Мы сообщаем о простом, эффективном по времени и высокопроизводительном флуоресцентном спектроскопии анализе для количественной оценки актиновых нитей в биологических образцах ex vivo из тканей мозга грызунов и людей.
Актин, основной компонент цитоскелета, играет решающую роль в поддержании структуры и функции нейронов. При физиологических состояниях актин возникает в равновесии в двух его формах: мономерной глобулярной (G-актин) и полимеризованной нитевидной (F-актин). На синаптических терминалях актиновый цитоскелет образует основу для критических пре- и постсинаптических функций. Кроме того, динамические изменения в статусе полимеризации актина (взаимопревращение между глобулярной и нитевидной формами актина) тесно связаны с пластичными изменениями в синаптической структуре и функции. Здесь мы сообщаем о модифицированной методологии на основе флуоресценции для оценки статуса полимеризации актина в условиях ex vivo. В анализе используется флуоресцентно меченый фаллоидин, фаллотоксин, который специфически связывается с актиновыми нитями (F-актин), обеспечивая прямую меру полимеризованного нитевидного актина. В качестве принципиального доказательства мы предоставляем доказательства пригодности анализа как у грызунов, так и у гомогенатов ткани мозга человека. Используя латрункулин А (препарат, который деполимеризует актиновые нити), мы подтверждаем полезность анализа для мониторинга изменений уровня F-актина. Далее мы распространяем анализ на биохимические фракции изолированных синаптических терминалей, в которых мы подтверждаем повышенную полимеризацию актина при стимуляции деполяризацией с высоким внеклеточнымK+.
Актин цитоскелетного белка участвует в нескольких клеточных функциях, включая структурную поддержку, клеточный транспорт, подвижность и деление клеток. Актин встречается в равновесии в двух формах: мономерный глобулярный актин (G-актин) и полимеризованный нитевидный актин (F-актин). Быстрые изменения в статусе полимеризации актина (взаимоконверсия между его G- и F-формами) приводят к быстрой сборке и разборке нитей и лежат в основе его регуляторных ролей в клеточной физиологии. Актин образует основной компонент нейрональной цитоскелетной структуры и влияет на широкий спектр нейронных функций1,2. Следует отметить, что актин цитоскелет является неотъемлемой частью структурной платформы синаптических терминалей. Таким образом, он является основным детерминантом синаптического морфогенеза и физиологии и играет фундаментальную роль в контроле размера, количества и морфологии синапсов3,4,5. В частности, динамическая полимеризация-деполимеризация актина является ключевым фактором, определяющим синаптическое ремоделирование, связанное с синаптической пластичностью, лежащей в основе процессов памяти и обучения. Действительно, как пресинаптические (такие как высвобождение нейромедиаторов6,7,8,9,10),так и постсинаптические функции (пластичность, связанная с динамическим ремоделированием11,12,13,14)критически полагаются на динамические изменения статуса полимеризации актинового цитоскелета.
В физиологических условиях уровни F-актина динамически и жестко регулируются через мультимодальный путь, включающий посттрансляционную модификацию4,15,16, а также актин-связывающие белки (ABP)4,17. ABP могут влиять на динамику актина на нескольких уровнях (таких как инициирование или ингибирование полимеризации, индуцирование ветвления нити, разрыв нитей на более мелкие кусочки, содействие деполимеризации и защита от деполимеризации) и, в свою очередь, находятся под строгим модулирующим контролем, чувствительным к различным вне- и внутриклеточным сигналам18,19,20. Такие регуляторные проверки на нескольких уровнях диктуют строгую регуляцию динамики актина в синаптическом цитоскелете, тонкую настройку пред- и постсинаптических аспектов физиологии нейронов как в базальном, так и в индуцированном активностью состояниях.
Учитывая важную роль актина в физиологии нейронов, неудивительно, что несколько исследований предоставили доказательства изменений в динамике актина как критических патогенных событий, связанных с широким спектром неврологических расстройств, включая нейродегенерацию, психологические заболевания, а также заболевания нервного развития3,21,22,23,24,25,26,27. Однако, несмотря на богатство исследовательских данных, указывающих на ключевую роль актина в физиологии нейронов и патофизиологии, в понимании динамики актина, особенно в синаптическом цитоскелете, все еще остаются значительные пробелы. Необходимы дополнительные исследования, чтобы лучше постить нейрональный актин и его изменения в патологических условиях. Одним из основных направлений деятельности в этом контексте является оценка статуса полимеризации актина. Существуют коммерческие наборы на основе вестерн-блоттинга (биохимический набор для анализа G-Actin/F-Actin in vivo; Цитоскелет SKU BK03728,29) и самодельные анализы для оценки уровня F-актина6. Однако, поскольку они требуют биохимической изоляции F-актина и G-актина и поскольку их последующая количественная оценка основана на протоколах иммуноблоттинга, они могут занять много времени. Здесь мы сообщаем об анализе на основе флуоресцентной спектроскопии, адаптированном из предыдущего исследования30 с модификациями, которые могут быть использованы для оценки как базальных уровней F-актина, так и динамических изменений в его сборке-разборке. Примечательно, что мы эффективно модифицировали оригинальный протокол, который требует образцов, подходящих для кюветы 1 мл, в текущем формате пластины с 96 скважинами. Таким образом, модифицированный протокол значительно уменьшил количество ткани/ образца, необходимое для анализа. Кроме того, мы предоставляем доказательства того, что протокол подходит не только для гомогенатов мозговой ткани, но и для субклеточных фракций, таких как изолированные синаптические терминали (синаптосомы и синаптоневросомы). Наконец, анализ может быть использован для свежепропарированных тканей мозга грызунов и длительно хранящихся посмертных образцов человеческого мозга. Следует отметить, что, хотя анализ представлен в нейронном контексте, он может быть соответствующим образом распространен на другие типы клеток и физиологические процессы, связанные с ними.
Анализ, описанный здесь, по существу адаптированный из предыдущего исследования30 с модификациями, использует фаллотоксин, фаллоидин, помеченный флуоресцентной меткой. Флуоресцентные аналоги фаллоидина считаются золотым стандартом окрашивания актиновых нитей в фиксиро?…
The authors have nothing to disclose.
Эта работа была поддержана Неврологическим фондом Новой Зеландии (1835-PG), Новозеландским советом по исследованиям в области здравоохранения (#16-597) и кафедрой анатомии Университета Отаго, Новая Зеландия. Мы в долгу перед Банком неврологических тканей HCB-IDIBAPS BioBank (Испания) для тканей головного мозга человека. Мы благодарим Цзясянь Чжан за помощь в записи и редактировании видео.
3.5 mL, open-top thickwall polycarbonate tube | Beckman Coulter | 349622 | For gradient centrifugation (synaptosome prep) |
Alexa Fluor 647 Phalloidin | Thermo Fisher Scientific | A22287 | F-actin specific ligand |
Antibody against b-actin | Santa Cruz Biotechnology | Sc-47778 | For evaluation of total actin levels by immunoblotting |
Antibody against GAPDH | Abcam | Ab181602 | For evaluation of GAPDH levels by immunoblotting |
Bio-Rad Protein Assay Dye Reagent Concentrate | Bio-Rad | 5000006 | Bradford based protein estimation |
Calcium chloride dihydrate (CaCl2·2H2O) | Sigma-Aldrich | C3306 | Krebs buffer component |
cOmplete, Mini, EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail | Sigma-Aldrich | 4693159001 | For inhibition of endogenous protease activity during sample preparation |
Corning 96-well Clear Flat Bottom Polystyrene | Corning | 3596 | For light-scattering measurements |
D-(+)-Glucose | Sigma-Aldrich | G8270 | Krebs buffer component |
Dimethyl sulfoxide | Sigma-Aldrich | D5879 | Solvent for phalloidin and latrunculin A |
Fluorescent flatbed scanner (Odyssey Infrared Scanner) | Li-Cor Biosciences | For detection of immunoreactive signals on immunoblots | |
Glutaraldehyde solution (25% in water) Grade II | Sigma-Aldrich | G6257 | Fixative |
HEPES | Sigma-Aldrich | H3375 | Buffer ingredient for sample preparation and Krebs buffer component |
Latrunculin A | Sigma-Aldrich | L5163 | Depolymerizer of actin filaments |
Magnesium chloride hexahydrate (MgCl2·6H2O) | Sigma-Aldrich | M2670 | Krebs buffer component |
Microplates | |||
Mitex membrane filter 5 mm | Millipore | LSWP01300 | Preparation of synaptoneurosomes |
Nunc F96 MicroWell Black Plate | Thermo Fisher Scientific | 237105 | For fluorometric measurements |
Nylon net filter 100 mm | Millipore | NY1H02500 | Preparation of synaptoneurosomes |
Phosphatase Inhibitor Cocktail IV | Abcam | ab201115 | For inhibition of endogenous phosphatase activity during sample preparation |
Potassium chloride (KCl) | Sigma-Aldrich | P9541 | Krebs buffer component and for depolarization of synaptic terminals |
Potassium phosphate monobasic ((KH2PO4) | Sigma-Aldrich | P9791 | Krebs buffer component |
Sodium borohydride (NaBH4) | Sigma-Aldrich | 71320 | Component of Permeabilization buffer |
Sodium chloride (NaCl) | LabServ (Thermo Fisher Scientific) | BSPSL944 | Krebs buffer component |
Sodium hydrogen carbonate (NaHCO3) | LabServ (Thermo Fisher Scientific) | BSPSL900 | Krebs buffer component |
SpectraMax i3x | Molecular Devices | For fluorometric measurements | |
Sucrose | Fisher Chemical | S/8600/60 | Buffer ingredient for sample preparation |
Swimnex Filter Holder | Millipore | Sx0001300 | Preparation of synaptoneurosomes |
Tissue grinder 5 mL Potter-Elvehjem | Duran Wheaton Kimble | 358034 | For tissue homogenization |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100 | Component of Permeabilization buffer |
Trizma base | Sigma-Aldrich | T6066 | Buffer ingredient for sample preparation |