Dit protocol demonstreert een eenvoudige en robuuste methode om in situ axongroei en groeikegeldynamiek te bestuderen. Het beschrijft hoe ex vivo fysiologisch relevante acute hersenplakken kunnen worden bereid en biedt een gebruiksvriendelijke analysepijplijn.
Tijdens neuronale ontwikkeling navigeren axonen door de corticale omgeving om hun eindbestemming te bereiken en synaptische verbindingen tot stand te brengen. Groeikegels – de sensorische structuren aan de distale uiteinden van zich ontwikkelende axonen – voeren dit proces uit. Het bestuderen van de structuur en dynamiek van de groeikegel is cruciaal voor het begrijpen van axonale ontwikkeling en de interacties met het omliggende centrale zenuwstelsel (CZS) die het mogelijk maken om neurale circuits te vormen. Dit is essentieel bij het bedenken van methoden om axonen te re-integreren in neurale circuits na letsel in fundamenteel onderzoek en preklinische contexten. Tot nu toe is het algemene begrip van groeikegeldynamiek voornamelijk gebaseerd op studies van neuronen gekweekt in twee dimensies (2D). Hoewel ongetwijfeld fundamenteel voor de huidige kennis van de structurele dynamiek van de groeikegel en de reactie op stimuli, geven 2D-studies een verkeerde voorstelling van de fysiologische driedimensionale (3D) omgeving die neuronale groeikegels tegenkomen in intact CZS-weefsel. Meer recent werden collageengels gebruikt om enkele van deze beperkingen te overwinnen, waardoor het onderzoek naar neuronale ontwikkeling in 3D mogelijk werd. Zowel synthetische 2D- als 3D-omgevingen missen echter signaalsignalen in CNS-weefsel, die de uitbreiding en pathfinding van ontwikkelende axonen sturen. Dit protocol biedt een methode voor het bestuderen van axonen en groeikegels met behulp van organotypische hersenplakken, waar zich ontwikkelende axonen fysiologisch relevante fysische en chemische signalen tegenkomen. Door fijn afgestemde in utero en ex utero elektroporatie te combineren om fluorescerende reporters spaarzaam te leveren, samen met superresolutiemicroscopie, presenteert dit protocol een methodologische pijplijn voor de visualisatie van axon- en groeikegeldynamica in situ. Verder is een gedetailleerde toolkit-beschrijving van de analyse van langetermijn- en live-cell imaging-gegevens opgenomen.
Neuronen zijn sterk gepolariseerde cellen die de basis computationele eenheid in het zenuwstelsel vertegenwoordigen. Ze ontvangen en zenden informatie uit die afhankelijk is van compartimentering van invoer- en uitvoerlocaties: dendrieten en axonen, respectievelijk1. Tijdens de ontwikkeling breiden axonen zich uit terwijl ze door een ongelooflijk complexe omgeving navigeren om hun bestemming te bereiken. Axonnavigatie wordt geleid door de groeikegel, een sensorische structuur aan de punt van het zich ontwikkelende axon. De groeikegel is verantwoordelijk voor het detecteren van omgevingssignalen en deze te vertalen in de dynamische ruimtelijke reorganisatie van zijn cytoskelet 2,3. De resulterende morfo-mechanische reacties instrueren de groeikegel om zich uit te breiden of terug te trekken van de triggering cue, wat leidt tot specifieke axonmanoeuvres.
Het huidige begrip van axonuitbreiding en groeikegeldynamica komt voort uit studies die axongroei evalueren over tweedimensionale (2D) substraten 2,4,5,6,7. Deze baanbrekende studies identificeerden een geavanceerd samenspel tussen groeikegels en groeisubstraten en onthulden opvallende verschillen afhankelijk van substraatkenmerken zoals kleefkracht en stijfheid 8,9. Onder leiding van deze inzichten werden extracellulaire omgevingssignalen verondersteld axongroei te dicteren, waarbij het cytoskelet van de groeikegel deze groei uitvoerde 2,10,11,12. Met name neuronen kunnen axonen uitbreiden in niet-klevende substraten (bijv. Poly-lysine, poly-ornithine)13. Bovendien kan substraatstijfheid de axongroeisnelheid beïnvloeden, onafhankelijk van cellijmcomplexen8. Daarom kan het bestuderen van groeikegeldynamica in 2D-substraten alleen niet nauwkeurig de balans van krachten modelleren die voortvloeien uit de interactie van axonale groeikegels met fysiologisch relevante driedimensionale (3D) omgevingen, zoals die in vivo worden gevonden.
Om de beperkingen van de 2D-assays te overwinnen, zijn axongroei en groeikegeldynamica bestudeerd in 3D-matrices 8,9. Deze matrices vormen een meer fysiologische context, maar maken het mogelijk om cel-intrinsieke mechanismen van axongroei te bestuderen. Het maakt groeikegelonderzoek op een eencellige manier mogelijk in verschillende omstandigheden en farmacologische behandelingen9. In dergelijke 3D-omgevingen vertoonden axonen een duidelijke cytoskeletdynamiek en groeiden ze sneller dan die waargenomen in 2D-gekweekte neuronen9. Deze elegante studies toonden de invloed aan van een extra dimensie op de reorganisatie van het groeikegelcytoskelet en bijgevolg op het gedrag ervan.
Ondanks de schijnbare voordelen van 3D-matrices ten opzichte van 2D-oppervlakken bij het ondersteunen van native-achtige neuronale ontwikkeling en axongroei, blijven ze een vereenvoudigde synthetische steiger die de complexiteit van de dynamiek die wordt waargenomen in weefsel van het centrale zenuwstelsel (CZS) niet kan weerspiegelen. Hier werd de levering van reporter plasmiden door ex utero en in utero elektroporatie gecombineerd met hersen organotypische slice cultuur en in situ live superresolutie beeldvorming om de dynamiek van de groeikegel binnen een fysiologische context te analyseren. Deze methodologie maakt visualisatie van ontwikkelende axonen mogelijk terwijl de 3-dimensionaliteit van in vivo omgevingen en de complexiteit van de fysisch-chemische samenstelling ervan worden ervaren. Ten slotte worden gebruiksvriendelijke procedures beschreven om axongroei en groeikegeldynamiek te meten met behulp van algemeen gelicentieerde en openbaar beschikbare software.
Hoe de groeikegels hun omgeving voelen en erop reageren om gelijktijdige axonuitbreiding en -geleiding te coördineren, is nog steeds een kwestie van discussie 3,18. Baanbrekende studies in 2D-substraten gaven een kijkje in de fundamentele moleculaire mechanismen die de krachten genereren die de groeikegeldynamiek aandrijven tijdens axonvorming, uitgroei en navigatie 2,10,11,12,19. Meer recent onthulden studies in 3D-matrices hoeveel invloed een derde dimensie heeft op het gedrag van de groeikegel en bijgevolg op axongroei 8,9. Niettemin moeten de ingewikkelde mechanismen die de dynamiek van de groeiconus in vivo instrueren, nog grondig worden onderzocht.
Bereiding van organotypische plakculturen uit IUE- of EUE-hersenen wordt op grote schaal gebruikt en goed gedocumenteerd. Het is een gouden standaard geworden waarmee wetenschappers inzicht kunnen krijgen in de ontwikkeling en het gedrag van neuronen in het levende hersenweefsel 20,21. Inderdaad, deze techniek is met succes gebruikt in combinatie met verschillende hoge resolutie beeldvormingstechnieken om specifieke moleculaire processen en morfologische gebeurtenissen in situ te visualiseren. Dergelijke studies omvatten, maar zijn niet beperkt tot axonvorming en -uitbreiding19,22, corticale neuronale migratie 19,22,23,24, centrosoomdynamica 25,26, microtubulidynamica27, evenals de functionele dynamica van pre- en postsynaptische compartimenten28,29.
Dit protocol pakt een kloof in de experimentele neurobiologie aan en visualiseert de groeikegeldynamiek van het ontwikkelen van corticale neuronen in situ, in ex vivo acute hersensegmentculturen en de hulpmiddelen om de verkregen gegevens te analyseren.
Acute brain slice culturen werden gebruikt om dit protocol vast te stellen omdat ze (1) met enige oefening, gemakkelijk te genereren zijn; (2) een toegankelijk systeem te presenteren voor het bestuderen van groeikegels die zijn ingebed in een quasi-volledig fysiologische omgeving, maar toch transparant genoeg om hoge-resolutie live-cell imaging mogelijk te maken; (3) kan worden uitgebreid voor het gebruik ervan met een groot aantal transgene muislijnen; (4) in combinatie met IUE of EUE bieden vrijwel onbeperkte mogelijkheden om moleculaire hulpmiddelen te leveren om de prestaties van groeikegels en axonen in vivo te evalueren onder verlies/ winst van functieregimes, samen met fluorescerende reporters en cytoskeletsondes.
Deze methodologie werd beschreven in de context van zowel EUE als IUE. Hoewel eue nog steeds een zeer betrouwbare methode is, resulteerde het in een verhoogde incidentie van hersenplakken met een ongeorganiseerd RG-netwerk in vergelijking met die verkregen met IUE als toedieningsmethode (figuur 4C). Verstoringen in de RG-array hebben een sterke invloed op neuronale migratie en het patroon van axon-elongatie30,31. Dit zijn belangrijke parameters die voorspellen waar axonen op een bepaald moment voor analyse kunnen worden gevonden en het type omgeving waarin ze navigeren. Hersenplakken met een aanzienlijk verstoord RG-netwerk hebben meestal een verminderde corticale neuronstratificatie. Dit produceert op zijn beurt axonen met chaotische trajecten. Daarom wordt sterk aanbevolen om de structurele integriteit van het RG-netwerk te controleren. Interessant is dat slechte structurele integriteit correleert met verhoogde leeftijd van de embryonale hersenen. Inderdaad, dergelijke effecten bij jongere E12.5-E13.5 embryo’s werden meestal niet waargenomen19.
Het huidige protocol is grondig en eenvoudig. Toch zijn er een paar kritische stappen waarbij speciale zorg en aandacht moet worden besteed aan het verkrijgen van optimale resultaten. Deze zijn uitdrukkelijk vermeld in het protocol en omvatten (1) het afstemmen van de hoeveelheid DNA die in de elektroporatie wordt gebruikt om schaarse etikettering te krijgen; (2) het voorkomen van schade tijdens de extractie van hersenen; (3) het regelen van de temperatuur van de agarose tijdens het omhullen van de hersenen; (4) het oplossen van het ideale percentage agarose voor hersenen van een bepaalde leeftijd; en (5) selectie van fluoroforen, waarvan de ervaring volgt. Tijdens protocoloptimalisatie werden de prestaties van verschillende fluoroforen in live-cell in situ beeldvorming getest. Voor dit protocol is gekozen voor monomere GFP-varianten EGFP en NeonGreen voor de bereiding van de LifeAct- en Lyn-tagged plasmiden (figuur 5A,B). Daarnaast is de RFP-variant mScarlet getest en zeer geschikt bevonden voor deze opstelling (gegevens niet getoond). Multimeric tRFP (dimer) en ZsGreen (tetrameer) (Figuur 5C en Supplementary Video 1, rechts) werden ook getest. Deze snelvouwende superheldere fluoroforen worden aanbevolen wanneer de methode een snelle fluorescerende signaalgeneratie na DNA-afgifte vereist.
Een veel voorkomende praktijk bij het gebruik van plakculturen is om plakjes uit verschillende hersenen te gebruiken om controle en experimentele omstandigheden te testen. Dit is een inherente bron van ongewenste variabiliteit. Hier werd een expressiesysteem gebruikt dat onafhankelijke modificatie van naburige neuronen en de expressie van verslaggevers voor identificatie mogelijk maakt. Merk op dat er in deze demonstratie (figuur 5C) geen verschillen waren tussen neuronen die een van de fluoroforen tot expressie brachten. Een voorbeeld hiervan is echter dat een dergelijke plasmidemix in combinatie met een transgene muizenlijn met een Cre-gevoelig gen labelt met tRFP (Dre-gevoelige) neuronen die als wild type zijn gebleven. Daarentegen zal de ZsGreen (ook Cre-gevoelig) de gerecombineerde neuronen labelen. Vandaar dat groeikegels van de twee verschillende genotypen, en waarschijnlijk ook fenotypes, tegelijkertijd naast elkaar in hetzelfde hersensegment kunnen worden bestudeerd.
Lokalisatie van axonen en groeikegels voor analyse is een belangrijke overweging. Corticale neuronen polariseren terwijl ze radiaal migreren van de ventriculaire zone (VZ) naar de corticale plaat (CP). Tijdens dit proces vormen neuronen een leidend proces (een toekomstig dendriet) en een trailing-proces dat het axon zal worden, uiteindelijk samen met baanbrekende axonen in de tussenzone (IZ), waardoor axonkanalenworden gevormd 32. Daarom, om axonale groeikegels te vangen, werd beeldvorming gedaan op axonale vezels in de IZ, inclusief axonen die de CP verlaten en vroeg gegenereerde axonen die al geassocieerd zijn met axonale bundels; of uiteindelijk in vezels die de IZ doorkruisen en eronder uitstrekken (figuur 7).
Dit protocol maakt het mogelijk om superresolutiebeeldvorming uit te voeren van neuronen in organotypische plakjes. Historisch gezien was lichtverstrooiing een belangrijk probleem bij het afbeelden van dikke exemplaren. In de afgelopen twee decennia hebben uitgebreide ontwikkelingen in optische technologieën beeldvorming van dikke exemplaren mogelijk gemaakt. Hier werd een lange werkafstandsdoelstelling gebruikt om kleinere structuren beter te visualiseren, zoals groeikegels. Onvermijdelijk legt dit protocol geen meer gedetailleerde gebeurtenissen vast, zoals retrograde actinestroom of microtubulidynamica. De langeafstandsdoelstelling, die een lager numeriek diafragma (NA) vereist, bewaart informatie uit dikke plakken. Het was echter ook mogelijk om dit protocol aan te passen aan het gebruik met als doel een kortere werkafstand. Dit vereiste een soepele overdracht van plakjes naar een schaal met glazen bodem om de structurele integriteit te behouden. Het gebruik van deze methode resulteerde echter in een kortere overleving – ~ 15 uur – als gevolg van verlies van gasuitwisseling (gegevens niet weergegeven). In tegenstelling tot 2D-culturen bezetten groeikegels in 3D een groter volume en vereisen ze bewegingsartefactencompensatie in de z-as. Om de mogelijkheid om gedetailleerde gebeurtenissen in beeld te brengen te vergroten, moet moderne confocale technologie worden gebruikt. Daarom wordt aanbevolen om een snel scannende z-stack motor te gebruiken, zoals de z-Galvo die beschikbaar is op zeer gevoelige confocale microscopen33.
Van belang is dat dit protocol drie belangrijke beperkingen biedt. Ten eerste is het vaak een uitdaging om de expressieniveaus / het aantal tot expressie brengende cellen van een bepaald plasmide in vivo te controleren. Dit introduceert variabiliteit tussen alle plakjes, zelfs bij behoud van dezelfde plasmideconcentratie. Daarom moet de selectie van de regulerende elementen in de gebruikte expressievectoren met zorg worden bepaald. Ten tweede is het in beeld brengen van gedetailleerde gebeurtenissen met behulp van membraaninzetstukken momenteel niet haalbaar. Deze tweede beperking kan worden opgeheven met de methodologische actualiseringen die in de vorige alinea zijn voorgesteld. Ten slotte zijn groeikegels zeer lichtgevoelig en kunnen ze snel gefotobleekeerd raken. Daarom kan frequente beeldvorming van de groeikegels, gedurende slechts 5 minuten met behulp van laserscanmicroscopen, de groeikegels vaak instorten. In dit opzicht kunnen nieuwe ontwikkelingen in door lichtplaatmicroscopie gegenereerde apparaten worden aangepast voor langetermijnbeeldvorming van de hersenplakken34.
Protocollen van deze soort zijn bedoeld om nieuwe onderzoeksmogelijkheden te openen, waardoor een beter begrip mogelijk wordt van wat er nodig is voor een groeikegel om te lezen en te reageren op een complexe in vivo omgeving, en nog belangrijker, om de mechanica van dit geavanceerde samenspel te ontrafelen.
The authors have nothing to disclose.
We willen Maria Eugenia Bernis bedanken voor het fotograferen van de procedures. We bedanken ook Emily Burnside, Emily Handley, Thorben Pietralla, Max Schelski en Sina Stern voor het lezen en bespreken van het manuscript. We zijn onze uitstekende technische assistenten, Jessica Gonyer, Blanca Randel en Anh-Tuan Pham dankbaar. We erkennen de waardevolle steun van de lichtmicroscoopfaciliteit en dierenfaciliteit van de DZNE. Dit werk werd ondersteund door Deutsche Forschungsgesellschaft (DFG), de International Foundation for Research in Paraplegia (IRP) en Wings for Life (tot F.B). F.B. is lid van de excellentiecluster ImmunoSensation2, de SFBs 1089 en 1158, en is ontvanger van de Roger De Spoelberchprijs.
Adson Forceps | Fine Science Tools | 11006-12 | |
Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A21202 | Goat Anti-Mouse |
Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21236 | Goat Anti-Mouse |
Anti-Vimentin antibody | sigma-Aldrich | V2258-.2ML | Monoclonal mouse, clone LN-6, ascites fluid |
B27 supplement | ThermoFisher Scientific | 17504044 | |
Betadine | B. Braun | 3864154 | |
Biozym Sieve GP Agarose | Biozyme | 850080 | |
Braunol, Sprühflasche | B. Braun | 3864073 | |
Buprenorphine (Temgesic) | GEHE Pharma | 345928 | |
DAPI | sigma-Aldrich | D9542 | |
DMZ unevirsal electrode puller | Zeitz | NA | |
Electric razor | Andes | NA | ProClip UltraEdge Super 2-Speed model |
Enrofloxacin (Baytril) | Bayer | 3543238 | 2,5% (wt/vol) |
Eppendorf microloader pipette tips | FischerScientific | 10289651 | |
Fast Green FCF | Sigma-Aldrich | F7252-5G | Dye content ≥ 85 % |
Fetal Bovine Serum | ThermoFisher Scientific | 10500064 | |
Fiji 2.1.0 | NIH | NA | https://imagej.net/software/fiji/downloads |
Fine Scissors | Fine Science Tools | 14058-09 | ToughCut/Straight/9cm |
FluoroDish Cell Culture Dish | World Precision Instruments | FD5040-100 | |
Fluoromount Aqueous Mounting Medium | sigma-Aldrich | F4680-25ML | |
Glucose | MedPex | 3705391 | 5% |
GlutaMAX Supplement | ThermoFisher Scientific | 35050061 | |
Glycine | Sigma-Aldrich | G8898 | |
HBSS | Life Technologies | 14025092 | calcium, magnesium, no phenol red |
Horse serum | Pan-Biotech | P30-0711 | |
Imaris 9.7.2 | Bitplane | NA | https://imaris.oxinst.com/products/imaris-for-neuroscientists |
Isoflurane | Virbac | NA | |
Isotonic saline solution | B. Braun | 8609261 | 0.90% |
Leica VT1200 S vibratome | Leica | 14048142066 | |
LSM 880 with Airyscan | Zeiss | NA | |
Metacam | Venusberg Apotheke | 8890217 | 5 mg/ml |
Mice | Janvier Labs | NA | C57BL/6JRj |
Micro-Adson Forceps | Fine Science Tools | 11018-12 | |
Micropipette Storage Jar | World Precision Instruments | E210 | 16.16.27 |
Microsoft Excel | Microsoft | NA | https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/p/excel/cfq7ttc0k7dx?activetab=pivot:overviewtab |
Millicell Cell Culture Insert | EMD Millipore | PICM0RG50 | 30 mm, hydrophilic PTFE, 0.4 µm |
Moria Perforated Spoons | Fine Science Tools | 10370-18 | |
Moria Spoon | Fine Science Tools | 10321-08 | |
Neurobasal Medium, minus phenol red | ThermoFisher Scientific | 12348017 | |
Neuropan-2 supplement | Pan-Biotech | P07-11010 | |
Normal goat serum | Abcam | ab138478 | |
Olsen-Hegar Needle Holder with Scissors | Fine Science Tools | 12002-12 | |
p-Tub-alpha-1-Dre | Addgene | 133925 | |
p-Tub-alpha-1-iCre | Addgene | 133924 | |
p-Tub-alpha-1-LifeAct-GFP | Addgene | 175437 | |
Parafilm | VWR | 52858-000 | |
Paraformaldehyde | sigma-Aldrich | P6148 | |
PBS | Sigma-Aldrich | P3813-10PAK | |
pCAG-lox-rox-STOP-rox-tRFP-lox-Lyn-ZsGreen | Addgene | 175438 | |
pCAG-lox-STOP-lox-Lyn-mNeonGreen | Addgene | 175257 | |
Penicillin-Streptomycin | ThermoFisher Scientific | 15140122 | |
PicoNozzle Kit v2 | World Precision Instruments | 5430-ALL | |
Platinum Tweezertrodes | Harvard Apparatus | 45-0487 | 1 mm / 3 mm |
QIAGEN Maxi kit | QIAGEN | 12162 | |
Reflex wound closure Clip | World Precision Instruments | 500344-10 | 7 mm |
Sekundenkleber Pattex Mini Trio | Lyreco | 4722659 | |
Square wave electroporation system ECM830 | Harvard Apparatus | W3 45-0052 | |
Sterile gauze | Braun Askina | 9031216 | |
Sterile lubricant eye ointment | Bayer Vital | PZN1578675 | |
Sterile surgical gloves | Sempermed | 14C0451 | |
Sucrose | Roth | 4621.2 | |
Supramid 5-0 surgical silk sutures | B. Braun | NA | |
Thin-wall glass capillaries | World Precision Instruments | TW100-4 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100 | |
Vannas spring scissors | Fine Science Tools | 15000-03 | |
µ-Slide 8 Well Glass Bottom | Ibidi | 80827 |