ナノボディは構造生物学の重要なツールであり、治療法の開発に大きな可能性を秘めています。しかし、抑制性を有するナノボディの選択は困難であり得る。ここでは、電気原性膜輸送体を標的とする抑制性および非阻害性ナノボディの分類に対する固体支持膜(SSM)ベースの電気生理学の使用を実証する。
単一ドメイン抗体(ナノボディ)は、タンパク質の機械学的研究や構造研究で広く使用されており、臨床療法を開発するためのツールとして大きな可能性を秘めており、その多くはトランスポーターなどの膜タンパク質の阻害に依存しています。しかし、輸送活動の阻害を決定するために使用される方法のほとんどは、ハイスループットルーチンで実行することは困難であり、それによって大規模なnanobodyライブラリのスクリーニングを複雑にする標識基質の可用性に依存する。固体支持膜(SSM)電気生理学は、電気原性輸送体の特性評価や輸送の動態と阻害の測定に使用されるハイスループット法です。ここでは、電気原発性二次輸送体を標的とする阻害性および非阻害性ナノボディを選択し、ナノボディ阻害定数を計算するSSMベースの電気生理学の実施を示す。この技術は、標識された基質が利用できないトランスポーターを標的とする抑制性ナノボディを選択するのに特に有用である可能性がある。
抗体は、2つの同一の重鎖と、抗原結合を担う2つの軽鎖から構成される。ラクダは、従来の抗体1,2と比較して、同結合抗原に対して類似した親和性を示す重鎖のみの抗体を有する。重鎖のみの抗体の単一可変ドメイン(VHH)は、完全な抗原結合電位を保持し、非常に安定であることが1、2であることが示されている。これらの単離されたVHH分子または「ナノボディ」は、立体構造を安定化するためのツールとして膜タンパク質生化学に関連する研究に実施されている3,4, 阻害剤として5,6, 安定化剤として7, 構造決定のためのガジェットとして8,9,10.ナノボディは、B細胞の標的特異的ナノボディおよびその後の単離をコードするB細胞の前濃縮のためのカメリッドの免疫化によって生成することができ、続いてnanobodyライブラリのクローニングとファージディスプレイ11、12、13による選択を行う。ナノボディを生成する別の方法は、ファージディスプレイ、リボソームディスプレイ、または酵母ディスプレイ14、15、16、17、18、19、20によるライブラリおよび選択の構築に依存するインビトロ選択方法に基づく。これらのin vitro法は、大きなライブラリサイズを必要としますが、動物の免疫を回避することから利益を得て、比較的低い安定性を有するタンパク質を標的とするナノボディの選択を好む。
ナノボディの小型化は、その高い安定性および溶解性、強い抗原親和性、低い免疫原性、および比較的容易な産生を、治療21、22、23の開発のための有力な候補となる。特に、複数の膜タンパク質の活性を阻害するナノボディは、臨床応用5、24、25、26の潜在的な資産である。膜輸送体の場合、ナネnobodyが阻害活性を有するかどうかを評価するためには、輸送された基質および/または共基質の検出を可能にするアッセイを開発する必要がある。このようなアッセイは、通常、標識された分子または基質特異的検出方法の設計を伴い、普遍的な適用を欠く可能性がある。さらに、阻害性ナノボディの同定には、一般に多数の結合剤のスクリーニングが必要である。したがって、ハイスループットモードで使用でき、ラベル付き基板に依存しない方法がこの選択に不可欠です。
SSMベースの電気生理学は、膜を越えて電荷の移動(例えば、イオン結合/輸送)27、28を検出することを可能にする非常に敏感で、非常に時間分解された技術である。この技術は、これらのタンパク質の相対的低回転率に起因する他の電気生理学的手法を用いて研究することが困難である電気原性トランスポーターの特徴付けに適用されてきた29、30、31、32、33、34、35。SSM電気生理学は標識された基質の使用を必要とせず、ハイスループットスクリーニングに適しており、また、目的のトランスポーターを含むプロテオリポソームまたは膜小胞のいずれかを使用することができる。ここでは、SSMベースの電気生理学が、トランスポーター標的ナノボディを阻害性および非阻害特性で分類できることを実証する。原理の証明として、我々はリポソームに細菌コリントランスポーターの再構成を記述し、続いてSSMセンサー上のプロテオリポソームの固定化のための詳細なステップを述べています。次に、コリン輸送のSSMベースの電気生理学的測定を行う方法と、半最大有効濃度を決定する方法について説明します(EC50)。次に、SSMベースの電気生理学を用いて、複数のナノボディをスクリーニングし、コリン輸送の阻害剤を同定する方法を示す。最後に、選択した阻害性ナノボディの半最大阻害濃度(IC50)を決定する方法を説明する。
ここで提示される技術は、電気原性輸送体を標的とする抑制性および非阻害性を有するナノボディを分類する。基質輸送の評価は、プロテオリポソームの膜に埋め込まれたトランスポーターを介した電荷の移動の検出に可能である。実験のセットアップ中の重要なステップのいくつかは、リポソームにおける活性タンパク質の再構成、SSMチップ上の安定した単層の調製、および結合されたナ?…
The authors have nothing to disclose.
チューリッヒ大学医学微生物学研究所のセドリック・A・J・ハッターとマルクス・A・シーガー、バーゼル大学バイオゼントルムのゴンサロ・セブレロに対し、合成ナノボディ(シボディ)の生成に協力していただきありがとうございます。ナニオン・テクノロジーズのマリア・バルトメスとアンドレ・バッツォーネの技術支援に感謝します。この研究は、スイス国立科学財団(SNSF)(PP00P3_170607とナニオン研究助成イニシアチブからC.P.)によって支援されました。
1-octadecanethiol solution | Sigma Aldrich | O1858-25ML | |
1,2-diphytanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine | Avanti Polar Lipids | 850356C-25mg | |
Bio-Beads SM-2 Adsorbent (Polystyrene adsorbent beads) | BioRad | #152-3920 | |
PD 10 Desalting Columns | GE Healthcare | GE17-0851-01 | |
Filter 200 nm membrane | Whatman Nucleopore | WHA800282 | |
2-Propanol | Merck | 33539-1L-R | |
n-Decane | Sigma Aldrich | 8034051000 | |
n-dodecyl-ß-D-maltoside (DDM) | Avanti Polar Lipids | 850520P-25g | |
Sodium Chloride | AppliChem | 131659.1211 | |
(SSM setup) SURFE2R N1 | Nanion | —– | |
SURFE2R N1 Single Sensor Chips | Nanion | # 161001 | |
Trizma Base | Sigma Aldrich | T1503 | |
E. coli Polar Lipid Extract | Avanti Polar Lipids | 100600C | |
Egg PC L-α-phosphatidylcholine | Avanti Polar Lipids | 840051C |