يمكن ربط البروتينات والليجانات المحتوية على الأمين بشكل مشترك بالبوليساتتشاريدات التي ينشطها كاشف السيانيل، 1-سيانو-4-ديميثيلامينوبريدين رباعي فلوريبوروبورات (CDAP)، لتشكيل البروتين التساهمي (ليغاند) -polysaccharide المصاحبة. توضح هذه المقالة بروتوكول محسن لتنفيذ تنشيط CDAP الخاضعة للرقابة عند 0 درجة مئوية و درجة الحموضة متفاوتة وإجراء اقتران اللاحقة من السكريات المنشطة.
اللقاحات المصاحبة هي تقدم ملحوظ في علم اللقاحات. لإعداد اللقاحات المترافقة مع السكريات المتعددة، يمكن تشغيل السكريات بشكل ملائم وربطها بالبروتينات الناقلة لللقاحات باستخدام 1-سيانو-4-ديميثيلامينوبيريدين رباعي فلوريدين (CDAP)، وهو كاشف سيانيلاتينغ سهل المعالجة. CDAP ينشط السكريات عن طريق التفاعل مع مجموعات هيدروكسيل الكربوهيدرات في PH 7-9. الاستقرار والتفاعل من CDAP تعتمد بدرجة عالية على درجة الحموضة. انخفاض درجة الحموضة من رد الفعل أيضا أثناء التنشيط بسبب التحلل المائي للCDAP، مما يجعل درجة الحموضة جيدة السيطرة على مفتاح لتنشيط استنساخها. تم تنفيذ بروتوكول تنشيط CDAP الأصلي في درجة حرارة الغرفة في حلول درجة الحموضة 9 غير المكتومة.
بسبب رد الفعل السريع في ظل هذه الحالة (<3 دقيقة) وانخفاض الرقم الحموضة السريع المصاحب من التحلل المائي السريع CDAP ، كان من الصعب ضبط درجة الحموضة المستهدفة والحفاظ عليها بسرعة في الإطار الزمني القصير. يتم تنفيذ البروتوكول المحسن الموصوف هنا عند 0 درجة مئوية ، مما يبطئ التحلل المائي CDAP ويمدد وقت التنشيط من 3 دقائق إلى ~ 15 دقيقة. كما تم استخدام Dimethylaminopyridine (DMAP) كمخزن مؤقت لضبط حل السكريات مسبقا إلى الرقم الحموضة لتنشيط الهدف قبل إضافة كاشف CDAP. وقت رد الفعل أطول، إلى جانب تحلل هيدروليسيس CDAP أبطأ واستخدام المخزن المؤقت DMAP، يجعل من الأسهل للحفاظ على درجة الحموضة التنشيط لكامل مدة عملية التنشيط. البروتوكول المحسن يجعل عملية التنشيط أقل المحمومة، وأكثر استنساخا، وأكثر قابلية للتوسع.
اللقاحات المصاحبة، مثل تلك التي تتكون من السكريات المتعددة المرتبطة بشكل مشترك إلى بروتين الناقل، هي من بين التقدم الملحوظ في علم اللقاحات1،2. السكريات، كما مستضدات تي الخلية المستقلة، هي المناعة سيئة في الرضع ولا تحفز الذاكرة، والتحول الطبقي، أو نضوج تقارب الأجسام المضادة3. يتم التغلب على أوجه القصور هذه في اللقاحات متعددة الشاريد المصاحبة4. وبما أن معظم السكريات ليس لديها مقبض كيميائي مناسب للإترافق ، فيجب أولا أن تكون تفاعلية أو “نشطة”. ثم يتم ربط البوليساكريد المنشط إما مباشرة مع البروتين (أو البروتين المعدل) أو يتم تفعيله للحصول على اشتقاق إضافي قبل اقتران4. تستخدم معظم اللقاحات المرخصة متعددة الشاريد المصاحبة إما الأمينية الاختزالية أو السيانيل لتنشيط هيدروكسيلات البوليساكريد. بروميد السيانوجين (CNBr)، وهو كاشف كان يستخدم في السابق لتنشيط راتنجات الكروماتوغرافيا، كان يستخدم في البداية لاستخلاص الشاريد المتعدد. ومع ذلك، يتطلب CNBr درجة الحموضة عالية، عادة ~ درجة الحموضة 10.5 أو أكثر، لإلغاء بروتونات جزئيا هيدروكسيلات البولي ساكريد بحيث تكون نوكليوفليك بما فيه الكفاية لمهاجمة مجموعة سيانو. ارتفاع درجة الحموضة يمكن أن تكون ضارة ل polysaccharides قاعدة labile، ولا CNBr ولا السيانو-إستر النشطة التي تشكلت في البداية مستقرة بما فيه الكفاية في مثل هذا درجة الحموضة العالية.
CDAP (1-سيانو-4-ديميثيلامينوبريدين رباعي فلوريبوروبورات; الشكل 1) وقدم من قبل Lees وآخرون لاستخدامها كعامل cyanylating لتفعيل السكريات5،6. تم العثور على CDAP ، وهو بلوري وسهل التعامل معه ، لتنشيط السكريات عند درجة الحموضة أقل من CNBr ومع ردود فعل جانبية أقل. على عكس CNBr ، يمكن ربط السكريات المتعددة المنشطة CDAP مباشرة بالبروتينات ، مما يسهل عملية التوليف. يمكن تشغيل السكريات المتعددة المنشطة CDAP مع ديامين (على سبيل المثال، الهيكسان ديامين) أو ديهيدرازيد (على سبيل المثال، ديهيدرازيد الديديبيك، ADH) لصنع السكريات الأمينية أو المشتقة من الهيدرازيد. يتم استخدام تركيز عال من الكاشف المثلي لقمع الربط المتبادل بين السكريات. يمكن بعد ذلك اقتران السكريات الأمينية باستخدام أي من التقنيات التي لا تعد ولا تحصى المستخدمة في اقتران البروتين. وغالبا ما تقترن السكريات المشتقة من هيدرازايد إلى البروتينات باستخدام كاشف كاربوديميد (على سبيل المثال، 1-إيثيل-3-(3-dimethylaminopropyl)كاربوديميد (EDAC))7. وقد وصف المزيد من التحسين لتفعيل CDAP polysaccharide من قبل Lees et al.8 ويتم دمجها في البروتوكول الموصوف هنا.
نظرة عامة على اقتران CDAP
يمكن تصور بروتوكول CDAP على أنه مرحلتين: (1) تنشيط البوليساكريد و (2) اقتران البوليساكريد المنشط ببروتين أو ليغند(الشكل 2). الهدف من الخطوة الأولى هو تنشيط السكريات بكفاءة ، في حين أن الهدف من الثانية هو اقترانها بكفاءة مع البوليساكريد المنشط. يربط تعدد الشاريد المنشط بين الخطوتين معا. ويساعد هذا التصور على التركيز على العناصر الحاسمة لكل خطوة. الشكل 2 يتوسع في هذا التصور ، مما يدل على التنشيط المطلوب وتفاعلات اقتران ، جنبا إلى جنب مع ردود الفعل التحلل المائي وردود الفعل الجانبية.
خلال مرحلة التنشيط ، والشواغل الرئيسية الثلاثة هي استقرار CDAP ، رد فعل CDAP مع هيدروكسيلات البوليساكريد ، واستقرار البوليساكريد المنشط(الشكل 3). يزداد التحلل المائي CDAP مع درجة الحموضة ، كما يفعل التحلل المائي للبوليساكريد المنشط وردود الفعل الجانبية. ومع ذلك، يتم تسهيل رد فعل CDAP مع البوليساكريد بزيادة درجة الحموضة. يتطلب تنشيط السكريات بكفاءة مع CDAP توازنا بين 1) تفاعل البوليساكريد وCDAP و 2) التحلل المائي وردود الفعل الجانبية لكل من الكاشف وبوليساكريد المنشط.
في بروتوكول تفعيل CDAP الأصلي الذي وصفه Lees et al.5، تم تنشيط CDAP من السكريات في درجة حرارة الغرفة في محلول درجة الحموضة 9 غير المكتبر. تم العثور على معدل التنشيط ليكون سريعا في ظل هذا الشرط، وسوف يكون التنشيط كاملة في غضون 3 دقائق. ورافق رد الفعل أيضا التحلل المائي السريع للCDAP، مما تسبب في انخفاض درجة الحموضة السريع من محلول رد الفعل غير المكتبر. وكان من الصعب رفع درجة الحموضة بسرعة والحفاظ عليها عند القيمة المستهدفة في مثل هذا الإطار الزمني القصير. في البروتوكول الموصوف، تم تنفيذ التنشيط عن طريق إضافة CDAP من محلول مخزون 100 ملغم/مل إلى محلول السكرييد غير المحشو. تم رفع رقم الحموضة 30 ق في وقت لاحق مع “حجم متساو من 0.2 M تريثيلامين”. ثم أضيف البروتين الذي سيتم اقترانه بعد 2.5 دقيقة إلى رد فعل التنشيط. وتجدر الإشارة إلى أن الرقم الحموضة لخطوة التنشيط لم يكن مسيطرا عليه بشكل جيد، ومن المرجح أن يكون قد تجاوز الرقم PH المستهدف في البداية. رد الفعل السريع الذي يتطلب تعديل درجة الحموضة الفوري جعل عملية التنشيط صعبة للسيطرة وصعبة لتوسيع نطاق.
وعلى النقيض من البروتوكول الأصلي، فإن البروتوكول المعدل الموصوف هنا له تحسينان رئيسيان. أولا، يتم ضبط الرقم الحموضة لحل السكريات قبل لاستهداف الرقم الحموضة التنشيط، وذلك باستخدام DMAP كمخزن مؤقت، قبل إضافة CDAP. DMAP لديه pKa من 9.5 وبالتالي لديه قوة التخزين المؤقت جيدة حول pH 9، وخلافا للعديد من المخازن المؤقتة الأخرى، لم يتم العثور على DMAP لتعزيز التحلل المائي CDAP8. وعلاوة على ذلك، DMAP هو بالفعل عملية وسيطة، وبالتالي لا يضيف عنصرا جديدا إلى خليط رد الفعل. قبل ضبط درجة الحموضة قبل إضافة CDAP يزيل أرجوحة درجة الحموضة الكبيرة في بداية رد الفعل ويسمح لصيانة أكثر كفاءة من الرقم الحموضة المستهدفة أثناء رد الفعل. التحسين الثاني هو إجراء رد فعل التنشيط عند 0 درجة مئوية ، حيث يكون معدل التحلل المائي CDAP أبطأ بشكل ملحوظ من ذلك في درجة حرارة الغرفة. مع فترة نصف عمر الكاشف الأطول عند 0 درجة مئوية ، يتم زيادة وقت التنشيط من 3 دقائق إلى 15 دقيقة للتعويض عن معدل التنشيط الأبطأ في درجة الحرارة المنخفضة. وقت رد الفعل الأطول، بدوره، يجعل من الأسهل للحفاظ على درجة الحموضة رد الفعل. كما يؤدي استخدام 0 درجة مئوية إلى إبطاء تدهور السكريات الحساسة ل درجة الحموضة، مما يجعل من الممكن إعداد اقترانات لهذا النوع من السكريات. التحسينات في البروتوكول تجعل عملية التنشيط أقل المحمومة، وأسهل للسيطرة، وأكثر استنساخها، وأكثر قابلية لتوسيع نطاق.
توضح هذه المقالة البروتوكول المحسن لتنفيذ تنشيط CDAP للبوليساكريد في 0 درجة مئوية وعلى درجة الحموضة الهدف المحدد وتنفيذ اشتقاق اللاحقة من السكريات المنشطة مع ADH. كما هو وصفها هو حمض كبرتونيك trinitrobenzene (TNBS) المقايسة، استنادا إلى طريقة تشيوآخرون. كما يوصف أيضا المقايسة المعدلة للهيكسوس على أساس ريسورسينول وحمض الكبريتيك10، والتي يمكن استخدامها لتحديد مجموعة أوسع من السكريات. لمزيد من المعلومات حول تفعيل CDAP و اقترانها، القارئ يشار إلى المنشورات السابقة5،6،8 من قبل Lees وآخرون.
CDAP هو كاشف مريحة ل derivatize وترافق السكريات. توضح هذه المقالة الأسلوب العام لاستخدام CDAP اشتقاق السكريات مع الهيدرازيدات (PS-ADH) ويتضمن التحسينات المنشورة مؤخرا8. أولا، تؤكد التقنية على أهمية الحفاظ على الرقم PH الهدف للتحكم في عملية التنشيط. وجدنا أنه في حين أن العديد من المخازن المؤقتة المشتركة تتداخل مع رد فعل تنشيط CDAP ، يمكن استخدام DMAP بنجاح كعازل لإدارة درجة الحموضة8. وعلاوة على ذلك، DMAP هو بالفعل نتيجة ثانوية رد فعل لتفعيل CDAP. وأخيرا، التخزين المؤقت حل السكريات مع DMAP قبل إضافة CDAP يسهل الاستهداف الدقيق والحفاظ على درجة الحموضة رد الفعل. كما نقوم بوصف ذلك، من المفيد ضبط درجة الحموضة في محلول مخزون DMAP المركز بحيث عندما يتم تخفيفه، يصل إلى درجة الحموضة المستهدفة. ثانيا، أدى أداء العملية في البرد إلى إبطاء وقت التفاعل، مما جعل عملية التنشيط أقل جنونا وأكثر تسامحا. انخفاض درجة الحرارة انخفض معدل التحلل المائي CDAP، ووقت التنشيط الأمثل في درجة الحموضة 9 يزيد من ~ 3 دقيقة إلى ~ 15 دقيقة. بالإضافة إلى ذلك، مطلوب CDAP أقل لتحقيق نفس المستوى من التنشيط مما كانت عليه عند تنفيذها في درجة حرارة الغرفة.
يمكن اقتران السكريات المشتقة من ADH بالبروتينات باستخدام الكاربيديميدات (على سبيل المثال، EDAC)7. على سبيل المثال، تستخدم العديد من لقاحات الأنفلونزا الهيموفلوس B (Hib) المرخصة فوسفات البولي ريبوسيلريبيتولات (PRP) المشتق من ADH للترافق مع توكسويد الكزاز باستخدام EDAC. تم استخدام CNBr في البداية ، ولكن CDAP هو كاشف أسهل بكثير لاستخدامه لهذا الغرض. في تجربتنا، مجموعة أهداف جيدة ل ADH اشتقاق هو 10-30 هيدرازيد لكل 100 كيلودا البوليساكريد أو ~ 1-3٪ ADH حسب الوزن.
ويمكن استخدام نفس العملية لاستخلاص السكريات مع الأمينات الأولية عن طريق استبدال ADH لديامين. فمن المستحسن استخدام الهيكسان ديامين ل derivatize السكريات مع الأمينات8. يمكن اقتران البوليساكريد الأميني (PS-NH2)باستخدام الكواشف المطورة لالترابط البروتيني11. عادة، يتم اشتقاق PS-NH2 مع maleimide (على سبيل المثال، succinimidyl 4-[N-maleimidomethyl]سيكلوهيكسان-1-كاربوكسيلات (SMCC) أو N-γ-ماليميدوبوترييل-أوكسيسوتشينيميد استر (GMBS))، ويتم ثيولاتيد البروتين (على سبيل المثال، مع succinimidyl 3-(2-بيريديلديثيو)بروبيونات (SPDP)). كيمياء ثيول ماليميد فعالة جدا.
ويمكن أيضا أن يقترن مباشرة البروتينات إلى السكريات البوليساكريد CDAP تنشيط عن طريق ɛ أمين على اليسينات. في حين أن بروتوكول التنشيط المستخدم يشبه بشكل عام البروتوكول الموضح هنا ، فمن الضروري تحسين مستوى التنشيط والبوليساكاريد وتركيز البروتين ، وكذلكنسبةالبروتين: البوليساكريد 5و6و8.
Dextran هي واحدة من أسهل السكريات لتنشيط مع CDAP نظرا لكثافة عالية نسبيا من مجموعات الهيدروكسيل، ولكن بعض السكريات، مثل مستضد Vi، يمكن أن يكون تحديا. وبالتالي، لا يوجد بروتوكول “أفضل” واحد لإقران CDAP مباشرة بالبروتينات. نقترح أولا تطوير بروتوكول لتحقيق مستويات مناسبة من التنشيط ، كما يحددها مدى اشتقاق الهيدرازيد ، ثم الشروع في توجيه اقتران البروتين إلى البوليساكريد المنشط CDAP.
The authors have nothing to disclose.
تم تمويل العمل الموصوف هنا من قبل شركة فينا Biosolutions ذ.م.م.
Acetonitrile | Sigma | 34851 | |
Adipic acid dihydrazide | Sigma | A0638 | MW 174 |
Amicon Ultra 15 10 kDa | Millipore | UFC901008 | MW cutoff can be 30 kDa for 200 kDa PS |
Analytical balance | |||
Autotitrator or electronic pipet | |||
Beaker 2-4 L | |||
CDAP | SAFC | RES1458C | Sigma |
DMAP | Sigma | 107700 | MW 122.2 |
Flake ice | |||
HCl 1 M | VWR | BDH7202-1 | |
Micro stir bar | VWR | 76001-878 | |
Microfuge tube (for CDAP) | VWR | 87003-294 | |
NaCl | VWR | BDH9286 | |
NaOH 1 M | Sigma | 1099130001 | |
NaOH 10 M | Sigma | SX0607N-6 | |
pH meter | |||
pH probe | Cole Parmer | 55510-22 | 6 mm x 110 mm Epoxy single junction |
pH temperature probe | |||
Pipets & tips | |||
Saline or PBS | |||
Small beaker 5-20 mL | VWR | 10754-696 | A 10 mL beaker allows room for pH probe & pipet |
Small ice bucket | |||
Small spatula | |||
Stir plate | |||
Resorcinol assay | |||
Combitip | Eppendorf | 10 ml | |
DI water | |||
Dialysis tubing | Repligen | 132650T | Spectra/Por 6-8kDa |
Dialysis tubing clips | Repligen | 142150 | |
Heating block | |||
Nitrile gloves | VWR | ||
Repeat pipettor | Eppendorf | M4 | |
Resorcinol | Sigma | 398047 | |
Sugar standard | As appropriate | ||
Sulfuric acid 75% | VWR | BT126355-1L | |
Timer | |||
TNBS assay | |||
Adipic dihydrazide | Sigma | A0638 | MW 174 |
Borosilcate test tubes 12 x 75 | VWR | 47729-570 | |
Sodium borate, 0.5 M pH 9 | Boston Biologicals | BB-160 | |
TNBS 5% w/v | Sigma | P2297 | MW 293.17 |