Questo protocollo ha lo scopo di descrivere come studiare l’estensione dell’internalizzazione dello Staphylococcus aureus e la sua capacità di sopravvivere all’interno della cellula ospite umana, nonché l’efficacia intracellulare dei composti antimicrobici.
Lo Staphylococcus aureus esprime fattori di virulenza per innescare la sua internalizzazione nelle cellule eucariote e per sopravvivere all’interno di diversi compartimenti subcellulari. Questo articolo descrive un test di protezione enzimatica per studiare l’entità dell’internalizzazione di S. aureus e la sua sopravvivenza intracellulare nelle cellule fagocitiche aderenti non professionali (NPPC), nonché l’efficacia intracellulare dei composti antimicrobici. Le NPPC vengono coltivate in una piastra multi-pozzo fino a raggiungere il 100% di confluenza. Le colture di S. aureus vengono coltivate durante la notte in terreno di coltura cellulare. La sospensione batterica viene diluita in base al numero di cellule per pozzetto per inoculare le cellule ad una molteplicità controllata di infezione. Le cellule inoculate vengono incubate per 2 ore per consentire ai batteri di essere internalizzati dalle NPPC, a seguito delle quali la lisostafina viene aggiunta al terreno di coltura per uccidere selettivamente i batteri extracellulari. La lisostafina è presente nel terreno di coltura per il resto dell’esperimento.
A questo punto, le cellule infette potrebbero essere incubate con composti antimicrobici per valutare la loro attività intracellulare contro S. aureus. Successivamente, le cellule vengono lavate tre volte per rimuovere i farmaci e il carico intracellulare di S. aureus viene quindi quantificato coltivando su piastre di agar. In alternativa, per studiare i fattori di virulenza stafilococcica coinvolti nella sopravvivenza intracellulare e nella tossicità cellulare, la lisostafina potrebbe essere inattivata con la proteinasi K per eliminare la necessità di fasi di lavaggio. Questo suggerimento migliora l’affidabilità della quantificazione della carica batterica intracellulare, soprattutto se le cellule tendono a staccarsi dalla piastra di coltura quando diventano pesantemente infettate a causa della moltiplicazione di S. aureus intracellulare. Questi protocolli possono essere utilizzati praticamente con tutti i tipi di NPPC aderenti e con modelli di coltura cellulare 3D come gli organoidi.
Lo Staphylococcus aureus è sia un agente patogeno potenzialmente letale che un batterio commensale della pelle e della mucosa che colonizza due miliardi di individui in tutto il mondo1. Nell’uomo, i portatori nasali di S. aureus hanno un aumentato rischio di infezione con il proprio ceppo di trasporto; tuttavia, i determinanti multifattoriali del trasporto mucoso di S. aureus non sono ancora chiari1,2. Oltre alle infezioni acute, i pazienti possono anche sviluppare infezioni croniche da S. aureus che sono spesso difficili da curare3. Una migliore comprensione delle interazioni ospite-patogeno durante la colonizzazione e l’infezione è fondamentale per sviluppare nuove strategie terapeutiche e migliorare la gestione del paziente.
In vitro, S. aureus può innescare la sua internalizzazione nelle cellule ospiti che esprimono l’integrina α5β14. L’interazione tripartita tra le proteine leganti la fibronectina stafilococcica ancorate alla parete cellulare di S. aureus, la fibronectina e l’integrina β1 espressa sulla superficie della cellula ospite è ben nota come la principale via di internalizzazione di S. aureus in NPPC come cheratinociti, osteoblasti, fibroblasti e cellule epiteliali ed endoteliali4. Studi recenti dimostrano che S. aureus può essere trovato all’interno delle cellule umane durante la colonizzazione nasale5,6 e l’infezione7. Tuttavia, il ruolo del serbatoio intracellulare nella patogenesi dell’infezione da S. aureus rimane poco chiaro. Le cellule ospiti potrebbero fungere da rifugio per S. aureus, che è protetto sia dal sistema immunitario8 che dalla maggior parte dei composti antimicrobici6,9.
Il test di protezione della lisostafina, descritto da Proctor10 all’inizio degli anni 1980, consente lo studio dei fattori batterici e dell’ospite coinvolti nell’internalizzazione degli isolati di S. aureus . La lisostafina è una batteriocina prodotta da Staphylococcus simulans, che mostra una potente attività contro quasi tutti gli isolati di S. aureus , compresi i ceppi resistenti agli antibiotici11. La lisostafina è stata utilizzata per distruggere solo S. aureus extracellulare per consentire il conteggio dei soli batteri intracellulari vitali12. Questa tecnica è stata ampiamente utilizzata e ha contribuito alla scoperta di diversi fattori di virulenza di S. aureus. La gentamicina, da sola e combinata con la lisostafina, è anche ampiamente utilizzata per studiare i batteri intracellulari.
Tuttavia, uno studio recente ha dimostrato che la gentamicina entra nelle cellule eucariotiche e raggiunge i batteri internalizzati in modo dipendente dal tempo e dalla concentrazione13. Questo studio ha anche dimostrato che la lisostafina non entra nelle cellule eucariotiche, confermando che un saggio di protezione enzimatica a base di lisostafina (EPA) è il test più accurato per quantificare il carico intracellulare di S. aureus per coltura13. Indipendentemente da quale composto viene utilizzato per distruggere i batteri extracellulari (ad esempio, lisostafina o gentamicina), deve essere rimosso lavando le cellule prima di placcare S. aureus intracellulare su piastre di agar. I lavaggi successivi possono provocare il distacco di cellule, in particolare cellule scarsamente aderenti (ad esempio, cellule fortemente infette), che porterebbero a una sottostima del carico intracellulare di S. aureus . Questo documento descrive in dettaglio come l’EPA può essere utilizzato per quantificare il carico intracellulare di S. aureus e per misurare l’efficacia intracellulare dei composti antimicrobici utilizzando un modello in vitro . Da notare, è stato proposto un metodo semplice per migliorare l’affidabilità della quantificazione del carico intracellulare evitando lavaggi intensivi.
I saggi qui descritti sono preziosi per studiare l’entità dell’internalizzazione e la sopravvivenza intracellulare di S. aureus nelle NPPC, nonché l’efficacia intracellulare dei composti antimicrobici6,15,16. Alcuni passaggi in entrambi i protocolli di analisi possono essere critici. Le condizioni di salute e la densità delle cellule devono essere perfettamente controllate e coerenti tra esperimenti indipendenti. L’inoculo batterico deve essere accuratamente standardizzato per ottenere un MOI reale vicino al MOI teorico mirato. In generale, bisogna fare attenzione a non staccare nessuna delle cellule durante il pipettaggio. I lavaggi per rimuovere la lisostafina e gli antibiotici sono passi critici nell’EPA. L’uso della proteinasi K è stato trovato per migliorare questo passaggio quando non viene utilizzato alcun antibiotico (vedi sotto). Ultimo ma non meno importante, le cellule dovrebbero essere completamente staccate in ogni pozzetto e completamente omogeneizzate dopo l’incubazione con il tampone di lisi per quantificare in modo affidabile il carico intracellulare di S. aureus.
In alcuni casi, possono verificarsi problemi e diversi punti devono essere controllati prima. In caso di mancanza di riproducibilità, si deve tenere presente che S. aureus può formare grumi, rendendo imprecisa la quantificazione per assorbanza. L’aggregazione dei batteri può essere aumentata mediante centrifugazione e fasi di lavaggio se il terreno di coltura deve essere sostituito (ad esempio, per eliminare una proteina secreta). La sospensione batterica deve essere utilizzata rapidamente perché i batteri continuano a crescere a temperatura ambiente. L’efficacia della lisostafina potrebbe diminuire a causa di condizioni di conservazione errate, pH subottimale per l’attività enzimatica nei terreni di coltura, variabilità nell’attività enzimatica tra lotti e fornitori e mancanza di sensibilità alla lisostafina di alcuni ceppi in specifiche condizioni di crescita. Il rosso fenolo potrebbe avere un leggero effetto batteriostatico, soprattutto quando il terreno di coltura è relativamente povero di sostanze nutritive rispetto ai tipici brodi utilizzati per la crescita dei batteri. Pertanto, è consigliabile utilizzare un terreno di coltura cellulare senza rosso fenolo, che migliora anche le osservazioni microscopiche a fluorescenza riducendo il rumore di fondo.
Sebbene questo metodo sia uno strumento prezioso per studiare il destino intracellulare di diversi ceppi, alcuni limiti del metodo dovrebbero essere considerati. L’uso di un MOI molto elevato può sovraccaricare la capacità di internalizzazione da parte delle NPPC e livellare le differenze tra i diversi ceppi testati. L’entità dell’internalizzazione dei ceppi più citotossici può essere sottovalutata perché la lisostafina (o antibiotici) distrugge rapidamente S. aureus che viene rilasciato dalle cellule danneggiate. Pertanto, gli esperimenti con durate estese (cioè per studiare la sopravvivenza intracellulare o l’attività intracellulare degli antibiotici) sono più facili da impostare con ceppi con bassa citotossicità. Pertanto, il tempo di incubazione e il MOI devono essere regolati accuratamente in base alla virulenza del ceppo, al tipo di cellula e allo scopo sperimentale.
Il metodo qui descritto con l’uso della lisostafina è più affidabile di quelli a base di gentamicina perché, a differenza della lisostafina, la gentamicina tende ad essere internalizzata dalle cellule ospiti13. L’altro vantaggio è la possibilità di inattivare la lisostafina. L’inibizione dell’attività della lisostafina è stata riportata da Kim et al.13 con l’uso di EDTA per chelare ioni di zinco o 1,10-fenantrolina; tuttavia, sono ancora necessari lavaggi intensivi per rimuovere l’enzima prima della placcatura dei batteri. Qui, la proteinasi K consente una rapida inattivazione della lisostafina. Abbiamo osservato che le cellule tendono a staccarsi dalla piastra di coltura quando diventano pesantemente infettate a causa della moltiplicazione di S. aureus intracellulare. Saltando la fase finale di lavaggio, il metodo iEPA ha notevolmente semplificato la gestione tecnica e ha permesso il recupero dei batteri interiorizzati in cellule vagamente aderenti o già staccate.
I reagenti e i tamponi più concentrati utilizzati in iEPA hanno anche contribuito a ridurre lo sforzo di pipettaggio e minimizzare la perdita di cellule. Inoltre, iEPA può essere utilizzato con celle in sospensione, nonché con organoidi difficili da lavare. In conclusione, i saggi di protezione enzimatica consentono lo studio dell’entità dell’internalizzazione e del destino intracellulare di S. aureus, nonché dell’attività intracellulare di farmaci antimicrobici con diversi modelli in vitro . Dovrebbero essere apportati miglioramenti per caratterizzare meglio la relazione tra internalizzazione e citotossicità per apprezzare meglio l’importanza di sviluppare farmaci in grado di raggiungere S. aureus all’interno della cellula.
The authors have nothing to disclose.
I ceppi di S. aureus SF8300 WT e SF8300 ΔfnbA/B sono stati generosamente donati dal Prof. Binh Diep (Università della California, San Francisco, USA). Questo lavoro è stato sostenuto da una sovvenzione dell’associazione FINOVI (#AO13 FINOVI) sotto l’egida della Fondazione per l’Università di Lione.
24-well plate | CORNING-FALCON | 353047 | |
A549 cell line | ATCC | CCL-185 | |
Acetate buffer solution pH 4.6 | Fluka | 31048 | Used to prepare lysostpahine stock solution at 10 mg/mL in 20 mM sodium acetate. |
AMBICIN (Recombinant lysostaphin) | AMBI | LSPN-50 | Lyophilized recominant lysostaphin. Freeze at -80 °C for long-term storage. |
COS – Colombia agar + 5% sheep blood | Biomerieux | 43049 | Any agar plate suitable for growing staphylococci can be used instead. |
Densitometer WPA CO8000 | Biochrom Ltd. | 80-3000-45 | Cell density meter |
Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium, high glucose with phenol red | Sigma-Aldrich | D6429 | |
Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium, high glucose without phenol red | Sigma-Aldrich | D1145 | |
Dulbecco’s Phosphate Buffered Saline | Sigma-Aldrich | D8537 | |
Dulbecco′s Phosphate-buffered Saline with MgCl2 and CaCl2, sterile-filtered | Sigma-Aldrich | D8662 | |
Dulbecco′s Phosphate-buffered Saline, sterile-filtered | Sigma-Aldrich | D8537 | |
Easyspiral dilute | Interscience | 414000 | Automatic diluter and spiral plater |
Fetal bovine serum | Gibco | 10270-106 | |
HaCaT cell line | Cell lines service (CLS) | 300493 | |
Hoechst 33342, Trihydrochloride, Trihydrate, 10 mg/mL Solution in Water | Fisher scientific | 11534886 | |
Propidium iodide, 1.0 mg/mL solution in water | Invitrogen | P3566 | |
Proteinase K, recombinant 20 mg/mL | Eurobio | GEXPRK01-B5 | > 30 U/mg, lot 901727 |
Scan 4000 | Interscience | 438000 | Automatic colony counter |
Sterile water | OTEC | 600500 | |
T-75 culture flask | CORNING-FALCON | 353136 | |
TC20 Automated cell counter | Biorad | 1450102 | Automatic cell counter |
Tris 1 M pH 8.0 | Invitrogen | AM9855G | Used to prepare lysostaphine working solution at 1 mg/mL in 0.1 M Tris-HCl. |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | |
Trypsin – EDTA solution | Sigma-Aldrich | T3924 | 0.05% porcine trypsin and 0.02% EDTA in Hanks′ Balanced Salt Solution with phenol red |
Wide-field fluorescence microscope | Nikon | Ti2 |