El ensayo de alimentación de microplacas ofrece un método económico y de alto rendimiento para cuantificar el consumo de alimentos líquidos en Drosophila. Un dispositivo impreso en 3D conecta una microplaca de 96 pozos en la que las moscas se alojan a una microplaca de 1536 pozos de la que las moscas consumen una solución de alimentación con un tinte trazador. La disminución del volumen de la solución se mide espectrofotométricamente.
La cuantificación de la ingesta de alimentos en Drosophila se utiliza para estudiar los fundamentos genéticos y fisiológicos de los rasgos asociados al consumo, sus factores ambientales y los efectos toxicológicos y farmacológicos de numerosas sustancias. Pocos métodos implementados actualmente son susceptibles de medición de alto rendimiento. El Microplate Feeder Assay (MFA) fue desarrollado para cuantificar el consumo de alimentos líquidos para moscas individuales utilizando absorbancia. En este ensayo, las moscas consumen un medio alimenticio líquido de pozos seleccionados de una microplaca de 1536 pozos. Al incorporar un colorante trazador diluido en el medio alimentario líquido y cargar un volumen conocido en cada pozo, las mediciones de absorbancia del pozo adquirido antes y después del consumo reflejan el cambio resultante en el volumen (es decir, el volumen consumido). Para permitir el análisis de alto rendimiento con este método, se diseñó un acoplador impreso en 3D que permite clasificar las moscas individualmente en microplacas de 96 pozos. Este dispositivo orienta con precisión las microplacas de 96 y 1536 pozos para dar a cada mosca acceso a hasta 4 pozos para el consumo, lo que permite la cuantificación de la preferencia de alimentos además del consumo regular. Además, el dispositivo tiene tiras de barrera que alternan entre posiciones abiertas y cerradas para permitir la contención controlada y la liberación de una columna de muestras a la vez. Este método permite mediciones de alto rendimiento del consumo de soluciones acuosas por muchas moscas simultáneamente. También tiene el potencial de adaptarse a otros insectos y para detectar el consumo de nutrientes, toxinas o productos farmacéuticos.
Drosophila melanogaster ha visto un amplio uso como un organismo modelo genético para estudiar los fundamentos biológicos de la ingesta de alimentos y los rasgos asociados con el consumo1. Se estima que el 65% de los genes causantes de enfermedades humanas tienen homólogos funcionales en moscas, y una proporción significativa de ellos se expresan en tejidos funcionalmente equivalentes entre moscas y humanos2. Además, el tamaño de D. melanogaster, el corto tiempo intergeneracional, el mantenimiento simple y la manejabilidad genética lo convierten en un modelo atractivo para estudios sobre el consumo de nutrientes3,4 y los efectos toxicológicos y farmacológicos de una variedad de sustancias, incluidos insecticidas5,contaminantes6,productos farmacéuticos7y drogas de abuso8,9,10.
En muchos casos, el estudio de tales rasgos requiere una cuantificación precisa del consumo. Los métodos para cuantificar el consumo son diversos e incluyen el ensayo CApillary FEeder (CAFE)11,el ensayo MAnual FEeding (MAFE)12,el ensayo Proboscis Extension Response (PER)13, laextracción de colorante trazador14,15, la extracción del trazador de oligonucleótidos16y la extracción de radioisótopos5,17. Los esfuerzos recientes se han centrado en mejorar el rendimiento de estos ensayos, como en el ensayo Expresso18 o el sistema FLat de alimentación animal entera (WAFFL) basado enplacas 19. A pesar de su utilidad, estos ensayos pueden ser complicados, costosos o laboriosos, lo que dificulta su uso en estudios de alto rendimiento.
Figura 1: Componentes del ensayo del alimentador de microplacas. (A) Representación 3D del ensayo de alimentador de microplacas ensamblado. La microplaca de 1536 pozos está orientada por el acoplador impreso en 3D de tal manera que cada pozo de la microplaca inferior de 96 pozos tiene acceso a cuatro pozos de la microplaca superior de 1536 pozos. El acceso a los pozos se puede controlar ajustando la posición de las tiras de barrera ranuradas a través del acoplador. (B) Una representación gráfica de cada pozo del ensayo alimentador de microplacas. Las soluciones de consumo se retienen en cada pozo utilizando una película de sellado que ha sido perforada para permitir el acceso por la mosca. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 2: Descripción general de los procedimientos en el ensayo de alimentación de microplacas. La figura muestra un diagrama de flujo que corresponde a los pasos 4.1-5.8 del protocolo. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Para superar estos obstáculos, el Microplate Feeder Assay (MFA; Figura 1) se desarrolló. En este ensayo, las moscas se alojan individualmente en microplacas de 96 pozos. Cada microplaca se acopla a una microplaca de 1536 pozos utilizando un dispositivo personalizado impreso en 3D. El dispositivo orienta con precisión las dos placas de tal manera que cada mosca en su respectivo pozo de la placa de 96 pozos tiene acceso a 4 pozos de la microplaca de 1536 pozos. Mediante el uso de una placa de 1536 pozos sin fondo y películas de sellado, las soluciones se dispensan en pozos seleccionados y se perforan con agujas precisas de 0,25 mm de diámetro para proporcionar acceso a las moscas. Críticamente, permitir el consumo directamente desde una microplaca permite mediciones inmediatas basadas en la absorbancia utilizando un lector de microplacas. Se incorpora un colorante trazador diluido en el medio de consumo, y el cambio en la absorbancia después de la exposición se utiliza para determinar el volumen consumido(Figura 2 y Figura 3). Dado que el líquido en cada pozo se aproxima a una columna de líquido, las diferencias volumétricas se manifestarán como diferencias en la altura de la columna. (Figura 3A) Según la ley Beer-Lambert20:
donde A es la absorbancia, ε es el coeficiente de absorción molar para el analito atenuante, l es la longitud de la trayectoria óptica y c es la concentración del analito atenuante. Por lo tanto, con un coeficiente de absorción molar y una concentración constantes, los cambios en la absorbancia se deben únicamente a cambios en la trayectoria de la luz óptica, es decir, el nivel de fluido dentro de un pozo dado. Al medir la absorbancia antes y después de la exposición, el cambio proporcional en la absorbancia refleja el cambio proporcional en el volumen(Figura 3B).
Figura 3: Cuantificación basada en la absorbancia del volumen del pozo. (A) Luz incidente de intensidad de entrada conocida (I0) atraviesa cada pozo. La atenuación de la luz en diferentes volúmenes de llenado produce diferentes intensidades de salida(I),exhibiendo una relación lineal entre volumen y absorbancia. (B) Medición empírica de absorbancia vs. volumen. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Sobre la base del cambio en el volumen, la cantidad de cualquier compuesto ingerido se puede calcular a partir de su concentración conocida en la solución de alimentación. Las piezas necesarias para el ensayo son de bajo costo y tienen un alto grado de reutilización, lo que reduce sustancialmente el costo recurrente del ensayo. Por lo tanto, este procedimiento ofrece un método asequible y de alto rendimiento para cuantificar con precisión el consumo.
El estudio describe un nuevo protocolo para cuantificar el consumo en Drosophila:el Microplate Feeder Assay (MFA). En este ensayo, las moscas consumen de pozos sellados de una microplaca de 1536 pomos a través de perforaciones de tamaño controlado(Figura 1, Figura 2; Video complementario S.1). Dado que los alimentos líquidos se tiñen y se proporcionan a través de microplacas, las mediciones de la absorbancia óptica de los alimentos se pueden obtener utilizando un espectrofotómetro de microplacas (Figura 3). De esta manera, el consumo se determina comparando la absorbancia antes y después del consumo, y luego aplicando esta proporción al volumen conocido dispensado antes del consumo. Esto se verificó empíricamente midiendo la absorbancia de diferentes volúmenes del medio teñido (Figura 3B).
Para desarrollar este ensayo, se necesitaba un dispositivo que pudiera aprovechar la cuantificación del consumo basada en la absorbancia. Probar moscas en un formato de microplaca es atractivo porque complementa la microplaca utilizada para dispensar alimentos y permite flexibilidad en la selección de múltiples formatos de placa (por ejemplo, formatos de 6, 12, 48 o 96 pozos) ajustando la geometría del acoplador. Se eligió un formato de microplaca de 96 pozos para permitir el cultivo individual de moscas.
El dispositivo impreso en 3D(Figura 1)orienta con precisión la placa alimentadora de 1536 pozos con la placa de cultivo de 96 pozos, dando a cada mosca acceso a hasta 4 pozos de la placa alimentadora para el consumo. Además, para proporcionar el tiempo adecuado para distribuir moscas en la placa de alojamiento y controlar el inicio del ensayo, el dispositivo incluye tiras de barrera de alternado que contienen las moscas en sus respectivos pozos y la prevención de brechas. Se proporcionan los archivos necesarios para adquirir o modificar estas piezas (Archivos complementarios S.2–S.3), así como las instrucciones de fabricación necesarias para las piezas pertinentes (Archivo complementario S.4).
El MFA proporciona un método simple de alto rendimiento que complementa los métodos más elaborados para monitorear el comportamiento de alimentación de Drosophila18,21,22. El MFA ofrece múltiples ventajas sobre otros métodos utilizados para cuantificar la ingesta de alimentos. El rendimiento se incrementa cuantificando el consumo utilizando un lector de placas. Esto elimina las mediciones manuales y evita la entrada manual de datos. Los datos también son susceptibles de extracción y procesamiento programático. Además, el mayor rendimiento aumenta el número factible de réplicas biológicas, particularmente en comparación con los diseños de alimentadores comunales, lo que aumenta sustancialmente el poder para detectar pequeñas diferencias en el consumo. Usando el MFA, un solo experimentador puede cuantificar el consumo o la preferencia de más de 500 moscas por ejecución nocturna del ensayo. Al superponer las ejecuciones del ensayo, se pueden probar más de 2,000 moscas en un período de 5 días. Por último, hay ahorros de costos a largo plazo debido a la reutilización de microplacas y acopladores (Expediente Suplementario S.5). Usando el MFA, el costo estimado por ensayo puede ser tan bajo como $ 14.80, con un costo inicial de $ 127.60 para el equipo. Utilizando el clásico ensayo CApillary FEeder (CAFE), que requiere costosos microcapilarios de precisión, el costo estimado por ensayo para un número comparable de réplicas es de $ 46.08. Por lo tanto, si bien hay una inversión inicial en la adquisición del equipo necesario, la reducción de los costos recurrentes puede conducir a ahorros sustanciales, particularmente en los casos en que se realizan pruebas repetidas.
Al igual que con todos los ensayos, el MFA tiene ciertas limitaciones. Principalmente, requiere acceso a un espectrofotómetro de microplacas capaz de leer microplacas de 1536 pozos. Además, la dependencia de las mediciones de absorbancia para la cuantificación hace que el método sea susceptible a la interferencia óptica. Esto se manifiesta como valores de consumo negativos para un pequeño subconjunto de muestras analizadas. Los nutrientes, medicamentos, productos farmacéuticos o toxinas de interés también deben ser solubles en agua para ser compatibles con el ensayo.
A pesar de sus limitaciones, este método ofrece un método de alto rendimiento para cuantificar los comportamientos de consumo en Drosophila. Además, el dispositivo de acoplamiento podría modificarse fácilmente para aceptar muchos formatos de placa, lo que le permite acomodar una variedad de especies de insectos.
The authors have nothing to disclose.
Este trabajo fue apoyado por una subvención del Instituto Nacional sobre el Abuso de Drogas (U01 DA041613) a TFCM y RRHA.
0.25 mm Diameter Needers | Rave Scientific | RS-MN-52-001012 | |
0.45 µm Syringe Filters | Olympus Plastics | 25-245 | |
10 mL Disposable Syringe | EXELINT | 26200 | |
Agarose | Fisher Scientific | BP1600 | |
Barrier Strips (Laser Cut) | Ponoko | – | Material: clear PETG, 0.5mm thickness; Supplementary File: |
Centrifuge 5810 R | Eppendorf | 22625501 | |
Centrifuge Rotor A-4-62 with micro-titer plate buckets | Eppendorf | 22638041 | |
FD&C Blue #1 | Spectrum Chemical Mfg Corp | FD110 | |
Film Sealing Paddle | Fisher Scientific | 50-563-280 | |
Flystuff Flypad | Genesee Scientific | #59-114 and #59-119 | CO2 Anesthesia: The Flypads come in two sizes, either of which is appropriate |
Microplate Coupler (3D Printed) | Shapeways | – | Material: Multi Jet Fusion nylon (MJF PA12); Supplementary File: |
Microplate Lids | Greiner Bio-One | 656170 | |
Molecular Devices SpectraMax iD5 | Molecular Devices | – | Any microplate reader with 1536-well resolution will do. |
Needle Probe Holder | Rave Scientific | RS-MN-52-001000 | |
Polyester Sealing Film | Excel Scientific, Inc. | 100-SEAL-PLT | |
Polystyrene 96-well microplates | Greiner Bio-One | 655101 | |
Polystyrene, Bottomless, 15396-well microplates | Greiner Bio-One | 783000 | Made to Order; allow for adequate lead time when purchasing. |
Rubber Bands | |||
Sucrose | Sigma | S7903 | |
Weather Stripping | 1/2" x 1/8" High Density Self Adhesive Neoprene Rubber | ||
Yeast Extract | Fisher Scientific | BP1422 |