זוהי שיטה לבודד תאי לימפה הרחם מעכברים בהריון ולא בהריון. שיטה זו יכולה לשמש עבור יישומים במורד הזרם מרובים כגון פנוטיפינג FACS, מיון תאים, בדיקות פונקציונליות, RNA-seq, ופרוטומיקה. הפרוטוקול כאן מדגים כיצד פנוטיפ קבוצה 1 תאי לימפה מולדים הרחם על ידי ציטומטריית זרימה.
מתואר כאן היא שיטה פשוטה לבודד פנוטיפ קבוצת עכבר 1 תאי לימפה מולדים הרחם (g1 uILCs) מן הרחם ההריוני בודדים על ידי ציטומטריית זרימה. הפרוטוקול מתאר כיצד להגדיר זמן הזדווגות כדי להשיג סכרים סינכרוניים מרובים, העיכול המכני והאנזימטי של הרחם ההרה, הכתמת השעיות של תא יחיד, ואסטרטגיה FACS פנוטיפ ולהפלות uILCs g1. למרות ששיטה זו מאבדת בהכרח את המידע המרחבי של הפצה תאית בתוך הרקמה, הפרוטוקול הוחל בהצלחה כדי לקבוע את הטרוגניות uILC, תגובתם לגורמים אימהיים ועובריים המשפיעים על ההריון, פרופיל ביטוי הגנים שלהם ותפקודיהם.
מתואר כאן היא שיטה פשוטה כדי להשיג תשואה גבוהה של לימפוציטים מולדים הרחם מן הרחם ההרה הפרט. שיטה זו משמרת ביטוי ופונקציונליות משטח חלבון של לימפוציטים מולדים ברחם והיא מתאימה ליישומים הבאים כגון פנוטיפינג FACS, RNAseq, פרוטאומיקה או בדיקות פונקציונליות. כאן, ההתמקדות היא על פנוטיפינג של uILCs קבוצה 1 על ידי ציטומטריה זרימה.
הרחם מורכב משלוש שכבות: רירית הרחם, מיומטריום וחלים (איור 1). רירית הרחם היא הרירית, רירית לומן של הרחם. פרוגסטרון, המיוצר על ידי הקורפוס לוטאום, ממיר את רירית הרחם לתביעה. myometrium מורכב משתי שכבות של שריר חלק המרכיבים את דופן הרחם. ה- perimetrium הוא הסרוזה העוטפת את הרחם ומחברת אותו אל הצפק דרך הרצועה הרחבה הנקראת מזומטריום. בחתך של הרחם, החלק שממול ללומן נקרא הצד המוזנטרי, ואילו החלק הקרוב ללומן נקרא הצד האנטי-מיוזטריאלי. מגוון של לויקוציטים אימהיים מאכלסים את רירית הרחם ואת decidua, כולל כמה סוגים של תאים, שבו תאי החיסון המולדים מייצגים את הרוב המכריע של התאים. תאי לימפה מולדים (ILCs), מקרופאגים, תאים דנדריטיים (DC), כמו גם לימפוציטים CD4+ ו- CD8+ T, תאי T רגולטוריים (Tregs) ותאי B נדירים, עשויים כולם למלא תפקידים חשובים בוויסות סביבת הרחם לאורך ההריון1,2. ILCs ברחם נמצאים לא רק ברירית, אלא גם myometrium בעכברים. כולל כל שלוש הקבוצות של ILCs, הרחם הוא אכן האיבר המאוכלס בצפיפות הגבוהה ביותר על ידי קבוצה 1 ILCs. עם השינוי המבני של רקמות הרחם במהלך ההיריון, גם מספר ושיעורם של לויקוציטים ברחם משתנים (ראה איור 2A לדוגמה של שינויים באחוז קבוצות המשנה של uILC קבוצה 1)3,4.
כאשר עכברים מכונים במאמר זה, זן C57BL/6 של עכברי מעבדה מלידה נועד. עכברים מלידה (למשל, עכברי NMRI) משמשים לעתים קרובות במחקר הרבייה בגלל קצב הרבייה הגבוה שלהם. עם זאת, השימוש בזנים מלידה נחוץ כדי לייצר תוצאות עקביות, והרקע הגנטי האהוב על אימונולוג הוא C57BL/6, הידוע גם בשם B6.
כ -30% של לויקוציטים הרחם בסכרי B6 באמצע ההריון הם uILCs g1, אשר מוגדרים על ידי cytometry זרימה כמו CD45 קיימא + CD3-CD19-NK1.1 +NKp46 + תאים (איור 2B): NK פרו-אנגיוגניים תושב רקמה (trNK), IFN-g המייצר NK קונבנציונאלי (cNK) ו uILC14,5. אחוז תאי uNK הוא אפילו גבוה יותר בבני אדם, להגיע כ 70% בשליש הראשון6. ישנם קווי דמיון יותר מאשר הבדלים בין uNK אנושי ועכבר ו uILC7,8. למרות שחשוב לזכור את ההבדלים, כדאי לשלב מידע זמין על שני המינים. כאשר משלבים מידע המתקבל מחקירת uILC בבני אדם ומכרסמים במעבדה, ברור שתאי NK מסייעים בשינויים הומיאוסטטיים החיוניים לביולוגיה של הרחם, כולל שמירה על שלמות העורקים9 ושיפוץ עורקים ספירליים10, כמו גם פלישת trophoblast11,12. הם גם ממלאים תפקידים ספציפיים בהגנה נגד פתוגנים13,14. בעכברים וחולדות, מלבד מילוי ההחלטה סביב אתר ההשתלה, תאי NK מצטברים בין שתי שכבות השריר של myometrium של סכרים במבנה חולף המכונה צבירה לימפואידית Mesometrial של הריון (MLAp)15 (איור 1B), הידוע גם בעבר כמו בלוטת המשפט, שתפקודו טרם התגלה.
המתואר כאן הוא פרוטוקול מפורט של השיטה המשמשת במעבדה כדי לבודד לימפוציטים מן הרחם של עכברים בהריון באמצעות שילוב של פירוק מכני ועיכול אנזימטי. כמו הרחם כולו משמש בשיטה, לימפוציטים מבודדים מהרחם במהלך ההריון הם תערובת של תאי רירית הרחם והחלטי. ניתוח נוסף של ההחלטה מקיר הרחם וה- MLAp שלה אפשרי, והוא תואר לפני 16. השיטה המתוארת כאן פותחה כדי להשיג לימפוציטים ברחם תוך שמירה על ביטוי פני השטח של החלבון, פונקציונליות התאים וההימור. התוצאה היא השעיית תא בודד עם פסולת תאית שיורית מינימלית ותשואה הנעה בדרך כלל בין 1-5 מיליון תאים באמצע ההריון (10.5 ימים) לרחם בהריון. היישומים של שיטה זו מקיפים phenotyping על ידי ציטומטריית זרימה, מיון תאים למחקרים שעתוק או פרוטאומיים הבאים, מחקרים פונקציונליים כגון ייצור ציטוקינים תאיים, degranulation, ELISPOT או בדיקות ציטוטוקסיות. הפרוטוקול המוצג כאן מתמקד בזיהוי קבוצה 1 ILCs אך ניתן להתאים אותו לסוגי תאים אחרים כגון ILCs אחרים, תאי T, תאי B, DC או מקרופאגים עם שינויים קלים בלוח הנוגדנים המשמש לניתוח FACS. הפרוטוקול יכול לשמש גם כדי לבודד תאים מרקמות אחרות עבור רחם שאינו בהריון.
השיטה מכילה מספר שלבים קריטיים הנידנים להלן. הצעד הקריטי הראשון הוא להשיג הריונות סינכרוניים מרובים כמו התדירות היחסית של אוכלוסיות לויקוציטים משתנה דרך ההריון. לאחר סכרים מרובים באותו יום ההריון מאפשר גם חזרות ביולוגיות באותם ניסויים או איגום לימפוציטים מסכרים בודדים כדי להשיג מספרים גדולים יותר הנדרשים עבור יישומים במורד הזרם. הזדווגות מתוזמן מאפשרת לחוקר להצביע על התעברות בתוך תקופה של 24 שעות. למרות עכברים לחיות סביב 2.5 שנים, הם יהיו בגיל הרבייה מ 4-7 שבועות עד 6-8 חודשים. כמו עכברים צעירים בדרך כלל לייצר גורים קטנים יותר, עכברים נקבה בדרך כלל אינם זוייפים עד שהם בין 6-8 שבועות, ועכברים זכרים עד שהם בין 8-10 שבועות. בהתחשב בכך שאסטרוס נמשך כ-15 שעות בעכברים ומתרחש כל 4-5 ימים, שיעור ההזדווגות הטיפוסי (שנחשף על ידי תקע בנרתיק, ראו איור 4) הוא כ-25%. לכן חשוב להשתמש בעכברים בestrus ולתכנן מספרים מספיקים כדי להשיג את המספר הנדרש של סכרים לניסוי נתון. שלב מחזור estrus יכול להיקבע על ידי ציטולוגיה מריחה בנרתיק22. קצב התקע יכול להשתפר על ידי מנוחה זכרים 48 שעות לפני ההזדווגות ועל ידי ניצול אפקט וויטן18. לחלופין, ניתן לנהל סרום סוסה בהריון, אשר מחקה את ההשפעה של הורמון מגרה זקיק אנדוגני, גרימת התבגרות ביציות, 42-50 שעות מאוחר יותר, גונדוטרופין כוריוני אנושי, אשר מחקה את ההשפעה של הורמון הלוטאין אנדוגני, גרימת ביוץ. טיפול הורמונלי זה עוקף את הדרישה לאסטרו והופך כמעט את כל הנקבות המטופלות לפתולוגיות.
צעד קריטי שני הוא להבטיח את איכות הכתמת ה- FACS. נוגדנים המשמשים ציטומטריית זרימה חייב תמיד להיות titrated ולהשתמש בריכוז האופטימלי, ויש צורך לבדוק כי העיכול אנזימטי אינו לבקע אפיטופים אנטיגניים חיוניים. כדי להעריך אם אנזים יבקע אפיטופ, אפשר להכתים שני שברים של אותה דגימה במקביל, אחד עובר אנזימטי והשני עיכול מכני. באופן דומה, השימוש בפקדים מתאימים וכתמים בודדים חיוני להשגת נתונים אמינים. עבור אירועים נדירים, חרוזים יכולים לשמש ליצירת דגימות כתם יחיד. מומלץ לא להשתמש חרוזים להגדרת מתחים אלא אוכלוסייה של תאים המכילים לימפוציטים וליקוציטים אחרים, כגון טחול. אם נעשה שימוש חרוזים, יש צורך titrate נוגדנים עבור כתמי חרוזים, כך עוצמת פלואורסצנטיות של חרוזים מוכתמים יהיה דומה לעוצמת הפלואורסצנטיות של תאים. במקרה של קושי בהפרדה חיובית מתאים שליליים עבור סמן מסוים, בקרת FMO יכולה לשמש גם כדי להקל על gating עבור סמן מסוים. במקרה של סמנים תאיים, בקרת איזוטיפ חייבת לשמש כתם תאי עלול לגרום שאריות נוגדנים לא מאוגדים, אשר עשוי עדיין להיות נוכח בתוך תאים לאחר צעדי הכביסה ולכן להגדיל את אות הרקע. מומלץ להפעיל את הדגימות בתוך 24 שעות של תיקון התאים כדי להשיג את התוצאות הטובות ביותר phenotyping על ידי ניתוח FACS, כמו autofluorescence עולה באופן משמעותי לאורך זמן ועוצמת פלואורסצנטיות של נוגדנים מסוימים עשוי לרדת עם הזמן.
גורם מכריע נוסף שיש לקחת בחשבון הוא היישום במורד הזרם של ההשעיה של תא יחיד המתקבל עם הפרוטוקול. עבור בדיקות פונקציונליות, זה חיוני לעבוד בתנאים סטריליים. באופן דומה, עבור מחקרים omics הבאים, חשוב לעבוד סטרילי RNase, DNase ו protease ללא.
הפרוטוקול המוצג כאן מתמקד קבוצת phenotyping 1 ILCs אבל יכול להיות מותאם עבור פנוטיפינג סוגי תאים אחרים על ידי שינוי לוח הנוגדנים. מומלץ כי כל הנוגדנים נבדקים נגד השעיית תאים מעוכל ולא מעוכל כדי לזהות את האובדן / שינוי של אפיטופים פני השטח על ידי הטיפול אנזימטי. באופן דומה, אנזימים שונים יכולים לשמש כדי לעכל את הרקמה ולהגדיל את תפוקת התא, אבל השפעתה על אפיטופים אנטיגניים חיוניים יש ללמוד בקפידה. בעוד NKp46 הוא סמן טוב עבור תאי NK טחול ועובד בכל הזנים של עכברי מעבדה, הביטוי של NKp46 על תאי uNK בעכברים C57BL / 6 הוא נמוך בהרבה מאשר על תאי טחול NK. עדיף להכתים הן עבור NK1.1 והן עבור NKp46 בו זמנית. אם יש להשוות איברים מרובים ישירות, מומלץ לטפל בכל הדגימות באופן שווה, גם אם העיכול אנזימטי אינו נדרש עבור רקמות כגון הטחול או מח העצם. למרות שהשיטה המוצגת כאן חלה על הרחם הלא בהריון, בידוד טבעת הלימפוציט על ידי שיפוע פרקול דו פאזי יהיה מאתגר, והתשואה של תאים מבודדים עשויה להיות נמוכה מדי לניתוח FACS אמין ולכן תדרוש צירוף תאים מבודדים מהרחם של עכברים בודדים, שאינם בהריון23.
ישנן מגבלות לפרוטוקול לשקול לפרשנות הנתונים. כפי שזה המקרה עבור כל הרקמות, לימפוציטים במחזור המגיעים מן הדם יהיה מבודד לצד תאים תושב רקמות. אם הדרת לימפוציטים במחזור חיונית לפרשנות נתונים, ניתן לבצע כתמים תוך-וינטליים כדי לתייג תאים במחזור. יתר על כן, מגבלה שנייה לפרוטוקול היא כי תאים מסוימים יאבדו כמו לא כל התאים ניתן לחלץ מן הרקמה. הבעיות הנפוצות ביותר ופתרון הבעיות שלהן מוצגות בטבלה 2.
מבחינה היסטורית, המחקר של תאים ברקמות הסתמך על בדיקה היסתולוגית של קטעי רקמות. הסקירה המצוינת של סנדרה פיל24 מסכמת את העבודה שנעשתה במשך יותר מ-100 שנה עד סוף שנות ה-80. תיאורים של תאים הידועים מאוחר יותר כתאי uNK אכן מופיעים בכתבי יד שפורסמו יותר מחצי מאה לפני שהלימפוציטים התגלו אפילו. אז, לפני גילוי של תאי NK בשנת 1975, ותאי uNK צוינו כתאי גליקוגן אימהיים או תאי בלוטת מיטראלי מגורען. אן קרוי תרמה תרומות גדולות בתחום25 ולימדה בחביבות את הצוות את הניתוח שהיא יטבה3, וכי הוא משמש כיום. למרות שזה אינסטרומנטלי בתיאור המורפולוגיה ומיקום הרקמה של תאי uNK, בדיקה היסתולוגית קלאסית מוגבלת לגילוי של רק כמה סמנים על התאים מעניינים. בשנת 2008 תוארה שיטה מבוססת ציטומטריית זרימה לזיהוי סמנים מרובים על לימפוציטים ברחם. זוהי למעשה השיטה שתוארה במאמר זה. טכנולוגיות עדכניות יותר כגון תמלול מרחבי והדמיה על ידי ציטומטריה המונית משלבות את כוחה של ההסטולוגיה וציטומטריית הזרימה, ומאפשרות הן זיהוי סימולטני של גנים או חלבונים מרובים, בהתאמה, והן שימור ארכיטקטורת הרקמות הרגילה.
היישומים של השיטה המתוארת כאן הם מרובים וכוללים פנוטיפינג FACS, בדיקה פונקציונלית (כגון ELISPOT, degranulation או בדיקות ציטוטוקסיות), מיון תאים, ו transcriptomics או proteomics הבאים. יישומים נוספים שניתן לפתח על בסיס שיטה זו כוללים את התרבות וההתרחבות של תאי NK החלטה לאחר מיון תאים או העשרה על ידי דלדול שלילי. נכון לעכשיו, אין פרוטוקול לתרבות ולהרחבת תאי uNK עכבר ולשמור על הכדאיות והפונקציונליות שלהם לתקופה ממושכת, באופן דומה לתאי NK אנושיים שניתן לטפח ולהרחיב במשך 7-14 ימים על ידי תוספת IL-2 או שילוב IL-12 ו- IL-15. אופטימיזציה של שיטה כזו עבור תאי uNK עכבר יספק גמישות רבה יותר בעת ביצוע בדיקות פונקציונליות ולאפשר תנאים מרובים להיבדק עם מספר תאים גבוה יותר. מצד שני, תנאי תרבות ידועים לשנות את הפנוטיפ הייחודי של לימפוציטים ואולי גם את תפקידם.
The authors have nothing to disclose.
אנו מודים לחברי הצוות הקודמים וההווה שעזרו לפתח שיטה זו, כולל ז’אן-מארק דויסן, נורמן שרייב, איווה פיליפוביץ ‘ ואניטה קוואלס. מחקר זה מומן על ידי קרן Wellcome [מספר גרנט 200841/Z/16/Z] ומועצת המחקר הרפואי (MR/P001092/1). לצורך גישה פתוחה, המחבר יישם רישיון זכויות יוצרים ציבורי של CC BY על כל גירסת כתב יד מקובלת של מחבר הנובעת מהגשה זו.
70 µm cell strainers | Falcon | 352350 | |
BSA | Sigma | A9647-100G | |
CD19 antibody | BD | 562701 | |
CD3 antibody | BD | 562600 | |
CD45 antibody | BioLegend | 103108 | |
CD49a antibody | BD | 740262 | |
DNase I | Roche (Sigma) | 10104159001 | |
EOMES antibody | eBioscience | 12-4875-82 | |
Fc block Trustain fcx | BioLegend | 101320 | |
Fetal Bovine Serum | Gibco | 10217-106 | |
Fix/Perm buffer (part of BD Cytofix/Cytoperm Fixation/Permeabilization Kit) | BD | 554714 | |
HBSS, calcium, magnesium, no phenol red | Gibco | 14025092 | |
Liberase DH | Roche (Sigma) | 5401089001 | |
Lysis buffer Pharmlyse | BD | 555899 | |
NK1.1 antibody | BioLegend | 108739 | |
NKp46 antibody | BioLegend | 137608 | |
Paraformaldehyde 16% Solution (methanol-free) | Agar Scientific | AGR1026 | |
PBS 10x | Gibco | 14030-048 | |
PBS 1x (no Ca2+ or Mg2+) | Thermo Scientific | 14190144 | |
Percoll | VWR international | 17-0891-01 | |
Phosphate buffered saline | Sigma-Aldrich | P5368-10PAK | |
Pre-Separation filters | Miltenyi | 130-095-823 | |
RMPI-1640 medium + GlutaMAX | Gibco | 61870-010 | |
UltraPure 0.5M EDTA, pH 8.0 | Thermo Scientific | 15575020 | |
Zombie Violet Fixable Viability dye | BioLegend | 423113 |