Summary

Directe herprogrammering van menselijke fibroblasten in myoblasten om therapieën voor neuromusculaire aandoeningen te onderzoeken

Published: April 03, 2021
doi:

Summary

Dit protocol beschrijft de omzetting van huidfibbroblasten in myoblasten en hun differentiatie in myotubes. De cellijnen zijn afgeleid van patiënten met neuromusculaire aandoeningen en kunnen worden gebruikt om pathologische mechanismen te onderzoeken en therapeutische strategieën te testen.

Abstract

Onderzoeken naar zowel de pathofysiologie als therapeutische doelen in spierdystrofieën zijn belemmerd door de beperkte proliferatieve capaciteit van menselijke myoblasten. Er zijn verschillende muismodellen gemaakt, maar ze vertegenwoordigen niet echt de menselijke fysiopathologie van de ziekte of zijn niet representatief voor het brede spectrum van mutaties bij mensen. De vereeuwiging van menselijke primaire myoblasten is een alternatief voor deze beperking; het is echter nog steeds afhankelijk van spierbiopsieën, die invasief zijn en niet gemakkelijk beschikbaar zijn. Huidbiopten zijn daarentegen gemakkelijker te verkrijgen en minder invasief voor patiënten. Fibroblasten afgeleid van huidbiopten kunnen worden vereeuwigd en getransdifferentieerd in myoblasten, waardoor een bron van cellen met een uitstekend myogen potentieel wordt geboden. Hier beschrijven we een snelle en directe herprogrammeringsmethode van fibroblast in een myogene afstamming. Fibroblasten worden getransduceerd met twee lentivirussen: hTERT om de primaire cultuur te vereeuwigen en een tet-inducerende MYOD, die bij toevoeging van doxycycline de omzetting van fibroblasten in myoblasten induceert en vervolgens myotubes rijpt, die late differentiatiemarkers uitdrukken. Dit snelle transdifferentiatieprotocol is een krachtig instrument om pathologische mechanismen te onderzoeken en innovatieve gengebaseerde of farmacologische biotherapieën voor neuromusculaire aandoeningen te onderzoeken.

Introduction

Cellulaire modellen die rechtstreeks uit menselijke weefsels worden verkregen, zijn nuttig om veel menselijke genetische aandoeningen te modelleren, met het voordeel dat ze de oorspronkelijke genomische context hebben en in veel gevallen dezelfde moleculaire en cellulaire kenmerken reproduceren die bij de patiënten worden waargenomen. Op het gebied van neuromusculaire aandoeningen zijn spierbiopten een grote bron van menselijke myoblasten geweest en hebben ze geholpen bij de opheldering van pathologische mechanismen. Bovendien zijn ze een belangrijk hulpmiddel voor in vivo testen van geneesmiddelen en gentherapieën. Aan de ene kant is de afleiding van myoblasten uit spierfragmenten relatief eenvoudig. Aan de andere kant zijn de cultuur en het onderhoud van primaire myoblasten uitdagend, vanwege hun beperkte proliferatiesnelheid en replicatieve senescentie in vitro1. Een alternatief voor deze beperkingen is het vereeuwigen van myoblasten met het inbrengen van de menselijke telomerase (hTERT) en/of cycline-afhankelijke kinase 4 (CDK4) genen2,3, met behoud van skeletspierkenmerken4. Niettemin is de obtentie van primaire myoblasten nog steeds afhankelijk van spierbiopsie, een chirurgische procedure met nadelen voor de patiënten, die in veel gevallen hun spieren in geavanceerde degeneratie hebben. De spier van deze patiënten bestaat dus uit een aanzienlijk deel van het fibrotische en/of vetweefsel en levert minder spiercellen op, waardoor de cellen eerder moeten worden gezuiverd tot de vereeuwiging.

In tegenstelling tot spierbiopten zijn huidbiopten toegankelijker en minder schadelijk voor patiënten. Primaire fibroblasten kunnen in vitroworden afgeleid uit huidfragmenten . Hoewel fibroblasten niet voornamelijk worden beïnvloed door mutaties die neuromusculaire aandoeningen veroorzaken, kunnen ze worden getransdifferentieerd in myoblasten. Dit kan worden bereikt door het inbrengen van het Myod-gen, een myogene transcriptiefactor5. In dit manuscript beschrijven we het protocol om getransdifferentieerde myoblasten te verkrijgen, van de oprichting van fibroblastenculturen tot de obtentie van gedifferentieerde myostubes (een representatieve samenvatting van de methode is afgebeeld in figuur 1).

Preklinisch testen van therapeutische strategieën is afhankelijk van cellulaire en dierlijke modellen met mutaties die vergelijkbaar zijn met de mutaties die bij menselijke patiënten worden gevonden. Hoewel de ontwikkeling van diermodellen haalbaarder is geworden met de opmars van genbewerkingstechnologieën zoals CRISPR/Cas96, is het nog steeds uitdagend en kostbaar. Van patiënten afgeleide cellijnen zijn dus een toegankelijke optie om modellen te hebben, die het grote spectrum van mutaties van ziekten zoals Duchenne spierdystrofie (DMD) bestrijken. Obtention en creatie van celmodellen zijn cruciaal voor de ontwikkeling van gepersonaliseerde therapieën voor dergelijke pathologieën.

Onder gepersonaliseerde therapieën die zijn onderzocht, exon skipping strategieën is een van de veelbelovende voor verschillende spierdystrofieën7,8. Deze strategie bestaat uit het produceren van een korter maar functioneel eiwit. Dit wordt uitgevoerd door de exon-definitie te verbergen voor het spliceosome, waardoor de gemuteerde exon wordt uitgesloten van de laatste boodschapper. Dit is een veelbelovende technologie die is goedgekeurd door de FDA voor DMD. Zo beschrijven we in dit protocol ook methoden om myoblasten te transfecteren met twee verschillende exon skipping gerelateerde technologieën: antisense oligonucleotiden (AON) en U7snRNA-adeno-geassocieerd virus (AAV). AON-transfectie is een goed hulpmiddel voor de eerste screening van verschillende sequenties die zijn ontworpen om exon skipping9te bevorderen. De activiteit van AON’s is echter van voorbijgaande aard. Om een aanhoudende expressie van antisense sequenties te verkrijgen, onderzochten we ook kleine nucleaire RNA’s (snRNA’s) in combinatie met AAV, waardoor nucleaire lokalisatie en opname in de splicingmachines mogelijk werd10. U7 is een snRNA dat betrokken is bij de verwerking van histon mRNA dat kan worden ontworpen om eiwitten te binden die het naar het spliceosome zullen leiden en antisense sequenties11zullen leveren. Het gebruik van gewijzigde U7-snRNA ‘s in combinatie met AAV-vectoren overwint beperkingen van AION ‘s , wat resulteert in een voortdurende expressie van de AION ‘s en een betere transductie van aandachtsweefsels12. We gebruiken cellen afgeleid van DMD-patiënten voor dit protocol om de exon-skippingstrategie te illustreren.

Protocol

Alle experimenten en biopsieën werden uitgevoerd volgens de ethische regels van de betrokken instellingen onder de goedkeuring van de Nationwide Children’s Hospital Institutional Review Board. 1. Initiatie van de huidfibbroblastencultuur Oprichting van de fibroblastencultuur Aliquot 10 ml fibroblastmedium (tabel 1) in conische buizen van 15 ml. De huidbiopsie moet in dit medium worden geplaatst en getransporteerd. De biopsie kan bij 4 °C worden bewaard totd…

Representative Results

Dit protocol laat zien hoe je menselijke huid-afgeleide fibroblastculturen vaststellen en omzetten in myoblasten en vervolgens in gedifferentieerde myotubes. Dit type cellijn is uiterst nuttig voor de studie van neuromusculaire aandoeningen en in vitro testen van potentiële therapieën. Een schematische weergave van de fibroblastconversie wordt weergegeven in figuur 1. Figuur 2A toont een stukje huid en de fibroblasten die e…

Discussion

Om FM-cellijnen van goede kwaliteit te verkrijgen, zijn sommige stappen van cruciaal belang. Hoe eerder de huidbiopsie wordt verwerkt, hoe groter de kans op het verkrijgen van gezonde fibroblasten. Het passageaantal fibroblastenculturen is ook belangrijk. Primaire cellen hebben een beperkte proliferatieve capaciteit en na vele passages komen ze binnen in replicatieve senescentie. Het is dus beter om een voorraad fibroblasten te hebben met een laag passagenummer en cellen zo snel mogelijk te transformeren.

<p class="…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We willen Dr. Vincent Mouly bedanken voor het delen van zijn kennis in het verleden over het model. Dit werk is ondersteund door het Us National Institutes of Health National Institute of Neurological Disorders and Stroke (R01 NS043264 (K.M.F., en R.B.W.)), de Us National Institutes of Health National Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin Diseases (NIAMS) (P50 AR070604-01 (K.M.F., K.M., R.N., en N.W.). N.W. heeft fellowship-steun ontvangen van de Ohio State University /Nationwide Children’s Hospital Muscle Group en de Philippe Foundation. Dit werk werd ook ondersteund door interne discretionaire fondsen en een deel van het exon 2 overslaande werk werd ook ondersteund door CureDuchenne (K.M.F.) en Association Francaise Contre Les Myopathies. IRB-nummer: IRB #: IRB10-00358/ CR00005138 en IBCSC#: IBS00000123.

Materials

100 mm dish Corning 430167
0.25% Trypsin-EDTA, phenol red Thermo Fisher 2500056
10X Phosphate buffered saline (PBS) Fisher Scientific BP3994
12-well plate Corning 3513
20X Transfer buffer Thermo Fisher NP00061
20X Tris-acetate SDS running buffer Thermo Fisher LA0041
3-8% Tris-Acetate gel Thermo Fisher EA0378BOX
75 cm2 flask Corning 430641U
Antibiotic-Antimicotic 100X Thermo Fisher 15240062
Anti-myosin heavy chain, sarcomere antibody Developmental Studies Hybridome Bank MF20 supernatant Dilution 1:50
Antioxidant Thermo Fisher NP0005
BCA Protein Assay Thermo Fisher 23227
Chloroform Sigma-Aldrich C2432
DAPI Thermo Fisher D3571 Dilution 1:1000
Digitonin Millipore Sigma 300410250MG
Dimethyl sulfoxide Sigma-Aldrich D2438
DMEM, High glucose, GlutaMAX supplement, Pyruvate Thermo Fisher 10569044
DNAse I set (250U) Zymo Research Corporation E1010
Doxycycline Hydrochloride Fisher Scientific BP2653-5
Dup2 human primers Fw_5' GCTGCTGAAGTTTGTTGG
TTTCTC 3'
Rv_5' CTTTTGGCAGTTTTTGCC
CTGT 3'
Dystrophin antibody Abcam ab15277 Dilution 1:200
Fetal bovine serum Thermo Fisher 16000
Glycine Sigma-Aldrich G8898
Goat anti-mouse, Alexa Fluor 488 Thermo Fisher A11001 Dilution 1:1000
Halt Protease inhibitor cocktail 100X Thermo Fisher 78430
Hemocytometer Hausser Scientific 3100
Hygromycin B Thermo Fisher 10687010
IRDye 680RD goat anti-Rabbit IgG (H+L) Li-Cor 926-68071 Dilution 1:5000
Lab-Tek II CC2 chamber slide system Thermo Fisher 15852
Laemmli Bioworld 105700201
Lipofectamine 3000 Transfection Reagent Thermo Fisher L3000008
Matrigel GFR membrane matrix Corning 354230
Methanol Fisher Scientific A412P-4
Mr. Frosty Freezing Container Thermo Fisher 51000001
Nitrocellulose membrane 0.45 µm GE Healthcare Life Sciences 10600002
Normal Goat serum control Thermo Fisher 10000C
Odyssey Blocking Buffer (PBS) Li-Cor 927-40003 Blocking buffer for Western blot
Opti-MEM I Reduced Serum Medium Thermo Fisher 11058021
Paraformaldehyde Sigma-Aldrich 158127
PCR master mix Thermo Fisher K0172
Phosphatase inhibitor Thermo Fisher A32957
Precision Plus Protein Dual Color Standards Bio Rad 1610374
Puromycin Thermo Fisher A1113803
Revert 700 Total Protein Stain for Western Blot Normalization Li-Cor 926-11021
RevertAid kit Thermo Fisher K1691
RNA Clean & Concentrator-25 Zymo Research Corporation R1018
Scalpels Aspen Surgical 372611
Skeletal Muscle Cell Differentiation medium Promocell C23061
Skeletal Muscle Cell Growth medium Promocell C23060
Triton X-100 Acros Organics 215682500
TRIzol reagent Thermo Fisher 15596026
Tween 20 Fisher Scientific BP337500
Ultra low temperature freezer Thermo Scientific 7402
UltraPure 0.5M EDTA, pH 8.0 Thermo Fisher 15575020
Vectashield antifade mounting medium Vector Labs H1000

References

  1. Bigot, A., et al. Replicative aging down-regulates the myogenic regulatory factors in human myoblasts. Biology of the Cell. 100 (3), 189-199 (2008).
  2. Mamchaoui, K., et al. Immortalized pathological human myoblasts: Towards a universal tool for the study of neuromuscular disorders. Skeletal Muscle. 1 (34), (2011).
  3. Pantic, B., et al. Reliable and versatile immortal muscle cell models from healthy and myotonic dystrophy type 1 primary human myoblasts. Experimental Cell Research. 342 (1), 39-51 (2016).
  4. Thorley, M., et al. Skeletal muscle characteristics are preserved in hTERT/cdk4 human myogenic cell lines. Skeletal Muscle. 6 (1), 43 (2016).
  5. Chaouch, S., et al. Immortalized skin fibroblasts expressing conditional MyoD as a renewable and reliable source of converted human muscle cells to assess therapeutic strategies for muscular dystrophies: Validation of an exon-skipping approach to restore dystrophin in duchen. Human Gene Therapy. 20 (7), 784-790 (2009).
  6. Zarei, A., Razban, V., Hosseini, S. E., Tabei, S. M. B. Creating cell and animal models of human disease by genome editing using CRISPR/Cas9. The Journal of Gene Medicine. 21 (4), 3082 (2019).
  7. Echevarría, L., Aupy, P., Goyenvalle, A. Exon-skipping advances for Duchenne muscular dystrophy. Human molecular genetics. 27 (2), 163-172 (2018).
  8. Hwang, J., Yokota, T. Recent advancements in exon-skipping therapies using antisense oligonucleotides and genome editing for the treatment of various muscular dystrophies. Expert reviews in molecular medicine. 21, 5 (2019).
  9. Wein, N., et al. Efficient Skipping of Single Exon Duplications in DMD Patient-Derived Cell Lines Using an Antisense Oligonucleotide Approach. Journal of Neuromuscular Diseases. 4 (3), 199-207 (2017).
  10. De Angelis, F. G., et al. Chimeric snRNA molecules carrying antisense sequences against the splice junctions of exon 51 of the dystrophin pre-mRNA induce exon skipping and restoration of a dystrophin synthesis in Δ48-50 DMD cells. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (14), 9456-9461 (2002).
  11. Gorman, L., Suter, D., Emerick, V., Schümperli, D., Kole, R. Stable alteration of pre-mRNA splicing patterns by modified U7 small nuclear RNAs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 95 (9), 4929-4934 (1998).
  12. Wein, N., et al. Translation from a DMD exon 5 IRES results in a functional dystrophin isoform that attenuates dystrophinopathy in humans and mice. Nature Medicine. 20 (9), 992-1000 (2014).
  13. Auré, K., Mamchaoui, K., Frachon, P., Butler-Browne, G. S., Lombès, A., Mouly, V. Impact on oxidative phosphorylation of immortalization with the telomerase gene. Neuromuscular Disorders. 17 (5), 368-375 (2007).
  14. Barde, I., et al. Efficient control of gene expression in the hematopoietic system using a single Tet-on inducible lentiviral vector. Molecular Therapy. 13 (2), 382-390 (2006).
  15. Wang, X., McManus, M. Lentivirus production. Journal of Visualized Experiments. (32), e1499 (2009).
  16. Amack, J. D., Mahadevan, M. S. Myogenic defects in myotonic dystrophy. Developmental Biology. 265 (2), 294-301 (2004).

Play Video

Cite This Article
Almeida, C. F., Frair, E. C., Huang, N., Neinast, R., McBride, K. L., Weiss, R. B., Flanigan, K. M., Wein, N. Direct Reprogramming of Human Fibroblasts into Myoblasts to Investigate Therapies for Neuromuscular Disorders. J. Vis. Exp. (170), e61991, doi:10.3791/61991 (2021).

View Video