Burada, CRISPR / Cas9 tabanlı genom düzenlemesi yoluyla genomlarını değiştirmek veya germline dönüşümü yoluyla işaretli transpoze edilebilir elementlerin eklenmesi amacıyla hücre öncesi mısır planthopper embriyolarının toplanması ve mikroenjekte edilmesi için protokoller bulunmaktadır.
Mısır planthopper, Peregrinus maidis, bir mısır zararlısı ve birkaç mısır virüsünün bir vektörüdür. Daha önce yayınlanmış yöntemler, P. maidis’te RNA girişiminin (RNAi) çift sarmallı RNA’ların (dsRNA’lar) nimflere ve yetişkinlere mikroenjeksiyonu yoluyla tetiklenmesini tanımlamaktadır. RNAi’nin gücüne rağmen, bu teknikle üretilen fenotipler geçicidir ve uzun süreli Mendel kalıtımından yoksundur. Bu nedenle, P. maidis alet kutusunun, kararlı mutant suşların üretimini sağlayacak fonksiyonel genomik araçları içerecek şekilde genişletilmesi ve araştırmacıların bu ekonomik açıdan önemli haşere üzerinde yeni kontrol yöntemleri getirmeleri için kapıyı açması gerekmektedir. Bununla birlikte, RNAi için kullanılan dsRNA’ların aksine, CRISPR / Cas9 tabanlı genom düzenleme ve germline transformasyonunda kullanılan bileşenler hücre zarlarını kolayca geçmez. Sonuç olarak, plazmid DNA’ları, RNA’lar ve / veya proteinler, embriyo hücreselleşmeden önce embriyolara mikroenjekte edilmelidir, bu da enjeksiyonun zamanlamasını başarı için kritik bir faktör haline getirir. Bu amaçla, embriyoların P. maidis dişilerinden nispeten kısa aralıklarla toplanmasını sağlamak için agaroz bazlı bir yumurta bırakma yöntemi geliştirilmiştir. Burada, CRISPR bileşenlerine sahip hücre öncesi P. maidis embriyolarının (kılavuz RNA’larla kompleksleştirilmiş Cas9 nükleazı) toplanması ve mikroenjekte edilmesi için ayrıntılı protokoller sağlanmıştır ve beyaz bir P. maidis göz rengi geninin Cas9 bazlı gen nakavtının sonuçları sunulmaktadır. Her ne kadar bu protokoller P. maidis’te CRISPR / Cas9-genom düzenlemesini tanımlasa da, enjeksiyon çözeltisinin bileşimini değiştirerek germline dönüşümü yoluyla transgenik P. maidis üretmek için de kullanılabilirler.
Mısır planthopper, Peregrinus maidis, mısırın ekonomik açıdan önemli bir zararlısıdır 1,2,3. Hem delici emici ağız kısımlarıyla beslenirken hem de üreme sırasında embriyolarını doğrudan bitki dokusuna bıraktıklarında bitkiye doğrudan fiziksel zarar verirler 2,4. Mahsullere doğrudan zarar veren çoklu yollara rağmen, bu böceklerin mahsul sağlığı üzerindeki en büyük etkisi, mısır mozaik virüsü (MMV) ve mısır şerit virüsü 5,6’nın vektörü olarak hareket ederek dolaylıdır. MMV, P. maidis vektörünün gövdesinde çoğalma yeteneğine sahiptir ve virüsün yaşamlarının tamamı boyunca bireysel böceklerde kalmasına izin verir, böylece virüsü yeni konakçı bitkilere yaymaya devam edebilirler 7,8. P. maidis’i ve dolayısıyla vektörleştirdiği virüsleri kontrol etmek için en yaygın yöntemler insektisitlerdir.
Ne yazık ki, bu ürünlerin yanlış yönetilmesi, hedef haşere içinde direnç gelişmesine ve çevrenin kirlenmesine neden olmuştur9. Bu nedenle, bu böcek/virüs-haşere kombinasyonundan kaynaklanan ürün kayıplarını azaltmak için yeni stratejilere ihtiyaç vardır. Önceki çalışmalar, RNA girişiminin (RNAi) P. maidis için etkili bir kontrol yöntemi olabileceğini, çünkü çift sarmallı RNA’yı (dsRNA) yutarken bile gen ekspresyonunda aşağı regülasyona duyarlı olduklarını göstermiştir10. Bununla birlikte, dsRNA’yı sahada yönetmenin en etkili yolu, böceklerin beslendiği bitkiler aracılığıyla olacaktır; Bu nedenle, mahsuller böceklerin zaten taşıdığı herhangi bir virüse karşı hala duyarlı olabilir. CRISPR / Cas9 genom düzenlemesinin ortaya çıkmasıyla, bir haşere popülasyonunun boyutunu azaltmak veya söz konusu popülasyonu vektörleştirdikleri virüslere dirençli bireylerle değiştirmek için kullanılabilecek Cas9 tabanlı gen sürücüsü11,12 de dahil olmak üzere yeni haşere kontrol stratejileri mümkündür.
Bununla birlikte, her türlü gen tahrik sisteminin geliştirilmesi ve konuşlandırılması, transgenik tekniklerin geliştirilmesini gerektirecektir. Bu tür yöntemler P. maidis’te RNAi deneylerini gerçekleştirmek için gerekli değildi, çünkü dsRNA’ların ve / veya siRNA’ların, RNAi’nin P. maidis10,13’teki etkinliği nedeniyle hücre zarlarını geçebildiği varsayılmaktadır. Bu, geleneksel transgenezde veya Cas9 tabanlı gen düzenlemede kullanılan DNA’lar ve / veya proteinler için geçerli değildir; bunlardan herhangi biri, bir gen sürücüsü taşıyan böceklerin yaratılmasının öncüsü olacaktır. Gen düzenlemeyi veya diğer germline transformasyon formlarını gerçekleştirmek için, bu DNA’lar ve proteinler, sinsityal blastoderm aşamasında, böcek embriyosunun hücreselleşmesinden önce ideal olarak embriyolara mikroenjekte edilir. Zamanlama kritiktir, çünkü sinsityal aşama gelişimin en erken kısmıdır14,15. P. maidis dişileri tercihen yumurtalarını bitki dokusuna bıraktıklarından, mikroenjeksiyonlar için yeterli miktarda hücre öncesi embriyonun çıkarılması emek yoğun ve zaman alıcı olabilir. Bu nedenle, hücreselleşmeden önce P. maidis embriyolarını hızlı bir şekilde toplamak ve mikroenjekte etmek için yeni teknikler geliştirilmiştir.
Yumurta bırakma kalitesi ve beslenmesi
Son zamanlarda, ilgili bir tür olan Nilaparvata lugens ile çalışan araştırmacılar, mikroenjeksiyonlar için kullandıkları yumurtaları doğrudan yapraktan elde ettiler ve enjekte edilen yumurtaları yumurtadan çıkana kadar yaprak dokusunda tuttular17. Bu yaprak bazlı yöntem, embriyonik gelişim için daha doğal bir ortam sağlarken, aynı zamanda çıkarma işlemi sırasında enfeksiyon ve yumurta hasarı olasılığını da arttırdı. Burada sunulan yapay yumurtlama sistemi daha düzgün bir ortam sağlar ve yumurtaların taşınmasından kaynaklanan hasar olasılığını azaltır. Cuma günü yumurtlama kaplarını kurarak, ovipozitlenmiş yumurtaların çoğu, mikroenjeksiyon işini yapanların yararına tipik bir çalışma haftası boyunca toplandı. Bununla birlikte, bu yönteme bir uyarı,% 10 sakkaroz çözeltisi diyetindeki besin eksikliğinin sonunda böceklerin sağlığını etkileyeceği ve bardaklardaki dişilerin genellikle sadece 10 gün sonra ölmeye başlamasıdır. Yumurta kalitesi, ölü veya sağlıksız görünümlü yumurtalardaki artışla kanıtlandığı gibi, 6 gün sonra düşmeye başlar. Sonuç olarak mikroenjeksiyon için kullanılan yumurtaların seçici olması ve dişilerin 6. günden sonra tutulmaması önemlidir.
Hayatta kalma oranı ve nem
Mikroenjeksiyon işlemi ile embriyonik sağkalım için iki faktör kritik görünmektedir. P. maidis embriyolarının işlenmesinin en zorlu yönü, yumurtlama ortamından çıkarıldıktan sonra ve mikroenjeksiyon boyunca kurumasını önlemektir. Yumurtalar tipik olarak bitki dokusunun içine serildiğinden, dehidrasyonu önlemek için yeterli bir kabuktan yoksundurlar. Nemlendirilmiş başlıkta bile bütün yumurta setleri kuruma nedeniyle kayboldu. Bununla birlikte, aşırı yüksek nem, çift taraflı bantta veya kapsamda su birikmesi durumunda mikroenjeksiyonları da etkileyebilir. Ne yazık ki, yumurta dehidrasyonunun mikroenjeksiyon işlemi sırasında fark edilmesi genellikle kolay değildi ve 2 veya 3 gün sonra, tamamen şeffaf hale geldiklerinde, hiçbir gelişme belirtisi göstermediklerinde sıklıkla normal görünüyorlardı.
İğne kalitesinin de hayatta kalmada önemli bir rol oynadığı görülmektedir. Yumurtaya gereksiz hasarı en aza indirmek için iğne eğimli olmalıdır. İğne bloke edildiğinde, iğnenin ucunu nemlendirilmiş bir boya fırçasıyla hafifçe okşarken enjektör üzerindeki temizleme işlevini kullanarak (bkz. adım 4.7) tipik olarak iğneyi işlevsel bir duruma döndürür. Ne olursa olsun, enjeksiyon işlemi boyunca iğne kalitesinin korunmasını sağlamak için her iğneye sadece az miktarda enjeksiyon çözeltisi (~ 0.25 μL) koymak ve her birkaç slaytta bir (~ 50-60 yumurta) yeni bir iğneye geçmek önerilir.
Nakavt fenotipinin başarılı bir şekilde üretilmesi
Germ hücrelerini başarılı bir şekilde dönüştürmek için, embriyo mikroenjeksiyonları genellikle hücreselleşmeden önce mümkün olduğunca erken yapılmalıdır. Böcek türlerine bağlı olarak, mikroenjeksiyonların tamamlanması için zaman aralığı sadece birkaç saatten tam bir gün 14,15,20’ye kadar değişmektedir. P. maidis embriyolarının ne zaman hücreselleşmeye uğradığı hala belirsizdir. Cas9 aracılı nakavt, yumurtlama sonrası 4 saat (pel) ila 16 saat pel kadar genç embriyolar üzerinde test edildi ve tüm deneylerde beklenen fenotipler gözlendi, bu da tüm mikroenjeksiyonların hücre öncesi pencere içinde gerçekleştirildiğini düşündürdü.
Göz rengi geninin P. maidis ortoloğu olan beyaz, seçildi, çünkü nakavt fenotipinin, hücre özerk doğası nedeniyle enjekte edenlerde taranmasının kolay olması bekleniyordu. Gerçekten de, beklendiği gibi, Cas9 ve kılavuz RNA’ları içeren enjeksiyon karışımını alan embriyolar arasında hem mozaik hem de toplam nakavtlar açıkça tanımlanabilirdi. Ne yazık ki, tam nakavtlı hiçbir enjekte yumurtadan çıkmadı ve hayatta kalan enjekte edenlerin kitlesel çiftleşmesi beyaz gözlü soy üretemedi. Bununla birlikte, mutant bir çizgi daha sonra farklı bir geni (Klobasa ve ark., devam ediyor) hedefleyerek başarılı bir şekilde üretildi. Bu, beyaz bir mutant çizginin oluşturulamamasının büyük olasılıkla ya hedef dışı etkilerden (yani, Cas9’un genomun başka bir yerindeki önemli bölgeleri kesmesi) yakından bağlantılı ölümcül bir mutasyon oluşturmasından ya da P. maidis’te beyaz için öngörülemeyen kritik bir rolden kaynaklandığını düşündürmektedir.
Fenotipik ve moleküler veriler (Şekil 8 ve Şekil 9), enjekte edilen embriyoların bir örneğinde beyaz lokusta önemli bir nakavt oluştuğunu ve bunun da gen fonksiyonunun toplam kaybına neden olacağını doğrulamaktadır. Dahası, beyazdaki mutasyonlar bazı türlerde uygulanabilir olsa da, azalmış beyaz aktivitenin zararlı olduğu için emsal vardır21,22. Bununla birlikte, hedef dışı etkiler tamamen göz ardı edilemez. Muhtemel hedef dışı hedefleri tahmin etmek, P. maidis’teki genomik kaynakların mevcut durumunun şu anda yapmayı imkansız kıldığı doğru genom dizisi verileri23 gerektirir. Ne olursa olsun, bu yeni yöntemlerle, diğer hedef genlerin test edilmesi güvenle yapılabilir, hatta bu zararlı zararlıya yeni genetik araçlar getirmek için daha geleneksel transgeneze doğru ilerleyebilir.
The authors have nothing to disclose.
Kuzey Carolina Eyalet Üniversitesi, Entomoloji ve Bitki Patolojisi Bölümü, DARPA’nın Böcek Müttefikleri Programını destekleyen bir ekibin parçasıdır. İfade edilen görüşler, görüşler ve/veya bulgular yazarlara aittir ve Savunma Bakanlığı veya ABD Hükümeti’nin resmi görüşlerini veya politikalarını temsil ettiği şeklinde yorumlanmamalıdır. Yazarlar birbiriyle çelişen çıkarlar olmadığını beyan ederler. MDL, DR ve AEW projeyi tasarladı ve finansman edinimi, proje yönetimi ve kaynakları sağladı. FC, WK, NG ve MDL, mikroenjeksiyon deneylerini tasarladı ve tasarladı; OH, yumurtlama yöntemini tasarladı ve tasarladı. FC ve WK deneyleri gerçekleştirdi; FC ve WK sonuçları analiz etti; ve FC, WK, NG ve MDL makaleyi yazdı. Yazarlar, Kyle Sozanski ve Victoria Barnett’e P. maidis kolonilerinin korunmasındaki yardımları için özel teşekkürlerini sunmak isterler.
1 oz Containers | Dart | P100N | Adult container for egg-laying setup |
15 mL Conical Tubes | Olympus | Genesee 28-103 | Serves as collection tube on vacuum aspirator setup |
15 mL Conical Tubes | Olympus | Genesee 28-106 | For making 10% sucorose solution and for holding adults when chilling before screening |
Aspirator | Bioquip | 1135A | For handling planthoppers |
Vacuum Aspirator | Fischer Technical | LAV-3 | Vacuum for aspirating larger numbers of insects |
Blue Spectrum LED Lights | Home Depot | GLP24FS/19W/LED | Grow lights for potted corn plants hoppers are feeding on |
Cas9 | TrueCut Cas9 Protein v2 | A36498 | Endonuclease for cutting planthopper genes |
Clear Vinyl Tubing | Home Depot | 3/8 in. I.D. x 1/2 in. O.D. x 10 ft. | Connects collection tube to pump on vacuum aspirator setup |
Corn planthoppers | North Carolina State University | N/A | Request from Dr. Anna Whitfield's lab |
Cotton balls | Genessee | 51-101 | Serves as a filter/insect catcher in collection tube on vacuum aspirator setup |
Double sided tape | Scotch Double Sided Tape | NA | Holding eggs for microinjection |
Early Sunglow corn | Park Seed Company | 05093-PK-N | Corn for rearing planthoppers |
epTIPS Microloader Tips | Eppendorf | C2554691 | Backfilling needle loading tips |
Femtojet Microinjection System | Eppendorf | 5247 | Controls injection pressure (12-20 psi, depending on needle bore size) |
Nutri-Fly Drosophila Agar | Genessee | 66-103 | Substrate for everything except egg-laying dish |
Fine forceps | Bioquip | 4731 | Egg handling |
General Purpose LE Agarose | Apex | 20-102 | Substrate inn egg-laying dish (oviposition medium) |
Guide RNA 1 – GGUUCAUCGCAAAAUAGCAG | Synthego | CRISPRevolution sgRNA EZ Kit (1.5 nmol) | RNA guides for targeting planthopper white gene |
Guide RNA 2 – UCUGAAAUCACUGGCCAAUA | Synthego | CRISPRevolution sgRNA EZ Kit (1.5 nmol) | RNA guides for targeting planthopper white gene |
Guide RNA 3 – GAGGGCAGAGUCGCUUUCUU | Synthego | CRISPRevolution sgRNA EZ Kit (1.5 nmol) | RNA guides for targeting planthopper white gene |
Humidifyer | Homedics | UHE-CM45 | For providing humidity in humidified hood |
Humidity chamber | Billups-Rothenberg | MIC-101 | For holding injected embryos until hatching |
Insect rearing cages | Bioquip (special order) | Close to 1450 L (has plastic front and mesh fabric sides) | Cage for planthoppers on corn |
Laser-based Micropipiette Puller | Sutter Instruments | P-2000/G | For making injection needles / Heat = 700, FIL = 4, VEL = 40, DEL = 170, PUL = 160 |
Leica M165 FC Fluorescence Stereomicroscope | Leica | M165 FC | Planthopper screening |
Microinjection Scope | Leica | MZ12-5 | Microinjection scope outfited with an XY stage |
Micromanipulator | Narishige | MN-151 | For positioning microinjection needle |
Micropipette beveler | Sutter Instruments | FG-BV10-D | For beveling injection needles / Used 'fine' graded plate at 20° angle |
Microscope Stage | AmScope | GT100 X-Y Gliding Table | For positioning and moving embryos under microscope |
Miniature Paint Brush | Testor #2 8733 | Sold in 3 pack 281206 | Fine paintbrushes for embryo handling |
Needle Holder | Narishige | HI-7 | For holding the microinjection needle |
Percival Incubator | Percival | I41VLH3C8 | Rearing injectees until hatch |
Petri Dishes (100 x 15 mm) | VWR | 89038-968 | Making agar dish for egg-lay |
pGEM-T Easy Vector System I cloning kit | Promega | A1360 | Cloning Pm white target site |
Phenol Red | Sigma | 143-78-8 | Microinjection buffer |
Plain Microscope Slides or coverslip | Fisher Scientific | 12-549-3 | Hold eggs for microinjection |
Plasmid DNA Midi Kit | Zymo | D4200 | Purification of injection-ready plasmid DNAs |
Plastic paraffin film | Pechiney Plastic Packaging | PM-996 | Roll size 4 in. x 125 ft |
Plastic wrap | Glad ClingWrap Plastic Wrap | NA | Wrap the entire egg-laying chamber |
Primer – PmW CRISPR check F1 – AAGGAATTTCTGGAGGTGAAA | IDT | 25 nmole DNA Oligo | First-round Primer for amplifing across target site within the Pm white gene |
Primer – PmW CRISPR check R1 – GATTCCTCGCTGTTGGGT | IDT | 25 nmole DNA Oligo | First-round Primer for amplifing across target site within the Pm white gene |
Primer – PmW CRISPR check F3 – TCACAGACCCTGGTGCTAATC | IDT | 25 nmole DNA Oligo | Second-round Primer for amplifing across target site within the Pm white gene |
Primer – PmW CRISPR check R3 – GTCCACAATCCACACTTCTGA | IDT | 25 nmole DNA Oligo | Second-round Primer for amplifing across target site within the Pm white gene |
Quartz capillaries | Sutter Instruments | QF100-50-10 | For making microinjection needles / O.D. 1 mm, I.D. 0.7 mm, 10 cm length |
Screen (White Organza Fabric) | Joann Fabrics | 16023889 | For covering the adult container |
Sparkleen | Fisher Scientific | 04-320-4 | Wash dishes |
Sucrose | Fisher Scientific | BP220-1 | To make 10% sucorose solution |