Questo protocollo dimostra un metodo semplice e robusto per studiare la crescita degli assoni in situ e la dinamica dei coni di crescita. Descrive come preparare ex vivo fette di cervello acuto fisiologicamente rilevanti e fornisce una pipeline di analisi di facile utilizzo.
Durante lo sviluppo neuronale, gli assoni navigano nell’ambiente corticale per raggiungere le loro destinazioni finali e stabilire connessioni sinaptiche. I coni di crescita – le strutture sensoriali situate sulle punte distali degli assoni in via di sviluppo – eseguono questo processo. Studiare la struttura e la dinamica del cono di crescita è fondamentale per comprendere lo sviluppo assonale e le interazioni con il sistema nervoso centrale circostante (SNC) che gli consentono di formare circuiti neurali. Ciò è essenziale quando si elaborano metodi per reintegrare gli assoni nei circuiti neurali a seguito di lesioni nella ricerca fondamentale e nei contesti pre-clinici. Finora, la comprensione generale della dinamica dei coni di crescita si basa principalmente su studi di neuroni coltivati in due dimensioni (2D). Sebbene indubbiamente fondamentale per l’attuale conoscenza delle dinamiche strutturali del cono di crescita e della risposta agli stimoli, gli studi 2D travisano l’ambiente fisiologico tridimensionale (3D) incontrato dai coni di crescita neuronale nel tessuto del SNC intatto. Più recentemente, i gel di collagene sono stati impiegati per superare alcune di queste limitazioni, consentendo lo studio dello sviluppo neuronale in 3D. Tuttavia, sia gli ambienti sintetici 2D che 3D mancano di segnali di segnalazione all’interno del tessuto del SNC, che dirigono l’estensione e il pathfinding degli assoni in via di sviluppo. Questo protocollo fornisce un metodo per studiare assoni e coni di crescita utilizzando fette di cervello organotipiche, in cui gli assoni in via di sviluppo incontrano segnali fisici e chimici fisiologicamente rilevanti. Combinando l’elettroporazione fine messa a punto in utero ed ex utero per fornire scarsamente reporter fluorescenti insieme alla microscopia a super-risoluzione, questo protocollo presenta una pipeline metodologica per la visualizzazione delle dinamiche degli assoni e dei coni di crescita in situ. Inoltre, è inclusa una descrizione dettagliata del toolkit dell’analisi dei dati di imaging a lungo termine e delle cellule vive.
I neuroni sono cellule altamente polarizzate che rappresentano l’unità computazionale di base nel sistema nervoso. Ricevono ed emettono informazioni che si basano sulla compartimentazione dei siti di input e output: dendriti e assoni, rispettivamente1. Durante lo sviluppo, gli assoni si estendono mentre navigano in un ambiente incredibilmente complesso per raggiungere la loro destinazione. La navigazione degli assoni è guidata dal cono di crescita, una struttura sensoriale situata sulla punta dell’assone in via di sviluppo. Il cono di crescita è responsabile della rilevazione dei segnali ambientali e della loro traduzione nella riorganizzazione spaziale dinamica del suo citoscheletro 2,3. Le reazioni morfo-meccaniche risultanti istruiscono il cono di crescita a estendersi o ritrarsi dal segnale scatenante, portando a specifiche manovre assonali.
L’attuale comprensione dell’estensione degli assoni e della dinamica dei coni di crescita deriva da studi che valutano la crescita degli assoni su substrati bidimensionali (2D) 2,4,5,6,7. Questi studi pionieristici hanno identificato una sofisticata interazione tra coni di crescita e substrati di crescita e hanno rivelato differenze sorprendenti dipendenti dalle caratteristiche del substrato come adesività e rigidità 8,9. Guidati da queste intuizioni, sono stati ipotizzati segnali ambientali extracellulari per dettare la crescita degli assoni, con il citoscheletro del cono di crescita che esegue questa crescita 2,10,11,12. In particolare, i neuroni possono estendere gli assoni in substrati non adesivi (ad esempio, poli-lisina, poli-ornitina)13. Inoltre, la rigidità del substrato può influenzare il tasso di crescita degli assoni indipendentemente dai complessi adesivi cellulari8. Quindi, lo studio della dinamica dei coni di crescita nei substrati 2D da solo non può modellare con precisione l’equilibrio delle forze che derivano dall’interazione dei coni di crescita assonali con ambienti tridimensionali (3D) fisiologicamente rilevanti, come quelli trovati in vivo.
Per superare i limiti dei saggi 2D, la crescita degli assoni e la dinamica dei coni di crescita sono state studiate in matrici 3D 8,9. Queste matrici pongono un contesto più fisiologico ma consentono di studiare i meccanismi intrinseci delle cellule della crescita degli assoni. Consente l’esame del cono di crescita in modo monocellulare in una varietà di condizioni e trattamenti farmacologici9. In tali ambienti 3D, gli assoni mostravano dinamiche citoscheletriche distinte e crescevano più velocemente di quelli osservati nei neuroni coltivati in 2D9. Questi eleganti studi hanno dimostrato l’influenza di una dimensione extra sulla riorganizzazione del citoscheletro del cono di crescita e, di conseguenza, sul suo comportamento.
Nonostante gli apparenti vantaggi presentati dalle matrici 3D rispetto alle superfici 2D nel supportare lo sviluppo neuronale nativo e la crescita degli assoni, rimangono un’impalcatura sintetica semplificata che non può riflettere la complessità delle dinamiche osservate nel tessuto del sistema nervoso centrale (SNC). Qui, la consegna di plasmidi reporter per elettroporazione ex utero e in utero è stata combinata con la coltura di fette organotipiche del cervello e l’imaging in situ dal vivo a super-risoluzione per analizzare le dinamiche del cono di crescita all’interno di un contesto fisiologico. Questa metodologia consente la visualizzazione degli assoni in via di sviluppo mentre si sperimenta la 3-dimensionalità degli ambienti in vivo e la complessità della sua composizione fisico-chimica. Infine, vengono descritte procedure user-friendly per misurare la crescita degli assoni e le dinamiche dei coni di crescita utilizzando software comunemente concesso in licenza e disponibile pubblicamente.
Come i coni di crescita percepiscono e reagiscono al loro ambiente circostante per coordinare l’estensione e la guida simultanea degli assoni è ancora oggetto di dibattito 3,18. Studi pionieristici su substrati 2D hanno fornito uno sguardo sui meccanismi molecolari fondamentali che generano le forze che guidano la dinamica del cono di crescita durante la formazione degli assoni, la crescita e la navigazione 2,10,11,12,19. Più recentemente, studi su matrici 3D hanno rivelato quanta influenza ha una terza dimensione nel comportamento del cono di crescita e di conseguenza nella crescita degli assoni 8,9. Tuttavia, gli intricati meccanismi che istruiscono la dinamica dei coni di crescita in vivo devono ancora essere esaminati a fondo.
La preparazione di colture di fette organotipiche da cervelli IUE o EUE è ampiamente utilizzata e ben documentata. È diventato uno standard aureo che consente agli scienziati di ottenere informazioni sullo sviluppo e sul comportamento dei neuroni nel tessuto cerebrale vivente20,21. In effetti, questa tecnica è stata utilizzata con successo in combinazione con varie tecniche di imaging ad alta risoluzione per visualizzare specifici processi molecolari ed eventi morfologici in situ. Tali studi includono, ma non sono limitati alla formazione di assoni e all’estensione19,22, alla migrazione neuronale corticale 19,22,23,24, alla dinamica del centrosoma 25,26, alla dinamica dei microtubuli27, nonché alla dinamica funzionale dei compartimenti pre e postsinaptici 28,29.
Questo protocollo affronta una lacuna nella neurobiologia sperimentale, visualizzando le dinamiche del cono di crescita dello sviluppo di neuroni corticali in situ, in colture di fette di cervello acute ex vivo e gli strumenti per analizzare i dati ottenuti.
Le colture acute di fette di cervello sono state utilizzate per stabilire questo protocollo perché (1) con una certa pratica, sono facili da generare; (2) presentare un sistema accessibile per studiare i coni di crescita incorporati in un ambiente quasi completamente fisiologico, ma abbastanza trasparente da consentire l’imaging di cellule vive ad alta risoluzione; (3) può essere espanso per il suo uso con una miriade di linee di topo transgeniche; (4) combinati con IUE o EUE, forniscono un potenziale virtualmente illimitato per fornire strumenti molecolari per valutare le prestazioni dei coni di crescita e degli assoni in vivo in regimi di perdita/guadagno di funzione, insieme a reporter fluorescenti e sonde citoscheletriche.
Questa metodologia è stata descritta nel contesto sia dell’EUE che dell’IUE. Sebbene sia ancora un metodo altamente affidabile, l’EUE ha determinato un aumento dell’incidenza di fette di cervello che mostrano una rete RG disorganizzata rispetto a quelle ottenute con IUE come metodo di consegna (Figura 4C). I disturbi nell’array RG influenzano fortemente la migrazione neuronale e il modello di allungamento degli assoni30,31. Questi sono parametri chiave che prevedono dove trovare gli assoni per l’analisi in un dato momento e il tipo di ambiente in cui stanno navigando. Le fette di cervello con una rete RG significativamente interrotta in genere hanno una stratificazione dei neuroni corticali compromessa. Questo, a sua volta, produce assoni con traiettorie caotiche. Pertanto, si raccomanda vivamente di controllare l’integrità strutturale della rete RG. È interessante notare che la scarsa integrità strutturale è correlata all’aumento dell’età del cervello embrionale. In effetti, tali effetti negli embrioni più giovani di E12,5-E13,5 non sono stati osservati in genere19.
Il presente protocollo è completo e semplice. Tuttavia, ci sono alcuni passaggi critici in cui è necessario prestare particolare attenzione e attenzione per ottenere risultati ottimali. Questi sono stati espressamente annotati nel protocollo e includono (1) la messa a punto della quantità di DNA utilizzata nell’elettroporazione per ottenere un’etichettatura sparsa; (2) evitare danni durante l’estrazione del cervello; (3) controllare la temperatura dell’agarosio durante l’involucro cerebrale; (4) risoluzione dei problemi della percentuale ideale di agarosio per cervelli di una data età; e (5) selezione di fluorofori, la cui esperienza segue. Durante l’ottimizzazione del protocollo, sono state testate le prestazioni di diversi fluorofori nell’imaging in situ a cellule vive. Per questo protocollo sono state scelte varianti monomeriche GFP e NeonGreen per la preparazione dei plasmidi LifeAct- e Lyn-tagged (Figura 5A,B). Inoltre, la variante RFP mScarlet è stata testata e trovata altamente adatta per questa configurazione (dati non mostrati). Sono stati testati anche tRFP multimerico (dimero) e ZsGreen (tetramero) (Figura 5C e Video supplementare 1, a destra). Questi fluorofori super-luminosi a rapida piegatura sono raccomandati quando il metodo richiede una rapida generazione di segnali fluorescenti dopo la consegna del DNA.
Una pratica comune nell’uso di colture di fette è quella di utilizzare fette di cervelli diversi per testare il controllo e le condizioni sperimentali. Ciò rappresenta una fonte intrinseca di variabilità indesiderata. Qui è stato utilizzato un sistema di espressione che consente la modifica indipendente dei neuroni vicini e l’espressione dei giornalisti per l’identificazione. Si noti che in questa dimostrazione (Figura 5C), non c’erano differenze tra i neuroni che esprimono uno dei fluorofori. Tuttavia, ad esempio, un tale mix di plasmidi combinato con una linea di topo transgenico che ospita un gene Cre-sensibile etichetterà con neuroni tRFP (Dre-sensitive) che sono rimasti come wild type. Al contrario, ZsGreen (anche Cre-sensibile) etichetterà i neuroni ricombinati. Quindi, i coni di crescita dei due diversi genotipi, e probabilmente anche i fenotipi, potrebbero essere studiati fianco a fianco contemporaneamente nella stessa fetta di cervello.
La localizzazione di assoni e coni di crescita per l’analisi è una considerazione importante. I neuroni corticali si polarizzano mentre migrano radialmente dalla zona ventricolare (VZ) verso la piastra corticale (CP). Durante questo processo, i neuroni formano un processo principale (un futuro dendrite) e un processo finale che diventerà l’assone, unendosi infine agli assoni pionieristici nella zona intermedia (IZ), stabilendo tratti assonali32. Pertanto, per catturare i coni di crescita assonali, l’imaging è stato fatto su fibre assonali nell’IZ, compresi gli assoni che escono dal CP e gli assoni generati precocemente già associati a fasci assonali; o eventualmente, in fibre che attraversano l’IZ e si estendono al di sotto di esso (Figura 7).
Questo protocollo rende possibile eseguire l’imaging a super-risoluzione dei neuroni all’interno di fette organotipiche. Storicamente, la diffusione della luce era un problema significativo affrontato durante l’imaging di campioni spessi. Negli ultimi due decenni, gli ampi progressi nelle tecnologie ottiche hanno reso possibile l’imaging di campioni spessi. Qui, un obiettivo a lunga distanza di lavoro è stato utilizzato per visualizzare meglio le strutture più piccole, come i coni di crescita. Inevitabilmente, questo protocollo non cattura eventi più dettagliati come il flusso di actina retrograda o la dinamica dei microtubuli. L’obiettivo a lunga distanza di lavoro, che richiede un’apertura numerica (NA) inferiore, conserva le informazioni da fette spesse. Tuttavia, è stato anche possibile adattare questo protocollo per utilizzarlo con obiettivi di distanza di lavoro più breve. Ciò ha richiesto un trasferimento regolare delle fette a un piatto con fondo di vetro per preservare l’integrità strutturale. Tuttavia, l’uso di questo metodo ha comportato una sopravvivenza più breve – ~ 15 ore – a causa della perdita di scambio di gas (dati non mostrati). A differenza delle colture 2D, i coni di crescita in 3D occupano un volume maggiore e richiedono una compensazione movimento-artefatto nell’asse z. Per aumentare la capacità di visualizzare eventi dettagliati, è necessario utilizzare la moderna tecnologia confocale. Pertanto, si consiglia di utilizzare un motore z-stack a scansione rapida, come lo z-Galvo disponibile su microscopi confocali ad alta sensibilità33.
Da notare, questo protocollo presenta tre limitazioni principali. In primo luogo, è spesso difficile controllare i livelli di espressione / numero di cellule che esprimono di un dato plasmide in vivo. Ciò introduce variabilità tra tutte le fette anche quando si mantiene la stessa concentrazione di plasmidi. Pertanto, la selezione degli elementi regolatori nei vettori di espressione utilizzati deve essere predeterminata con cura. In secondo luogo, l’imaging di eventi dettagliati utilizzando inserti a membrana non è attualmente fattibile. Questa seconda limitazione potrà essere superata con gli aggiornamenti metodologici proposti nel paragrafo precedente. Infine, i coni di crescita sono altamente fotosensibili e possono diventare rapidamente fotosbiancati. Pertanto, l’imaging frequente dei coni di crescita, per un minimo di 5 minuti utilizzando microscopi a scansione laser, può spesso far collassare i coni di crescita. A questo proposito, i nuovi progressi nei dispositivi generati dalla microscopia a foglio luminoso possono essere adattati per l’imaging a lungo termine delle fette di cervello34.
Protocolli di questo tipo sono concepiti per aprire nuove strade di ricerca, consentendo una migliore comprensione di ciò che serve a un cono di crescita per leggere e reagire verso un ambiente complesso in vivo e, cosa più importante, per svelare i meccanismi di questa sofisticata interazione.
The authors have nothing to disclose.
Ringraziamo Maria Eugenia Bernis per aver fotografato le procedure. Ringraziamo anche Emily Burnside, Emily Handley, Thorben Pietralla, Max Schelski e Sina Stern per aver letto e discusso il manoscritto. Siamo grati ai nostri eccezionali assistenti tecnici, Jessica Gonyer, Blanca Randel e Anh-Tuan Pham. Riconosciamo il prezioso supporto della struttura per microscopi ottici e della struttura per animali del DZNE. Questo lavoro è stato sostenuto da Deutsche Forschungsgesellschaft (DFG), dalla International Foundation for Research in Paraplegia (IRP) e da Wings for Life (a F.B). F.B. è membro del cluster di eccellenza ImmunoSensation2, delle SFB 1089 e 1158, e ha ricevuto il Premio Roger De Spoelberch.
Adson Forceps | Fine Science Tools | 11006-12 | |
Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A21202 | Goat Anti-Mouse |
Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21236 | Goat Anti-Mouse |
Anti-Vimentin antibody | sigma-Aldrich | V2258-.2ML | Monoclonal mouse, clone LN-6, ascites fluid |
B27 supplement | ThermoFisher Scientific | 17504044 | |
Betadine | B. Braun | 3864154 | |
Biozym Sieve GP Agarose | Biozyme | 850080 | |
Braunol, Sprühflasche | B. Braun | 3864073 | |
Buprenorphine (Temgesic) | GEHE Pharma | 345928 | |
DAPI | sigma-Aldrich | D9542 | |
DMZ unevirsal electrode puller | Zeitz | NA | |
Electric razor | Andes | NA | ProClip UltraEdge Super 2-Speed model |
Enrofloxacin (Baytril) | Bayer | 3543238 | 2,5% (wt/vol) |
Eppendorf microloader pipette tips | FischerScientific | 10289651 | |
Fast Green FCF | Sigma-Aldrich | F7252-5G | Dye content ≥ 85 % |
Fetal Bovine Serum | ThermoFisher Scientific | 10500064 | |
Fiji 2.1.0 | NIH | NA | https://imagej.net/software/fiji/downloads |
Fine Scissors | Fine Science Tools | 14058-09 | ToughCut/Straight/9cm |
FluoroDish Cell Culture Dish | World Precision Instruments | FD5040-100 | |
Fluoromount Aqueous Mounting Medium | sigma-Aldrich | F4680-25ML | |
Glucose | MedPex | 3705391 | 5% |
GlutaMAX Supplement | ThermoFisher Scientific | 35050061 | |
Glycine | Sigma-Aldrich | G8898 | |
HBSS | Life Technologies | 14025092 | calcium, magnesium, no phenol red |
Horse serum | Pan-Biotech | P30-0711 | |
Imaris 9.7.2 | Bitplane | NA | https://imaris.oxinst.com/products/imaris-for-neuroscientists |
Isoflurane | Virbac | NA | |
Isotonic saline solution | B. Braun | 8609261 | 0.90% |
Leica VT1200 S vibratome | Leica | 14048142066 | |
LSM 880 with Airyscan | Zeiss | NA | |
Metacam | Venusberg Apotheke | 8890217 | 5 mg/ml |
Mice | Janvier Labs | NA | C57BL/6JRj |
Micro-Adson Forceps | Fine Science Tools | 11018-12 | |
Micropipette Storage Jar | World Precision Instruments | E210 | 16.16.27 |
Microsoft Excel | Microsoft | NA | https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/p/excel/cfq7ttc0k7dx?activetab=pivot:overviewtab |
Millicell Cell Culture Insert | EMD Millipore | PICM0RG50 | 30 mm, hydrophilic PTFE, 0.4 µm |
Moria Perforated Spoons | Fine Science Tools | 10370-18 | |
Moria Spoon | Fine Science Tools | 10321-08 | |
Neurobasal Medium, minus phenol red | ThermoFisher Scientific | 12348017 | |
Neuropan-2 supplement | Pan-Biotech | P07-11010 | |
Normal goat serum | Abcam | ab138478 | |
Olsen-Hegar Needle Holder with Scissors | Fine Science Tools | 12002-12 | |
p-Tub-alpha-1-Dre | Addgene | 133925 | |
p-Tub-alpha-1-iCre | Addgene | 133924 | |
p-Tub-alpha-1-LifeAct-GFP | Addgene | 175437 | |
Parafilm | VWR | 52858-000 | |
Paraformaldehyde | sigma-Aldrich | P6148 | |
PBS | Sigma-Aldrich | P3813-10PAK | |
pCAG-lox-rox-STOP-rox-tRFP-lox-Lyn-ZsGreen | Addgene | 175438 | |
pCAG-lox-STOP-lox-Lyn-mNeonGreen | Addgene | 175257 | |
Penicillin-Streptomycin | ThermoFisher Scientific | 15140122 | |
PicoNozzle Kit v2 | World Precision Instruments | 5430-ALL | |
Platinum Tweezertrodes | Harvard Apparatus | 45-0487 | 1 mm / 3 mm |
QIAGEN Maxi kit | QIAGEN | 12162 | |
Reflex wound closure Clip | World Precision Instruments | 500344-10 | 7 mm |
Sekundenkleber Pattex Mini Trio | Lyreco | 4722659 | |
Square wave electroporation system ECM830 | Harvard Apparatus | W3 45-0052 | |
Sterile gauze | Braun Askina | 9031216 | |
Sterile lubricant eye ointment | Bayer Vital | PZN1578675 | |
Sterile surgical gloves | Sempermed | 14C0451 | |
Sucrose | Roth | 4621.2 | |
Supramid 5-0 surgical silk sutures | B. Braun | NA | |
Thin-wall glass capillaries | World Precision Instruments | TW100-4 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100 | |
Vannas spring scissors | Fine Science Tools | 15000-03 | |
µ-Slide 8 Well Glass Bottom | Ibidi | 80827 |