них. Однако все эти методы все еще имеют недостатки, и культивирование PHH в более физиологически значимой микросреде может обеспечить им более высокий уровень функциональности в течение длительных периодов времени, чтобы позволить исследовать длительное воздействие потенциальных гепатотоксикантов. Кроме того, для улучшения трансляционной релевантности любой продвинутой культуры PHH in vitro необходимо использовать клинически значимые функциональные конечные точки или биомаркеры выхода токсичности, чтобы можно было сравнивать данные in vivo или клинические сценарии18.
В этом исследовании мы оценили, может ли MPS, также известный как Organ-on-a-Chip (OOC), модель печени in vitro быть использована для понимания подробных механистических аспектов токсичности печени. Ранее было показано, что MPS поддерживает высокофункциональные 3D-микротизы печени под течением до 4 недель19. Система была недавно протестирована FDA и показала высокую воспроизводимость при выполнении лекарственной токсичности, метаболизма и внутриклеточного накопления20. Более того, по сравнению со сфероидами и сэндвич-культурами система имела более стабильную функцию и более высокую чувствительность при обнаружении токсичности нескольких препаратов20. На сегодняшний день MPS используется в широком спектре применений, которые охватывают ADME21, моделирование заболеваний (HBV22, NAFLD23,24,25) и лекарственно-лекарственные взаимодействия26, что потенциально делает его очень подходящим для оценки острого и хронического DILI. Технология, представленная здесь, предлагает альтернативу для сокращения разрыва между более традиционными клеточными культурами и моделями на животных и клиническими испытаниями на людях, продвигаясь к моделированию биологических условий человека для поддержки оценки токсичности печени соединений-кандидатов на доклинических стадиях процесса разработки препарата.
MPS предназначены для рекапитуляции функциональных единиц органов человека in vitro и были разработаны для устранения ограничений обычных 3D-моделей клеточных культур27. Печень является одним из наиболее моделируемых органов с использованием MPS, и было разработано большое разнообразие систем. Печень человека отвечает за метаболизм лекарств и генерацию токсичных метаболитов лекарств, и ее функция является ключевым элементом для моделирования разработки лекарств, включая оценку ответственности DILI соединений28. Здесь мы ввели новый метод оценки DILI с использованием печеночного MPS; протокол позволяет искать механистическую информацию для каждого анализируемого соединения, чтобы определить, как оно может вызвать DILI, а также является высокочувствительным и надежным анализом. Микроткани печени образуются в пластинах MPS, которые представляют собой кокультуру PHH и HKCs и являются высокофункциональными с высоким уровнем производства альбумина и мочевины, а также высокой активностью CYP3A4 по сравнению со стандартными моделями печени in vitro 20.
Хотя модель DILI, описанная здесь, может служить полезным инструментом на более поздних этапах доклинического тестирования в процессе разработки лекарств, она также имеет несколько ограничений. Поскольку большинство MPS в настоящее время доступны на рынке, это платформа с низкой пропускной способностью и, следовательно, более сложная в использовании для крупномасштабных мероприятий по скринингу наркотиков. Состоящая из микротравм, образованных кокультурными PHH и HKCs, модель DILI также не может полностью охватить сложность печени человека, и дальнейшая оптимизация путем включения различных типов клеток (например, иммунных клеток) была бы полезна для повышения ценности существующей модели. Этот одноорганный MPS также может быть объединен с другими платформами органов, которые могут иметь общую среду и допускать перекрестные помехи органов на клеточном или эндокринном уровне, и это может помочь лучше понять механистическое понимание токсичности, не ограничивающееся только самой печенью. Кроме того, как и любая относительно новая технология, она может считаться дорогостоящей и, следовательно, ограниченной доступностью.
MPS – это платформа, используемая для разработки органотипических моделей одиночных или многочеловеческих тканей. Система состоит из контроллера, пуповинного кабеля и драйвера MPS, в который вставлена пластина (рисунок 5A). Каждая пластина MPS печени имеет 12 независимых открытых скважин для культивирования первичных клеток печени в 3D на инженерных каркасах. Таким образом, система проверяется QC, и пластины грунтуются в день -1, PHH и HKC высеиваются на пластинах в нулевой день (рисунок 5B, см. 1). Встроенные микронасосы облегчают циркуляцию клеточных культуральных сред через каркасы, облегчая образование 3D-микротравм (рисунок 5B, см. 2). Сформированные микроткани получают QC на 4-й день, дозируют с различными концентрациями каждого соединения каждые 48 ч в течение 4 дней и анализируют на биомаркеры конечных точек на 8-й день (рисунок 5C). Экспериментальная временная шкала анализа DILI на пластине MPS изображена на рисунке 5D.
Рисунок 5: Микрофизиологическая система и экспериментальная временная шкала стандартного анализа DILI. (A) Микрофизиологическая система с ее компонентами: контроллером (1), пуповинным кабелем (2), док-станцией (3), драйвером MPS (4) и пластиной LC12 (5). (B) Посев PHH и HTC на пластину LC12 в день 1 (1) и встроенные микронасосы облегчают циркуляцию среды для культивирования клеток с настраиваемыми скоростями потока через 3D-микроткани, засеянные на каркасах (2). (C) Снос строительных лесов в конце исследования. D) Экспериментальная временная шкала. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
При выполнении протокола важно, чтобы перед запуском была выполнена надежная проверка контроля качества системы, проверка правильной работы системы, а расходные пластины визуально проверяются и эффективно грунтуются, чтобы обеспечить равномерную функциональность во всех скважинах. Наличие высококачественных первичных клеток человека имеет важное значение для этого протокола, поскольку гепатоциты, как известно, последовательно придерживаются в экспериментах с клеточными культурами и образуют 3D-взаимодействия. Оттаивание этих клеток также является критическим шагом, так как первичные гепатоциты не должны быть повторно суспендированы пипетным действием, поскольку это может быстро привести к гибели клеток. Жизнеспособность клеток выше 85% имеет решающее значение для успешного посева, так как большое количество клеточного мусора будет мешать образованию 3D-микротизнеса. Проверка КК сформированных микротизов печени на 4-й день также важна, и пользователь должен убедиться, что измерены приемлемые уровни ЛДГ и мочевины, поскольку параметры вне диапазона могут указывать на некачественное образование тканей и позволяют легко устранять неполадки. Наконец, гидрокортизон, используемый в среде клеточной культуры, должен быть приготовлен свежим в день использования, чтобы предотвратить любую нежелательную деградацию, которая может повлиять на функциональность клеточной культуры, поскольку это требуется для поддержания метаболической функциональности гепатоцитов.
Несмотря на значительную сложность, МПС печени не содержит всех типов клеток печени человека. Можно добавить дополнительные типы клеток в модель 24,29 для повышения физиологической значимости, но они должны быть добавлены только с четким обоснованием контекста использования. Для изучения DILI PHH являются ключевым типом клеток, и включение ГКЦ в эту модель позволяет определить некоторые иммунологические ответы. Следует также отметить, что PHH, выделенные из печени человека, и коммерчески доступные криоконсервированные PHH, как правило, демонстрируют некоторые вариации от партии к партии. Здесь мы продемонстрировали, что этот протокол дает воспроизводимые результаты при использовании с высококачественными препаратами клеток. Тем не менее, можно было бы ожидать некоторого разнообразия лотов, и это можно было бы еще больше преодолеть, используя объединенные партии нескольких доноров. Эти ограничения могут быть преодолены путем использования гепатоцитоподобных клеток, дифференцированных от iPSC, которые повторяют многие функциональные свойства PHH и которые были использованы в процессе разработки лекарственного средства30. ГХК также демонстрируют вариативность многих партий и высокий уровень активации при оттаивании; таким образом, доноры ГХК предварительно валидируются внутри компании перед использованием в экспериментальной клеточной культуре (кокультура с валидированными PHH) и должны иметь низкие уровни активации после оттаивания; это оценивается путем измерения биомаркеров IL-6 и TNF-альфа (см. Дополнительный материал).
Представленные здесь данные подтверждают, что анализ может точно обнаруживать DILI, помогая идентифицировать гепатотоксиканты, которые могут не быть обнаружены 2D10,11 и даже некоторыми 3D-моделями. Данные, полученные с помощью MPS, по-прежнему не используются в качестве стандарта фармацевтической промышленностью для нормативных представлений или скрининга лекарств из-за отсутствия стандартизации и гармонизации процессов, включая воспроизводимость между сайтами20. Данные и экспериментальные подходы, продемонстрированные здесь, решают эту проблему, показывая, что модель печени может использоваться регулярно и надежно в скринингах DILI для точного прогнозирования ответственности новых соединений.
Путем измерения диапазона конечных точек для получения «сигнатуры гепатотоксичности», помогая идентифицировать соединения с различными уровнями беспокойства DILI (включая соединения, не обнаруживаемые другими методами in vitro) и их механизмы токсичности. Эта технология может сократить разрыв между традиционной клеточной культурой и животными моделями с одной стороны и клиническими испытаниями на людях, продвигаясь к моделированию биологических условий человека для доклинической оценки токсичности печени в рамках процесса разработки препарата.
The authors have nothing to disclose.
CN Bio Innovations Ltd. финансировала это исследование.
24 well cell culture cluster plates flat bottom | Corning | 3524 | |
96 well clear assay plates, flat bottom clear plastic | Greiner | 655101 | |
96 well plates black flat bottom | Corning | 3915 | |
96 Well White/Clear Bottom Plate, TC Surface | ThermoScientific | 165306 | |
Advanced DMEM (1x) | Gibco | 12491015 | Cell culture media. |
AssayMax Albumin ELISA Kit | AssayPro | EA3201-1 | Dilution 1:250. Time point Day 4, 6, and 8. |
Cell Maintenance Cocktail B, (Primary Hepatocyte Maintenance Supplements) | Gibco | CM4000 | |
CellTiter-Glo 3D Cell Viability Assay | Promega | G9682 | Dilution 1:1. Time point Day 8. |
Chlorpromazine HCl | Sigma Aldrich | C8138 | |
Chromacol blue lids, 9 mm Autosampler Vial Screw Thread Caps | ThermoScientific | 9-SCK(B)-ST1 | glass vial |
Chromacol vials, 9 mm Clear Glass Screw Thread Vials | ThermoScientific | 2-SVW | |
Class 2 Microbiological Safety Cabinets – Trimat2 1500 exhaust | Contained Air Solutions | ||
Conical tubes 50 mL | Greiner | 227261 | |
Cryopreserved Hepatocyte Recovery Medium (CHRM) | ThermoFisher Scientific | Gibco CM7000 | |
Cryopreserved primary human hepatocytes | BioIVT Europe | Lot. RAS | |
CytoTox 96 Cytotoxicty (LDH) Assay Kit | Promega | G1781 | Dilution – none. Time point Day 4, 6 and 8 |
>Data analysis model used to generate the graph and EC:50 curves was nonlinear regression (curve fit) asymmetric sigmoidal, 5PL, where X is log(concentration | GraphPad Prism 9 | ||
Disposable PES Filter Units 500mL | Fisher Scientific | 15913307 | |
Disposable Pipette Basins 50ml | Fisher Scientific | 12369175 | |
DMSO (Dimethyl sulfoxide) | Sigma-Aldrich | Sigma D2650 | |
Dulbeco’s Phosphate Buffered Saline without Ca2+ and Mg2+ (D-PBS) | ThermoFisher Scientific | 14190-144 | |
Easy Reader Conical Polypropylene Centrifuge Tubes 15 mL | Fisher Scientific | 11889640 | |
Foetal bovine serum | Gibco | 10500064 | |
Human ALT ELISA Kit | Abcam | ab 234578 | Dilution 1:5. Time point Day 6 and 8. |
Human Cryopreserved Kupffer Cells | Lonza Europe | Lot. 190088KC | |
hydrocortisone | Merck | H0888-1G | |
Incubators models: New Brunswick Galaxy 170 S, New Brunswick Galaxy 170 R and CellXpert® C170. | Eppendorf | All serviced yearly; paperwork available upon request. | |
Inverted Microscope | Leica DMIL LED | ||
MPS know as Organ-on-a-Chip (OOC) | CN Bio Innovations Ltd. | ||
MPS LC-12 plate | CN Bio Innovations Ltd. | ||
Neubauer Improved C-Chip Disposable Haemocytometer (2 channel) | Cambridge Bioscience | DHC-N01-50 | |
P450-Glo CYP3A4 Assay and Screening System | Promega | V9002 | Dilution – none. Time point Day 8 |
PhysioMimix MPS platform | CN Bio Innovations Ltd. | ||
Pioglitazone | MedChemExpress Tocris | HY-13956/CS-1700 | |
Quantichrom Urea Assay Kit – Bioassay systems | Bioassay Systems | DY970-05 | Dilution 1:2 if initial reading is too high. Time point Day 4, 6 and 8. |
Silica gel | Sigma-Aldrich | S7625 | |
Software used to analyse and generate all the graphs was | GraphPad Prism 9 | ||
Stripettes 10 mL | Fisher Scientific | 11839660 | |
Stripettes 25 mL | Fisher Scientific | 11839181 | |
Thawing plate Cocktail A, (Primary Hepatocyte Thawing and Plating Supplements) | Gibco | CM3000 | |
Troglitazone | MedChemExpress Tocris | 97322-87-7 | |
Trypan Blue Solution, 0.4% | Gibco | 15250061 | |
Tubes 1.5 mL | Greiner | 616201 | |
Weighing balance – model PA214C and AV213C | Ohaus Corp |