Summary

代謝標識と薄層クロマトグラフィーによる サッカロミセス・セレビシエ における中性脂質合成の解析

Published: February 02, 2021
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Summary

ここでは 、14C-酢酸を用いた酵母の代謝標識に関するプロトコルが提示され、これは中性脂質の分離のための薄層クロマトグラフィーと結合される。

Abstract

中性脂質(ヌル)は、エネルギーおよび脂質恒常性において重要な役割を果たす疎水性、無用な生体分子のクラスです。NLsはアセチルCoAからデノボを合成し、主にトリグリセリド(TG)およびステロールエステル(SE)の形で真核生物に存在する。ネルの合成を担う酵素は 、サッカロミセス・セレビシエ (酵母)からヒトまで高度に保存されており、酵母はNL代謝酵素の機能と調節を解剖するのに有用なモデル生物となっています。アセチルCoAがNL種の多様なセットに変換される方法については多くのことが知られていますが、NL代謝酵素を調節するメカニズム、および誤調節が細胞病理にどのように寄与できるかはまだ発見されています。NL種の分離と特性評価のための数多くの方法が開発され、研究の数十年にわたって使用されています。しかし、主要なNL種の包括的な特性評価のための定量的かつ単純なプロトコルは議論されていない。ここでは、酵母における主要なNL種のデノボ合成を定量化する簡便かつ適応可能な方法が提示される。薄層クロマトグラフィーと組み合わせた 14のC-酢酸代謝標識を適用して、生理学的に重要なNLの多様な範囲を分離し定量化します。

Introduction

アセチルCoAは、膜を構築し、ATPを生成し、細胞シグナル伝達調節するための汎用性の高い生体分子通貨として機能する中性脂質(NLs)を含む多様な生体分子の基本的なビルディングブロックである1,2。これらのそれぞれの経路のいずれかにシャントされるLSの可用性は、部分的には、その貯蔵によって調節される。脂質滴(LD)は、トリグリセリド(TG)およびステロールエステル(SE)の疎水性コアからなる細胞質小器官であり、ほとんどの細胞のヌルの主な貯蔵室である。したがって、DLは、分解し、その後生化学的および代謝プロセス3、4に利用することができるDLを隔離し、調節する。NLおよびLD関連タンパク質の誤調節は、リポジストロフィーおよびメタボリックシンドローム5,6を含む病理の発症と相関することが知られている。このため、現在のLD研究は、NL合成が空間的、時間的、および多細胞生物の異なる組織にわたってどのように調節されているかに重点を置いて行われています。NLsのユビキタスな細胞の役割のために、DLの合成と調節を担当する多くの酵素は真核生物全体で保存される7.実際、一部の原核生物でさえ、DL 8にDLを保管しています。したがって、サッカロミセス・セレビシエ(出芽酵母)などの遺伝的に難解なモデル生物は、NLの合成および調節の研究に有用であった。

細胞抽出物からのNLの分離と定量は、ガスクロマトグラフィー質量分析(GC-MS)、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)、超高性能液体クロマトグラフィー質量分析(UPLC-MS)9、10、11など無数の方法で達成できます。おそらく、最も簡単な方法は、薄層クロマトグラフィー(TLC)を介して、標準曲線12、13からのその後の密度定量を可能にする。TLC は、NLs のコース粒度の分離のみを提供しますが、コストが安価で、複数のサンプルから同時に NL を迅速に分離できるため、強力な手法です。TLCを介してのNLの研究が直面している最もかなりの課題の2つは、1)NL種とその中間体の細胞豊富の広い範囲、および2)NL合成経路内の脂質中間体の親水性/疎水性の範囲である。その結果、TLCを介したNL種の定量は、典型的には最も豊富な種に限定される。しかし、14C-酢酸放射標識の導入は、NL経路内の低存在性中間体の検出を有意に高めることができる。酢酸はアセチルCoA合成酵素ACS214によってアセチルCoAに急速に変換され、これは14C-酢酸を酵母15において適切な放射性標識基質にする。さらに、疎水性のNLsとNの親水性中間体の両方の分離は、複数の溶媒システム16を使用することにより、TLCによって達成することができる。ここでは、酵母における14のC-酢酸代謝標識を用いたNLsの分離方法を提示する。パルス期間中に標識された脂質は、その後、十分に確立された全脂質単離プロトコル17によって単離され、続いてTLCによるNL種の分離が続く。標識脂質を可視化するオートラジオグラフィーと、全脂質を可視化する化学スプレーの両方によるTLCプレートの開発は、複数の定量方法を可能にする。個々の脂質バンドはまた、カミソリの刃を使用してTLCプレートから容易に抽出することができ、およびシンチレーションカウントは、バンド内の放射性標識材料の量を定量するために使用することができる。

Protocol

1. 14C-酢酸を用いて酵母細胞の増殖と標識 プレートからコロニーを摘み取り、2%デキストロースを含む合成完全(SC)培地の20mLに分配して酵母培養を接種する(SC培地のレシピについては 補足ファイル を参照)。200rpmで振盪して一晩30°Cでインキュベートする。注:成長条件、サンプル量、および治療は、対象の脂質に基づいて異なります。完全な実験を実行する前に?…

Representative Results

このプロトコルでは、14C-酢酸代謝標識によってNL種の標識、検出、定量化が可能であることを実証しました。主なNL種は、50:40:10:10:1(v/v/v/v)ヘキサン:石油エーテル:ジエチルエーテル:酢酸(図1A、B)の溶媒系で分離することができます。蛍光体イメージングは、標識遊離脂肪酸(FFA)、トリアシルグリセロール(TG)、ジアシルグリセロール(DG)、コレステロー…

Discussion

ここでは、酵母におけるNL種の合成を定量的に監視する多目的な放射標識プロトコルが提示される。このプロトコルは非常にモジュラーで、3-6日以内に手続きを終わらせることができます。さらに、脂質種と代謝産物を分離するためのTLCの使用に関する豊富な文献が存在し、これはユーザーがTLC溶媒系16,19の単純な変化で関心のあるいくつかの脂質?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

著者らは、この研究の完了に関するヘルプと概念的なアドバイスをヘンネ研究所のメンバーに感謝したいと考えています。W.M.H.は、ウェルチ財団(I-1873)、NIH NIGMS(GM119768)、アラパレスギアン医学研究基金、UT南西部寄付奨学生プログラムからの資金によって支えられています。S.R は T32 プログラム交付 (5T32GM008297) によってサポートされています。

Materials

[1-C14] Acetic acid sodium salt specific activity: 45-60mCi PerkinElmer NEC084H001MC
18:1 1,2 dioleoyl-sn-glycerol Avanti 800811O
200 proof absolute ethanol Sigma 459836
Acid washed glass beads 425-600um Sigma G8772
Amber bulbs for Pastuer pipettes Fisher 03-448-24
Ammonium Sulfate >99% Sigma A4418
Beckman LS6500 scintillation counter PerkinElmer A481000
Chloroform (HPLC grade) Fisher C607SK
Cholesterol >99% Sigma C8667
Cholesteryl-linoleate >98% Sigma C0289
Concentrated sulfuric acid Sigma 339741
Corning 50mL conical tubes, polypropylene with centristar cap Sigma CLS430829
Dextrose, anhydrous grade Sigma D9434
Diethyl ether anhydrous grade Sigma 296082
Drying oven Fisher 11-475-155
EcoLume scintillation liquid VWR IC88247001
Eppendorf 5424R centrifuge Fisher 05-401-205
GE Storage phosphor screen Sigma GE28-9564-75
GE Typhoon FLA9500 imager
Glacial acetic acid, ACS grade Sigma 695092
Glass 6mL scintillation vials Sigma M1901
Glass centrifuge tube caps Fisher 14-595-36A
Glass centrifuge tubes Fisher 14-595-35A
Glass Pasteur pipette Fisher 13-678-20C
Hexane, anhydrous grade Sigma 296090
L-Adenine >99% Sigma A8626
L-Alanine >98% Sigma A7627
L-Arginine >99% Sigma A1270000
L-Asparagine >98% Sigma A0884
L-Aspartate >98% Sigma A9256
L-Cysteine >97% Sigma W326305
L-Glutamic acid monosodium salt monohydrate >98% Sigma 49621
L-Glutamine >99% Sigma G3126
L-Glycine >99% Sigma G8898
L-Histidine >99% Sigma H8000
L-Isoleucine >98% Sigma I2752
L-Leucine >98% Sigma L8000
L-Lysine >98% Sigma L5501
L-Methionine, HPLC grade Sigma M9625
L-Phenylalanine, reagent grade Sigma P2126
L-Proline >99% Sigma P0380
L-Serine >99% Sigma S4500
L-Theronine, reagent grade Sigma T8625
L-Tryptophan >98% Sigma T0254
L-Tyrosine >98% Sigma T3754
L-Uracil >99% Sigma U0750
L-Valine >98% Sigma V0500
Methanol, ACS grade Fisher A412
Oleic acid >99% Sigma O1008
p-anisaldehyde Sigma A88107
Petroleum ether, ACS grade Sigma 184519
Phosphatidylcholine, dipalmitoyl >99% Sigma P1652
Pipettes Eppendorf 2231000713
Potassium chloride, ACS grade Sigma P3911
Sodium Hydroxide pellets, certified ACS Fisher S318-100
Squalene >98% Sigma S3626
Succinic Acid crystalline/certified Fisher 110-15-6
TLC saturation pad Sigma Z265225
TLC silica gel 60G glass channeled plate Fisher NC9825743 No fluorescent indicators
Transparency plastic film Apollo 829903
Tricine Sigma T0377
Triolein >99% Sigma T7140
Vortex mixer Fisher 02-215-414
Whatman exposure cassette Sigma WHA29175523
Yeast nitrogen base without ammonium sulfate and amino acids Sigma Y1251

References

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Cite This Article
Rogers, S., Henne, W. M. Analysis of Neutral Lipid Synthesis in Saccharomyces cerevisiae by Metabolic Labeling and Thin Layer Chromatography. J. Vis. Exp. (168), e62201, doi:10.3791/62201 (2021).

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