מאמר זה מדווח על שיטה פשוטה לבודד את שכבות המשנה החיצוניות והפנימיות של ביצי עוף תוך מזעור השינוי המבני ולייעל את סולביליזציה של חלבונים של כל שכבת משנה לניתוחים פרוטאומיים.
שכבת הפריוויטליין המקיפה את חלמון הביצה ממלאת תפקיד בסיסי בהפריה, בהגנה על הביציות ובהתפתחות עובר העופות. היא נוצרת על ידי שתי שכבות חלבון הקשורות קשר הדוק ונוצרות על ידי איברי רבייה נשיים מובהקים. ההנחה היא שלשני המבנים יש ספציפיות תפקודית משלהם, שנותרה מוגדרת. כדי לאפיין את תפקידם של חלבונים המרכיבים כל שכבת משנה, האתגר הראשון הוא לקבוע את התנאים שיאפשרו הפרדה מכנית של שתי שכבות מורכבות אלה, תוך הגבלת כל נזק מבני. השלב השני הוא לייעל את התנאים הניסיוניים כדי להקל על סולובליזציה של חלבונים משתי שכבות משנה אלה, לניתוחים ביוכימיים עוקבים. היעילות של גישה זו מוערכת על ידי ניתוח פרופיל החלבון של כל שכבת משנה על ידי נתרן דודציל סולפט-פולי-אקרילאמיד ג’ל אלקטרופורזה (SDS-PAGE), אשר צפוי להיות נבדל בין שני המבנים. הליך דו-שלבי זה נשאר פשוט; זה דורש ציוד ביוכימי קלאסי ריאגנטים; ותואם לפרוטאומיות מעמיקות נוספות. זה יכול להיות גם טרנספוזיציה ביצי עופות אחרים לביולוגיה השוואתית, בידיעה כי המבנה ואת ההרכב של שכבת perivitelline הוכח יש תכונות ספציפיות למינים. בנוסף, התנאים שאינם מנומרים שפותחו עבור הפרדת שכבות משנה (שלב 1) מאפשרים ניתוחים מבניים שלהם על ידי מיקרוסקופ אלקטרונים סריקה והעברה. זה עשוי גם להוות את הצעד הראשוני עבור טיהור החלבון הבאים לנתח את הפעילות הביולוגית שלהם בהתאמה מבנה 3D, או לבצע ניתוחים אימונוהיסטוכימיים או פונקציונליים נוספים. מחקרים כאלה יסייעו לפענח את הפונקציה הפיזיולוגית של שתי שכבות משנה אלה, אשר integrities מבניים ותפקודיים הם קריטריונים מכריעים של הצלחת הרבייה.
מטרת שיטה זו היא לספק פרוטוקול המאפשר אפיון ביוכימי עוקב של שכבת perivitelline (PL), שכבה חלבונית דקה המקיפה את חלמון הביצה וממלאת תפקיד בסיסי ברפרודוקציה של מיני העופות. PL, המכונה גם “קרום ויטלין” בספרות, היא רשת תלת מימדית של סיבים עבים המורכבת ממספר סוגים של גליקופרוטאינים. הוא מורכב משכבת פריוויטליין פנימית (IPL) (במגע עם החלמון) המורכבת בשחלה, ומשכבת פריוויטליין חיצונית (OPL, במגע עם הלבן), שוכבת על ה- IPL (איור 1) ומיוצרת על ידי הפונפוניבלום. רקמה אחרונה זו היא החלק העליון דמוי המשפך של ה- oviduct המקבל את זקיק החלמון הבוגר לאחר הביוץ, ואת האתר בו מתרחשת ההפריה. הפרשת OPL מתרחשת לאחר שני אירועים אלה ואחריו הפקדה רצופה של לבן ביצה קליפת ביצה בקטעים ספציפיים אחרים של oviduct. הפונקציות הפיזיולוגיות של PL קשורות לא רק להפריה ולשלבים המוקדמים של העובר, אלא גם להגנה הפיזית והמולקולרית של העובר. הניתוח הפרוטאומי של ביצת העוף שבוצע על כל PL גילה את נוכחותם של 137 חלבונים שונים1, אבל ההפצה של רוב החלבונים האלה בין IPL ו OPL נשאר להיות ברור. הכמות המינימלית של נתונים הזמינים בדו”ח הספרות כי IPL ו OPL להפגין פרופילי חלבון ברורים מאוד2,3,4, אשר מציע תכונות מבניות ותפקודיות שונות. המחסור היחסי בנתונים על התפלגות החלבונים בין OPL ל-IPL נובע ככל הנראה מהקושי להפריד בין שתי שכבות המשנה הדקות והמוטמעות.
השיטה המוצגת כאן מתארת את התנאים שישמשו להפרדת שתי שכבות המשנה בעלות השפעה מוגבלת על המבנה ההיסטולוגי שלהן תוך שמירה על תכולת החלבון שלהן, ולספק את הפרוטוקול המאפשר את ההסתבכות המלאה של חלבונים לניתוח הבא על ידי פרוטאומיקה. הוא כולל שני שלבים עיקריים: 1) דגימת PL והפרדת OPL/IPL ו-2) טיפול PL, OPL ו- IPL לסלוביליזציה של חלבונים ואלקטרופורזה לניתוח ספקטרומטריית מסה. זרימת העבודה מוצגת באיור 2. באופן בולט, למרות שהפרוטוקול הנוכחי עבר אופטימיזציה לניתוחים פרוטאומיים (שלב 2.2), ניתן לעצור אותו בשלבים מסוימים עבור היסטולוגית (למשל, מיקרוסקופ אלקטרונים), ניתוחים אימונוהיסטוכימיים, מחקרים תפקודיים (שלב 1), ולטיהור חלבונים מסיסים במלח כדי לאפיין את המבנה שלהם ואת הפעילות הביולוגית (שלב 2.1) (איור 2).
הצעד הראשון הוא הסרת PL הכולל מחלמון הביצה(איור 2, שלב 1.1). כל השיטות שפורסמו מתחילות בהפרדת הביצה הלבנה מהחלמון באופן ידני או באמצעות מפריד ביצים. לאחר מכן מסירים את הביצה הלבנה הנותרת ואת הצ’לאזה העבה באמצעות מלקחיים או על ידי ספיחה על ניירמסנן 5 (איור 2A). לאחר מכן, הטכניקות שנבחרו לדגום PL משתנות בהתאם למאמרים שפורסמו. ניירות מסוימים כוללים מספר שטיפות של החלמון, במים deionized או מזוקק1,5,6, ב 0.85 כדי 1% תמיסת מלח2,7,8, בפתרונות אגירה כגון 0.15 M NaCl / N-[Tris(hydroxymethyl)מתיל]-2-אמינואתנסולפונית, pH 7.44, או ב- 0.01N HCl (עמ’ 2)3. הליכים אלה יושמו על עוף, ברווז, פסיון צוואר טבעת, פרטרידג ‘אפור, תוכי קוקטיאל, יונה ביתית, או ביצי ratites2,6,9. הסרת PL בעוד חלמון הביצה נשמר בצלחת פטרי ללא פתרונות מימית עשוי להיות מייגע מאוד כמו PL הוא שביר חלמון ביצה נוטה להידבק PL1,5 ולכן נשארקשה לחסל לאחר מכן. השימוש של חיץ חומצי או פתרון במשך שעה ב 37 °C3 הוא גם לא מועדף כמו תנאים כאלה עשוי לשנות את מבנה PL ועלול לגרום לאובדן חלבון. כמו כן, חשוב להסיר את האזור המכיל את הדיסק הנביט, שכן אזור זה עשוי להיות בעל תבנית מבנית ומולקולרית מובהקת, שאינה משקפת את כל PL4,6,10 ( איור2B). שיטה זו מנצלת רעיונות המודגשים על ידי כמה מאמרים שפורסמו ומציעה כמה שיפורים כדי להקל על דגימת PL תוך שמירה על שלמותה (איור 2C).
השלב השני מורכב מהפרדת שתי שכבות המשנה(איור 2, שלב 1.2). שלב זה הוא קריטי כמו OPL ו- IPL קשורים בחוזקה זה לזה. שלב זה צריך להתבצע בזהירות עם מלקחיים תחת מיקרוסקופ ניתוח משקפת. פרסומים המדווחים על הפרדת OPL/IPL מוגבלים למדי2,3,7,11 וחלקם משתמשים בתנאים ספציפיים (חיץ חומצי ב 37 מעלות צלזיוס למשך שעה2,3 ) שעשויים להשפיע על המבנה ההיסטולוגי של שכבות המשנה ו / או לתרום לאובדן חלבון או חלמון אוזיהומיםלבנים. כדי להבחין טוב יותר OPL מן IPL, כמה מחברים דיווחו על השימוש בכחול טולואידין כדי לצבוע מעט את OPL (השכבה הפנימית נשארת חסרת צבע)11. בשיטה שפותחה, אופטימיזציה של התנאים כך שההפרדה מושגת בקלות ואינה דורשת שימוש בצבע כלשהו (איור 2D).
הצעד העיקרי השני הוא solubilization של חלבונים להרכיב כל שכבת משנה. באופן קלאסי, הוא מושגת על ידי ערבוב נקי lyophilized1, מיובש2,6, או מוכן טרי3,4,11 PL / sublayers ישירות עם מאגר Laemmli המשמש אלקטרופורזה. מחברים אחרים העדיפו solubilization ראשוני של שכבות ב 1% NaCl, בתמיסת אגירה 1% SDS2,3,11 או בתמיסה המכילה מעכבי פרוטאז ו SDS6 בטמפרטורת החדר או טריטון ואחריו דגירה ב 45 °C(70°F 12 ), תחת ערבוב נמרץ מתמיד. כמה מחברים תיארו גם פרוטוקול שבו PL היה דגירה מלוחים מאגר פוספט או אוריאה נתון sonication13. טיפולים אלה היו כל ואחריו צנטריפוגה ודילול במאגר Laemmli וכולם חולקים את החיסרון של solubilization חלבון שלם משכבות כמו החומר מסיס (גלולה המתקבל לאחר צנטריפוגה) מושלך מן המדגם כדי להיות מנותח.
בנוסף, השימוש בתנאים דנאטוריים (אוריאה, חומר ניקוי, טמפרטורה גבוהה וכו ‘) על ידי מחברים מסוימים עבור solubilization חלבון אינו תואם את טיהור החלבון הבאים לאפיון כפי שהם עשויים להשבית חלבונים באופן בלתי הפיך, להפריע לפעילות הביולוגית שלהם וגם לפגוע במבנה 3D שלהם. עבור שלב ספציפי זה 2, הפרוטוקול כולל תת-צעד ראשון המאפשר זלזול בחלבונים הנפוצים ביותר בתנאים שאינם מנומקים לאחר פירוק מכני של PL/OPL/IPL, אשר לא יפריע למחקרי חלבון נוספים, במידת הצורך (איור 2, שלב 2.1), ותת-צעד שני המאפשר פירוק מלא של חלבונים לאלקטרופורזה ופרוטאומיקה מעמיקה (איור 2, שלב 2). הוא משלב הצעות שנלקחו ממאמרים שונים שפורסמו והתאמות הנובעות מרעיונות חדשים המאומתים על ידי מחקרים ניסיוניים.
ההצלחה של הפרוטוקול הנוכחי מסתמכת על שני צעדים קריטיים אשר היו אופטימיזציה עצמאית: ההפרדה המכנית של OPL ו- IPL כי צריך להיות פחות de-structuring ככל האפשר, ואחריו solubilization החלבון המלא של כל שכבת משנה, שהוא, לעומת זאת, de-structuring ו denaturing. זה גם מדגיש כמה נקודות ספציפיות שיש לקחת בחשבון כדי להבטיח את ההישג המוצלח של כל צעד.
הפרוטוקול אינו תלוי בצבע קליפת הביצה, במשקל הביצה, בסוג הייצור או בזן הגנטי של התרנגולת. עם זאת, זה תלוי טריות הביצה. אכן, הביצה עוברת שינויים פיזיוכימיים פנימיים עמוקים במהירות לאחר שהוטל, אם כי שינויים אלה יכולים להתעכב כאשר האחסון מבוצע בתנאים בקירור14,15. אובדן פחמן דו חמצני דרך נקבוביות קליפת הביצה במהלך האחסון גורם לעלייה של pH לבן ביצה (מ 7.8 ל 9.5) בעוד כמה חילופי מים מתרחשים בין החלמון ללבן, על פני PL. שני השינויים משפיעים לרעה על המבנה המולקולרי וההיסטולוגי של ה- PL שהופך חלש ומתוח פחות14,15, ככל הנראה עקב שינויים פיזיוכימיים של תכולת החלבון שלו16,17,18. ההנחה היא כי ההפרדה של שכבות משנה יהיה קשה מאוד עם ביצים מאוחסנות במיוחד אם האחסון מתנהל במשך תקופה ארוכה בטמפרטורת החדר. עד כה, הפרוטוקול בוצע באמצעות ביצים המאוחסנות פחות מ 4 ימים ב 4 מעלות צלזיוס ואת משך הזמן המקסימלי של אחסון עבור ביצה לדגום ביעילות שכבות משנה PL עדיין לא ידוע. בנוסף, אם המטרה היא ניתוח של כל שכבת משנה, חיוני להשתמש בביצים לא מופרות. ביום ההטילה, העובר של ביצית מופרית הוא בן 23 שעות והתפתחותו מהירה מאוד לאחר מכן, אם הביצית דגירה. אכן, התפתחות עוברית וצמיחה של כמה מבנים extraembryonic להרחיב באמצעות PL כמו substratum, אשר ולכן מושפל במהירות, והוחלף על ידי שק חלמון extraembryonic19.
לאחר הפרדה ידנית של החלמון והלבן ביצה, החלמון צריך להיות ניקה מן העקבות לבן ביצה מ chalazae שנשאר מחובר היטב PL. הקצה הוא לגלגל את החלמון בזהירות על נייר סינון ולבצע שטיפות נרחבות של החלמון בפתרונות אגירה (10 mM Tris-HCl pH 8). רמת ה- pH המשמשת עבור החיץ עולה בקנה אחד עם ה- pH הפיזיולוגי של הביצה הלבנה14 והוכח כמצמצמת את אובדן החלבון (איור 3). השימוש במאגר בקירור יעזור להסיר את ה- PL מהחלמון מכיוון ש- 4 מעלות צלזיוס, המאגר יקל על הסרת PL כאשר החלמון השומני נסוג והופך לפחות נוזלי בטמפרטורה זו. שטיפות נוספות יאפשרו הסרת שאריות חלמון מן PL. חשוב גם לגזור את האזור המתאים דיסק נביטה כי מבנה זה המכיל pronucleus נקבה לא יכול להיות נציג של PL. זהו האתר של הפריה וכפל של התאים העובריים כאשר הביצית מופרית. זה אמור להיות הרכב מסוים שעשוי להיות לא מייצג של PL כולו, וזו הסיבה מדוע הוא הוסר. צעד ספציפי זה הוא הקל מאוד כאשר החלמון הוא שקוע חיץ קר. למרות מבנה דיסק נביטה זה מושלך בפרוטוקול הנוכחי (מתוך המטרות), ניתוחים ספציפיים של אזור זה בביצים מופרות יכול להיות מאוד שימושי עבור מדענים המעוניינים לחקור את האבולוציה של תוכן PL (פרוטאומיקה ופעילות) ומבנה (מיקרוסקופ אלקטרונים), בשלבים המוקדמים של embryogenesis19,20,21. בשלב זה, ה-PL כולו שלם מבחינה מבנית וניתן לעבד אותו לניתוח מבני נוסף באמצעות מיקרוסקופ אלקטרונים (איור 2), לשלב 1.2 או לשלב 2.1 (אם המטרה היא לנתח את כל ה-PL).
שלב 1.2 צריך להתבצע תחת מיקרוסקופ ניתוח משקפת, כמו PL הוא דק מאוד שביר (על 10 מיקרומטר עובי). ההפרדה של שכבות משנה היא כמעט בלתי אפשרית במים או באגירה חסר מלח מינימלי, וניסיונות ראשוניים באמצעות אפשרויות אלה גרמו נזק PL חמור. לכן, המאגר שנבחר עבור שלב זה נשאר ב- pH פיזיולוגי (pH 8) ומכילים 50 mM NaCl. שלב זה הוא מפרך ויש לבצעו בזהירות ובעדינות כדי למנוע קריעת PL. לאחר ההפרדה, ניתן לזהות בקלות את שתי שכבות המשנה מכיוון שהן מציגות מאפיינים פיזיים מוזרים (אטומים לעומת שקופים). חוסר הומוגניות של IPL תחת אור המיקרוסקופ צריך לשקף הפרדה חלקית ובכך את נוכחותם של כתמים הנותרים של OPL נוכח על IPL. בנוסף, קשה מאוד לטפל בקרום כולו ואת השימוש 2 ס”מ x 3 חתיכות ס”מ מאוד לשפר את סיכויי ההצלחה. שכבת המשנה המתקבלת מתאימה למחקר היסטולוגי של מיקרוסקופ אלקטרונים (איור 1). ראוי לציין כי מבנה ליניארי ספציפי (בעובי 0.05 עד 1 מיקרומטר) הנקרא הקרום הרציף (CM) גלוי במיקרוגרף (איור 1) ונשאר מחובר בדרך כלל לקוטלת משנה זו או אחרת במהלך תהליך ההפרדה. זה פורסם בעבר כי בעת שימוש טוחנות מלח גבוהה יחסית להפרדה (500 מ”מ), CM נשאר מחובר OPL7 בעוד השימוש במים5 יעדיף את ההחזקה של CM ל- IPL. בפרוטוקול זה, טוחנת מלח נמוכה משמשת להשגת המטרות הספציפיות (שכבת משנה של PL ללא פגע ואובדן מינימלי של חלבונים), כלומר CM זה קשור ככל הנראה ל- IPL. עם זאת, ניתוח נוסף של IPL ו- OPL על ידי מיקרוסקופ אלקטרונים שידור היה בבירור המדינה על השערה זו. שכבות PL, OPL או IPL שהושגו בסוף שלב 1 עשויות לשמש גם למטעני במבחנה לניתוחי כריכת ביציות זרע22 או לנתח את השלבים המוקדמים של התפתחות עוברית23,24.
שלב 2 מתייחס לסלוביליזציה של תכולת החלבון, באופן חלקי (שלב 2.1) או לחלוטין (שלב 2.2). PL ו/או OPL הם תחילה lyophilized כדי להסיר מולקולות מים ולאפשר מדידות משקל מדויקות. ואכן, PL מורכב בעיקר ממים (88%)7, בעוד החומר היבש מכיל בעיקר חלבונים (80% עד 90% בהתאם למחקרים), פחמימות, שומנים, ומינרלים2,7,25. בהתחשב בכך המים הכלולים PL מוסר על ידי הקפאת ייבוש, כי פחמימות הם התאוששו למעשה גליקופרוטאינים PL, וכי שומן ומינרלים שמקורם חלמון מושלכים למעשה על ידי שטיפות נרחבות, ההנחה היא כי PL וכתוצאה מכך מורכב כמעט אך ורק של חלבונים. לכן, ערך המשקל המתקבל לאחר ליאופיליזציה מלאה צריך להתאים בעיקר חלבונים. כמות שווה של PL, OPL ו/או IPL מדוללים לאחר מכן במאגר המכיל 0.5 M NaCl. טוחנת המלח הגבוהה המשולבת להרס המכני של הרשת הסיבית על ידי שחיקה מקלה מאוד על סלוביליזציה של חלבונים בתנאים שאינם מכבידים. שלב זה מלווה את solubilization מלא באמצעות רותחים, חומר ניקוי SDS ואת סוכן צמצום בטא-mercaptoethanol (שלב 2.2). ואכן, כמה חלבונים IPL הם גליקופרוטאינים מסיסים SDS25,26,27 ואת המרכיבים העיקריים של OPL הם NaCl-מסיסים1,11. באמצעות פרוטוקול זה, לא ראינו שום גלולה שנותרה של חלבונים בלתי מסיסים לאחר צנטריפוגה, אשר מציין כי solubilization היה ככל הנראה הושלם. חלבונים מ- PL, OPL ו/ או IPL נותחו לאחר מכן על-ידי SDS-PAGE. פרופילי החלבון המתקבלים עולים בקנה אחד עם ספרות שפורסמה2,4,11,16, אבל הרזולוציה והעוצמה של האות משופרת מאוד והומוגנית הרבה יותר בין דגימות עצמאיות שונות של IPL ו- OPL.
בנוסף, השוואה כמותית בין OPL ו- IPL מתאפשרת הודות לדיוק המשקל שהסקנו עבור שכבות המשנה המתאימות2,7. יתר על כן, הן פרופילי OPL והן פרופיל IPL הם מאוד ברורים למעט רצועה חלשה ב 14 kDa ו 75 kDa, שתי שכבות המשנה PL אינם חולקים בעליל להקות המציגות את אותו משקל מולקולרי. תצפית זו מאמתת את היעילות של הפרדת שכבות משנה ללא זיהום צולב משמעותי. על פי הניתוח הפרוטאומי היחיד של PL שפורסם1, הרצועות האינטנסיביות ביותר ב- OPL (30 kDa) הם כנראה חלבון Zona-Pellucida 1 (102 kDa) ו Zona-Pellucida חלבון 3 (47 kDa). ההתפלגות של החלבונים PL בשפע מאוד ovotransferrin (78 kDa), חלבון הקשורות ovalbumin X (45 kDa), ovalbumin (43 kDa)1 בין שכבות משנה נשאר להיות מואר. אכן, המשקל המולקולרי הגבוה של חלבונים אלה (>30 kDa) מרמז כי הם חלבוני IPL המבוססים על פרופיל SDS-PAGE, אבל הספציפיות שלהם לרקמות (חלבונים המובעים על ידי oviduct) מעדיפה לקשר חלבונים אלה ל- OPL28,29. יתר על כן, כמה הציעו זיהום פוטנציאלי של דגימות PL על ידי חלבונים חלבון לבן ביצה עקב שטיפה לא מספקת1. מידע חסר זה הוא הבסיס לפיתוח הפרוטוקול הנוכחי, אשר ישמש עוד יותר פרוטאומיקה כמותית מעמיקה של PL, OPL, ו- IPL.
לחלופין, משלב 2.1 ולאחר צנטריפוגה כדי להסיר את החומר מסיס, ניתן לחלץ כמה חלבונים ספציפיים עבור אפיון ביוכימי וביולוגי נוסף. גישה כזו יושמה לאחרונה כדי לאפיין את הפעילויות הביולוגיות ו / או את המבנה 3D של שני המרכיבים העיקריים של OPL, חלבון השכבה החיצונית קרום ויטלין 1 (VMO1) ו בטא-דפנסין עופות 11 (AvBD11)30,31. הזמינות של חלבונים אלה כמולקולות מטוהרות עשויה גם לסייע לייצר נוגדנים ספציפיים לניסויים נוספים כגון אימונוהיסטוכימיה או לפיתוח מבחנים כמותיים, כולל מבחנים אימונוסורבנטיים המקושרים לאנזימים.
שתי המגבלות העיקריות של פרוטוקול זה הן (1) האתגר עם הפרדת שכבות משנה במיוחד אם ביצים אוחסנו יותר מ 4 ימים ב 4 מעלות צלזיוס ו (2) העובדה כי solubilization החלבון המלא דורש צמצום ו denaturing מאגרים, אשר פוגעים בפעילות הביולוגית המהותית של הדגימות וכתוצאה מכך. לגבי המגבלה הראשונה, הפרדה מכנית דורשת מיומנויות טכניות אך מושגת בקלות לאחר 2 או 3 אימונים ניסיוניים. חלקים קטנים של IPL עשויים להישאר מחוברים ל- OPL ולהיפך מכיוון ששתי שכבות המשנה משויכות היטב. עם זאת, זיהום של שכבת משנה אחת על ידי השני צריך להיות מינימלי אם ההפרדה המכנית מבוצעת בזהירות. פרופילי IPL ו- OPL SDS-PAGE אופייניים לאחר הפרדת שכבת משנה מיטבית מודגמים באיור 5. לגבי המגבלה השנייה, צעדים ניסיוניים שהוצגו במאמר זה מוטבו לניתוחים פרוטאומיים, על מנת לספק רשימה ממצה של חלבונים המרכיבים כל שכבת משנה. לאפיון נוסף של הפעילות הביולוגית של כל חלבון, יש צורך לעצור בשלב 2.1.2, לפני השימוש בתנאים denaturing (שלב 2.2.1, שימוש חוצץ עם SDS ובטא-mercaptoethanol ואחריו רותחים). עם זאת, ראוי לציין כי חלבונים הנובעים משלב 2.1.2 הם רק חלבונים מסיסים במלח בעוד חלבונים מסיסים במלח יוצרים אגרגטים. אפשרות אחת להעריך עוד יותר את פעילותם בהתאמה עשויה להיות לייצר חלבונים מסיסים במלח כחלבונים רקומביננטיים באמצעות מערכות הטרולוגיות (E. coli, baculovirus, שמרים וכו ‘).
פרוטוקול זה עשוי להיות מותאם ביצי עופות אחרים למחקרים השוואתיים כדי להעריך טוב יותר את המקוריות של כל מין. אכן, PL מציג כמה ספציפי ציפור הן מבחינה מבנית והן מבחינת הרכב החלבון, ככל הנראה בשל הסתגלות לסביבות חדשות, אלא גם ספציפיות התפתחותית2,6,9,32. פיתוח פרוטוקול זה הדורש טכנאיות מתונה וציוד/חומרים קלאסיים פותח אפיקי מחקר חדשים בתחום מחקרי רביית ציפורים ודגימות.
The authors have nothing to disclose.
אנו מודים לפיליפ דידייה וקארין אנגר (INRAE, PEAT, 37380, Nouzilly, צרפת, https://doi.org/10.15454/1.5572326250887292E12) על אספקת ביצים חומות איסה לא מופרות. אנו מודים גם לאוניברסיטת טורס, צרפת על מימון הדוקטורט של מ. ברג’ון. עבודה זו קיבלה תמיכה כספית מסוכנות המחקר הלאומית הצרפתית (EQLIPSE, ANR-19-CE21-0006).
Binocular dissecting microscope | Vision Engineering, France | Model Mantis Elite | |
Lyophilizer | Cryotec, France | Model Cosmos 80 | |
Mini-Protean II electrophoresis cell | Biorad, Hercules, USA | 1652960 | Any apparatus adapted for protein electrophoresis |
Mixer Mill MM400 | Retsch, Hann, Germany | 20.745.0001 | Mixer mill adapted for for dry, wet, and cryogenic grinding of small amounts of sample |
Ultra fine dissection scissors in stainless steel length 12 cm | Dutscher, Brumath | 5066 | |
Ultra precise tip forceps anti-magnetic stainless steel 9.5x 109.3 mm | Dutscher, Brumath | 327005 |