Hier presenteren we een protocol voor de geoptimaliseerde FlashPack capillaire kolomverpakkingsprocedure. Toepassing van een geoptimaliseerd protocol op een gemeenschappelijke 100-bar drukbomopstelling maakt 10 keer snellere verpakking en productie van lange ultra-high performance capillaire kolommen mogelijk.
Capillaire ultra-high performance vloeistofchromatografie (UHPLC) is momenteel een voorkeursmethode voor de monsterscheidingsstap in op LC-MS gebaseerde proteomics. Capillaire kolommen zijn echter veel minder robuust in vergelijking met hun hogere stromingstellertypen. Vanwege eenvoudige vervuiling en blokkering zijn ze vaak aan vervanging toe. Dat maakt ze een aanzienlijk duur onderdeel van de totale LC-MS-analysekosten. In-house verpakking van UHPLC capillaire kolommen bespaart veel geld en maakt maatwerk mogelijk. De standaard verpakkingsprocedure in de 100-bar drukbom werkt echter alleen goed voor HPLC-kolommen, maar is te traag voor UHPLC-sorptiemiddelen. Hier geven we een beschrijving van een geoptimaliseerd FlashPack-protocol dat wordt toegepast op dezelfde 100-bar drukbomopstelling. De methode is gebaseerd op verpakking uit slurry met ultrahoge sorptieconcentratie en is ontwikkeld voor de interne productie van UHPLC-capillaire kolommen van onbeperkte lengte binnen een redelijke tijd.
Moderne proteomics is gebaseerd op vloeistofchromatografie-gekoppelde massaspectrometrie met de ultra-high performance nano-flow chromatografie (50-150 μm kolom interne diameter (ID)) scheiding die de beste analysesnelheid en gevoeligheid biedt1. Hoewel er tal van commerciële UHPLC-capillaire kolommen beschikbaar zijn, vormt hun prijs een groot deel van de kosten van verbruiksartikelen, vooral wanneer meerdere uiteenlopende projecten in het laboratorium worden uitgevoerd en projectspecifieke kolomverontreiniging een frequent probleem is. Bovendien maakt het verpakken van kolommen in eigen huis het gebruik van aangepaste experimentspecifieke sorptiemiddelen (zoals bijvoorbeeld polyCAT-A-sorptiemiddel2)en kolomkenmerken mogelijk die niet beschikbaar zijn om te kopen als een kant-en-klare kolom.
Om dat het hoofd te bieden, pakken veel laboratoria capillaire kolommen in huis. De gebruikelijke verpakkingsprocedure met een drukbom van 100 bar (drukinjectiecel)3 is echter niet geschikt voor de UHPLC-kolomverpakking vanwege de hoge tegendruk van sub-2 μm UHPLC-sorptiemiddelen, wat resulteert in een dramatische verlaging van de verpakkingssnelheid in vergelijking met grotere HPLC-sorptiemiddelen. Hoewel korte UHPLC-kolommen nog steeds zeer langzaam kunnen worden verpakt, is de productie van lange UHPLC-kolommen fysiek onmogelijk4.
Standaard capillaire kolomverpakking gebeurt bij relatief lage drukken – tot 100 bar, en met een zeer lage sorberende slurryconcentratie. Daarom zijn er twee mogelijke richtingen beschikbaar om het proces te versnellen. Het is mogelijk om de pakdruk te verhogen5. Dit vereist echter speciale apparatuur en, praktisch, installatie van een nieuwe methode in het laboratorium. Een andere manier is om de sorptiemiddeldrijfmestconcentratie te verhogen6. Verpakking met hoge sorptiemiddelconcentratie wordt in een eerdere publicatie beschreven in combinatie met ultrahoge verpakkingsdruk7. Bij een druk van 100 bar, die in de meeste bestaande verpakkingsbommen wordt gebruikt, resulteert een hogere sorptieconcentratie echter in een vertraging van de verpakkingssnelheid of een regelrechte stopzetting van de verpakking. Het effect werd onlangs aangetoond als gevolg van sorbent clustering bij de kolomingang, en een eenvoudige truc van sorbent koepel destabilisatie door hameren de kolom ingang met een magneet staaf in een sorbent flacon werd voorgesteld4. De resulterende methode, genaamd FlashPack, gebruikt dezelfde 100-bar drukbomverpakkingsopstelling. Tegelijkertijd maken kleine maar kritische wijzigingen in de verpakkingsprocedure het mogelijk om in minder dan een uur te verpakken met een zeer hoge sorptieve mestconcentratie en productie van zeer lange UHPLC-kolommen (50 tot 70 cm en langer), terwijl een korte kolom in minuten kan worden geproduceerd met de scheidingskwaliteit gelijk aan commerciële kolommen van dezelfde parameters4. De FlashPack-aanpak werd al met succes gebruikt in meerdere proteomics-projecten voor de voorbereiding van zowel omgekeerde fase(RP) 8,9,10,11,12,13,14 als hydrofiele interactie (HILIC)2 capillaire kolommen.
Hier beschrijven we in detail de aanpassingen die nodig zijn voor aanpassing van de FlashPack-benadering aan de standaard 100-bar drukbomverpakkingsprocedure.
In-house capillaire kolomverpakking is zeer populair in grote laboratoria die aan meerdere onafhankelijke projecten werken. Een gangbare verpakkingsmethode van een sorptieveuspensie met lage concentratie heeft echter grote beperkingen in de snelheid en is niet in staat om lange UHPLC-kolommen te produceren.
FlashPack is een aanpassing van de standaard verpakkingsprocedure die verpakking vanuit een zeer hoge sorptieconcentratie mogelijk maakt. De theoretische basis van de methode ligt in de continue sorptieve koepel destabilisatie bij de kolomingang gedurende de gehele verpakkingsduur. Dit laatste wordt technisch bereikt door kolomingang continu te raken met een magneetbalk. De methode van koepelonstabilisatie is opzettelijk ontwikkeld om de verpakkingsopstelling volledig vergelijkbaar te hebben met het gebruikelijke verpakkingsproces, maar de truc van FlashPack ligt in de details van de sorberende slurrybereiding, capillaire positionering en het gebruik van magneetbalken tijdens het verpakkingsproces.
De absorberende slurry wordt bereid als een sedimentsorberende laag in een groot oplosmiddelvolume. Het is interessant dat de op drukbommen gebaseerde verpakking niet dezelfde verpakkingsvoorwaarden vereist voor kolom tot kolom. In FlashPack weten we nooit de exacte concentratie van sorptiemiddeldrijfmest rond de kolomingang. Het is onmogelijk om precies te meten en te controleren, omdat het ook verandert tijdens het verpakkingsproces. De laatste kolommen zijn echter nog steeds zeer reproduceerbaar4, ongeacht hoe de verpakking is bereikt.
De basis voor de snelle verpakking ligt in de efficiënte sorbent koepel destabilisatie. Om deze reden is het belangrijk om het absorberende sorptiemiddel dat het capillair binnendringt te beheersen en de optimale koepel destabilisatieomstandigheden gedurende de gehele verpakkingsduur te handhaven. Er zijn verschillende mogelijke problemen die een efficiënte sorptiemiddelafgifte kunnen verhinderen. Enkele voorbeelden hiervan zijn sorbentlaag resuspensie door snelle magnetische staafrotatie, inefficiënte koepel destabilisatie als gevolg van een verkeerde relatieve capillaire positionering van de magneetbalk of een te langzame rotatie van de magneetbalk. De problemen zelf en hoe deze moeten worden aangepakt, worden in detail besproken in het protocolgedeelte.
Nadat de kolom is ingepakt, is de belangrijkste kolomparameter die u moet controleren de kolomtegendruk. De drukwaarden in tabel 5 bieden een referentiepunt voor wat wordt verwacht voor een van de populaire sub 2 μm kraalgrootte sorbent-ReproSil PUR C18 AQ (1,9 μm). Tegelijkertijd kan extra tegendruk worden toegevoegd door de frit of een te nauw getrokken emitter en men moet daar constant op letten. Als het verpakken in een getrokken emitter wordt gedaan, raden we nog steeds aan om de verwachte kolomtegendruk voor het specifieke gebruikte sorptiemiddel te meten door eerst gefrituurde haarvaten te verpakken en vervolgens te zien of de zelfassemblerende frit te veel toevoegt. Gebruik voor problemen met hoge druk de richtlijnen in tabel 1 om het probleem te lokaliseren.
Onze ervaring is dat een verpakte kolom zonder verkleuringen, openingen en met de juiste tegendruk in 100% van de gevallen werkt en de scheidingskwaliteit dicht bij wat kan worden verwacht van de kolomlengte en sorptie-eigenschappen. Een kolom met verkleuringen werkt niet gegarandeerd goed, maar kan toch bevredigende resultaten geven.
Meestal, als er problemen zijn met de scheidingskwaliteit, komen ze niet van de kolom zelf, maar eerder van andere delen van het scheidingssysteem, namelijk pompen, oplosmiddelen of verbindingen. Vooral potentieel schadelijk zijn eventuele verbindingen na de kolom. Een slechte verbinding met een dood volume tussen de emitter en de gefrituurde kolom leidt tot grote piekverbreding en tailing als gevolg van zeer lage stroomsnelheden in capillaire chromatografie.
Een ander belangrijk probleem dat specifiek is voor de FlashPack-aanpak is dat het veel dure sorptiemiddelen gebruikt in een werkende sorbent slurry-injectieflacon. Houd er rekening mee dat de absorberende slurry in FlashPack bedoeld is voor meervoudig gebruik. Zorg voor het sorptiemiddel. Vermijd onnodig roeren van de magneetstaaf om het sorptiemiddelslijpen te verminderen – vergeet niet om de rotatie te stoppen zodra de verpakking is voltooid. En laat de open injectieflacon met sorptiemiddel niet in de drukbom om te voorkomen dat het sorptiemiddel droogt. Hoewel het sorptiemiddel daarna nog steeds kan worden gebruikt, kost het tijd om de sorbent-slurry opnieuw te maken.
De methode werkt even goed voor zowel gefrituurde haarvaten als pulled-emitter haarvaten. Het FlashPack-principe verhoogt de paksnelheid voor capillaire IDs van 20 naar 250 μm (kleiner en groter werden niet getest). Het is ook van toepassing op alle sorptiemiddelen, zowel volledig als oppervlakkig poreus, die we zouden kunnen testen (wat aangeeft dat de sorptiemiddel koepelvorming in hoge sorbent slurryconcentratie niet specifiek beperkt is tot RP-sorptiemiddelen). Bovendien hebben oplosmiddelparameters duidelijk invloed op de verpakking op basis van hun fysische en chemische kenmerken. Minder viskeuze aceton geeft bijvoorbeeld een nog hogere paksnelheid dan methanol bij dezelfde pakdruk. Het is echter ook minder polair dan methanol en vermindert sorptiedeeltjes die aan elkaar kleven. Het effect op zichzelf voorkomt sorbent koepelvorming in het begin van de verpakking wanneer de stroomsnelheid nog hoog is. Vermindering van de interactie tussen absorberende deeltjes leidt echter ook tot minder betrouwbare zelfassemblerende fritvorming en frequentere pulled-end-blokkering tijdens het verpakken. Dus, terwijl aceton beter is voor het verpakken van gefrituurde haarvaten, is het minder geschikt voor pulled-emitter capillairen, waarbij de methanol als een slurry-oplosmiddel langzamer is, maar geschikt voor beide soorten uiteinden. Verpakking van hexaan of dichloormethaan (DCM) zijn extreme gevallen van overschakelen naar aceton uit methanol: ze zijn nog minder polair, dus ze voorkomen de vorming van sorbent koepel volledig, maar ze zijn helemaal niet geschikt voor pulled-emitter verpakking. Bovendien werd opgemerkt dat een extreem lage DCM-polariteit ertoe leidt dat absorberende deeltjes aan de interne capillaire wand blijven plakken en er een dikke laag op maken. De laagdikte groeit geleidelijk en willekeurige lokale blokken vormen zich, wat resulteert in de kolom verpakt in verschillende delen gescheiden door gebieden zonder sorptiemiddel. Een dergelijk effect werd waargenomen voor C18 Peptide Aeris sorbent.
Een ander waargenomen probleem was dat YMC Triart C18-sorptiemiddel niet goed in methanol werd gesuspendeerd, maar om een soort vlokken te vormen. Dat voorkomt echter niet dat het vol komt te zitten met de FlashPack en een zeer behoorlijke scheidingsefficiëntie geeft (ongepubliceerde gegevens). Hoewel methanol in sommige gevallen niet optimaal was, was het dus het meest universele oplosmiddel om te werken voor alle geteste sorptiemiddelen en kolommen. Het is noodzakelijk om te vermelden dat we nog niet hebben geanalyseerd hoe verschillende mestoplomiddelen de kolomscheidingsefficiëntie beïnvloeden. Tegelijkertijd is de efficiëntie van kolommen verpakt uit methanol al volledig gelijk aan commerciële kolommen voor dezelfde sorptiemiddelen4.
FlashPack is niet de enige bestaande aanpak om de paksnelheid van UHPLC-kolommen te verbeteren. Snel verpakken met een hoge sorptiemiddelconcentratie is ook mogelijk met behulp van ultrahogedrukverpakking7. Het voordeel van FlashPack is dat het veel eenvoudiger is omdat het geen speciale ultrahogedrukpompen en drukbommen vereist voor sorbentafgifte en capillaire verbindingen. Tegelijkertijd werd aangetoond dat de kolommen die bij extreme druk zijn verpakt, een scheidingsefficiëntie kunnen hebben die hoger is dan kolommen met een lagere druk17. En hoewel FlashPack kolommen produceert die identiek zijn aan commerciële kolommen die worden gebruikt in de vergelijking4, waarvoor we de verpakkingsmethode niet kennen, werd nog niet getest hoe FlashPack-kolommen staan tegen ultrahoge druk verpakte kolommen.
Samenvattend kan de beschreven FlashPack-methode eenvoudig worden aangepast aan het bestaande verpakkingsprotocol in het laboratorium met enkele aanpassingen aan het protocol, terwijl de installatie volledig hetzelfde blijft. Het versnelt de HPLC capillaire kolomverpakking tot minuten tijd en maakt de productie van lange UHP capillaire kolommen mogelijk, wat duidelijk onmogelijk is met de standaard verpakkingsprocedure. De totale zuinigheid in tijd en geld voor het laboratorium door toepassing van de FlashPack-aanpak kan worden geteld in tienduizenden euro’s per jaar. Bovendien opent de mogelijkheid om UHP-capillaire kolommen lokaal te produceren de mogelijkheden voor experimentaanpassing die onmogelijk zijn met de beschikbare commerciële producten.
The authors have nothing to disclose.
Het werk werd ondersteund door RSF-subsidie 20-14-00121. De auteurs danken P. V. Shliaha (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) voor vruchtbare discussies.
Acetonitrile with 0.1% (v/v) Formic acid | Merck | 1.59002 | |
centrifuge tube 1.5 mL | Eppendorf | ||
Ceramic Scoring Wafer | Restek | 20116 | any ceramic wafer is suitable for capillary polishing |
Diamond-chip bladed scribe | NewObjective | Diamond-chip bladed scribe | recommended for capillary cutting |
fused silica capillary 100 mm ID 375 mm OD | CM Scientific | TSP100375 | |
GELoader tips | Eppendorf | 30001222 | |
HPLC system | ThermoScientific | Ultimate3000 RSLCnano | |
laser puller | Sutter | P2000/F | |
magnet bar 2×5 mm | Merck | Z283819 | |
MeOH | Merck | 1.06018 | |
microspatula | Merck | Z193216 | |
PEEK ferrule 360 mm | VICI | JR-C360NFPK | use to connect the column to UPLC union |
pipette tip, 1000 uL | Merck | Z740095 | |
pipette, 1000 uL | Gilson | Pipetman L P1000L | |
pressure bomb | NextAdvance | PC-77 MAG | |
regulator | GCE | Jetcontrol 600 200/103 | |
Reprosil Pur C18 AQ 120 1.9 mm | Dr. Maisch | r13.aq.0001 | |
Screw cap tubes without caps, conical bottom, self-standing, 0.5 mL | Merck | AXYST050SS | |
Screw cap tubes without caps, conical bottom, self-standing, 1.5 mL | Merck | AXYST150SS | |
Screw caps with O-rings | Merck | AXYSCOC | |
sonication bath | Elma | Elmasonic S30 H | |
union HPLC | VICI | JR-C360RU1PK6 | HPLC connection from 1/16 OD HPLC capillary to 360 um capillary column |
union UPLC | VICI | JR-C360RU1FS6 | UPLC connection from 1/16 OD HPLC capillary to 360 um capillary column |
vortex | BioSan | V-1plus | |
Water with 0.1% (v/v) Formic acid | Merck | 1.59013 |