DetectSyn ist ein unvoreingenommener, schneller fluoreszierender Assay, der Veränderungen der relativen Synapsenzahl (prä- und postsynaptisches Engagement) über Behandlungen oder Krankheitszustände hinweg misst. Diese Technik verwendet eine Proximity-Ligationstechnik, die sowohl in kultivierten Neuronen als auch in festem Gewebe eingesetzt werden kann.
Synapsen sind der Ort der Kommunikation zwischen Neuronen. Die Stärke des neuronalen Schaltkreises hängt mit der synaptischen Dichte zusammen, und der Abbau von Synapsen ist charakteristisch für Krankheitszustände wie schwere depressive Störungen (MDD) und Alzheimer-Krankheit. Traditionelle Techniken zur Untersuchung der Synapsenzahlen umfassen die genetische Expression von fluoreszierenden Markern (z. B. grün fluoreszierendes Protein (GFP)), Farbstoffe, die ein Neuron füllen (z. B. Carbocyaninfarbstoff, DiI), und der immunfluoreszierende Nachweis von Wirbelsäulenmarkern (z. B. postsynaptische Dichte 95 (PSD95)). Ein wichtiger Vorbehalt gegenüber diesen Proxy-Techniken ist, dass sie nur postsynaptische Veränderungen identifizieren. Eine Synapse ist jedoch eine Verbindung zwischen einem präsynaptischen Terminal und einer postsynaptischen Wirbelsäule. Der Goldstandard zur Messung der Synapsenbildung/-elimination erfordert zeitaufwändige Elektronenmikroskopie- oder Array-Tomographie-Techniken. Diese Techniken erfordern spezielle Schulungen und teure Ausrüstung. Darüber hinaus kann nur eine begrenzte Anzahl von Neuronen beurteilt werden und wird verwendet, um Veränderungen in einer ganzen Gehirnregion darzustellen. DetectSyn ist eine schnelle fluoreszierende Technik, die Veränderungen der Synapsenbildung oder -eliminierung aufgrund eines Krankheitszustands oder einer Arzneimittelaktivität identifiziert. DetectSyn verwendet einen schnellen Proximity-Ligationsassay, um nebeneinander liegende prä- und postsynaptische Proteine und die Standard-Fluoreszenzmikroskopie nachzuweisen, eine Technik, die den meisten Labors leicht zur Verfügung steht. Die fluoreszierende Detektion der resultierenden Puncta ermöglicht eine schnelle und unvoreingenommene Analyse von Experimenten. DetectSyn liefert repräsentativere Ergebnisse als die Elektronenmikroskopie, da größere Bereiche analysiert werden können als eine begrenzte Anzahl fluoreszierender Neuronen. Darüber hinaus funktioniert DetectSyn für in vitro kultivierte Neuronen und festsitzende Gewebeschnitte. Schließlich wird eine Methode bereitgestellt, um die von dieser Technik gesammelten Daten zu analysieren. Insgesamt bietet DetectSyn ein Verfahren zur Erkennung relativer Veränderungen der Synapsendichte über Behandlungen oder Krankheitszustände hinweg und ist zugänglicher als herkömmliche Techniken.
Synapsen sind die grundlegende Einheit der Kommunikation zwischen Neuronen1. Viele Synapsen zwischen Neuronen innerhalb derselben Regionen führen zu Schaltkreisen, die das Verhalten vermitteln2. Synapsen bestehen aus einem präsynaptischen Terminal von einem Neuron, das Neurotransmitter oder Neuropeptide freisetzt, die Informationen an postsynaptische Rezeptoren eines anderen Neurons weiterleiten. Die Summe präsynaptischer Signale bestimmt, ob das postsynaptische Neuron ein Aktionspotential auslöst und die Nachricht an andere Neuronen weitergibt.
Synaptopathologie, der Abbau von Synapsen, entsteht bei Krankheiten und Störungen, die durch ein vermindertes neuronales Volumen gekennzeichnet sind, wie Alzheimer-Krankheit und schwere depressive Störung, was zu Schaltkreisen führt, die nicht mehr optimal funktionieren 3,4,5. Die Wiederherstellung der Synapsendichte liegt wahrscheinlich der Wirksamkeit potenzieller Behandlungen für diese Erkrankungen zugrunde. Zum Beispiel wurde kürzlich gezeigt, dass zunehmende Synapsen der Verhaltenswirksamkeit von schnellen Antidepressivazugrunde liegen 6. Um mögliche synaptopathologische Behandlungen schnell zu screenen, benötigen Forscher Techniken, die Veränderungen der Synapsenzahlen schnell identifizieren.
Aktuelle Methoden sind entweder zeitaufwendig und teuer (Elektronenmikroskopie, Array-Tomographie) oder sie untersuchen nur postsynaptische Veränderungen, ohne präsynaptische Interaktion (Wirbelsäulenanalysen, Immunfluoreszenz/-kolokalisation) einzubeziehen. Farbstoffe wie DiI oder fluoreszierende Proteine wie GFP helfen, Neuronen sichtbar zu machen und postsynaptische Stacheln zu charakterisieren. Die Wirbelsäulenanalyse verwendet jedoch von Forschern definierte Verhältnisse, um die Morphologie zu bestimmen, was die Reproduzierbarkeit verringernkann 7. Darüber hinaus wird immer noch aufgedeckt, wie sich die verschiedenen Wirbelsäulenklassen auf funktionelle Synapsen beziehen8. Die Wirbelsäulenbildung kann vorübergehend sein und die postsynaptische Plastizität widerspiegeln, aber diese Stacheln könnten eliminiert werden, bevor sie sich mit einem präsynaptischen Neuron9 zu einer Synapse stabilisieren.
Die Kolokalisation bietet einen besseren Proxy für Synapsen als die Wirbelsäulenanalyse, da man eine Immunstrukturierung für präsynaptische und postsynaptische Proteine durchführen kann. Synaptische Proteine können jedoch niedrige Kolokalisationswerte ergeben, da die Proteine nebeneinander stehen und sich möglicherweise nicht konsistent überlappen. Da die Proteine nicht vollständig überlagert sind, können Kolokalisierungstechniken aufgrund dieser fehlenden Informationen Änderungen der Synapsenbildung möglicherweise nicht genau messen. Obwohl sowohl die Elektronenmikroskopie (EM) als auch die Array-Tomographie hochauflösende Bilder von Synapsen liefern, sind sie zeitaufwendig. EM erfordert außerdem spezielle Ausrüstung, und die Forscher sind auf kleine Gewebevolumina für ein bestimmtes Experiment beschränkt. Während die Array-Tomographie elegant die Möglichkeit bietet, auf ultradünne Abschnitte nach vielen Proteinen zu suchen und mit EM10 kombiniert werden kann, kann diese Technik zu arbeitsintensiv sein und den Rahmen von Experimenten sprengen, die schnell nach Veränderungen der Synapsenbildung suchen müssen.
DetectSyn ist eine spezifische Anwendung des Duolink Proximity Ligation Assay. Der PLA-Assay ermöglicht den allgemeinen Nachweis von Protein-Protein-Interaktionen. DetectSyn überbrückt postsynaptische Proxy-Messungen, indem es ein fluoreszierendes Signal verstärkt, das von markierten prä- und postsynaptischen Proteinen innerhalb von 40 nm voneinander emittiert wird. Wenn sich die synaptischen Proteine innerhalb von 40 nm befinden, wie in einem synaptischen Spalt, dann hybridisieren die sekundären Antikörper, die DNA-Sonden enthalten, zu zirkulärer DNA. Diese hybridisierte zirkuläre DNA exprimiert eine fluoreszierende Sonde, die dann mit Standard-Fluoreszenzmikroskopie-Techniken amplifiziert und nachgewiesen wird (siehe Abbildung 1). Entscheidend ist, dass diese Technik im Gegensatz zu EM und Array-Tomographie keine spezielle Ausrüstung erfordert und etwa die gleiche Zeit in Anspruch nimmt wie die Standard-Immunhistochemie. Die Zugänglichkeit dieser Technik ermöglicht es somit Forschern außerhalb forschungsintensiver Institutionen, an der synaptopathologischen Forschung teilzunehmen. Darüber hinaus kann diese Technik Veränderungen der synaptischen Dichte in mehreren Gehirnregionen innerhalb eines einzigen Experiments untersuchen und bietet eine ganzheitlichere Darstellung synaptischer Veränderungen aufgrund von Krankheit oder Behandlung.
DetectSyn ist ein Schnellassay, der einen Proximity-Ligationsassay verwendet, um Proteine innerhalb von 40 nm voneinander nachzuweisen, was den Nachweis der Synapsenbildung ermöglicht. Diese Technik verbessert aktuelle fluoreszierende Assays, die nur als Proxy-Messungen für die Synapsenbildung dienen. DetectSyn erkennt quantifizierbare Veränderungen in synaptischen Proteinen, die innerhalb von 40 nm, d.h. innerhalb des synaptischen Spalts, voneinander lokalisiert sind. Darüber hinaus ist DetectSyn kostengünstiger un…
The authors have nothing to disclose.
Diese Arbeit wurde von den National Institutes of Health NINDS R01 NS105005 (KRG) und NS105005-03S1 (KRG), dem Verteidigungsministerium USAMRMC W81XWH-14-1-0061 (KRG), NIAAA R01AA016852, NIAAA T32AA007565 (CFH) und einem Zuschuss von FRAXA Research (CFH) und der Alzheimer’s Association, AARG-NTF-21-852843 (KRG), AARF-19-614794-RAPID (KRG), unterstützt.
10x PBS | Fisher Scientific | BP39920 | PBS made in house works, as well. |
24 well plates | Fisher Scientific | FB012929 | For tissue slices, pre-sterilized plates may be unnecessary. |
50 mL conical tubes | Fisher Scientific | 14-432-22 | |
Aluminium foil | Fisher Scientific | 15-078-290 | |
Chicken anti-MAP2 antibody | Abcam | ab5392 | |
Clear nail polish | Fisher Scientific | NC1849418 | Other clear nail polish works, as well. |
Cold block | Fisher Scientific | 13131012 | |
Computer workstation | HP | ||
Confocal or fluorescent microscope | Nikon | A1R HD25 | |
Donkey anti-chicken FITC | Fisher Scientific | SA1-72000 | |
Duolink donkey anti-Mouse PLUS | Sigma | DUO92001 | |
Duolink donkey anti-Rabbit MINUS | Sigma | DUO92005 | |
Duolink In Situ Detection Reagents Far Red | Sigma | DUO92013 | Contains ligation stock, amplification stock, ligase, and polymerase. |
Duolink In Situ Mounting Medium with DAPI | Sigma | DUO82040 | |
Duolink In Situ Wash Buffers, Fluorescence | Sigma | DUO82049 | Contains Wash Buffer A and Wash Buffer B; dilute Wash Buffer B to 1% in diH20 for 1% Wash Buffer B. |
Fine-tipped paintbrush | Fisher Scientific | NC9691026 | Sable hair, size 00 or 000, can also find at craft stores |
Fisherbrand Cover Glasses: Rectangles | Fisher Scientific | 12545MP | Cover glass is unnecessary for cultured neurons already on glass coverslips. |
Fisherbrand Superfrost Plus Microscope Slides | Fisher Scientific | 1255015 | For cultured neurons already on glass coverslips, Superfrost slides may be unnecessary. |
Freezer, -20°C | VWR | 76449-108 | |
Glass coverslips | Fisher Scientific | 125480 | |
Glycine | Fisher Scientific | BP381-1 | |
Image processing software | e.g. NIS Elements, ImageJ | ||
Incubator | Fisher Scientific | 15-015-2633 | |
Large petri dish, 100mm | Fisher Scientific | FB0875712 | |
Molecular grade water | Fisher Scientific | BP24701 | |
Mouse anti-Synapsin1 antibody | Synaptic Systems | 106-011 | |
Normal donkey serum | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 | |
Orbital shaker | Fisher Scientific | 02-106-1013 | |
Parafilm | Fisher Scientific | 13-374-10 | |
Pipette tips | Fisher Scientific | 02-707-025 | |
Pipettes | Fisher Scientific | 14-388-100 | Working volumes range from 3 µL to 500 µL |
Plastic pasteur pipette | Fisher Scientific | 02-708-006 | |
Precision tweezers/foreceps | Fisher Scientific | 12-000-122 | |
Rabbit anti-PSD95 antibody | Abcam | ab18258 | Other antibody pairs may work, as well, with optimization. |
Refrigerator | VWR | 76470-402 | |
Small petri dish, 60 mm | Fisher Scientific | FB0875713A | |
Timer | Fisher Scientific | 14-649-17 | |
Tween 20 | Fisher Scientific | BP337-100 |