يقدم هذا البروتوكول سير عمل للتصور 2D الفرعية من متعدد المغذيات غير العضوية الملوثات والملوثات الأنواع باستخدام التدرجات الناشرة في الأفلام رقيقة (DGT) جنبا إلى جنب مع التصوير الطيفي الشامل. ويرد وصف تفصيلي لأخذ العينات المذابة والتحليل الكيميائي العالي الدقة من أجل رسم خرائط كمية للسولوتات في الغلاف الريزوسفيري للنباتات الأرضية.
نحن وصف طريقة لتصور ثنائي الأبعاد (2D) وتكميم توزيع اشرح (أي، عكسي الممتزة) المغذيات غير العضوية (على سبيل المثال، P، Fe، Mn) والملوثات (على سبيل المثال، كما، CD، Pb) الأنواع المذابة في التربة المتاخمة لجذور النبات (‘rhizosphere’) في شبه ملليمتر (~ 100 ميكرومتر) تحليل المكاني. وتجمع هذه الطريقة بين أخذ العينات المذابة المستندة إلى بالوعة بواسطة التدرجات الناشرية في تقنية الأفلام الرقيقة (DGT) مع التحليل الكيميائي الذي تم حله مكانياً عن طريق الاستئصال بالليزر مقروناً بالحث لقياس الطيف الكتلي الكتلي (LA-ICP-MS). تعتمد تقنية DGT على الهيدروجيلات الرقيقة مع مراحل الربط التحليلية الانتقائية الموزعة بشكل متجانس. مجموعة متنوعة من مراحل الربط المتاحة يسمح لإعداد أنواع هلام DGT مختلفة بعد إجراءات بسيطة تصنيع هلام. لنشر هلام DGT في رهيزوفير، تزرع النباتات في حاويات نمو مسطحة وشفافة (rhizotrons)، والتي تمكن من الحد الأدنى من الوصول الغازية إلى نظام الجذر التربة المزروعة. بعد فترة ما قبل النمو، يتم تطبيق المواد الهلامية DGT على مناطق مختارة من الفائدة لأخذ العينات في الموقع في ريزوسفير. بعد ذلك، يتم استرداد المواد الهلامية DGT وإعدادها للتحليل الكيميائي اللاحق لل solutes ملزمة باستخدام LA-ICP-MS خط التصوير المسح الضوئي. تطبيق التطبيع الداخلي باستخدام 13C والمعايرة الخارجية باستخدام المصفوفة مطابقة هلام المعايير يسمح كذلك لتكميم التدفقات 2D. وهذه الطريقة فريدة من نوعها في قدرتها على توليد صور كمية، دون مم، 2D من التدفقات المذابة متعددة العناصر في بيئات التربة النباتية، متجاوزة درجة الدقة المكانية القابلة للتحقيق للأساليب الأخرى لقياس التدرجات المذابة في الغلاف الريزوسفيري بشكل كبير. نقدم تطبيق وتقييم طريقة تصوير الأنواع المتعددة المذابة واليونية في رهيزوفير النباتات الأرضية ونسلط الضوء على إمكانية الجمع بين هذه الطريقة وتقنيات التصوير المذابة التكميلية.
10 – يشكل اقتناء المغذيات بواسطة النباتات المحصولية عاملاً رئيسياً في تحديد إنتاجية المحاصيل. وقد تمت دراسة العمليات التي تحكم كفاءة امتصاص المحاصيل للمغذيات، ولا سيما الآليات التي تتحكم في توافر المغذيات إلى الجذور النباتية في الواجهة البينية للتربة – الجذر، وهي رهيزوفير، التي تم الاعتراف بها لدورها في الحصول على مغذيات المحاصيل. وتشمل العمليات الهامة لمحتوى المغذيات النباتية ما يلي: نقل المغذيات نحو الجذر؛ ومدى المغذيات موازين الضم الديناميكية بين الأنواع المذابة في مياه التربة والأنواع المربوطة بأسطح التربة الصلبة؛ المنافسة الميكروبية على المواد الغذائية؛ تمعدن ميكروبي للمغذيات الموجودة في المواد العضوية في التربة؛ و المغذيات الداخلة في تكافل الجذر. يتم التحكم إلى حد كبير في امتصاص الملوثات المعدنية النزرة غير العضوية (oid) من خلال نفس الآليات.
ويمكن ملاحظة أنماط المغذيات المختلفة في طبقة الريزوسفير، وذلك اعتماداً على توافر المغذيات والملوثات والطلب على النباتات والانتفاض في التربة. لعناصر الخربة بقوة مع معدلات استيعاب عالية نسبيا (على سبيل المثال، P، Fe، Mn، ZN، AS، CD، Pb)، نضوب من الكسر العنصر (أي، مدمة عكسي) مقارنة بالتربة السائبة، مع عرض منطقة النضوب غالبا ما يجري ≤1 ملم، في حين أن لمزيد من المواد الغذائية المتنقلة مثل NO3–، يمكن أن تمتد مناطق النضوب تصل إلى عدة سنتيمترات1. وعلاوة على ذلك، لوحظ تراكم عناصر مثل Al وCD عندما يتجاوز توافر معدلات امتصاص النباتات2،3.
ونظرا لأهمية عمليات ريزوسفير في المغذيات والملوثات الدراجات ، وقد وضعت عدة تقنيات لقياس جزء العنصر النباتي المتاحة في دقة المكانية العالية4،5. ومع ذلك، فإن قياس التوزيعات الصغيرة الحجم في اللبوليات قد ثبت أنها صعبة لعدة أسباب. وتقابل صعوبة كبيرة في ذلك أخذ عينات من كميات صغيرة جداً (نطاق ميكرولتر منخفض) من التربة و/أو المسام في مواقع محددة متوازِقة لجذور النباتات الحية لحل تدرجات المغذيات الحادة في الغلاف الريزوسفيري. أحد النهج لمعالجة هذه المشكلة هو استخدام أكواب الشفط الجزئي لاستخراج عينات المسام6. بهذه الطريقة، قام A. Göttlein و A. Heim و E. Matzner7 بقياس تركيزات المغذيات المسامية للتربة في محيط جذور Quercus robur L. بدقة مكانية تبلغ حوالي 1 سم. ومن الصعوبة في تحليل كميات الميكL من التربة أو محلول التربة، أن هذه الأحجام الصغيرة للعينات، بالإضافة إلى التركيزات المنخفضة لجميع الأنواع الغذائية الرئيسية، تتطلب تقنيات تحليل كيميائية شديدة الحساسية.
نظام بديل، قادرة على حل التدرجات المغذيات في قرار وصولا الى ~ 0.5 ملم، هو أن تنمو حصيرة الجذر على سطح كتلة التربة، مع طبقة رقيقة غشاء هيدروفيلي يفصل التربة من الجذور8،9. في هذا التكوين، يمكن أن تمر الملوثات من خلال الغشاء والجذور يمكن أن يستغرق المواد الغذائية والملوثات من التربة في حين exudates الجذر يمكن أن تنتشر في التربة. بعد إنشاء طبقة جذر كثيفة، يمكن أخذ عينات من كتلة التربة وشرائحها للحصول على عينات التربة لاستخراج الكسور اللاحقة من العناصر. وبهذه الطريقة، يمكن تحليل المغذيات أحادية البعد، والتدرجات الملوثة، متوسط عبر مساحة كبيرة نسبيا (~ 100 سم2).
وثمة تحد آخر يتمثل في الحصول على عينات من جزء العناصر المُتَرَض، الذي يتوفر في النبات، لأن معظم تقنيات استخراج التربة الكيميائية تعمل بشكل مختلف جدا مقارنة بالآليات التي تأخذ بها النباتات المغذيات والملوثات. في العديد من بروتوكولات استخراج التربة، يتم خلط التربة مع محلول مستخرج بهدف إقامة توازن (زائف) بين جزء العنصر المذاب والكسر المُرَكَّب. ومع ذلك، فإن النباتات تُستوعب المغذيات بشكل مستمر، وبالتالي، غالباً ما تستنفد تدريجياً تربة ريزوسفير. على الرغم من أن بروتوكولات استخراج التوازن قد اعتمدت على نطاق واسع كما اختبارات التربة كما هي سهلة لتنفيذ, الكسر المغذيات المستخرجة غالبا لا يمثل الكسر المغذيات المتاحة للنبات جيدا10,11,12,13. وقد اقترحت أساليب بالوعة التي تستنفد باستمرار التربة العينة للمغذيات كأساليب مفيدة وربما تشبه أفضل آلية امتصاص المغذيات الأساسية من خلال محاكاة عمليات امتصاص الجذر10،11،14،15.
بالإضافة إلى الطرق المذكورة أعلاه، تم تطوير تطبيقات التصوير الأصلية، قادرة على قياس خرائط المعلمة المستمرة مع قرارات ≤100 ميكرومتر عبر مجالات الرؤية من عدة سم2 عناصر محددة والتربة (الحيوي) المعلمات الكيميائية5. يمكن استخدام التصوير الذاتي لتصوير توزيع العنصر في ريزوسفير شريطة أن النظائر المشعة المناسبة متوفرة16. يمكن تحديد optodes planar تصور المعلمات الكيميائية الهامة للتربة مثل درجة PH و pO217،18،19، ويمكن تعيين نشاط الإنزيم أو توزيعات البروتين الكلي باستخدام تقنيات التصوير مؤشر الفلورسنت مثل zymography التربة20،21،22،23 و / أو طرق النشاف الجذر24. بينما يقتصر التصوير الزموغرافي والرادوغرافيا التلقائي على قياس معلمة واحدة في وقت واحد، يمكن إجراء التصوير pO2 و pO باستخدام optodes الألواح الألواح في وقت واحد. توفر تقنيات حصيرة الجذر التقليدية معلومات 1D فقط ، في حين توفر أكواب الشفط الجزئي قياسات نقطة أو معلومات 2D منخفضة الدقة ، ولكن كلا النهجين يسمحان بتحليل العناصر المتعددة. وفي الآونة الأخيرة، قدم P. D. Ilhardt، وآخرون25 نهجا جديدا باستخدام التحليل الطيفي للانهيار المستحث بالليزر (LIBS) لرسم خريطة توزيعات متعددة العناصر 2D الكلية بدقة تبلغ ~ 100 ميكرومتر في عينات أساسية من جذور التربة حيث تم الحفاظ على توزيع العناصر الطبيعية عن طريق إعداد العينة بعناية.
التقنية الوحيدة القادرة على أخذ العينات المستهدفة 2D من الملوثات الغذائية المتعددة والملوثات في القرار المكاني العالي هو التدرجات الناشرية في الأفلام الرقيقة (DGT) تقنية، طريقة أخذ العينات المستندة إلى بالوعة أن يشل اللبل تتبع المعادن (loid) الأنواع في الموقع على مادة ملزمة جزءا لا يتجزأ من طبقة هيدروجيل26،27. تم إدخال DGT كتقنية تحديد دقيق للمواد الكيميائية لقياس اللواتات اللطيفية في الرواسب والمياه ، وسرعان ما تم اعتماده لاستخدامه في التربة28. فإنه يتيح دون ملم حجم التصوير الملتهب متعددة العناصر، والتي أظهرت في البداية في رواسب النهر29، وقد تم تطويرها أكثر لتطبيقها في رهيزوفيرس النباتية30،31،32،33.
وبالنسبة لأخذ عينات DGT، يتم تطبيق ورقة هلامية بحجم 3 سم × 5 سم تقريبًا على جذر نباتي واحد ينمو في الطبقة السطحية من كتلة التربة، مع غشاء هيدروفيلي يفصل الجل عن التربة. خلال وقت الاتصال، تنتشر العناصر الغذائية اللملية و/أو الملوثات نحو الجل وترتبط على الفور بالمواد الملزمة المدرجة في الجل. وبهذه الطريقة، يتم تأسيس تدرج تركيز، وبالتالي تدفق صافي مستمر نحو الجل وتغلب خلال وقت أخذ العينات. بعد أخذ العينات، يمكن إزالة الهيدروجيل وتحليله باستخدام تقنية كيميائية تحليلية تسمح بتحليل مكاني. وهناك تقنية متخصصة للغاية وتستخدم كثيرا لهذا الغرض هو الليزر الاجتثاث موحى يقترن البلازما الطيفي كتلة (LA-ICP-MS). وفي بعض الدراسات المبكرة، استخدمت أيضاً انبعاثات الأشعة السينية الناجمة عن الجسيمات الدقيقة (PIXE)29. يسمح أخذ العينات DGT مع تحليل LA-ICP-MS للتصوير الكيميائي متعدد العناصر بدقة مكانية تبلغ حوالي 100 ميكرومتر. وإذا استخدمت تقنيات شديدة الحساسية من نوع ICP-MS (مثل مجال القطاع ICP-MS) يمكن تحقيق حدود منخفضة للغاية للكشف. في دراسة حول تأثير liming على Zn وامتصاص CD من الذرة15، تمكنا من رسم خريطة القرص المضغوط في الذرة rhizosphere في التربة غير الملوثة مع حد من الكشف عن 38 pg سم-2 من القرص المضغوط في منطقة هلام. DGT، optodes بلا تخطيطي، وzymography تعتمد على انتشار العنصر المستهدف من التربة إلى طبقة هلام، والتي يمكن استغلالها لتطبيق مجتمعة من هذه الأساليب من أجل صورة في وقت واحد، أو على التوالي، صورة عدد كبير من المعلمات ذات الصلة للمغذيات النباتية وامتصاص الملوثات. معلومات مفصلة عن الجوانب الكيميائية التحليلية للتصوير DGT، حول إمكانية الجمع بين DGT وطرق التصوير الأخرى، وعلى تطبيقاتها يتم استعراض شامل في المرجع34،35.
في هذه المقالة وصف كيفية تنفيذ تجربة التصوير المذاب باستخدام تقنية DGT على جذور النباتات الأرضية في بيئة التربة غير المشبعة، بما في ذلك زراعة النباتات، وتصنيع الجل، وتطبيق هلام، وتحليل هلام وتوليد الصورة. وقد تم تفصيل جميع الخطوات بالتفصيل، بما في ذلك ملاحظات عن الخطوات الحاسمة والبدائل التجريبية.
بروتوكول التصوير المذاب المقدم هنا هو طريقة متعددة الاستخدامات لتصور وقياس تدفقات المغذيات والملوثات 2D في بيئات النباتات التربة. وهي فريدة من نوعها في قدرتها على توليد صور متعددة العناصر دون ملم من الأنواع المذابة في الواجهة التربة الجذر، متجاوزاً الدقة المكانية القابلة للتحقيق للأساليب البديلة لقياس التدرجات المذابة في الغلاف الريزوسفيري بشكل كبير4. وييسر نهج أخذ العينات في الموقع الذي يستخدم في الموقع، بالإضافة إلى طريقة تحليل كيميائية شديدة الحساسية مثل LA-ICP-MS، إجراء تحقيق مفصل لديناميات التدفق المذاب حول جذور النباتات الفردية التي تزرع في التربة أو ركائز مماثلة. ونظرا لعملية أخذ العينات المستندة إلى بالوعة، فإن الصور التي تم الحصول عليها تعكس قابلية solutes التصور، وبالتالي هي تقدير لتوافر النباتات الخاصة بهم10. وعلى الرغم من أن قياس التدفقات المذابة المتأصلة في الأسلوب ينطوي على مزايا كبيرة مثل قابلية التفسير ككسور مغذيات متاحة للنباتات، فإن قياسات التدفق أقل استقامة بكثير لفهمها من قياسات تركيز المسام. هندسة أخذ العينات DGT القياسية في تطبيقات التربة السائبة (على وجه التحديد 0.8 ملم سميكة هلام الانتشار المستخدمة في هذا الإعداد) يسمح لمقارنة تركيز المسام الفعلية، جسولان،وتقدير تركيز المسام متوسط الوقت من قبل قياس DGT السائبة، cDGT، وللتفسير هذه المعلمات فيما يتعلق بديناميات إعادة التموين من الأنواع المذابة. ومع ذلك ، لا يمكن إجراء مثل هذه المقارنة بناءً على تطبيق التصوير DGT مع طبقات انتشار رقيقة جدًا ، حيث أن قيم cDGT المشتقة هي صغيرة بشكل غير واقعي34. ولذلك فإن نتائج التصوير DGT ليست دائما بسيطة وسريعة في التفسير وغالبا ما تكون غير قابلة للمقارنة مباشرة مع قياسات تركيزات المسام التقليدية.
عند تطبيق هذه الطريقة، يجب النظر بعناية في بعض الخطوات الحاسمة، التي تتعلق بشكل رئيسي بملء وسقي حاويات النمو rhizotron. أثناء ملء التربة في رهيزوترون، من المهم جدا تجنب ضغط التربة أكثر من اللازم، كما جذور النبات لا يمكن اختراق التربة المضغوطة بقوة وسيتم تثبيط نمو الجذر. لاحظنا جذور تجنب التربة المضغوطة بقوة وتنمو على طول الحواف الداخلية للحاوية نمو rhizotron، حيث التربة عادة أقل ضغط. في هذه الحالة، قد جذور الفردية تقع في وسط rhizotrons، حيث يمكن تطبيق المواد الهلامية DGT مريح، لا تتطور على الإطلاق، مما يحول بشكل فعال تطبيق هلام ناجحة. في مختبرنا، أظهرت التجربة أن الكثافات السائبة في التربة الجافة من 1.0-1.4 غرام سم-3 تسمح بتطوير الجذور دون عوائق. وعلاوة على ذلك، فإن ضغط التربة المفرط هو أيضا مصدر محتمل للتحف المتعلقة بذوبان العناصر الحساسة لل الأكسدة والأنواع المرتبطة بها بيولوجيا. ومع انخفاض حجم المسام الكلي وتحول توزيع قطر المسام نحو أقطار أقل في التربة شديدة الضغط، يتوفر حجم مسام أكبر قطراً أقل مملوءاً بالهواء، مما قد يؤدي إلى ظروف اختزالية محلياً. وبالتالي، يمكن تقليل MnIII/IV– و FeIII-أكاسيد، مما يؤدي إلى زيادة Mn2+ و Fe2+ fluxs. وقد يؤدي ذوبان أكاسيد Fe-oxides، التي هي مواقع هامة للفوسفات والمغذيات الدقيقة، مثلاً إلى تحرير أنواع مُرَكَّب و/أو مُركَّب لها، وبالتالي تُسبِّب تدفقات مرتفعة اصطناعياً للأنواع المرتبطة بالجيوكيميائية الأحيائية. وقد تنشأ مسألة مماثلة إذا كانت حاويات النمو تسقي أكثر من اللازم. التبخر عبر مساحة سطح التربة الصغيرة في الجزء العلوي من حاوية النمو منخفض وقد تظل التربة مشبعة بالماء لمدة تصل إلى عدة أسابيع بعد الزراعة ، مما قد يسبب أيضًا مصنوعات الأكسدة.
وثمة اعتبار آخر مهم هو وظيفة الكيميائية من جل ملزم HR-DGT ملفقة. باتباع البروتوكول، يتم الحصول على المواد الهلامية الرقيقة مع توزيع متجانس لمراحل الربط. إذا كان للجل مناطق توزيع المواد غير المتجانسة (على سبيل المثال، ثقوب في الجل أو مجاميع من مراحل الربط) هذه المناطق تحتاج إلى إزالة أو، إذا كانت واسعة جدا، بروتوكول تصنيع هلام يحتاج إلى تكرار. إذا أعدت بشكل صحيح، يجب أن يكون الجل قادرا على ربط الأنواع المذابة المستهدفة التي تنتشر في هلام على الفور وكميا27، والتي يتم تحديدها من قبل قدرة الجل الجل محددة محددة. وفي حين أن تجاوز سعة الجل أقل إشكالية في التربة غير الملوثة، فإنه ينبغي النظر في التربة الملوثة بالمعادن وبيئات التربة المالحة. إن تشبع مراحل الربط الهلامي لن يضعف فقط أخذ العينات الكمية المذابة، بل سيؤدي أيضاً إلى الانتشار الجانبي للسولات بين مراحل الربط في الجل، مما يؤدي إلى توطين غير محدد لخصائص تدفق المذاب على نطاق صغير. وهكذا، إذا كان من المتوقع وجود كميات عالية جداً من أنواع المغذيات/الملوثات في بيئة التربة المستهدفة، ينبغي إجراء اختبارات أولية. لتقدير الأحمال DGT المتوقعة، والتربة السائبة DGT المكبس أخذ العينات تليها elution هلام وتحليل المواد الكيميائية الرطب يمكنتطبيقها 15،49. إذا لزم الأمر، قد يتم تعديل أوقات نشر DGT لتقليل وقت الاتصال هلام وبالتالي تجنب تشبع هلام فوق عتبات القدرة. وعلى العكس من ذلك، يمكن أن تكون الاختبارات الأولية مفيدة أيضاً لتحديد أوقات الاتصال المطلوبة من الجل و/أو حساسيات LA-ICP-MS إذا كان من المتوقع أن تكون التحميلات المذابة منخفضة جداً، والتي قد تكون مهمة لرسم خرائط العناصر النزرة في مستويات خلفية التربة الطبيعية15. إلى جانب ذلك، ينبغي التحقق من أداء هلام DGT الصحيح قبل تطبيقه التجريبي عن طريق تحميل المواد الهلامية الخاضعة للرقابة في إعداد معايير معايرة DGT LA-ICP-MS. يوفر معيار الجل تحميل جل التحليلات المرجعية المتطابقة بالمصفوفة والتي يمكن استخدامها لتقييم ما إذا كان تحميل هلام العينة الذي يحدده LA-ICP-MS ضمن النطاق المتوقع. وإذا لم يتمكن المشغل من الحصول على إشارة تختلف عن ضجيج الخلفية الفارغة للغاز والطريقة، فيجب على المشغل أن يتأكد من تنفيذ الإجراءات المختبرية لتحليل العناصر النزرة وأن جميع خطوات البروتوكول قد تم تنفيذها بشكل صحيح. في بعض الأحيان، يتم قلب هلام DGT بطريق الخطأ بعد أخذ العينات المذابة مع الجانب المحرض للتربة، والمحملة التي تواجه نحو لوحة زجاجية بدلا من شعاع الليزر، مما أدى إلى انخفاض كثافة الإشارة وملامح انقلبت خطأ في الصور تدفق مذاب النهائي.
أثناء تحليل LA-ICP-MS، يتم إنشاء كمية كبيرة من البيانات، الأمر الذي يستغرق وقتاً طويلاً لتقييم. في مختبرنا، نستخدم برامج تقييم البيانات الداخلية المصممة لتنسيق إخراج البيانات المستهدف باستخدام برامج جداول البيانات القياسية. بعد الفرز شبه الآلي والمعايرة، يتم إجراء رسم الصورة باستخدام المصدر المفتوح، فتح أدوات تحليل الصور الوصول (ImageJ، فيجي50). يسمح هذا النهج بالتحكم الكامل في فرز البيانات وتقييمها وعرضها، وهو أمر ضروري لأن البيانات التي تم جمعها تتوافق مع وحدات البكسل المستطيلة، وليس التربيعية، والتي يجب عرضها بشكل صحيح في الخرائط المُولّعة. وعلاوة على ذلك، أثناء معالجة البيانات، ينبغي تجنب أي الاستيفاء بكسل بعناية. يؤدي الاستيفاء بكسل إلى التدرجات الممهدة في الصور الكيميائية، مما يؤدي إلى تليين، وغالبا ما تكون دورية ميزات توزيع العناصر وبالتالي هو تغيير غير مرغوب فيه من البيانات الأصلية. الاستيفاء بكسل هو إجراء قياسي في عمليات إعادة التحجيم وإعادة التنسيق في العديد من منتجات برامج معالجة الصور ولكن يمكن إلغاء تحديدها عادة.
وفي الختام، فإن الطريقة الموصوفة هي تقدم كبير في فهم المغذيات وديناميات الملوثات في النظم الطبيعية للنباتات بين التربة والريازفير. بالإضافة إلى تطبيقات DGT فقط، يمكن الجمع بين الأسلوب مع تقنيات التصوير الأخرى القائمة على الانتشار مثل optodes3و33و42و43و48و51 و zymography20و21و22و23و24، ويمكن تطويرها بشكل أكبر لإدراج عناصر إضافية ومعلمات التربة.
The authors have nothing to disclose.
شارك في تمويل هذه الدراسة صندوق العلوم النمساوي (FWF): P30085-N28 (توماس بروهاسكا) وصندوق العلوم النمساوي (FWF) والدولة الاتحادية للنمسا السفلى: P27571-BBL (جاكوب سانتنر).
(NH4)2S2O8 (ammonium persulfate; APS) | VWR | 21300.260 | ≥98.0%, analytical reagent |
2-(N-morpholino)-ethanesulfonic acid (MES) | Sigma-Aldrich | M8250-100G | ≥99.5% |
Acrylamide solution | Sigma-Aldrich | A4058-100ML | 40%, for electrophoresis |
Analyte salts | n/a | n/a | Use water soluble analyte salts of analytical grade or higher |
Buechner funnel | VWR | 511-0065 | 13 cm plate diameter |
Chemical equilibrium modelling software | KTH Sweden | n/a | Visual MINTEQ |
Clamp | Local warehouse | n/a | |
Desktop publishing software | Adobe Inc. | n/a | InDesign CS6 |
DGT cross-linker | DGT Research Ltd | n/a | 2%, agarose derivative |
DGT piston sampler | DGT Research Ltd | n/a | 2 cm diameter exposure window |
Digital single-lens reflex (DSLR) camera | Canon Inc. | n/a | Canon EOS 1000D |
Dispersion device | IKA | 3737000 | Ultra-Turrax T10 Basic |
Double-sided adhesive tape | Tesa | 56171 | |
Ethanol | Sigma-Aldrich | 34923 | Puriss. p.a., absolute, ≥99.8% |
Gel blotting paper | Whatman | 10426981 | Blotting Papers, Grade GB005, 20 × 20 cm, 1.5 mm thickness |
Gel drier | UniEquip | n/a | UNIGELDRYER 3545 |
High-pressure microwave system | Anton Paar | n/a | Multiwave 3000 |
HNO3 | VWR | 1.00456.2500P | 65%, ISO for analysis |
Horizontal shaker | GFL | 305 | |
HydroMed D4 | AdvanSource Biomaterials Corp. | n/a | Ether-based hydrophilic urethane |
ICP-MS software | Perkin Elmer | n/a | Syngistix |
Image analysis software | National Institutes of Health (NIH) | n/a | ImageJ Fiji, freely available at https://fiji.sc/ |
Knife-coating device | BYK | 5561 | Single Bar 6″, 0.5 mils |
LA software | Elemental Scientific Lasers | n/a | ActiveView |
LA system | Elemental Scientific Lasers | n/a | NWR193 |
Laminar flow bench | Telstar Laboratory Equipment B.V. | n/a | Class II biological safety cabinet |
Magnetic stirrer | IKA | 0003582400 | C-MAG MS 7 |
Moisture-retaining film | Bemis Company, Inc. | PM999 | Parafilm M, 4" x 250' |
N,N,N’,N’-tetramethylethylenediamine (TEMED) | Sigma-Aldrich | T9281-50ML | BioReagent, suitable for electrophoresis, ~99% |
NaNO3 | Sigma-Aldrich | 229938-10G | 99.995% trace metals basis |
NaOH | Sigma-Aldrich | 1064980500 | Pellets for analysis |
Overhead shaker | GFL | 3040 | |
Perfluoroalkoxy alkane (PFA) vials | Savillex | 200-015-20 | 15 mL Standard Vial, Rounded Interior |
pH meter | Thermo Scientific | 13-644-928 | Orion 3-Star Benchtop pH Meter |
pH probe | Thermo Scientific | 8157BNUMD | Orion ROSS Ultra pH/ATC Triode |
Plastic cutter | DGT Research Ltd | n/a | Use empty cross-linker vials from DGT research Ltd |
Plastic tweezers | Semadeni | 602 | |
Plasticine | Local stationary shop | n/a | non-drying plastic modelling mass based on paraffin wax and bulking agents |
Polycarbonate membrane discs | Whatman | 110606 | Nuclepore Hydrophilic Membrane, 25 mm diameter, 0.2 µm pore size, 10 µm thickness |
Polycarbonate membrane sheet | Whatman | 113506 | Nuclepore Hydrophilic Membrane, 8 × 10 in, 0.2 µm pore size, 10 µm thickness |
Polyethersulfone membrane discs | Pall Corporation | 60172 | Supor 450 Membrane Disc Filters, 25 mm diameter, 0.45 µm pore size, 0.14 mm thickness |
Polyethersulfone membrane sheet | Pall Corporation | 60179 | Supor 450 Membrane Disc Filters, 293 mm diameter, 0.45 µm pore size, 0.14 mm thickness |
PTFE foil | Haberkorn | n/a | 50 µm thickness |
PTFE spacer | Haberkorn | n/a | Variable thicknesses available |
PTFE-coated razor blades | Personna GEM | 62-0178 | Stainless steel single edge blades (coated) |
PTFE-coated Tygon tubing | S-prep GmbH | SP8180 | 0.32 cm inner diameter |
Quadrupole ICP-MS | Perkin Elmer | N8150044 | NexION 2000B |
Quantitative filter paper, 454 | VWR | 516-0854 | Particle retention 12-15 µm |
Spreadsheet software | Microsoft Corporation | n/a | Microsoft Excel 2016 (v16.0) |
Stainless-steel cutter | Local locksmithery | n/a | 2.5 cm diameter |
Suspended particulate reagent-iminodiacetate (SPR-IDA) | Teledyne CETAC Technologies | n/a | 10 µm diameter polystyrene beads, 10 % (w/v) bead suspension |
Transistor-transistor logic (TTL) cable | n/a | n/a | Consult ICP-MS technician to identify a suitable TTL cable for a specific instrument |
Two-volume cell | Elemental Scientific Lasers | n/a | Two-volume cell 1 |
Vinyl electrical tape | 3M | n/a | Scotch Super 33+ |
Water purification system | Termo Electron LED GmbH | n/a | TKA-GenPure |
ZrOCl2 × 8H2O | Alfa Aesar | 86108.30 | 99.9 %, metals basis |