Este protocolo demonstra um método simples e robusto para estudar na dinâmica do cone de crescimento e crescimento do axônio. Ele descreve como preparar ex vivo fisiologicamente relevantes fatias cerebrais agudas e fornece um pipeline de análise amigável.
Durante o desenvolvimento neuronal, os axônios navegam pelo ambiente cortical para chegar aos seus destinos finais e estabelecer conexões sinápticas. Cones de crescimento – as estruturas sensoriais localizadas nas pontas distais do desenvolvimento de axônios – executam esse processo. Estudar a estrutura e a dinâmica do cone de crescimento é crucial para entender o desenvolvimento axonal e as interações com o sistema nervoso central circundante (SNC) que lhe permitem formar circuitos neurais. Isso é essencial ao elaborar métodos para reintegrar axônios em circuitos neurais após lesões em pesquisas fundamentais e contextos pré-clínicos. Até agora, a compreensão geral da dinâmica do cone de crescimento é baseada principalmente em estudos de neurônios cultivados em duas dimensões (2D). Embora, sem dúvida, fundamental para o conhecimento atual da dinâmica estrutural do cone de crescimento e da resposta a estímulos, estudos 2D deturpam o ambiente fisiológico tridimensional (3D) encontrado por cones de crescimento neuronal no tecido CNS intacto. Mais recentemente, os géis de colágeno foram empregados para superar algumas dessas limitações, permitindo a investigação do desenvolvimento neuronal em 3D. No entanto, tanto os ambientes sintéticos 2D quanto os 3D carecem de sinalização dentro do tecido CNS, que direcionam a extensão e o pathfinding de axônios em desenvolvimento. Este protocolo fornece um método para estudar axônios e cones de crescimento usando fatias cerebrais organotípicas, onde os axônios em desenvolvimento encontram pistas físicas e químicas fisiologicamente relevantes. Ao combinar afinação na eletroporação uterópica e ex utero para entregar repórteres fluorescentes e pouco, juntamente com microscopia de super resolução, este protocolo apresenta um pipeline metodológico para a visualização da dinâmica do axônio e do cone de crescimento in situ. Além disso, uma descrição detalhada do kit de ferramentas da análise de dados de imagem de células vivas e de longo prazo está incluída.
Os neurônios são células altamente polarizadas que representam a unidade computacional básica no sistema nervoso. Eles recebem e emitem informações que dependem da compartimentação dos locais de entrada e saída: dendritos e axônios, respectivamente1. Durante o desenvolvimento, os axônios se estendem enquanto navegam em um ambiente complexo incrível para chegar ao seu destino. A navegação axon é guiada pelo cone de crescimento, uma estrutura sensorial localizada na ponta do axônio em desenvolvimento. O cone de crescimento é responsável por detectar pistas ambientais e traduzi-las na reorganização espacial dinâmica de seu citoesqueleto 2,3. As reações morfom mecânicas resultantes instruem o cone de crescimento a estender ou retrair-se da deixa de acionamento, levando a manobras específicas de axônio.
O entendimento atual da dinâmica da extensão do axônio e do cone de crescimento decorre de estudos que avaliam o crescimento do axônio em relação aos substratos bidimensionais (2D) 2,4,5,6,7. Esses estudos pioneiros identificaram uma interação sofisticada entre cones de crescimento e substratos de crescimento e revelaram diferenças marcantes dependentes de características de substrato, como adesivo e rigidez 8,9. Liderados por esses insights, as pistas ambientais extracelulares foram hipóteses para ditar o crescimento do axônio, com o citoesqueleto de cone de crescimento executando esse crescimento 2,10,11,12. Notavelmente, os neurônios podem estender axônios em substratos não adesivos (por exemplo, poli-lysina, poli-ornitina)13. Além disso, a rigidez do substrato pode influenciar a taxa de crescimento do axônio independente dos complexos adesivoscelulares 8. Assim, estudar a dinâmica do cone de crescimento em substratos 2D sozinhos não pode modelar com precisão o equilíbrio de forças que surgem da interação de cones de crescimento axonal com ambientes tridimensionais (3D) fisiologicamente relevantes, como os encontrados in vivo.
Para superar as limitações dos ensaios 2D, o crescimento do axônio e a dinâmica do cone de crescimento têm sido estudados em matrizes 3D 8,9. Essas matrizes representam um contexto mais fisiológico, mas permitem estudar mecanismos intrínsecos de crescimento de axônio. Permite o exame do cone de crescimento de forma unicelular em uma variedade de condições e tratamentos farmacológicos9. Em tais ambientes 3D, os axônios apresentaram dinâmicas citoesqueléticos distintas e cresceram mais rápido do que os observados nos neurônios 2Dcultivados 9. Esses estudos elegantes demonstraram a influência de uma dimensão extra na reorganização do citoesqueleto do cone de crescimento e, consequentemente, no seu comportamento.
Apesar das vantagens aparentes apresentadas pelas matrizes 3D sobre superfícies 2D no suporte ao desenvolvimento neuronal nativo e ao crescimento do axônio, elas continuam sendo um andaime sintético simplificado que não pode refletir a complexidade da dinâmica observada no tecido do sistema nervoso central (SNC). Aqui, a entrega de plasmídeos repórteres pelo ex utero e na eletroporação uteral foi combinada com a cultura de fatia organotípica cerebral e imagens de super-resolução ao vivo in situ para analisar a dinâmica do cone de crescimento dentro de um contexto fisiológico. Essa metodologia permite a visualização do desenvolvimento de axônios ao experimentar a tridimensionalidade dos ambientes in vivo e a complexidade de sua composição físico-química. Por fim, são descritos procedimentos fáceis de usar para medir a dinâmica do cone de crescimento e crescimento do axônio usando softwares comumente licenciados e disponíveis publicamente.
Como os cones de crescimento sentem e reagem ao seu ambiente circundante para coordenar a extensão e orientação simultânea do axônio ainda é uma questão de debate 3,18. Estudos pioneiros em substratos 2D forneceram um vislumbre dos mecanismos moleculares fundamentais que geram as forças que impulsionam a dinâmica do cone de crescimento durante a formação do axônio, o crescimento e a navegação 2,10,11,12,19. Mais recentemente, estudos em matrizes 3D revelaram quanta influência uma terceira dimensão tem no comportamento do cone de crescimento e, consequentemente, no crescimento do axônio 8,9. No entanto, os mecanismos intrincados que instruem a dinâmica do cone de crescimento in vivo continuam a ser minuciosamente examinados.
A preparação de culturas de fatias organotipas de cérebros IUE ou EUE é amplamente utilizada e bem documentada. Tornou-se um padrão dourado que permite aos cientistas obter insights sobre o desenvolvimento e comportamento dos neurônios no tecido cerebral vivo 20,21. De fato, esta técnica tem sido utilizada com sucesso em combinação com várias técnicas de imagem de alta resolução para visualizar processos moleculares específicos e eventos morfológicos in situ. Tais estudos incluem, mas não se limitam à formação de axônio e extensão19,22, migração neuronal cortical 19,22,23,24, dinâmica centrosome25,26, dinâmica microtúbula27, bem como a dinâmica funcional dos compartimentos pré e postssináspicos28,29.
Este protocolo aborda uma lacuna na neurobiologia experimental, visualizando a dinâmica do cone de crescimento do desenvolvimento de neurônios corticais in situ, nas culturas de fatias cerebrais agudas ex vivo e nas ferramentas para analisar os dados obtidos.
Culturas agudas de fatias cerebrais foram utilizadas para estabelecer esse protocolo porque elas (1) com alguma prática, são fáceis de gerar; (2) apresentar um sistema acessível para estudar cones de crescimento incorporados em um ambiente quase totalmente fisiológico, mas transparente o suficiente para permitir imagens de células vivas de alta resolução; (3) pode ser expandido para seu uso com uma miríade de linhas de camundongos transgênicos; (4) combinado com iUE ou EUE, fornecem potencial praticamente ilimitado para fornecer ferramentas moleculares para avaliar o desempenho de cones de crescimento e axônios in vivo sob perda/ganho de regimes de função, juntamente com repórteres fluorescentes e sondas de citoesqueleto.
Essa metodologia foi descrita no contexto tanto da UEE quanto da IUE. Embora ainda seja um método altamente confiável, o EUE resultou em uma incidência crescente de fatias cerebrais mostrando uma rede RG desorganizada em comparação com aquelas obtidas com iUE como método de entrega (Figura 4C). Distúrbios na matriz RG afetam fortemente a migração neuronal e o padrão de alongamento do axônio 30,31. Estes são parâmetros-chave que predizem onde encontrar axônios para análise em um determinado momento e o tipo de ambiente que eles estão navegando. Fatias cerebrais com uma rede RG significativamente interrompida normalmente têm prejudicado a estratificação do neurônio cortical. Isso, por sua vez, produz axônios com trajetórias caóticas. Portanto, é fortemente recomendável controlar a integridade estrutural da rede RG. Curiosamente, a má integridade estrutural se correlaciona com o aumento da idade do cérebro embrionário. De fato, tais efeitos nos embriões E12.5-E13,5 mais jovens normalmente não foram observados19.
O presente protocolo é minucioso e simples. No entanto, existem algumas etapas críticas em que é preciso ter cuidado e atenção especiais para obter resultados ideais. Estes foram expressamente observados no protocolo e incluem (1) afinar a quantidade de DNA usada na eletroporação para obter rotulagem esparsa; (2) evitar danos durante a extração de cérebros; (3) controlar a temperatura da agarose durante o invólucro cerebral; (4) solução de problemas para a porcentagem ideal de agarose para cérebros de uma determinada idade; e (5) seleção de fluoroforos, a experiência da qual se segue. Durante a otimização do protocolo, foi testado o desempenho de vários fluoroforos em células vivas em imagens in situ. As variantes monoméricas GFP EGFP e NeonGreen para a preparação dos plasmídeos marcados por LifeAct e Lyn foram escolhidas para este protocolo (Figura 5A,B). Além disso, a variante MScarlet da variante RFP foi testada e encontrada altamente adequada para esta configuração (dados não mostrados). TRFP multimédico (dimer) e ZsGreen (tetramer) (Figura 5C e Vídeo Suplementar 1, à direita) também foram testados. Estes fluoroforos super brilhantes dobráveis são recomendados quando o método requer uma rápida geração de sinal fluorescente após a entrega do DNA.
Uma prática comum no uso de culturas de fatias é utilizar fatias de diferentes cérebros para testar o controle e condições experimentais. Isso representa uma fonte inerente de variabilidade indesejada. Aqui, utilizou-se um sistema de expressão que permite modificação independente dos neurônios vizinhos e a expressão dos repórteres para identificação. Note-se que nesta demonstração (Figura 5C), não houve diferenças entre os neurônios que expressam qualquer um dos fluoroforos. No entanto, como exemplo, tal mistura plasmida combinada com uma linha de rato transgênico que abriga um gene sensível à Cre rotulará com neurônios tRFP (sensíveis a Dre) que permaneceram como tipo selvagem. Em contraste, o ZsGreen (também sensível ao Cre) rotulará os neurônios recombinados. Assim, cones de crescimento dos dois genótipos diferentes, e provavelmente também fenótipos, poderiam ser estudados lado a lado simultaneamente na mesma fatia cerebral.
A localização de axônios e cones de crescimento para análise é uma consideração importante. Os neurônios corticais polarizam-se enquanto migram radialmente da zona ventricular (VZ) em direção à placa cortical (CP). Durante esse processo, os neurônios formam um processo de liderança (um dendrite futuro) e um processo de trailing que se tornará o axônio, eventualmente unindo axônios pioneiros na zona intermediária (IZ), estabelecendo os setores axônio32. Portanto, para capturar cones de crescimento axonal, a imagem foi feita em fibras axonanas no IZ, incluindo axônios saindo do CP e axônios gerados precocemente já associados a feixes axonais; ou eventualmente, em fibras que transversam o IZ e se estendem abaixo dela (Figura 7).
Este protocolo torna viável realizar imagens de super resolução de neurônios dentro de fatias organotipas. Historicamente, a dispersão de luz era um problema significativo enfrentado quando a imagem de espécimes espessos. Nas últimas duas décadas, amplos avanços em tecnologias ópticas tornaram possível a imagem de espécimes espessos. Aqui, um objetivo de longa distância de trabalho foi utilizado para visualizar melhor estruturas menores, como cones de crescimento. Inevitavelmente, este protocolo não captura eventos mais detalhados, como fluxo de actina retrógrada ou dinâmica de microtúbulos. O objetivo de longa distância de trabalho, que requer uma abertura numérica inferior (NA), preserva informações de fatias grossas. No entanto, também foi possível adaptar este protocolo para uso com objetivos de menor distância de trabalho. Isso exigiu uma transferência suave de fatias para um prato com fundo de vidro para preservar a integridade estrutural. No entanto, o uso deste método resultou em uma sobrevida mais curta – ~15 h – devido à perda de troca de gás (dados não mostrados). Ao contrário das culturas 2D, os cones de crescimento em 3D ocupam um volume maior e requerem compensação de artefatos de movimento no eixo z. Para aumentar a capacidade de imagem de eventos detalhados, a tecnologia confocal moderna deve ser utilizada. Portanto, recomenda-se usar um motor z-stack de varredura rápida, como o z-Galvo disponível em microscópios confocal altamente sensíveis33.
Note-se que este protocolo apresenta três limitações principais. Em primeiro lugar, muitas vezes é desafiador controlar níveis de expressão/número de células expressas de qualquer plasmídeo in vivo. Isso introduz a variabilidade entre todas as fatias, mesmo mantendo a mesma concentração plasmida. Portanto, a seleção dos elementos regulatórios na expressão vetores utilizados deve ser predeterminada com cuidado. Em segundo lugar, eventos detalhados de imagem usando pastilhas de membrana atualmente não são viáveis. Essa segunda limitação pode ser superada com as atualizações metodológicas propostas no parágrafo anterior. Por fim, os cones de crescimento são altamente fotosensíveis e podem rapidamente se tornar fotobleachados. Portanto, imagens frequentes dos cones de crescimento, por apenas 5 minutos usando microscópios de varredura a laser podem frequentemente colapsar os cones de crescimento. Nesse sentido, um novo avanço nos dispositivos gerados por microscopia de folha de luz pode ser adaptado para imagens de longo prazo das fatiascerebrais 34.
Protocolos desse tipo são imaginados para abrir novos caminhos de pesquisa, permitindo uma melhor compreensão do que é preciso para um cone de crescimento ler e reagir em direção a um ambiente in vivo complexo e, mais importante, desvendar a mecânica dessa sofisticada interação.
The authors have nothing to disclose.
Gostaríamos de agradecer a Maria Eugenia Bernis por fotografar os procedimentos. Agradecemos também a Emily Burnside, Emily Handley, Thorben Pietralla, Max Schelski e Sina Stern por lerem e discutirem o manuscrito. Somos gratos às nossas excelentes assistentes técnicas, Jessica Gonyer, Blanca Randel e Anh-Tuan Pham. Reconhecemos o valioso apoio das instalações de microscópio leve e instalações de animais da DZNE. Este trabalho foi apoiado pela Deutsche Forschungsgesellschaft (DFG), a Fundação Internacional para a Pesquisa em Paraplegia (IRP) e as Asas pela Vida (para F.B). F.B. é membro do cluster de excelência ImmunoSensation2, os SFBs 1089 e 1158, e é um dos ganhadores do Prêmio Roger De Spoelberch.
Adson Forceps | Fine Science Tools | 11006-12 | |
Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A21202 | Goat Anti-Mouse |
Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21236 | Goat Anti-Mouse |
Anti-Vimentin antibody | sigma-Aldrich | V2258-.2ML | Monoclonal mouse, clone LN-6, ascites fluid |
B27 supplement | ThermoFisher Scientific | 17504044 | |
Betadine | B. Braun | 3864154 | |
Biozym Sieve GP Agarose | Biozyme | 850080 | |
Braunol, Sprühflasche | B. Braun | 3864073 | |
Buprenorphine (Temgesic) | GEHE Pharma | 345928 | |
DAPI | sigma-Aldrich | D9542 | |
DMZ unevirsal electrode puller | Zeitz | NA | |
Electric razor | Andes | NA | ProClip UltraEdge Super 2-Speed model |
Enrofloxacin (Baytril) | Bayer | 3543238 | 2,5% (wt/vol) |
Eppendorf microloader pipette tips | FischerScientific | 10289651 | |
Fast Green FCF | Sigma-Aldrich | F7252-5G | Dye content ≥ 85 % |
Fetal Bovine Serum | ThermoFisher Scientific | 10500064 | |
Fiji 2.1.0 | NIH | NA | https://imagej.net/software/fiji/downloads |
Fine Scissors | Fine Science Tools | 14058-09 | ToughCut/Straight/9cm |
FluoroDish Cell Culture Dish | World Precision Instruments | FD5040-100 | |
Fluoromount Aqueous Mounting Medium | sigma-Aldrich | F4680-25ML | |
Glucose | MedPex | 3705391 | 5% |
GlutaMAX Supplement | ThermoFisher Scientific | 35050061 | |
Glycine | Sigma-Aldrich | G8898 | |
HBSS | Life Technologies | 14025092 | calcium, magnesium, no phenol red |
Horse serum | Pan-Biotech | P30-0711 | |
Imaris 9.7.2 | Bitplane | NA | https://imaris.oxinst.com/products/imaris-for-neuroscientists |
Isoflurane | Virbac | NA | |
Isotonic saline solution | B. Braun | 8609261 | 0.90% |
Leica VT1200 S vibratome | Leica | 14048142066 | |
LSM 880 with Airyscan | Zeiss | NA | |
Metacam | Venusberg Apotheke | 8890217 | 5 mg/ml |
Mice | Janvier Labs | NA | C57BL/6JRj |
Micro-Adson Forceps | Fine Science Tools | 11018-12 | |
Micropipette Storage Jar | World Precision Instruments | E210 | 16.16.27 |
Microsoft Excel | Microsoft | NA | https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/p/excel/cfq7ttc0k7dx?activetab=pivot:overviewtab |
Millicell Cell Culture Insert | EMD Millipore | PICM0RG50 | 30 mm, hydrophilic PTFE, 0.4 µm |
Moria Perforated Spoons | Fine Science Tools | 10370-18 | |
Moria Spoon | Fine Science Tools | 10321-08 | |
Neurobasal Medium, minus phenol red | ThermoFisher Scientific | 12348017 | |
Neuropan-2 supplement | Pan-Biotech | P07-11010 | |
Normal goat serum | Abcam | ab138478 | |
Olsen-Hegar Needle Holder with Scissors | Fine Science Tools | 12002-12 | |
p-Tub-alpha-1-Dre | Addgene | 133925 | |
p-Tub-alpha-1-iCre | Addgene | 133924 | |
p-Tub-alpha-1-LifeAct-GFP | Addgene | 175437 | |
Parafilm | VWR | 52858-000 | |
Paraformaldehyde | sigma-Aldrich | P6148 | |
PBS | Sigma-Aldrich | P3813-10PAK | |
pCAG-lox-rox-STOP-rox-tRFP-lox-Lyn-ZsGreen | Addgene | 175438 | |
pCAG-lox-STOP-lox-Lyn-mNeonGreen | Addgene | 175257 | |
Penicillin-Streptomycin | ThermoFisher Scientific | 15140122 | |
PicoNozzle Kit v2 | World Precision Instruments | 5430-ALL | |
Platinum Tweezertrodes | Harvard Apparatus | 45-0487 | 1 mm / 3 mm |
QIAGEN Maxi kit | QIAGEN | 12162 | |
Reflex wound closure Clip | World Precision Instruments | 500344-10 | 7 mm |
Sekundenkleber Pattex Mini Trio | Lyreco | 4722659 | |
Square wave electroporation system ECM830 | Harvard Apparatus | W3 45-0052 | |
Sterile gauze | Braun Askina | 9031216 | |
Sterile lubricant eye ointment | Bayer Vital | PZN1578675 | |
Sterile surgical gloves | Sempermed | 14C0451 | |
Sucrose | Roth | 4621.2 | |
Supramid 5-0 surgical silk sutures | B. Braun | NA | |
Thin-wall glass capillaries | World Precision Instruments | TW100-4 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100 | |
Vannas spring scissors | Fine Science Tools | 15000-03 | |
µ-Slide 8 Well Glass Bottom | Ibidi | 80827 |