פרוטוקול זה מתאר הליכי מיקרו-אינצ’ק עבור עוברים Culex quinquefasciatus הממוטבים לעבודה עם כלי עריכת גנים CRISPR/Cas9. טכניקה זו יכולה ליצור ביעילות מוטציות ספציפיות לאתר, תורשתיות, נבטים שניתן להשתמש בהן לבניית טכנולוגיות גנטיות בווקטור המחלה המאופק הזה.
Culex quinquefasciatus הוא וקטור של מגוון רחב של מחלות המועברות בווקטור כגון מלריה עופות, וירוס הנילוס המערבי (WNV), דלקת המוח היפנית, דלקת המוח של הסוס המזרחי, פילאריאזיס הלימפה ודלקת המוח של סנט לואיס. ראוי לציין כי מלריה עופות מילאה תפקיד מרכזי בהכחדתם של מיני ציפורים אנדמיים רבים באי, בעוד WNV הפך למחלה חשובה המועברת על ידי וקטור בארצות הברית. כדי לקבל תובנה נוספת על ביולוגיה C. quinquefasciatus ולהרחיב את ארגז הכלים שלהם שליטה גנטית, אנחנו צריכים לפתח שיטות יעילות ובמחיר סביר יותר להנדסת גנום במין זה. עם זאת, כמה תכונות ביולוגיות ייחודיות יתושי Culex, במיוחד רפסודות הביצים שלהם, הקשו על ביצוע הליכי microinjection הנדרשים להנדסת גנום. כדי להתמודד עם אתגרים אלה, פיתחנו פרוטוקול מיקרו-ייחוס עוברי ממוטב המתמקד בהפחתת המכשולים הטכניים הקשורים למאפיינים הייחודיים של יתושי Culex. נהלים אלה מדגימים שיטות אופטימליות לאיסוף ביצים, הפרדת רפסודות ביצים והליכי טיפול אחרים החיוניים למיקרו-לינג’ק מוצלח ב- C. quinquefasciatus. בשילוב עם טכנולוגיית עריכת הגנום CRISPR/Cas9, הליכים אלה מאפשרים לנו להשיג מוטציות נבטים ספציפיות לאתר, יעילות ותודישתיות, הנדרשות לבצע הנדסת גנום מתקדמת ולפתח טכנולוגיות בקרה גנטית בווקטור המחלה החשוב, אך כיום אינו אמין.
C. quinquefasciatus, הידוע בכינויו יתוש הבית הדרומי, הוא וקטור מוסמך של פתוגנים רבים כולל וירוס הנילוס המערבי (WNV), דלקת המוח היפנית, דלקת המוח של סנט לואיס ודלקת המוח של הסוס המזרחי. בפרט, מאז זוהה לראשונה בניו יורק בשנת 1999, WNV הפך למחלה וקטורית מרכזית ברחבי ארצות הברית היבשתית (ארה”ב) עם מעל 50,000 מקרים אנושיים שדווחו וכתוצאה מכך כ -2,300 מקרי מוות בין 1999 ל -20181, כמו גם מעל 4,500 מקרי סוסים שדווחו בין השנים 2008-20192. בנוסף, לפחות 23 מיני ציפורים שנמצאו בצפון אמריקה הושפעו מזיהומים ב-WNV עם לפחות 12 מינים המסווגים כבלתי הפיכים כתוצאה מ-WNV3. ההשפעה של WNV על אוכלוסיות אנושיות, סוסים ועופות נובעת מהתנהגות האכלה אופורטוניסטית של הווקטורים שלה. בדרך כלל, ציפורים הן המארחות העיקריות של WNV, ובני אדם וסוסים הם מארחים מקריים או ללא מוצא. כמה פתוגנים וקטור על ידי C. quinquefasciatus רק להדביק ציפורים כגון טפיל מלריה עופות, שריד פלסמודיום. בהוואי, C. quinquefasciatus הוא וקטור עיקרי של מלריה עופות וגרם להכחדתם של מיני ציפורים מקומיים רבים4,5.
כדי לשלוט במחלות המועברות על ידי C. quinquefasciatus, חוקרים וסוכנויות בקרה וקטורים השתמשו בכלים נפוצים לבקרת אוכלוסיית יתושים כגון יישום קוטל חרקים6, עם זאת, שיטות אלה הן יקרות, לא ספציפיות למינים, ויש להם יעילות מוגבלת כמו עמידות לחומרי הדברה גבוהה באוכלוסיות C. quinquefasciatus רבים6,7,8,9. טכניקות בקרה אחרות, כגון אסטרטגיות בקרת אוכלוסין מבוססות וולבצ’יהפותחו בשנים האחרונות10,11, אבל עלויות הכושר הקשורות זיהום Wolbachia להגביל את ההיתכנות של גישה זו עבור וקטור זה12. ישנן גם שיטות בקרה מבוססות גנטית שפותחו במינים אחרים של יתושים כגון Aedes aegypti13,14, אנופלס גמביה15 ו אנופלס סטיבנסי16, כולל פיתוח יתושים עמידים לפתוגן17,18,19, זה יכול להיות מפותח גם עבור C. quinquefasciatus אם הכלים הנדסת הגנום הנדרשים הם פותח עבור מין זה. עם זאת, ביולוגיה C. quinquefasciatus שונה מאוד מווקטורים אחרים של יתושים Aedes ו Anopheles אשר עשה את הפיתוח של טכנולוגיות גנטיות דומות קשה בווקטור זה. עם הופעתן של טכנולוגיות הנדסת גנום מבוססות CRISPR, הנדסת גנום מדויקת הפכה לטריוויאלית יותר ויותר, משתלמת ומסתגלת וכתוצאה מכך הובילה לפיתוח כלים גנטיים חדשניים במגוון רחב של מינים.
כדי ליצור מוטציות עם טכנולוגיות מבוססות CRISPR, תערובת של חלבון Cas9 ו- RNA מדריך סינתטי (sgRNA), המשלים את הלוצי הרצוי, הוא microinjected לתוך עוברים שלב טרום blastoderm. מאחר שנקבות C. quinquefasciatus מטילות את ביציהן בקבוצות המחוברות במבנה רפסודה צף (איור 1),בניגוד לתפיסת ביצים בודדות, תכונה של יתושי Aedes ו- Anopheles, מיקרו-יינות עוברים מסובכים יותר ויותר במין זה. זחלי קולקס מגיחים גם מהצד הצידה הצידי של כל ביצה, שנמצא במגע עם פני המים(איור 1),כך שכיוון הביצה לאחר המניפולציה חשוב במין זה. כאן אנו מתארים פרוטוקול מפורט המיועד למיקרו-הזרקה של חלבון Cas9 ו- sgRNA לעוברים C. quinquefasciatus. פרוטוקול זה תוכנן כדי להתאים תכונות ייחודיות לביולוגיה של Culex על מנת לשפר את הישרדות העובר ואת שיעורי מוטציית הגנום באמצעות שלבים מסוימים שהם המפתח לאיסוף ביצים בזמן והישרדות הביצים.
עם המאמצים האחרונים לייצר כלים מהונדסים גנטית לשליטה וקטורית יתושים, יש צורך לפתח ולייעל פרוטוקולי microinjection העובר עבור וקטורים נפוצים מחלת יתושים. למרות ששיטות פותחו עבור יתושי Aedes ו Anopheles, פרוטוקול שתוכנן במיוחד עבור Culex נחקר באופן מינימלי. באופן כללי ניתן לחלק פרוטוקולי הזרקת עוברים יתושים לשלושה שלבים כלליים: 1) איסוף והכנה של עוברים, 2) הזרקת עוברים, ו -3) התאוששות לאחר הזרקה. על מנת ליצור מוטציות בהצלחה, כל שלושת השלבים חייבים להיות מותאמים למין היעד. פרוטוקול שונה זה עבור מיקרו-הנדסה עוברית הוא ספציפי להנדסת גנום מוצלחת של יתושי קולקס.
מקסום אוסף העוברים הוא צוואר בקבוק נפוץ בפרוטוקולי מיקרו-נג’ק של העובר. על מנת להגדיל את מספר הביצים שנאספו בפרק זמן קצר, היתושים הוגבלו ממצע oviposition במשך 2-3 ימים לאחר ארוחת הדם. חשוב לציין כי C. quinquefasciatus נוטים להעדיף מקורות דם עופות לעומת מקורות יונקים או ממברנה האכלה עם דם יונקים. עם זאת, חוקרים רבים מתקשים להשיג מקור אמין של עופות חיים או דם עופות להאכלת דם, כך שמלאי המעבדה יכול להיות מותאם כדי להאכיל מקורות דם נגישים יותר. זה גם חיוני כדי להשתמש במים עשירים בחומרים מזינים עבור מצע oviposition כפי שהוא מספק רמזים oviposition עבור C. quinquefasciatus ורוב וקטורים אחרים Culex. ישנן שיטות רבות כדי לייצר מים עשירים בחומרים מזינים, אשר ייתכן שיהיה צורך אופטימיזציה בין מעבדות כדי להבטיח מספר מתאים של ביצים זמינים עבור microinjection. לדוגמה, בעוד שיטה זו הייתה המוצלחת ביותר עם צואת ארנב מותסס במים deionized במשך 5 ימים או יותר, חוקרים אחרים יש הצלחה רבה יותר עם דשא או מזון דגים כמקור התזונתי וחלקם אפילו עם מים מזוקקים21.
מאז יתושי קולקס להטיל קבוצות של ביצים רפסודות, איסוף ביצים הוא פשוט למדי. ביצים ניתן פשוט לאסוף על ידי גרף את כל הרפסודה עם מברשת צבע. הפרדת ביצים היא מורכבת יותר, אבל חיוני להזרקה מוצלחת. ביצים ניתן להפריד בזהירות מן הרפסודה על ידי הפעלת לחץ עדין כלפי מטה בין ביצים עם מברשת צבע או מלקחיים. עם קצת תרגול, משתמשים מרובים היו מסוגלים באופן אמין להפריד ביצים בודדות רפסודות ביצים. לאחר הפרדת כל ביצה, הביצים מיושרות באותו כיוון על סרט דביק דו צדדי, אשר מייצב את הביצים במהלך microinjection. ביצים מוזרקות לקצה האחורי המחודד ותוספת שמן הילוקרבון שומרת על הביצים לחות במהלך מניפולציה.
כדי להגביל את נזק העובר במהלך microinjection, מחטי הזרקה צריך להיות של כוח מתאים משופע בזווית מתאימה. למחטים אלומינוסיליות משופעות במשך 10 שניות בזווית של 50 מעלות היו התוצאות הטובות ביותר, אבל מחטי בורוסיליקט וקוורץ עשויות גם הן לעבוד, למרות שהן עשויות להיות פחות עמידות ויקרות יותר. בנוסף, שיפוע מחט תקין מאפשר זרימה טובה יותר של תערובות Cas9 ו- sgRNA ויוצר נקודה חדה יותר לחדירה קלה יותר לעובר. במקרים רבים, שיפוע הוא גם דרך יעילה לתקן במהירות מחטים סתומות במקום לבזבז את הזמן והמאמץ להחליף מחטים סתומות.
לאחר ההזרקה, ביצים צריכות להישאר ללא הפרעה לפחות 5 דקות עם שמן halocarbon מוסר מיד לאחר מכן על ידי צחצוח בעדינות משם עם מברשת צבע נקייה. לאחר הסרת שמן halocarbon, ביצים מוזרקות ניתן להציב במים כדי לבקוע, אשר מתרחשת בדרך כלל בתוך 3 ימים לאחר הזרקה. עם תרגול ומספר מספיק של ביצים, פרוטוקול זה יכול להשיג מוטציות סומטיות ונבטים עקביים ב- C. quinquefasciatus והוא רב-תכליתי מספיק כדי שניתן יהיה להתאים אותו בקלות ליתושי קולקס אחרים.
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו נתמכה בחלקה על ידי קרנות הפעלה UCSD המופנות ל- O.S.A.
9 oz clear plastic pet cup | Karat | C-KC9 | Insect Rearing and Egg Collection |
Aluminosilicate glass capillary tubing 1mm(outside diameter) X 0.58mm (inner diameter) | Sutter Instruments | BF100-58-10 | Microinjection, borosilicate and quartz needles could also be used but we prefered aluminosilicate |
Blood | Colorado Serum Company | 31025 | The colony took multiple generations to adapt to this blood source. Other blood sources are likely just as appropriate. See protocol notes on blood source selection. |
Bugdorm | Bugdorm | 4F2222 | Insect Rearing Cage |
Cas9 Protein with NLS | PNABio | CP01 | Microinjection |
Compound Microscope | Olympus BX41 | Microinjection, for embryo injection | |
Diamond abrasive plate (0.7u to 2.0u tip sizes) | Sutter Instruments | 104E | Microinjection, to be used with beveler |
DNase/RNase-Free distilled Water | Invitrogen | 10977-015 | Microinjection |
Double-sided Tape | Scotch | B084NVQGXD | Microinjection, embryo alignment |
Femtojet 4x or 4i programmable microinjector | Eppendorf | Microinjection | |
Femtotips Microloader tips | Fisher Scientific | E5242956003 | Microinjection |
Filter Paper | Whatman | 1001-090 | Microinjection, embryo collection |
Fine-tip paintbrush | ZEM | 2595 | Microinjection, embryo alignment |
Halocarbon oil 27 | Sigma-Aldrich | H8773 | Microinjection, embryo alignment |
Halocarbon oil 700 | Sigma-Aldrich | H8898 | Microinjection, embryo alignment |
Hemotek | Hemotek | PS5 | Line Maintenance |
Microelectrode Beveler | Sutter Instruments | BV10 | Microinjection, needle beveling |
Micropipette Puller | Sutter Instruments | P-1000 or P-2000 | Microinjection, needle pulling |
Microscope Slides | Fisherbrand | 12-550-A3 | Microinjection, embryo alignment |
Non-Drying Modeling Clay | Jovi | B0025Z71IM | Microinjection, needle storage |
Stereo Microscope | Olympus | SZ51 | Microinjection, for embryo alignment |
Sugar | Domino | 20% sugar solution for adult sugar source. | |
T7 Endonuclease I | NEB | M0302 | Preparation of microinjection materials |
TOPO TA Cloning Kit | ThermoFischer Scientific | K451020 | Preparation of microinjection materials |
Ultra-fine tip forceps | Fisher Scientific | 16-100-121 | Microinjection, embryo alignment |