本プロトコールは、培養ラット海馬ニューロンおよび3D構造化照明顕微鏡(3D−SIM)を用いて軸索初期セグメントの膜周期骨格のアクチン環および他の成分を視覚化および測定する方法を記載する。
軸索初期セグメント(AIS)は、活動電位が開始する部位であり、体性樹状貨物を選別することによってニューロン極性の維持に寄与する輸送フィルターおよび拡散障壁を構成する。周期的アクチン環を含む膜周期骨格(MPS)は、構造タンパク質および異なるイオンチャネルを含む様々なAISタンパク質を固定するための足場を提供する。最近のプロテオミクス的アプローチでは、かなりの数の新規AIS成分が同定されているが、MPSの構造とその個々の構成要素の役割の詳細は欠けている。MPS内の個々のアクチン環間の距離(〜190nm)は、MPSの構造的詳細を解明するために超解像顕微鏡技術の採用を必要とする。このプロトコルは、培養ラット海馬ニューロンを使用して、3D構造化照明顕微鏡(3D-SIM)を用いて膜下アクチン環に対するMPSにおけるAISタンパク質の正確な局在を調べるための方法を記載している。さらに、個々の成分の周期性およびアクチン環に対するそれらの位置を定量的に評価するための分析的アプローチも記載されている。
軸索初期セグメント(AIS)は、脊椎動物ニューロンの近位軸索の短く、一意に専門化された領域である1。AISは、ソマト樹状貨物2,3,4,5,6,7を選別することにより、ニューロン極性の維持に不可欠な輸送フィルターと拡散バリアを備える。さらに、AISのユニークな構造により、活動電位開始部位としての機能を容易にする電位依存性イオンチャネルのクラスターを収容することができます8。非常に安定した構造複合体は、AISのユニークな機能の根底にあります。過去10年間の研究により、スペクトリンによって接続されたアクチン環を含む膜周期骨格(MPS)の存在が明らかになり、さまざまなAISタンパク質を固定するための足場が提供されました9,10。
MPS(〜190nm)9,10におけるアクチン環間の距離は、従来の光学顕微鏡の分解能限界以下である。電子顕微鏡を使用してMPSを視覚化しようとする初期の試みは、MPSの構造を保存するのに失敗したため、失敗した。したがって、超解像顕微鏡技術は、MPS11の構造の詳細のいくつかを解明する上で非常に貴重であることが証明されています。しかし、AIS構造複合体、その構成要素の同一性と機能、およびその時空間調節の理解はまだ不完全である。最近のプロテオミクス研究は、AISの構造成分に近いAISに局在するタンパク質のかなりのリストを作成することに成功しました12,13。それでも、AIS複合体におけるそれらの機能の詳細と正確な位置は欠けています。したがって、超解像顕微鏡技術は、他のMPS成分に対するこれらのタンパク質の正確な位置を調べ、それらの機能を調べるために不可欠なツールとして役立つ。いくつかの光学顕微鏡技術は、光の回折限界よりも高い分解能を達成することができ、いくつかは単一分子を局在化させることさえできる。しかし、これらの技術の多くは、通常、特殊な蛍光色素またはイメージングバッファーを必要とし、画像取得にはしばしば時間がかかります14。
3D構造化照明顕微鏡(3D-SIM)は、その使いやすさと簡単なサンプル調製要件により、イメージングやサンプル調製のための特別な試薬を必要とせず、幅広い蛍光色素やサンプルでうまく動作し、複数の色で容易に実装でき、生細胞イメージングが可能です15。SIMが提供する可能な限り最高の解像度(〜120nm)は、他の多くの超解像技術と比較して低いが、多くのアプリケーション(例えば、ニューロン内のMPSの成分を解像する)には十分である。したがって、SIMが適切な選択肢であるかどうか、またはさらに高い解像度が必要かどうかを判断するために、特定のアプリケーションの要件を考慮することが重要です。ここでは、Abouelezzらで実施されているように、培養海馬ニューロンおよび3D構造化照明顕微鏡(3D-SIM)を使用して、MPSにおけるアクチン環に対する推定AISタンパク質の位置および組織を調べるためのプロトコルが記載されている16。
ここで説明するプロトコルは、超解像技術を使用してMPSタンパク質を視覚化および測定する方法を提供します。アクチンリングおよび他のMPS成分は〜190nm9,10の周期性を示すので、従来の回折制限イメージングアプローチはMPSの詳細を明らかにすることができない。いくつかの顕微鏡セットアップは、回折が制限された構造を超解像で解決する可能?…
The authors have nothing to disclose.
ピルタ・ホトゥライネン博士は、この原稿を準備する上で非常に貴重な批判的なコメントで認められています。リマンテ・ミンケビシエネ博士は、元の実験に使用されたニューロン培養物の準備における彼女の助けで認められています。全てのイメージングは、バイオメディカムイメージングユニットで行った。この研究は、アカデミー・オブ・フィンランド(D.M、SA 266351)と博士課程Brain & Mind(A.A.)の支援を受けました。
24-well plates | Corning | 3524 | |
4% Paraformaldehyde | |||
Alexa-488 Phalloidin | ThermoFisher | A12379 | |
Alexa-647 anti-mouse | ThermoFisher | A31571 | |
Anti-Ankyrin G antibody | UC Davis/NIH NeuroMab Facility, Clone 106/36 | 75-146 | |
Anti-MAP2 antibody | Merck Millipore | AB5543 | |
B-27 | Invitrogen | 17504044 | |
Bovine Serum Albumin (BSA) | BioWest | P6154 | |
Deltavision OMX SR | GE Healthcare Life Sciences | N/A | |
Fiji software package | ImageJ | ||
GNU Octave | GNU | ||
High performance coverslips | Marienfeld | 117530 | |
Immersion Oil Calculator | Cytiva Life Sciences | https://tinyurl.com/ImmersionOilCalculator | |
L-Glutamine | VWR | ICNA1680149 | |
MATLAB R2020a | Mathworks | ||
Neurobasal media | Invitrogen | 21103049 | |
OMX SR | Delta Vision OMX | ||
Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | |
ProLong Gold mounting media | Invitrogen | P10144 | |
softWoRx Deconvolution | Cytiva Life Sciences | ||
Superfrost Slides | Epredia | ISO 8037/1 | |
TetraSpeck microspheres 0.1 µm | ThermoFisher | T7279 | |
Triton-X | Sigma | X100 |