Cartographie cérébrale IRMf en temps réel chez les animaux
Summary
La cartographie fonctionnelle du cerveau animal peut bénéficier de la configuration expérimentale d’imagerie par résonance magnétique fonctionnelle (IRMf) en temps réel. En utilisant le dernier logiciel implémenté dans le système d’IRM animale, nous avons établi une plate-forme de surveillance en temps réel pour l’IRMf des petits animaux.
Abstract
Les réponses dynamiques de l’IRMf varient considérablement en fonction des conditions physiologiques des animaux, soit sous anesthésie, soit en état d’éveil. Nous avons développé une plate-forme IRMf en temps réel pour guider les expérimentateurs afin de surveiller instantanément les réponses IRMf pendant l’acquisition, ce qui peut être utilisé pour modifier la physiologie des animaux afin d’obtenir les réponses hémodynamiques souhaitées dans le cerveau des animaux. La configuration de l’IRMf en temps réel est basée sur un système d’IRM préclinique de 14,1 T, permettant la cartographie en temps réel des réponses dynamiques de l’IRMf dans le cortex somatosensoriel primaire de la patte antérieure (FP-S1) des rats anesthésiés. Au lieu d’une analyse rétrospective pour étudier les sources confondantes conduisant à la variabilité des signaux IRMf, la plate-forme IRMf en temps réel fournit un schéma plus efficace pour identifier les réponses IRMf dynamiques à l’aide de macro-fonctions personnalisées et d’un logiciel d’analyse d’images neurologiques commun dans le système IRM. En outre, il fournit une faisabilité de dépannage immédiate et un paradigme de stimulation par biofeedback en temps réel pour les études fonctionnelles du cerveau chez les animaux.
Introduction
L’imagerie par résonance magnétique fonctionnelle (IRMf) est une méthode non invasive pour mesurer les réponses hémodynamiques 1,2,3,4,5,6,7,8,9, par exemple, le signal de volume sanguin cérébral et de flux sanguin dépendant du niveau d’oxygène dans le sang (BOLD), associé à l’activité neuronale dans le cerveau. Dans les études animales, les signaux hémodynamiques peuvent être affectés par l’anesthésie 10, le niveau de stress des animaux éveillés11, ainsi que les artefacts non physiologiques potentiels, par exemple, les pulsations cardiaques et les mouvements respiratoires12,13,14,15. Bien que de nombreuses méthodes de post-traitement aient été développées pour fournir une analyse rétrospective du signal IRMf pour la dynamique fonctionnelle liée à la tâche et à l’état de repos et la cartographie de la connectivité16,17,18,19, il existe peu de techniques pour fournir une solution de cartographie de la fonction cérébrale en temps réel et des lectures instantanées dans le cerveau animal 20 (dont la plupart sont principalement utilisées pour la cartographie du cerveau humain 21, 22,23,24,25,26,27). En particulier, ce type de méthode de cartographie IRMf en temps réel fait défaut dans les études animales. Il est nécessaire de mettre en place une plate-forme IRMf pour permettre l’étude en temps réel des stades physiologiques dépendants de l’état cérébral et fournir un paradigme de stimulation du biofeedback en temps réel pour les études fonctionnelles du cerveau animal.
Dans le présent travail, nous illustrons une configuration expérimentale IRMf en temps réel avec les macro-fonctions personnalisées du logiciel de la console IRM, démontrant la surveillance en temps réel des réponses BOLD-IRMf évoquées dans le cortex somatosensoriel primaire de la patte antérieure (FP-S1) des rats anesthésiés. Cette configuration en temps réel permet de visualiser l’activation cérébrale en cours dans des cartes fonctionnelles, ainsi que des cours temporels individuels de manière voxel, à l’aide du logiciel d’analyse de neuroimages existant, Analysis of Functional NeuroImages (AFNI)28. La préparation de la configuration expérimentale IRMf en temps réel pour l’étude animale est décrite dans le protocole. Outre la configuration des animaux, nous fournissons des procédures détaillées pour configurer la visualisation et l’analyse des signaux IRMf en temps réel à l’aide du dernier logiciel de console en parallèle avec les scripts de traitement d’image. En résumé, la configuration proposée de l’IRMf en temps réel pour les études animales est un outil puissant pour surveiller les signaux IRMf dynamiques dans le cerveau animal à l’aide du système de console IRM.
Protocol
Representative Results
Discussion
La surveillance en temps réel du signal IRMf aide les expérimentateurs à ajuster la physiologie des animaux pour optimiser la cartographie fonctionnelle. Les artefacts de mouvement chez les animaux éveillés, ainsi que l’effet anesthésique, sont des facteurs majeurs qui interviennent dans la variabilité des signaux IRMf, confondant l’interprétation biologique du signal par lui-même 31,32,33,34,35,36,37,38 …
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Nous remercions le Dr D. Chen et le Dr C. Yen d’avoir partagé le script AFNI pour mettre en place l’IRMf en temps réel pour PV 5 et l’équipe AFNI pour le support logiciel. Cette recherche a été financée par le financement de la NIH Brain Initiative (RF1NS113278-01, R01 MH111438-01) et la subvention de l’instrument S10 (S10 RR023009-01) au Martinos Center, à la Fondation allemande pour la recherche (DFG) Yu215 / 3-1, BMBF 01GQ1702 et au financement interne de la Société Max Planck.
Materials
| 14.1T Bruker MRI system | Bruker BioSpin MRI GmbH | N/A | |
| A365 Stimulus Isolator | World Precision Instruments | N/A | |
| AcqKnowledge Software | Biopac | RRID:SCR_014279, http://www.biopac.com/product/acqknowledge-software/ | |
| AFNI | Cox, 1996 | RRID:SCR_005927, http://afni.nimh.nih.gov | |
| CO2SMO (ETCO2/SpO2 Monitor), Model 7100 | Novametrix Medical Systems Inc | N/A | |
| Isoflurane | CP-Pharma | Cat# 1214 | |
| Master-9 | A.M.P.I | N/A | |
| Nanoliter Injector | World Precision Instruments | Cat# NANOFIL | |
| Pancuronium Bromide | Inresa Arzneimittel | Cat# 34409.00.00 | |
| ParaVision 6 | Bruker BioSpin MRI GmbH | RRID:SCR_001964 | |
| Phosphate Buffered Saline (PBS) | Gibco | Cat# 10010-023 | |
| Rat: Sprague Dawley rat | Charles River Laboratories | Crl:CD(SD) | |
| SAR-830/AP Ventilator | CWE | N/A | |
| α-chloralose | Sigma-Aldrich | Cat# C0128-25G;RRID |
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